# TARGET T0487 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0487.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 486 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 G 0.362 0.116 0.032 0.103 0.100 0.078 0.091 0.050 0.034 0.021 0.011 2 L 0.099 0.065 0.032 0.074 0.069 0.081 0.127 0.111 0.141 0.116 0.086 3 G 0.230 0.318 0.052 0.125 0.092 0.056 0.057 0.030 0.021 0.012 0.007 4 T 0.243 0.193 0.039 0.135 0.126 0.071 0.083 0.051 0.029 0.018 0.012 5 P 0.427 0.145 0.032 0.106 0.092 0.072 0.049 0.032 0.023 0.015 0.008 6 E 0.281 0.305 0.052 0.183 0.097 0.040 0.025 0.008 0.005 0.002 0.001 7 A 0.073 0.059 0.027 0.121 0.105 0.105 0.145 0.126 0.110 0.074 0.054 8 V 0.018 0.028 0.022 0.060 0.090 0.127 0.178 0.160 0.141 0.101 0.075 9 R 0.040 0.188 0.138 0.345 0.175 0.055 0.033 0.012 0.007 0.005 0.002 10 A 0.009 0.007 0.010 0.019 0.025 0.050 0.115 0.147 0.213 0.199 0.206 11 Q 0.176 0.221 0.072 0.316 0.155 0.028 0.016 0.006 0.005 0.003 0.001 12 A 0.024 0.028 0.026 0.076 0.050 0.072 0.115 0.100 0.198 0.171 0.142 13 Y 0.025 0.046 0.039 0.146 0.168 0.148 0.165 0.083 0.089 0.056 0.035 14 R 0.040 0.122 0.081 0.204 0.154 0.109 0.138 0.058 0.049 0.029 0.017 15 L 0.012 0.012 0.016 0.031 0.038 0.066 0.125 0.162 0.195 0.185 0.159 16 S 0.220 0.341 0.105 0.184 0.077 0.029 0.022 0.009 0.007 0.005 0.002 17 I 0.052 0.049 0.023 0.113 0.107 0.126 0.156 0.143 0.104 0.072 0.056 18 P 0.349 0.157 0.058 0.137 0.098 0.063 0.053 0.029 0.025 0.020 0.011 19 K 0.088 0.133 0.053 0.271 0.210 0.108 0.075 0.031 0.018 0.008 0.004 20 L 0.010 0.009 0.013 0.019 0.019 0.034 0.084 0.114 0.226 0.230 0.243 21 M 0.033 0.081 0.053 0.202 0.213 0.116 0.133 0.071 0.050 0.031 0.017 22 G 0.025 0.056 0.065 0.086 0.068 0.075 0.127 0.118 0.152 0.131 0.098 23 R 0.107 0.094 0.059 0.200 0.183 0.113 0.111 0.050 0.040 0.027 0.016 24 R 0.273 0.176 0.057 0.145 0.097 0.069 0.079 0.044 0.032 0.018 0.009 25 A 0.261 0.150 0.045 0.156 0.120 0.080 0.076 0.045 0.033 0.022 0.012 26 V 0.084 0.072 0.033 0.096 0.095 0.117 0.173 0.123 0.098 0.067 0.041 27 S 0.185 0.165 0.072 0.153 0.115 0.083 0.094 0.057 0.039 0.025 0.013 28 K 0.317 0.210 0.077 0.122 0.083 0.059 0.056 0.032 0.022 0.015 0.008 29 P 0.301 0.166 0.048 0.126 0.098 0.080 0.079 0.043 0.029 0.019 0.012 30 A 0.225 0.123 0.040 0.127 0.121 0.110 0.101 0.063 0.044 0.028 0.017 31 D 0.280 0.189 0.088 0.163 0.107 0.067 0.053 