# TARGET T0495 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t04-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0495.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 129 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.098 0.098 0.018 0.038 0.028 0.110 0.103 0.506 2 P 0.116 0.054 0.016 0.012 0.018 0.092 0.041 0.652 3 M 0.110 0.129 0.021 0.019 0.022 0.095 0.073 0.531 4 T 0.163 0.085 0.029 0.011 0.018 0.105 0.084 0.505 5 L 0.113 0.041 0.030 0.012 0.020 0.106 0.208 0.470 6 D 0.011 0.112 0.025 0.011 0.015 0.123 0.077 0.627 7 L 0.042 0.324 0.012 0.006 0.008 0.071 0.062 0.474 8 Q 0.028 0.800 0.004 0.006 0.003 0.020 0.061 0.079 9 P 0.015 0.936 0.001 0.001 0.001 0.004 0.011 0.031 10 G 0.015 0.946 0.001 0.001 0.001 0.002 0.023 0.011 11 Q 0.010 0.864 0.004 0.002 0.001 0.005 0.095 0.018 12 R 0.034 0.766 0.010 0.003 0.004 0.010 0.126 0.047 13 L 0.066 0.863 0.002 0.001 0.001 0.004 0.036 0.025 14 A 0.019 0.865 0.004 0.001 0.002 0.012 0.033 0.064 15 R 0.006 0.906 0.002 0.001 0.001 0.006 0.029 0.048 16 G 0.007 0.905 0.002 0.001 0.001 0.004 0.057 0.022 17 V 0.009 0.935 0.004 0.001 0.001 0.004 0.033 0.014 18 A 0.012 0.915 0.003 0.001 0.001 0.005 0.033 0.030 19 R 0.024 0.820 0.010 0.003 0.002 0.010 0.061 0.071 20 H 0.068 0.329 0.054 0.006 0.009 0.029 0.378 0.126 21 L 0.095 0.045 0.203 0.026 0.011 0.057 0.370 0.192 22 R 0.604 0.007 0.011 0.002 0.003 0.024 0.030 0.319 23 A 0.099 0.003 0.016 0.002 0.002 0.083 0.016 0.779 24 H 0.007 0.002 0.049 0.002 0.007 0.146 0.017 0.769 25 G 0.008 0.005 0.067 0.021 0.030 0.156 0.039 0.675 26 F 0.002 0.001 0.023 0.020 0.017 0.098 0.006 0.833 27 V 0.009 0.004 0.439 0.125 0.142 0.052 0.042 0.188 28 S 0.050 0.007 0.257 0.056 0.081 0.071 0.060 0.418 29 V 0.158 0.008 0.206 0.057 0.072 0.071 0.082 0.346 30 E 0.042 0.007 0.105 0.070 0.142 0.083 0.053 0.498 31 E 0.008 0.004 0.079 0.097 0.230 0.079 0.020 0.484 32 F 0.007 0.002 0.043 0.097 0.203 0.117 0.022 0.508 33 V 0.029 0.002 0.076 0.204 0.134 0.107 0.092 0.356 34 P 0.480 0.003 0.008 0.015 0.017 0.050 0.037 0.389 35 A 0.328 0.005 0.015 0.008 0.016 0.066 0.032 0.531 36 R 0.004 0.001 0.009 0.005 0.009 0.114 0.005 0.852 37 G 0.009 0.005 0.015 0.036 0.064 0.121 0.040 0.710 38 L 0.011 0.008 0.109 0.145 0.173 0.094 0.054 0.407 39 R 0.014 0.013 0.202 0.173 0.191 0.067 0.060 0.281 40 V 0.010 0.004 0.076 0.109 0.129 0.079 0.033 0.560 41 D 0.030 0.016 0.229 0.177 0.349 0.036 0.065 0.097 42 V 0.041 0.011 0.159 0.096 0.284 0.051 0.058 0.300 43 M 0.012 0.003 0.141 0.167 0.231 0.068 0.044 0.335 44 G 0.007 0.001 0.136 0.118 0.360 0.090 0.032 0.257 45 L 0.015 0.001 0.115 0.086 0.152 0.089 0.056 0.486 46 G 0.313 0.002 0.019 0.039 0.039 0.087 0.103 0.398 47 P 0.211 0.002 0.010 0.009 0.018 0.114 0.034 0.603 48 K 0.007 0.001 0.004 0.009 