This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 323 NATAA G A 2 324 NATAA R A 3 325 NATAA R A 4 326 NATAA A A 5 327 NATAA V A 6 328 NATAA S A 7 329 NATAA K A 8 330 NATRO P A 9 331 NATAA A A 10 332 NATAA D A 11 333 NATAA A A 12 334 NATAA L A 13 335 NATAA R A 14 336 NATAA V A 15 337 NATAA G A 16 338 NATAA F A 17 339 NATAA Y A 18 340 NATAA R A 19 341 NATAA A A 20 342 NATAA Q A 21 343 NATAA E A 22 344 NATAA T A 23 345 NATAA A A 24 346 NATAA L A 25 347 NATAA A A 26 348 NATAA L A 27 349 NATAA L A 28 350 NATAA R A 29 351 NATAA L A 30 352 NATAA D A 31 353 NATAA G A 32 354 NATAA A A 33 355 NATAA Q A 34 356 NATAA G A 35 357 NATAA W A 36 358 NATRO P A 37 359 NATAA E A 38 360 NATAA F A 39 361 NATAA L A 40 362 NATAA R A 41 363 NATAA R A 42 364 NATAA A A 43 365 NATAA L A 44 366 NATAA L A 45 367 NATAA R A 46 368 NATAA A A 47 369 NATAA F A 48 370 NATAA G A 49 371 NATAA A A 50 372 NATAA S A 51 373 NATAA G A 52 374 NATAA A A 53 375 NATAA S A 54 376 NATAA L A 55 377 NATAA R A 56 378 NATAA L A 57 379 NATAA H A 58 380 NATAA T A 59 381 NATAA L A 60 382 NATAA H A 61 383 NATAA A A 62 384 NATAA H A 63 385 NATRO P A 64 386 NATAA S A 65 387 NATAA Q A 66 388 NATAA G A 67 389 NATAA L A 68 390 NATAA A A 69 391 NATAA F A 70 392 NATAA R A 71 393 NATAA E A 72 394 NATAA A A 73 395 NATAA L A 74 396 NATAA R A 75 397 NATAA K A 76 398 NATAA A A 77 399 NATAA K A 78 400 NATAA E A 79 401 NATAA E A 80 402 NATAA G A 81 403 NATAA V A 82 404 NATAA Q A 83 405 NATAA A A 84 406 NATAA V A 85 407 NATAA L A 86 408 NATAA V A 87 409 NATAA L A 88 410 NATAA T A 89 411 NATRO P A 90 412 NATRO P A 91 413 NATAA M A 92 414 NATAA A A 93 415 NATAA W A 94 416 NATAA E A 95 417 NATAA D A 96 418 NATAA R A 97 419 NATAA N A 98 420 NATAA R A 99 421 NATAA L A 100 422 NATAA K A 101 423 NATAA A A 102 424 NATAA L A 103 425 NATAA L A 104 426 NATAA L A 105 427 NATAA R A 106 428 NATAA E A 107 429 NATAA G A 108 430 NATAA L A 109 431 NATRO P A 110 432 NATAA S A 111 433 NATAA Q A 112 434 NATAA I A 113 435 NATAA L A 114 436 NATAA N A 115 437 NATAA V A 116 438 NATRO P A 117 439 NATAA L A 118 440 NATAA R A 119 441 NATAA E A 120 442 NATAA E A 121 443 NATAA E A 122 444 NATAA R A 123 445 NATAA H A 124 446 NATAA R A 125 447 NATAA W A 126 448 NATAA E A 127 449 NATAA N A 128 450 NATAA A A 129 451 NATAA L A 130 452 NATAA L A 131 453 NATAA G A 132 454 NATAA L A 133 455 NATAA L A 134 456 NATAA A A 135 457 NATAA K A 136 458 NATAA A A 137 459 NATAA G A 138 460 NATAA L A 139 461 NATAA Q A 140 462 NATAA V A 141 463 NATAA V