0.025 0.016 0.009 0.004 32 A 0.081 0.086 0.066 0.170 0.160 0.121 0.131 0.078 0.055 0.033 0.020 33 L 0.017 0.018 0.022 0.045 0.054 0.096 0.172 0.167 0.175 0.135 0.098 34 R 0.057 0.121 0.124 0.275 0.183 0.096 0.074 0.030 0.020 0.013 0.006 35 V 0.012 0.015 0.028 0.045 0.048 0.082 0.148 0.170 0.186 0.146 0.119 36 G 0.165 0.129 0.102 0.221 0.138 0.079 0.071 0.033 0.030 0.022 0.010 37 F 0.028 0.034 0.038 0.099 0.086 0.113 0.169 0.131 0.136 0.102 0.063 38 Y 0.030 0.035 0.042 0.097 0.091 0.119 0.162 0.117 0.137 0.102 0.067 39 R 0.065 0.105 0.092 0.187 0.161 0.112 0.124 0.060 0.049 0.031 0.015 40 A 0.056 0.069 0.059 0.099 0.086 0.104 0.156 0.113 0.107 0.083 0.068 41 Q 0.107 0.076 0.049 0.129 0.119 0.114 0.149 0.089 0.073 0.053 0.042 42 E 0.272 0.206 0.078 0.173 0.098 0.055 0.052 0.027 0.020 0.012 0.008 43 T 0.107 0.088 0.045 0.163 0.167 0.138 0.124 0.065 0.053 0.031 0.019 44 A 0.045 0.045 0.031 0.103 0.123 0.156 0.175 0.110 0.103 0.065 0.045 45 L 0.004 0.013 0.018 0.058 0.085 0.140 0.194 0.167 0.151 0.110 0.061 46 A 0.001 0.005 0.011 0.022 0.032 0.045 0.127 0.267 0.207 0.165 0.118 47 L 0.001 0.002 0.007 0.009 0.009 0.014 0.053 0.120 0.212 0.307 0.266 48 L 0.001 0.002 0.007 0.008 0.008 0.019 0.062 0.111 0.222 0.268 0.293 49 R 0.005 0.011 0.028 0.068 0.074 0.122 0.203 0.160 0.141 0.107 0.080 50 L 0.006 0.008 0.011 0.030 0.040 0.081 0.166 0.185 0.193 0.157 0.121 51 D 0.142 0.171 0.071 0.192 0.152 0.075 0.076 0.047 0.034 0.027 0.012 52 G 0.252 0.154 0.043 0.139 0.112 0.084 0.090 0.057 0.035 0.024 0.011 53 A 0.167 0.146 0.050 0.129 0.110 0.094 0.093 0.060 0.062 0.056 0.034 54 Q 0.189 0.131 0.051 0.151 0.122 0.111 0.111 0.054 0.041 0.025 0.015 55 G 0.398 0.184 0.077 0.111 0.067 0.045 0.048 0.029 0.020 0.015 0.007 56 W 0.027 0.074 0.033 0.088 0.095 0.114 0.177 0.141 0.120 0.084 0.046 57 P 0.016 0.019 0.018 0.049 0.068 0.141 0.226 0.175 0.135 0.095 0.059 58 E 0.483 0.100 0.197 0.133 0.038 0.021 0.014 0.006 0.004 0.003 0.001 59 F 0.016 0.031 0.059 0.203 0.224 0.192 0.163 0.071 0.026 0.010 0.004 60 L 0.001 0.002 0.005 0.004 0.004 0.008 0.046 0.071 0.231 0.340 0.289 61 R 0.001 0.003 0.023 0.051 0.098 0.246 0.362 0.113 0.064 0.026 0.013 62 R 0.030 0.026 0.773 0.113 0.028 0.015 0.008 0.003 0.002 0.002 0.001 63 A 0.002 0.005 0.027 0.067 0.113 0.253 0.371 0.099 0.041 0.016 0.006 64 L 0.001 0.001 0.004 0.002 0.002 0.003 0.025 0.068 0.208 