# TARGET T0495 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0495.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 82 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 2 P 0.009 0.024 0.006 0.036 0.004 0.037 0.884 3 M 0.010 0.013 0.019 0.055 0.247 0.133 0.523 4 T 0.009 0.012 0.083 0.165 0.205 0.185 0.342 5 L 0.018 0.007 0.085 0.160 0.221 0.233 0.277 6 D 0.018 0.010 0.072 0.274 0.186 0.139 0.302 7 L 0.011 0.018 0.015 0.335 0.207 0.032 0.381 8 Q 0.003 0.003 0.010 0.792 0.043 0.040 0.110 9 P 0.001 0.001 0.006 0.918 0.013 0.036 0.026 10 G 0.001 0.001 0.002 0.977 0.004 0.009 0.007 11 Q 0.001 0.001 0.001 0.987 0.004 0.003 0.004 12 R 0.001 0.001 0.001 0.990 0.002 0.002 0.004 13 L 0.001 0.001 0.002 0.991 0.001 0.004 0.002 14 A 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.006 0.001 15 R 0.001 0.001 0.001 0.969 0.001 0.029 0.001 16 G 0.001 0.001 0.001 0.952 0.002 0.043 0.003 17 V 0.001 0.001 0.001 0.984 0.002 0.007 0.006 18 A 0.001 0.001 0.001 0.994 0.002 0.002 0.002 19 R 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.002 0.001 20 H 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 21 L 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.003 0.001 22 R 0.001 0.001 0.002 0.981 0.001 0.015 0.001 23 A 0.001 0.001 0.006 0.853 0.003 0.135 0.002 24 H 0.001 0.001 0.005 0.139 0.014 0.839 0.003 25 G 0.001 0.001 0.002 0.005 0.056 0.915 0.021 26 F 0.134 0.013 0.005 0.004 0.080 0.032 0.732 27 V 0.666 0.017 0.003 0.001 0.020 0.006 0.288 28 S 0.811 0.004 0.003 0.001 0.021 0.005 0.155 29 V 0.862 0.003 0.003 0.001 0.019 0.002 0.111 30 E 0.859 0.004 0.002 0.001 0.014 0.002 0.119 31 E 0.755 0.004 0.002 0.001 0.022 0.002 0.214 32 F 0.720 0.013 0.003 0.001 0.027 0.004 0.232 33 V 0.571 0.099 0.003 0.001 0.038 0.006 0.282 34 P 0.116 0.014 0.011 0.001 0.048 0.037 0.773 35 A 0.009 0.002 0.021 0.001 0.158 0.691 0.118 36 R 0.001 0.002 0.030 0.001 0.097 0.849 0.020 37 G 0.011 0.003 0.027 0.001 0.450 0.294 0.214 38 L 0.095 0.061 0.018 0.003 0.207 0.057 0.560 39 R 0.404 0.165 0.006 0.001 0.054 0.030 0.339 40 V 0.372 0.004 0.001 0.001 0.032 0.001 0.590 41 D 0.699 0.001 0.001 0.001 0.256 0.001 0.043 42 V 0.988 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 43 M 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 44 G 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 45 L 0.939 0.008 0.001 0.001 0.007 0.001 0.045 46 G 0.177 0.002 0.002 0.001 0.043 0.005 0.771 47 P 0.032 0.005 0.012 0.001 0.215 0.666 0.069 48 K 0.021 0.007 0.012 0.001 0.151 0.767 0.041 49 G 0.151 0.006 0.002 0.001 0.628 0.028 0.185 50 E 0.536 0.013 0.001 0.001 0.031 0.006 0.412 51 I 0.948 0.005 0.001 0.001 0.002 0.001 0.045 52 W 0.989 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.006 53 V 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 54 I 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 55 E 0.987 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.010 56 C 0.928 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.065 57 K 0.787 0.012 0.002 0.001 0.029 0.004 0.166 58 S 0.378 0.025 0.001 0.003 0.161 0.010 0.423 59 S 0.088 0.011 0.001 0.007 0.156 0.012 0.725 60 R 0.002 0.001 0.045 0.844 0.049 0.048 0.011 61 A 0.001 0.001 0.044 0.908 0.017 0.024 0.007 62 D 0.001 0.001 0.057 0.906 0.007 0.023 0.007 63 F 0.002 0.001 0.019 0.939 0.009 0.019 0.011 64 Q 0.002 0.001 0.017 0.888 0.006 0.073 0.012 65 A 0.001 0.001 0.024 0.641 0.017 0.300 0.016 66 D 0.002 0.003 0.033 0.398 0.103 0.354 0.108 67 A 0.004 0.009 0.087 0.300 0.173 0.262 0.165 68 K 0.004 0.011 0.078 0.304 0.176 0.198 0.229 69 W 0.003 0.007 0.083 0.182 0.139 0.102 0.485 70 Q 0.001 0.002 0.359 0.275 0.040 0.282 0.041 71 G 0.004 0.002 0.377 0.219 0.053 0.283 0.062 72 Y 0.006 0.007 0.436 0.246 0.057 0.103 0.145 73 L 0.014 0.012 0.351 0.295 0.051 0.144 0.132 74 E 0.027 0.005 0.279 0.197 0.066 0.350 0.077 75 W 0.043 