# TARGET T0492 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0492.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 61.5359 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.051 0.011 0.059 0.017 0.026 0.047 0.010 0.780 2 F 0.086 0.014 0.260 0.065 0.078 0.097 0.013 0.387 3 S 0.019 0.007 0.040 0.025 0.045 0.093 0.004 0.767 4 L 0.022 0.014 0.051 0.022 0.130 0.052 0.002 0.708 5 R 0.022 0.016 0.018 0.020 0.049 0.504 0.005 0.366 6 D 0.196 0.028 0.005 0.008 0.014 0.403 0.018 0.327 7 A 0.524 0.171 0.020 0.019 0.024 0.032 0.016 0.194 8 K 0.119 0.139 0.030 0.052 0.050 0.175 0.037 0.397 9 C 0.041 0.046 0.040 0.036 0.043 0.043 0.026 0.726 10 G 0.134 0.082 0.048 0.101 0.136 0.059 0.088 0.353 11 Q 0.463 0.005 0.066 0.079 0.106 0.106 0.026 0.149 12 T 0.005 0.001 0.038 0.045 0.036 0.030 0.002 0.843 13 V 0.014 0.001 0.106 0.315 0.436 0.034 0.002 0.092 14 K 0.007 0.001 0.153 0.387 0.333 0.015 0.001 0.103 15 V 0.002 0.001 0.092 0.212 0.468 0.016 0.001 0.209 16 V 0.001 0.001 0.260 0.368 0.353 0.004 0.001 0.014 17 K 0.001 0.001 0.071 0.237 0.349 0.021 0.001 0.319 18 L 0.004 0.001 0.268 0.125 0.426 0.024 0.002 0.151 19 H 0.006 0.002 0.071 0.106 0.160 0.114 0.002 0.539 20 G 0.015 0.003 0.036 0.028 0.073 0.085 0.005 0.755 21 T 0.025 0.007 0.023 0.012 0.027 0.147 0.005 0.755 22 G 0.060 0.015 0.012 0.009 0.011 0.089 0.011 0.793 23 A 0.120 0.025 0.011 0.007 0.012 0.238 0.007 0.579 24 L 0.097 0.165 0.021 0.020 0.037 0.214 0.009 0.438 25 K 0.065 0.447 0.023 0.021 0.047 0.095 0.008 0.294 26 R 0.016 0.698 0.014 0.012 0.020 0.046 0.004 0.191 27 R 0.020 0.846 0.007 0.009 0.015 0.013 0.004 0.086 28 I 0.017 0.905 0.006 0.007 0.020 0.005 0.004 0.036 29 M 0.013 0.923 0.003 0.004 0.014 0.007 0.006 0.031 30 D 0.045 0.904 0.003 0.003 0.003 0.003 0.013 0.026 31 M 0.211 0.629 0.014 0.012 0.006 0.003 0.097 0.029 32 G 0.853 0.010 0.004 0.004 0.002 0.002 0.091 0.035 33 I 0.014 0.013 0.838 0.023 0.014 0.010 0.010 0.078 34 T 0.016 0.025 0.088 0.121 0.186 0.146 0.012 0.406 35 R 0.004 0.002 0.033 0.013 0.016 0.021 0.003 0.907 36 G 0.021 0.012 0.128 0.095 0.101 0.225 0.024 0.395 37 C 0.493 0.002 0.118 0.060 0.055 0.127 0.016 0.131 38 E 0.012 0.001 0.064 0.163 0.116 0.058 0.003 0.584 39 I 0.006 0.001 0.040 0.320 0.502 0.023 0.001 0.108 40 Y 0.003 0.001 0.094 0.464 0.402 0.006 0.001 0.031 41 I 0.001 0.001 0.044 0.264 0.499 0.012 0.001 0.180 42 R 0.001 0.001 0.226 0.304 0.445 0.005 0.001 0.018 43 K 0.002 0.002 0.066 0.353 0.460 0.021 0.001 0.097 44 V 0.006 0.003 0.098 0.098 0.501 0.024 0.004 0.266 45 A 0.019 0.003 0.094 0.176 0.248 0.092 0.004 0.363 46 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 47 L 0.024 0.002 0.019 0.046 0.138 0.131 0.009 0.631 48 G 0.212 0.006 0.019 0.025 0.028 0.068 0.050 0.591 49 D 0.288 0.003 0.030 0.043 0.041 0.130 0.013 0.452 50 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.997 51 I 0.021 0.002 0.080 0.158 0.343 0.209 0.003 0.185 52 Q 0.110 0.004 0.163 0.204 0.312 0.064 0.004 0.139 53 I 0.011 0.008 0.118 0.413 0.347 0.013 0.002 0.088 54 N 0.009 0.004 0.156 0.248 0.391 0.022 0.002 0.168 55 V 0.006 0.005 0.118 0.273 0.375 0.031 0.003 0.188 56 R 0.003 0.003 0.045 0.119 0.184 0.048 0.003 0.596 57 G 0.019 0.003 0.033 0.067 0.133 0.120 0.016 0.609 58 Y 0.274 0.004 0.072 0.055 0.086 0.185 0.012 0.312 59 E 0.041 0.007 0.130 0.199 0.193 0.118 0.004 0.308 60 L 0.019 0.023 0.095 0.203 0.382 0.046 0.003 0.230 61 S 0.020 0.029 0.208 0.205 0.371 0.045 0.005 0.115 62 L 0.038 0.064 0.079 0.197 0.250 0.077 0.006 0.289 63 R 0.057 0.102 0.073 0.117 0.300 0.119 0.014 0.218 64 K 0.061 0.105 0.072 0.038 0.152 0.105 0.017 0.451 65 S 0.030 0.111 0.011 0.013 0.031 0.141 0.013 0.649 66 A 0.152 0.147 0.005 0.007 0.019 0.160 0.020 0.490 67 A 0.131 0.598 0.008 0.009 0.016 0.059 0.018 0.160 68 E 0.057 0.768 0.011 0.015 0.015 0.025 0.022 0.088 69 M 0.165 0.485 0.029 0.019 0.023 0.023 0.044 0.213 70 I 0.138 0.426 0.092 0.098 0.071 0.023 0.025 0.126 71 E 0.027 0.155 0.125 0.192 0.181 0.030 0.011 0.279 72 V 0.012 0.060 0.133 0.168 0.200 0.023 0.008 0.395 73 E 0.020 0.040 0.192 0.198 0.207 0.051 0.007 0.286