0.312 0.375 65 L 0.001 0.004 0.069 0.089 0.173 0.220 0.253 0.084 0.055 0.037 0.014 66 R 0.004 0.014 0.676 0.141 0.105 0.029 0.018 0.007 0.003 0.002 0.001 67 A 0.007 0.012 0.044 0.048 0.064 0.171 0.372 0.131 0.084 0.046 0.022 68 F 0.012 0.007 0.013 0.010 0.009 0.020 0.089 0.154 0.219 0.243 0.224 69 G 0.098 0.112 0.179 0.207 0.136 0.105 0.081 0.042 0.021 0.013 0.006 70 A 0.186 0.160 0.205 0.179 0.099 0.067 0.044 0.023 0.018 0.012 0.006 71 S 0.157 0.099 0.038 0.091 0.092 0.129 0.167 0.086 0.067 0.049 0.026 72 G 0.317 0.220 0.036 0.137 0.092 0.067 0.060 0.028 0.023 0.012 0.008 73 A 0.025 0.022 0.022 0.028 0.034 0.050 0.101 0.129 0.192 0.193 0.204 74 S 0.102 0.228 0.078 0.243 0.183 0.064 0.054 0.022 0.014 0.008 0.005 75 L 0.012 0.011 0.009 0.021 0.020 0.039 0.087 0.117 0.206 0.216 0.264 76 R 0.230 0.264 0.076 0.236 0.117 0.036 0.020 0.009 0.006 0.005 0.002 77 L 0.102 0.081 0.037 0.127 0.108 0.116 0.144 0.102 0.084 0.058 0.042 78 H 0.164 0.107 0.050 0.155 0.136 0.104 0.095 0.060 0.056 0.046 0.027 79 T 0.101 0.125 0.069 0.196 0.154 0.121 0.119 0.053 0.035 0.018 0.009 80 L 0.036 0.039 0.042 0.074 0.067 0.079 0.146 0.137 0.159 0.133 0.088 81 H 0.054 0.053 0.042 0.127 0.135 0.133 0.178 0.106 0.085 0.056 0.031 82 A 0.183 0.191 0.108 0.183 0.106 0.066 0.067 0.037 0.031 0.019 0.010 83 H 0.062 0.061 0.032 0.085 0.096 0.126 0.176 0.120 0.106 0.081 0.056 84 P 0.271 0.168 0.053 0.146 0.121 0.070 0.077 0.043 0.026 0.017 0.010 85 S 0.431 0.207 0.062 0.102 0.065 0.036 0.037 0.024 0.017 0.012 0.007 86 Q 0.193 0.315 0.061 0.157 0.115 0.062 0.052 0.023 0.013 0.007 0.003 87 G 0.362 0.119 0.038 0.106 0.107 0.075 0.090 0.048 0.031 0.017 0.009 88 L 0.241 0.110 0.083 0.152 0.124 0.124 0.091 0.036 0.021 0.013 0.006 89 A 0.037 0.092 0.104 0.262 0.170 0.135 0.119 0.042 0.022 0.012 0.004 90 F 0.001 0.003 0.005 0.006 0.010 0.019 0.099 0.214 0.258 0.214 0.170 91 R 0.007 0.015 0.059 0.127 0.166 0.285 0.209 0.070 0.033 0.024 0.007 92 E 0.100 0.041 0.637 0.163 0.030 0.016 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 93 A 0.001 0.003 0.012 0.028 0.040 0.118 0.296 0.247 0.139 0.074 0.043 94 L 0.001 0.001 0.006 0.004 0.006 0.011 0.062 0.119 0.232 0.310 0.248 95 R 0.006 0.008 0.402 0.208 0.190 0.113 0.052 0.011 0.004 0.004 0.001 96 K 0.007 0.018 0.575 0.204 0.126 0.045 0.020 0.003 0.001 0.001 0.001 97 A 0.001 0.002 0.003 0.003 0.004 0.015 0.089 