This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATRO P A 3 3 NATAA M A 4 4 NATAA T A 5 5 NATAA L A 6 6 NATAA D A 7 7 NATAA L A 8 8 NATAA Q A 9 9 NATRO P A 10 10 NATAA G A 11 11 NATAA Q A 12 12 NATAA R A 13 13 NATAA L A 14 14 NATAA A A 15 15 NATAA R A 16 16 NATAA G A 17 17 NATAA V A 18 18 NATAA A A 19 19 NATAA R A 20 20 NATAA H A 21 21 NATAA L A 22 22 NATAA R A 23 23 NATAA A A 24 24 NATAA H A 25 25 NATAA G A 26 26 NATAA F A 27 27 NATAA V A 28 28 NATAA S A 29 29 NATAA V A 30 30 NATAA E A 31 31 NATAA E A 32 32 NATAA F A 33 33 NATAA V A 34 34 NATRO P A 35 35 NATAA A A 36 36 NATAA R A 37 37 NATAA G A 38 38 NATAA L A 39 39 NATAA R A 40 40 NATAA V A 41 41 NATAA D A 42 42 NATAA V A 43 43 NATAA M A 44 44 NATAA G A 45 45 NATAA L A 46 46 NATAA G A 47 47 NATRO P A 48 48 NATAA K A 49 49 NATAA G A 50 50 NATAA E A 51 51 NATAA I A 52 52 NATAA W A 53 53 NATAA V A 54 54 NATAA I A 55 55 NATAA E A 56 56 NATRO C A 57 57 NATAA K A 58 58 NATAA S A 59 59 NATAA S A 60 60 NATAA R A 61 61 NATAA A A 62 62 NATAA D A 63 63 NATAA F A 64 64 NATAA Q A 65 65 NATAA A A 66 66 NATAA D A 67 67 NATAA A A 68 68 NATAA K A 69 69 NATAA W A 70 70 NATAA Q A 71 71 NATAA G A 72 72 NATAA Y A 73 73 NATAA L A 74 74 NATAA E A 75 75 NATAA W A 76 76 NATRO C A 77 77 NATAA D A 78 78 NATAA R A 79 79 NATAA Y A 80 80 NATAA F A 81 81 NATAA W A 82 82 NATAA A A 83 83 NATAA V A 84 84 NATAA D A 85 85 NATAA M A 86 86 NATAA E A 87 87 NATAA F A 88 88 NATRO P A 89 89 NATAA A A 90 90 NATAA E A 91 91 NATAA L A 92 92 NATAA L A 93 93 NATRO P A 94 94 NATAA A A 95 95 NATAA E A 96 96 NATAA S A 97 97 NATAA G A 98 98 NATAA L A 99 99 NATAA L A 100 100 NATAA I A 101 101 NATAA A A 102 102 NATAA D A 103 103 NATAA A A 104 104 NATAA Y A 105 105 NATAA D A 106 106 NATAA A A 107 107 NATAA E A 108 108 NATAA I A 109 109 NATAA V A 110 110 NATAA R A 111 111 NATAA M A 112 112 NATAA A A 113 113 NATRO P A 114 114 NATAA E A 115 115 NATAA Q A 116 116 NATAA K A 117 117 NATAA L A 118 118 NATAA A A 119 119 NATRO P A 120 120 NATAA A A 121 121 NATAA R A 122 122 NATAA R A 123 123 NATAA K A 124 124 NATAA V A 125 125 NATAA L A 126 126 NATAA I A 127 127 NATAA Q A 128 128 NATAA K A 129 129 NATAA F A 130 130 NATAA A A 131 131 NATAA T A 132 132 NATAA H A 133 133 NATAA A A 134 134 NATAA A A 135 135 NATAA R A 136 136 NATAA R A 137 137 NATAA L A 138 138 NATAA Q A 139 139 NATAA A A 140 140 NATAA L A 141 141 NATAA R A 142 142 NATAA D A 143 143 NATRO P A 144 144 NATAA E A 145 145 NATAA G A 146 146 NATAA H A 147 147 NATAA G A 148 148 NATAA I A 149 149 NATAA F A 150 150 NATAA E