This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA S A 2 2 NATAA N A 3 3 NATAA A A 4 4 NATAA S A 5 5 NATAA Y A 6 6 NATAA R A 7 7 NATAA S A 8 8 NATAA T A 9 9 NATAA Q A 10 10 NATAA Q A 11 11 NATAA I A 12 12 NATAA T A 13 13 NATAA D A 14 14 NATAA F A 15 15 NATAA T A 16 16 NATAA K A 17 17 NATAA E A 18 18 NATAA I A 19 19 NATAA L A 20 20 NATAA V A 21 21 NATAA N A 22 22 NATAA G A 23 23 NATAA E A 24 24 NATAA A A 25 25 NATAA V A 26 26 NATAA T A 27 27 NATAA A A 28 28 NATAA F A 29 29 NATAA D A 30 30 NATAA R A 31 31 NATAA Q A 32 32 NATAA G A 33 33 NATAA D A 34 34 NATAA L A 35 35 NATRO P A 36 36 NATAA N A 37 37 NATAA V A 38 38 NATAA V A 39 39 NATAA V A 40 40 NATAA T A 41 41 NATRO P A 42 42 NATAA N A 43 43 NATAA F A 44 44 NATAA E A 45 45 NATAA A A 46 46 NATAA G A 47 47 NATAA V A 48 48 NATAA D A 49 49 NATAA Q A 50 50 NATAA V A 51 51 NATAA V A 52 52 NATAA D A 53 53 NATAA Q A 54 54 NATAA L A 55 55 NATAA A A 56 56 NATAA M A 57 57 NATAA N A 58 58 NATAA D A 59 59 NATAA S A 60 60 NATAA E A 61 61 NATAA R A 62 62 NATAA D A 63 63 NATAA T A 64 64 NATAA T A 65 65 NATAA A A 66 66 NATAA I A 67 67 NATAA I A 68 68 NATAA G A 69 69 NATAA K A 70 70 NATAA S A 71 71 NATAA L A 72 72 NATAA A A 73 73 NATAA E A 74 74 NATRO C A 75 75 NATAA E A 76 76 NATAA A A 77 77 NATAA L A 78 78 NATAA T A 79 79 NATAA K A 80 80 NATAA A A 81 81 NATAA L A 82 82 NATAA K A 83 83 NATAA A A 84 84 NATAA R A 85 85 NATAA G A 86 86 NATAA E A 87 87 NATAA Q A 88 88 NATAA V A 89 89 NATAA T A 90 90 NATAA L A 91 91 NATAA I A 92 92 NATAA Q A 93 93 NATAA T A 94 94 NATAA E A 95 95 NATAA N A 96 96 NATAA Q A 97 97 NATAA R A 98 98 NATAA L A 99 99 NATAA A A 100 100 NATRO P A 101 101 NATAA G A 102 102 NATAA V A 103 103 NATAA I A 104 104 NATAA V A 105 105 NATAA V A 106 106 NATRO P A 107 107 NATAA S A 108 108 NATAA F A 109 109 NATAA L A 110 110 NATAA A A 111 111 NATAA K A 112 112 NATAA G A 113 113 NATAA L A 114 114 NATAA E A 115 115 NATAA F A 116 116 NATAA D A 117 117 NATAA A A 118 118 NATAA V A 119 119 NATAA I A 120 120 NATAA V A 121 121 NATAA W A 122 122 NATAA N A 123 123 NATAA A A 124 124 NATAA N A 125 125 NATAA Q A 126 126 NATAA E A 127 127 NATAA N A 128 128 NATAA Y A 129 129 NATAA Q A 130 130 NATAA R A 131 131 NATAA E A 132 132 NATAA D A 133 133 NATAA E A 134 134 NATAA R A 135 135 NATAA Q A 136 136 NATAA L A 137 137 NATAA L A 138 138 NATAA Y A 139 139 NATAA T A 140 140 NATAA I A 141 141 NATRO C A 142 142 NATAA S A 143 143 NATAA R A 144 144 NATAA A A 145 145 NATAA M A 146 146 NATAA H A 147 147 NATAA E A 148 148 NATAA L A 149 149 NATAA T A 150 150 NATAA L A 151 151 NATAA V A 152 152 NATAA A A 153 153 NATAA V A 154 154 NATAA G A 155 155 NATAA S A 156 156 NATAA L A 157 157 NATAA S A 158 158 NATRO P A 159 159 NATAA L A 160 160 NATAA L A 161 161 NATAA A A 162 162 NATAA R A 163 163 NATAA V A 164 164 NATAA N A 165 165 NATAA H A 166 166 NATAA A A 167 167 NATAA L A 168 168 NATAA Y A 169 169 NATAA T A 170 170 NATAA L A 171 171 NATAA N A 172 172 NATAA E A 173 173 NATAA A A 174 174 NATAA K