0.181 0.248 0.272 0.183 98 K 0.021 0.049 0.055 0.092 0.106 0.172 0.275 0.114 0.058 0.040 0.017 99 E 0.263 0.140 0.474 0.082 0.021 0.008 0.005 0.003 0.002 0.001 0.001 100 E 0.292 0.164 0.087 0.179 0.100 0.099 0.059 0.012 0.005 0.002 0.001 101 G 0.587 0.158 0.022 0.081 0.060 0.028 0.030 0.014 0.011 0.006 0.004 102 V 0.002 0.004 0.006 0.017 0.032 0.085 0.133 0.144 0.194 0.168 0.212 103 Q 0.020 0.105 0.163 0.275 0.212 0.128 0.067 0.015 0.009 0.004 0.002 104 A 0.001 0.001 0.003 0.003 0.007 0.014 0.065 0.191 0.248 0.237 0.231 105 V 0.001 0.001 0.004 0.006 0.011 0.021 0.075 0.158 0.219 0.279 0.225 106 L 0.001 0.001 0.002 0.002 0.003 0.006 0.027 0.091 0.176 0.319 0.374 107 V 0.001 0.002 0.006 0.006 0.009 0.017 0.053 0.121 0.211 0.292 0.282 108 L 0.002 0.002 0.007 0.010 0.014 0.027 0.088 0.135 0.213 0.263 0.239 109 T 0.004 0.009 0.010 0.029 0.043 0.076 0.181 0.204 0.185 0.150 0.110 110 P 0.024 0.046 0.026 0.103 0.147 0.150 0.188 0.144 0.083 0.059 0.029 111 P 0.314 0.154 0.057 0.154 0.121 0.064 0.057 0.038 0.020 0.015 0.007 112 M 0.253 0.162 0.053 0.145 0.126 0.082 0.069 0.044 0.031 0.024 0.012 113 A 0.195 0.218 0.057 0.132 0.102 0.073 0.075 0.045 0.044 0.039 0.022 114 W 0.087 0.058 0.035 0.090 0.107 0.140 0.182 0.119 0.086 0.059 0.038 115 E 0.425 0.200 0.126 0.112 0.053 0.027 0.023 0.015 0.010 0.007 0.003 116 D 0.105 0.163 0.062 0.147 0.124 0.126 0.134 0.059 0.044 0.025 0.011 117 R 0.039 0.028 0.018 0.059 0.084 0.129 0.208 0.158 0.137 0.086 0.055 118 N 0.185 0.105 0.169 0.208 0.124 0.086 0.065 0.025 0.017 0.012 0.004 119 R 0.015 0.039 0.106 0.250 0.226 0.151 0.131 0.054 0.020 0.007 0.003 120 L 0.001 0.002 0.006 0.006 0.007 0.015 0.073 0.091 0.237 0.289 0.272 121 K 0.002 0.004 0.026 0.063 0.090 0.165 0.290 0.132 0.126 0.061 0.041 122 A 0.004 0.016 0.315 0.217 0.183 0.104 0.080 0.036 0.026 0.014 0.005 123 L 0.003 0.007 0.041 0.051 0.088 0.162 0.302 0.162 0.101 0.053 0.030 124 L 0.007 0.009 0.024 0.018 0.014 0.022 0.086 0.156 0.203 0.245 0.215 125 L 0.009 0.012 0.039 0.069 0.068 0.130 0.211 0.175 0.129 0.101 0.058 126 R 0.145 0.190 0.268 0.204 0.100 0.039 0.025 0.013 0.008 0.005 0.002 127 E 0.185 0.092 0.049 0.106 0.115 0.125 0.156 0.075 0.050 0.033 0.014 128 G 0.414 0.148 0.032 0.087 0.065 0.069 0.073 0.035 0.036 0.025 0.015 129 L 0.021 0.021 0.017 0.032 0.043 0.069 0.136 0.152 0.198 0.172 0.140 130 P 0.026 0.041 0.044 