0.020 0.108 0.009 0.843 49 G 0.006 0.002 0.014 0.066 0.239 0.142 0.038 0.493 50 E 0.003 0.003 0.039 0.320 0.461 0.040 0.053 0.080 51 I 0.002 0.001 0.032 0.201 0.464 0.049 0.027 0.225 52 W 0.001 0.001 0.106 0.424 0.406 0.010 0.039 0.014 53 V 0.001 0.001 0.047 0.345 0.433 0.025 0.019 0.130 54 I 0.001 0.001 0.102 0.531 0.269 0.020 0.022 0.055 55 E 0.002 0.002 0.144 0.336 0.345 0.027 0.047 0.096 56 C 0.004 0.003 0.146 0.348 0.244 0.041 0.030 0.184 57 K 0.009 0.006 0.157 0.224 0.302 0.058 0.043 0.201 58 S 0.014 0.011 0.130 0.117 0.160 0.073 0.034 0.460 59 S 0.182 0.151 0.067 0.048 0.082 0.068 0.111 0.290 60 R 0.279 0.171 0.022 0.017 0.020 0.076 0.088 0.327 61 A 0.092 0.163 0.022 0.018 0.026 0.080 0.083 0.515 62 D 0.145 0.208 0.027 0.013 0.036 0.080 0.121 0.371 63 F 0.200 0.135 0.021 0.023 0.036 0.104 0.103 0.379 64 Q 0.127 0.159 0.014 0.018 0.029 0.105 0.102 0.446 65 A 0.066 0.187 0.009 0.014 0.025 0.083 0.049 0.566 66 D 0.091 0.338 0.010 0.020 0.022 0.073 0.080 0.366 67 A 0.052 0.190 0.021 0.022 0.021 0.094 0.114 0.487 68 K 0.114 0.473 0.008 0.010 0.011 0.039 0.057 0.289 69 W 0.232 0.458 0.005 0.005 0.006 0.033 0.035 0.226 70 Q 0.094 0.450 0.009 0.011 0.009 0.042 0.030 0.356 71 G 0.172 0.401 0.011 0.006 0.020 0.035 0.046 0.309 72 Y 0.157 0.269 0.026 0.023 0.024 0.063 0.088 0.351 73 L 0.173 0.098 0.033 0.031 0.044 0.076 0.123 0.422 74 E 0.148 0.055 0.019 0.020 0.029 0.072 0.041 0.615 75 W 0.160 0.048 0.037 0.016 0.031 0.091 0.054 0.563 76 C 0.080 0.030 0.059 0.025 0.035 0.137 0.062 0.573 77 D 0.021 0.022 0.067 0.032 0.062 0.142 0.079 0.576 78 R 0.005 0.011 0.188 0.086 0.158 0.120 0.071 0.361 79 Y 0.006 0.016 0.242 0.147 0.226 0.069 0.051 0.242 80 F 0.005 0.012 0.390 0.150 0.194 0.044 0.051 0.154 81 W 0.009 0.005 0.218 0.203 0.231 0.058 0.039 0.237 82 A 0.006 0.003 0.279 0.161 0.220 0.065 0.048 0.219 83 V 0.135 0.009 0.142 0.061 0.062 0.086 0.048 0.457 84 D 0.511 0.015 0.016 0.009 0.014 0.049 0.119 0.268 85 M 0.014 0.007 0.023 0.011 0.013 0.109 0.018 0.804 86 E 0.012 0.004 0.003 0.005 0.009 0.070 0.006 0.893 87 F 0.037 0.016 0.026 0.038 0.022 0.087 0.029 0.745 88 P 0.679 0.040 0.007 0.008 0.008 0.024 0.025 0.209 89 A 0.478 0.024 0.004 0.003 0.009 0.040 0.032 0.411 90 E 0.008 0.006 0.025 0.012 0.032 0.117 0.015 0.784 91 L 0.016 0.010 0.028 0.031 0.149 0.145 0.038 0.583 92 L 0.026 0.014 0.069 0.070 0.068 0.191 0.161 0.400 93 P 0.186 0.024 0.037 0.029 0.032 0.133 0.208 0.351 94 A 0.169 0.047 0.041 0.011 0.023 0.128 0.130 0.452 95 E 0.010 0.022 0.101 0.016 0.034 0.206 0.066 0.544 96 S 0.002 0.023 0.120 0.058 0.188 0.174 0.087 0.348 97 G 0.002 0.024 0.211 0.198 0.345 0.051 0.072 0.097 98 L 0.001 0.011 0.163 0.388 0.220 0.035 0.054 0.129 99 L 0.001 0.005 0.315 0.318 0.268 0.014 0.040 0.039 100 I 0.009 0.004 0.146 