# TARGET T0495 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0495.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 82 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.006 0.006 0.002 0.009 0.126 0.850 2 P 0.024 0.046 0.007 0.046 0.142 0.736 3 M 0.023 0.016 0.019 0.079 0.265 0.597 4 T 0.013 0.005 0.081 0.294 0.323 0.283 5 L 0.014 0.019 0.067 0.383 0.262 0.254 6 D 0.012 0.016 0.031 0.357 0.218 0.365 7 L 0.006 0.009 0.014 0.536 0.104 0.331 8 Q 0.001 0.001 0.006 0.895 0.030 0.067 9 P 0.001 0.001 0.006 0.960 0.015 0.018 10 G 0.001 0.001 0.005 0.982 0.007 0.005 11 Q 0.001 0.001 0.003 0.992 0.004 0.001 12 R 0.001 0.001 0.005 0.988 0.005 0.001 13 L 0.001 0.001 0.007 0.982 0.008 0.003 14 A 0.001 0.001 0.003 0.982 0.008 0.007 15 R 0.001 0.001 0.001 0.980 0.007 0.012 16 G 0.001 0.001 0.001 0.953 0.006 0.040 17 V 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.004 18 A 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 19 R 0.001 0.001 0.001 0.997 0.002 0.001 20 H 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 21 L 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 22 R 0.001 0.001 0.002 0.994 0.004 0.001 23 A 0.001 0.001 0.004 0.981 0.010 0.006 24 H 0.001 0.001 0.009 0.824 0.053 0.112 25 G 0.002 0.001 0.001 0.004 0.069 0.924 26 F 0.063 0.002 0.001 0.001 0.081 0.853 27 V 0.635 0.011 0.001 0.001 0.057 0.296 28 S 0.871 0.018 0.001 0.001 0.023 0.087 29 V 0.865 0.004 0.007 0.001 0.033 0.091 30 E 0.742 0.003 0.022 0.001 0.071 0.161 31 E 0.694 0.007 0.025 0.004 0.092 0.177 32 F 0.624 0.027 0.012 0.005 0.111 0.221 33 V 0.491 0.082 0.005 0.005 0.128 0.289 34 P 0.114 0.056 0.008 0.006 0.647 0.168 35 A 0.024 0.006 0.009 0.007 0.884 0.070 36 R 0.013 0.005 0.009 0.007 0.919 0.048 37 G 0.043 0.010 0.003 0.002 0.825 0.118 38 L 0.289 0.073 0.002 0.002 0.211 0.424 39 R 0.585 0.039 0.002 0.002 0.086 0.286 40 V 0.646 0.011 0.005 0.003 0.093 0.242 41 D 0.773 0.010 0.010 0.004 0.080 0.124 42 V 0.849 0.009 0.027 0.006 0.053 0.055 43 M 0.903 0.003 0.014 0.004 0.037 0.040 44 G 0.922 0.002 0.007 0.003 0.034 0.031 45 L 0.850 0.030 0.003 0.002 0.046 0.069 46 G 0.206 0.025 0.005 0.003 0.723 0.039 47 P 0.010 0.001 0.018 0.003 0.950 0.017 48 K 0.015 0.003 0.009 0.001 0.951 0.022 49 G 0.109 0.011 0.006 0.001 0.821 0.052 50 E 0.570 0.015 0.001 0.001 0.052 0.363 51 I 0.970 0.005 0.001 0.001 0.003 0.021 52 W 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 53 V 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 54 I 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 55 E 0.983 0.001 0.001 0.001 0.002 0.014 56 C 0.932 0.001 0.001 0.001 0.014 0.051 57 K 0.647 0.016 0.002 0.005 0.059 0.272 58 S 0.073 0.010 0.003 0.010 0.128 0.777 59 S 0.005 0.003 0.001 0.005 0.068 0.918 60 R 0.002 0.001 0.049 0.780 0.080 0.088 61 A 0.001 0.001 0.054 0.871 0.062 0.010 62 D 0.002 0.001 0.084 0.872 0.038 0.003 63 F 0.001 0.001 0.070 0.881 0.041 0.006 64 Q 0.001 0.001 0.070 0.884 0.038 0.005 65 A 0.002 0.001 0.048 0.861 0.068 0.020 66 D 0.005 0.004 0.035 0.555 0.205 0.197 67 A 0.010 0.024 0.062 0.463 0.222 0.219 68 K 0.009 0.009 0.041 0.162 0.300 0.479 69 W 0.002 0.005 0.418 0.231 0.211 0.134 70 Q 0.003 0.004 0.563 0.178 0.161 0.091 71 G 0.002 0.003 0.572 0.240 0.116 0.067 72 Y 0.004 0.009 0.194 0.596 0.111 0.086 73 L 0.004 0.005 0.111 0.626 0.176 0.078 74 E 0.004 0.003 0.065 0.722 0.145 0.060 