0.016 0.208 0.215 0.097 0.321 0.100 76 C 0.127 0.024 0.052 0.128 0.132 0.146 0.392 77 D 0.210 0.005 0.028 0.065 0.242 0.103 0.347 78 R 0.578 0.007 0.025 0.070 0.158 0.054 0.108 79 Y 0.846 0.014 0.008 0.041 0.007 0.014 0.070 80 F 0.923 0.002 0.004 0.023 0.007 0.008 0.032 81 W 0.910 0.003 0.002 0.010 0.011 0.005 0.058 82 A 0.636 0.007 0.006 0.013 0.046 0.013 0.278 83 V 0.258 0.025 0.013 0.021 0.146 0.023 0.512 84 D 0.046 0.019 0.080 0.033 0.114 0.073 0.636 85 M 0.013 0.006 0.220 0.047 0.134 0.444 0.135 86 E 0.014 0.009 0.199 0.043 0.168 0.462 0.105 87 F 0.015 0.024 0.034 0.026 0.531 0.048 0.322 88 P 0.015 0.028 0.023 0.013 0.087 0.045 0.790 89 A 0.006 0.005 0.624 0.065 0.026 0.214 0.060 90 E 0.006 0.001 0.702 0.037 0.030 0.161 0.064 91 L 0.015 0.016 0.548 0.052 0.112 0.151 0.107 92 L 0.044 0.090 0.019 0.021 0.331 0.027 0.468 93 P 0.028 0.016 0.070 0.016 0.078 0.069 0.723 94 A 0.016 0.011 0.215 0.019 0.127 0.545 0.066 95 E 0.058 0.010 0.258 0.012 0.112 0.485 0.065 96 S 0.429 0.005 0.016 0.004 0.053 0.023 0.470 97 G 0.860 0.001 0.001 0.001 0.072 0.008 0.057 98 L 0.979 0.003 0.001 0.001 0.002 0.001 0.014 99 L 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 100 I 0.985 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.012 101 A 0.939 0.003 0.001 0.001 0.005 0.001 0.051 102 D 0.554 0.006 0.002 0.001 0.045 0.020 0.373 103 A 0.138 0.003 0.028 0.002 0.268 0.464 0.096 104 Y 0.029 0.005 0.038 0.003 0.183 0.702 0.040 105 D 0.150 0.003 0.037 0.003 0.294 0.332 0.182 106 A 0.727 0.007 0.003 0.002 0.025 0.007 0.230 107 E 0.961 0.005 0.001 0.001 0.005 0.001 0.026 108 I 0.958 0.005 0.001 0.002 0.002 0.001 0.030 109 V 0.926 0.004 0.003 0.004 0.006 0.003 0.055 110 R 0.685 0.009 0.010 0.012 0.059 0.011 0.213 111 M 0.211 0.008 0.011 0.013 0.215 0.019 0.523 112 A 0.051 0.007 0.006 0.009 0.304 0.019 0.603 113 P 0.015 0.010 0.033 0.021 0.202 0.091 0.629 114 E 0.007 0.012 0.138 0.051 0.189 0.178 0.425 115 Q 0.004 0.004 0.150 0.062 0.239 0.208 0.333 116 K 0.004 0.006 0.124 0.088 0.248 0.214 0.316 117 L 0.004 0.021 0.056 0.128 0.208 0.074 0.509 118 A 0.001 0.005 0.023 0.183 0.081 0.042 0.664 119 P 0.001 0.001 0.021 0.832 0.028 0.051 0.066 120 A 0.001 0.001 0.007 0.931 0.016 0.024 0.021 121 R 0.001 0.001 0.002 0.968 0.008 0.011 0.011 122 R 0.001 0.001 0.001 0.983 0.003 0.006 0.007 123 K 0.001 0.001 0.001 0.991 0.002 0.005 0.002 124 V 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.005 0.001 125 L 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.004 0.001 126 I 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 127 Q 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 128 K 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.002 0.001 129 F 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 130 A 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 131 T 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 132 H 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.003 0.001 133 A 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.008 0.001 134 A 0.001 0.001 0.001 0.984 0.002 0.011 0.003 135 R 0.001 0.001 0.001 0.972 0.003 0.021 0.003 136 R 0.001 0.001 0.001 0.951 0.008 0.029 0.010 137 L 0.001 0.001 0.002 0.956 0.008 0.014 0.020 138 Q 0.001 0.001 0.007 0.946 0.005 0.031 0.010 139 A 0.001 0.001 0.018 0.892 0.008 0.072 0.009 140 L 0.001 0.001 0.020 0.763 0.018 0.180 0.017 141 R 0.001 0.003 0.015 0.653 0.056 0.229 0.044 142 D 0.001 0.003 0.011 0.035 0.126 0.035 0.789 143 P 0.001 0.003 0.148 0.078 0.050 0.664 0.057 144 E 0.001 0.001 0.143 0.030 0.041 0.749 0.035 145 G 0.007 0.020 0.222 0.075 0.192 0.155 0.329 146 H 0.049 0.032 0.092 0.120 0.147 0.117 0.443 147 G 0.076 0.017 0.103 0.111 0.156 0.183 0.354 148 I 0.068 0.028 0.078 0.097 0.137 0.193 0.399 149 F 0.042 0.026 0.024 0.054 0.008 0.134 0.711 150 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998