0.193 0.380 0.048 0.078 0.143 101 A 0.024 0.003 0.194 0.154 0.183 0.094 0.082 0.266 102 D 0.373 0.023 0.019 0.019 0.033 0.094 0.072 0.368 103 A 0.092 0.023 0.005 0.008 0.009 0.131 0.039 0.694 104 Y 0.020 0.038 0.005 0.008 0.016 0.107 0.020 0.787 105 D 0.082 0.145 0.012 0.044 0.058 0.095 0.135 0.428 106 A 0.027 0.064 0.012 0.114 0.076 0.089 0.034 0.582 107 E 0.067 0.167 0.050 0.148 0.244 0.045 0.079 0.200 108 I 0.077 0.059 0.022 0.129 0.252 0.054 0.062 0.345 109 V 0.079 0.022 0.026 0.141 0.252 0.075 0.061 0.343 110 R 0.046 0.042 0.026 0.126 0.230 0.081 0.032 0.417 111 M 0.056 0.054 0.018 0.043 0.095 0.067 0.020 0.647 112 A 0.122 0.096 0.026 0.083 0.061 0.091 0.069 0.451 113 P 0.209 0.082 0.024 0.038 0.051 0.072 0.071 0.452 114 E 0.201 0.046 0.021 0.018 0.028 0.066 0.050 0.570 115 Q 0.109 0.031 0.017 0.018 0.027 0.087 0.034 0.676 116 K 0.025 0.047 0.013 0.012 0.022 0.105 0.020 0.756 117 L 0.055 0.178 0.015 0.008 0.015 0.090 0.056 0.583 118 A 0.133 0.546 0.004 0.008 0.005 0.032 0.096 0.176 119 P 0.158 0.504 0.006 0.003 0.004 0.029 0.082 0.214 120 A 0.040 0.597 0.008 0.003 0.005 0.031 0.059 0.258 121 R 0.022 0.822 0.007 0.001 0.002 0.010 0.082 0.054 122 R 0.006 0.913 0.001 0.001 0.001 0.003 0.054 0.022 123 K 0.003 0.929 0.001 0.001 0.001 0.002 0.054 0.009 124 V 0.002 0.980 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.006 125 L 0.003 0.978 0.002 0.001 0.001 0.001 0.013 0.003 126 I 0.008 0.960 0.001 0.001 0.001 0.001 0.026 0.003 127 Q 0.006 0.082 0.004 0.001 0.001 0.004 0.894 0.009 128 K 0.004 0.691 0.009 0.002 0.001 0.014 0.229 0.051 129 F 0.007 0.941 0.004 0.001 0.001 0.004 0.032 0.011 130 A 0.004 0.953 0.002 0.001 0.001 0.004 0.018 0.017 131 T 0.007 0.915 0.001 0.001 0.001 0.006 0.044 0.026 132 H 0.011 0.888 0.003 0.001 0.001 0.005 0.075 0.017 133 A 0.026 0.817 0.004 0.001 0.001 0.005 0.126 0.021 134 A 0.011 0.844 0.003 0.001 0.001 0.012 0.065 0.063 135 R 0.016 0.795 0.009 0.002 0.002 0.020 0.064 0.092 136 R 0.068 0.640 0.028 0.006 0.006 0.031 0.093 0.128 137 L 0.268 0.373 0.031 0.007 0.007 0.039 0.087 0.187 138 Q 0.331 0.220 0.023 0.006 0.015 0.046 0.048 0.312 139 A 0.142 0.011 0.023 0.007 0.017 0.110 0.042 0.648 140 L 0.005 0.010 0.065 0.018 0.055 0.233 0.037 0.578 141 R 0.008 0.017 0.038 0.008 0.017 0.113 0.014 0.784 142 D 0.670 0.073 0.004 0.006 0.003 0.031 0.090 0.125 143 P 0.137 0.066 0.008 0.006 0.004 0.093 0.049 0.636 144 E 0.048 0.050 0.034 0.003 0.015 0.072 0.027 0.752 145 G 0.092 0.045 0.029 0.020 0.026 0.106 0.056 0.625 146 H 0.072 0.020 0.038 0.070 0.076 0.115 0.060 0.549 147 G 0.100 0.013 0.022 0.035 0.105 0.083 0.040 0.602 148 I 0.105 0.010 0.023 0.030 0.079 0.091 0.037 0.623 149 F 0.071 0.010 0.029 0.052 0.078 0.118 0.032 0.612 150 E 0.077 0.014 0.016 0.045 0.078 0.105 0.037 0.627