0.068 0.088 0.104 0.170 0.147 0.135 0.109 0.068 131 S 0.009 0.017 0.025 0.052 0.071 0.088 0.159 0.147 0.169 0.160 0.103 132 Q 0.006 0.010 0.018 0.040 0.058 0.070 0.140 0.203 0.185 0.145 0.126 133 I 0.004 0.008 0.021 0.028 0.027 0.038 0.095 0.120 0.188 0.271 0.200 134 L 0.003 0.007 0.018 0.027 0.027 0.057 0.134 0.168 0.201 0.181 0.177 135 N 0.013 0.039 0.060 0.162 0.169 0.159 0.183 0.095 0.060 0.040 0.020 136 V 0.100 0.063 0.067 0.148 0.162 0.126 0.158 0.077 0.052 0.034 0.013 137 P 0.433 0.209 0.069 0.142 0.077 0.030 0.021 0.009 0.006 0.003 0.001 138 L 0.032 0.032 0.016 0.051 0.041 0.070 0.150 0.124 0.188 0.170 0.125 139 R 0.058 0.121 0.047 0.152 0.157 0.131 0.142 0.075 0.059 0.035 0.025 140 E 0.290 0.451 0.105 0.092 0.038 0.009 0.007 0.003 0.002 0.001 0.001 141 E 0.352 0.185 0.047 0.117 0.097 0.074 0.065 0.033 0.016 0.008 0.005 142 E 0.515 0.225 0.039 0.091 0.050 0.027 0.026 0.013 0.008 0.005 0.002 143 R 0.153 0.105 0.058 0.235 0.183 0.127 0.086 0.030 0.014 0.005 0.003 144 H 0.104 0.074 0.102 0.131 0.117 0.126 0.146 0.081 0.060 0.040 0.021 145 R 0.016 0.057 0.057 0.185 0.196 0.179 0.169 0.067 0.044 0.021 0.009 146 W 0.003 0.004 0.012 0.013 0.018 0.031 0.085 0.164 0.231 0.227 0.211 147 E 0.016 0.040 0.107 0.196 0.196 0.151 0.142 0.056 0.045 0.038 0.014 148 N 0.011 0.036 0.094 0.182 0.183 0.146 0.161 0.093 0.053 0.027 0.014 149 A 0.001 0.002 0.006 0.009 0.011 0.027 0.091 0.121 0.227 0.268 0.237 150 L 0.002 0.004 0.022 0.029 0.032 0.058 0.155 0.129 0.243 0.175 0.151 151 L 0.001 0.004 0.029 0.028 0.034 0.116 0.174 0.180 0.199 0.133 0.103 152 G 0.002 0.007 0.051 0.100 0.147 0.196 0.237 0.108 0.078 0.052 0.023 153 L 0.001 0.001 0.004 0.003 0.005 0.007 0.037 0.200 0.251 0.256 0.237 154 L 0.004 0.011 0.042 0.050 0.046 0.070 0.145 0.128 0.189 0.210 0.106 155 A 0.001 0.002 0.018 0.012 0.009 0.032 0.081 0.108 0.230 0.257 0.251 156 K 0.004 0.010 0.029 0.057 0.075 0.107 0.225 0.196 0.154 0.084 0.058 157 A 0.009 0.013 0.025 0.028 0.031 0.054 0.135 0.147 0.211 0.226 0.120 158 G 0.055 0.069 0.058 0.128 0.105 0.124 0.157 0.084 0.091 0.074 0.055 159 L 0.031 0.021 0.022 0.051 0.061 0.093 0.161 0.168 0.169 0.129 0.093 160 Q 0.023 0.050 0.041 0.145 0.143 0.141 0.157 0.111 0.090 0.065 0.034 161 V 0.011 0.017 0.022 0.052 0.044 0.059 0.112 0.124 0.182 0.183 0.196 162 V 0.006 0.009 0.012 0.026 0.029 0.058 0.129 0.158 0.205 0.181 0.185 163 