75 W 0.013 0.012 0.078 0.715 0.127 0.054 76 C 0.037 0.009 0.062 0.647 0.179 0.066 77 D 0.156 0.004 0.055 0.420 0.248 0.117 78 R 0.243 0.010 0.055 0.375 0.195 0.122 79 Y 0.434 0.027 0.040 0.295 0.116 0.088 80 F 0.409 0.008 0.033 0.225 0.139 0.186 81 W 0.563 0.015 0.011 0.121 0.087 0.202 82 A 0.404 0.053 0.004 0.032 0.083 0.425 83 V 0.079 0.052 0.001 0.014 0.083 0.771 84 D 0.036 0.026 0.011 0.011 0.553 0.362 85 M 0.016 0.005 0.055 0.019 0.692 0.213 86 E 0.015 0.009 0.045 0.012 0.807 0.112 87 F 0.030 0.069 0.023 0.006 0.681 0.191 88 P 0.034 0.033 0.035 0.013 0.266 0.620 89 A 0.009 0.014 0.625 0.016 0.212 0.124 90 E 0.010 0.004 0.651 0.014 0.234 0.087 91 L 0.029 0.026 0.428 0.019 0.328 0.170 92 L 0.032 0.022 0.055 0.010 0.420 0.461 93 P 0.019 0.021 0.096 0.011 0.619 0.234 94 A 0.019 0.007 0.171 0.018 0.647 0.137 95 E 0.041 0.002 0.098 0.011 0.708 0.141 96 S 0.260 0.015 0.026 0.005 0.477 0.217 97 G 0.730 0.005 0.003 0.001 0.087 0.174 98 L 0.962 0.005 0.001 0.001 0.008 0.024 99 L 0.967 0.002 0.001 0.001 0.006 0.023 100 I 0.972 0.004 0.001 0.001 0.006 0.016 101 A 0.944 0.005 0.002 0.001 0.018 0.030 102 D 0.554 0.013 0.004 0.003 0.330 0.096 103 A 0.068 0.006 0.024 0.009 0.865 0.029 104 Y 0.031 0.002 0.026 0.005 0.909 0.026 105 D 0.101 0.007 0.024 0.009 0.805 0.054 106 A 0.524 0.019 0.008 0.009 0.228 0.211 107 E 0.873 0.025 0.003 0.006 0.034 0.059 108 I 0.901 0.012 0.006 0.007 0.034 0.040 109 V 0.852 0.011 0.007 0.009 0.058 0.063 110 R 0.571 0.005 0.012 0.019 0.160 0.233 111 M 0.224 0.009 0.010 0.016 0.232 0.509 112 A 0.087 0.027 0.005 0.008 0.218 0.657 113 P 0.043 0.011 0.014 0.013 0.195 0.724 114 E 0.033 0.019 0.205 0.049 0.306 0.388 115 Q 0.025 0.023 0.229 0.066 0.335 0.322 116 K 0.006 0.008 0.077 0.045 0.233 0.631 117 L 0.001 0.005 0.005 0.026 0.095 0.868 118 A 0.001 0.002 0.008 0.094 0.053 0.842 119 P 0.001 0.003 0.041 0.670 0.046 0.240 120 A 0.001 0.001 0.023 0.947 0.016 0.014 121 R 0.001 0.001 0.013 0.970 0.011 0.005 122 R 0.001 0.001 0.004 0.984 0.008 0.005 123 K 0.001 0.001 0.001 0.993 0.004 0.002 124 V 0.001 0.001 0.001 0.994 0.003 0.002 125 L 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 126 I 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 127 Q 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 128 K 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 129 F 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 130 A 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 131 T 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 132 H 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 133 A 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 134 A 0.001 0.001 0.001 0.994 0.003 0.002 135 R 0.001 0.001 0.001 0.992 0.004 0.003 136 R 0.001 0.001 0.001 0.990 0.006 0.003 137 L 0.001 0.001 0.001 0.992 0.004 0.002 138 Q 0.001 0.001 0.007 0.965 0.017 0.011 139 A 0.001 0.001 0.014 0.933 0.030 0.022 140 L 0.002 0.005 0.021 0.824 0.081 0.068 141 R 0.002 0.015 0.020 0.458 0.164 0.341 142 D 0.001 0.009 0.018 0.039 0.590 0.342 143 P 0.001 0.002 0.291 0.029 0.610 0.067 144 E 0.001 0.002 0.323 0.017 0.620 0.036 145 G 0.008 0.016 0.264 0.016 0.654 0.043 146 H 0.045 0.018 0.052 0.024 0.460 0.401 147 G 0.074 0.044 0.047 0.028 0.343 0.463 148 I 0.085 0.056 0.030 0.032 0.268 0.529 149 F 0.044 0.026 0.016 0.029 0.140 0.745 150 E 0.004 0.003 0.003 0.006 0.048 0.935