A 0.018 0.047 0.063 0.175 0.142 0.126 0.144 0.095 0.083 0.065 0.040 164 L 0.002 0.003 0.005 0.011 0.010 0.025 0.077 0.138 0.214 0.242 0.272 165 S 0.064 0.096 0.053 0.201 0.168 0.110 0.128 0.068 0.056 0.037 0.020 166 G 0.313 0.189 0.056 0.108 0.075 0.060 0.070 0.042 0.039 0.029 0.019 167 A 0.282 0.139 0.037 0.137 0.113 0.094 0.084 0.040 0.031 0.024 0.019 168 Y 0.155 0.102 0.028 0.116 0.095 0.086 0.129 0.093 0.084 0.059 0.054 169 P 0.155 0.214 0.047 0.178 0.161 0.080 0.074 0.040 0.026 0.014 0.012 170 A 0.201 0.149 0.056 0.163 0.144 0.104 0.088 0.044 0.027 0.014 0.009 171 E 0.044 0.048 0.033 0.130 0.154 0.189 0.181 0.090 0.068 0.037 0.027 172 L 0.002 0.004 0.005 0.013 0.021 0.038 0.114 0.217 0.244 0.186 0.156 173 A 0.002 0.005 0.009 0.012 0.020 0.030 0.105 0.188 0.208 0.216 0.206 174 V 0.001 0.001 0.005 0.004 0.007 0.011 0.047 0.121 0.235 0.314 0.255 175 G 0.003 0.004 0.009 0.012 0.018 0.031 0.093 0.126 0.212 0.220 0.270 176 F 0.001 0.001 0.003 0.006 0.010 0.015 0.057 0.107 0.225 0.296 0.279 177 D 0.009 0.014 0.010 0.038 0.062 0.077 0.142 0.184 0.191 0.141 0.133 178 A 0.007 0.009 0.009 0.027 0.041 0.056 0.132 0.161 0.207 0.190 0.161 179 G 0.022 0.033 0.022 0.062 0.079 0.101 0.170 0.153 0.141 0.123 0.093 180 G 0.038 0.035 0.025 0.094 0.115 0.128 0.165 0.146 0.103 0.083 0.069 181 R 0.172 0.159 0.048 0.157 0.133 0.099 0.077 0.055 0.041 0.035 0.023 182 E 0.390 0.210 0.050 0.130 0.092 0.041 0.033 0.019 0.014 0.011 0.008 183 S 0.454 0.177 0.031 0.100 0.082 0.044 0.043 0.025 0.019 0.014 0.011 184 F 0.126 0.063 0.030 0.091 0.084 0.111 0.142 0.096 0.103 0.080 0.073 185 R 0.198 0.197 0.088 0.208 0.122 0.071 0.060 0.023 0.017 0.010 0.006 186 F 0.069 0.046 0.031 0.091 0.101 0.127 0.179 0.142 0.099 0.062 0.053 187 G 0.069 0.073 0.042 0.138 0.154 0.161 0.151 0.075 0.063 0.045 0.028 188 G 0.013 0.021 0.025 0.064 0.086 0.123 0.199 0.165 0.141 0.093 0.069 189 A 0.003 0.005 0.011 0.014 0.024 0.042 0.116 0.175 0.233 0.208 0.170 190 A 0.001 0.001 0.004 0.005 0.009 0.017 0.070 0.144 0.241 0.253 0.254 191 C 0.001 0.002 0.005 0.007 0.011 0.017 0.068 0.146 0.242 0.258 0.243 192 A 0.001 0.001 0.003 0.004 0.006 0.010 0.045 0.098 0.219 0.280 0.333 193 V 0.002 0.003 0.005 0.009 0.013 0.022 0.073 0.114 0.221 0.222 0.317 194 G 0.005 0.006 0.009 0.025 0.036 0.061 0.146 0.176 0.209 0.163 0.164 195 G 0.017 0.020 0.019 0.063 0.093 0.120 0.200 0.186 0.131 0.085 0.066 196 D 0.053 0.065 0.036 0.123 0.138 0.135 0.160 0.122 0.078 0.057 0.033 197 G 0.198 0.109 0.040 0.141 0.129 0.104 0.092 0.068 0.051 0.042 0.027 198 G 0.183 0.112 0.043 0.134 0.136 0.103 0.091 0.063 0.055 0.050 0.031 199 H 0.080 0.095 0.045 0.151 0.137 0.118 0.120 0.083 0.075 0.056 0.039 200 L 0.018 0.015 0.016 0.030 0.031 0.046 0.104 0.130 0.202 0.208 0.200 201 L 0.020 0.024 0.031 0.071 0.072 0.103 0.170 0.133 0.152 0.122 0.104 202 W 0.023 0.036 0.053 0.100 0.086 0.120 0.142 0.111 0.135 0.120 0.072 203 T 0.028 0.039 0.043 0.090 0.090 0.140 0.182 0.131 0.115 0.082 0.059 204 L 0.039 0.042 0.037 0.100 0.091 0.105 0.140 0.141 0.122 0.107 0.075 205 P 0.072 0.049 0.045 0.079 0.081 0.099 0.143 0.125 0.123 0.113 0.072 206 E 0.099 0.157 0.085 0.274 0.207 0.074 0.050 0.024 0.016 0.009 0.004 207 A 0.009 0.006 0.009 0.014 0.012 0.026 0.065 0.087 0.225 0.271 0.276 208 Q 0.058 0.098 0.068 0.236 0.210 0.114 0.099 0.047 0.037 0.023 0.012 209 A 0.038 0.082 0.071 0.104 0.083 0.088 0.142 0.110 0.121 0.098 0.063 210 G 0.046 0.043 0.038 0.099 0.115 0.129 0.176 0.132 0.104 0.073 0.045 211 E 0.268 0.202 0.116 0.153 0.088 0.055 0.051 0.029 0.019 0.013 0.005 212 R 0.309 0.118 0.073 0.153 0.096 0.075 0.074 0.041 0.028 0.022 0.011 213 I 0.106 0.084 0.043 0.101 0.110 0.136 0.158 0.108 0.074 0.052 0.028 214 P 0.312 0.320 0.099 0.125 0.055 0.032 0.027 0.013 0.009 0.006 0.002 215 Q 0.135 0.077 0.056 0.125 0.149 0.170 0.148 0.076 0.036 0.019 0.009 216 E 0.565 0.124 0.098 0.084 0.045 0.029 0.025 0.012 0.009 0.007 0.003 217 V 0.036 0.066 0.059 0.185 0.179 0.169 0.162 0.072 0.041 0.023 0.009 218 V 0.004 0.008 0.017 0.015 0.018 0.030 0.101 0.149 0.239 0.236 0.183 219 W 0.012 0.026 0.064 0.153 0.222 0.238 0.180 0.053 0.028 0.017 0.005 220 D 0.155 0.105 0.449 0.183 0.055 0.026 0.015 0.006 0.003 0.002 0.001 221 L 0.002 0.004 0.012 0.031 0.042 0.101 0.252 0.191 0.168 0.125 0.072 222 L 0.001 0.002 0.006 0.005 0.006 0.013 0.072 0.123 0.257 0.264 0.252 223 E 0.003 0.011 0.207 0.208 0.255 0.176 0.097 0.024 0.010 0.007 0.002 224 E 0.025 0.028 0.567 0.189 0.102 0.047 0.030 0.007 0.003 0.002 0.001 225 T 0.001 0.002 0.008 0.011 0.016 0.051 0.219 0.222 0.222 0.167 0.081 226 L 0.001 0.001 0.007 0.004 0.006 0.016 0.097 0.129 0.256 0.262 0.222 227 W 0.004 0.009 0.398 0.192 0.183 0.104 0.067 0.023 0.011 0.008 0.002 228 A 0.004 0.017 0.335 0.202 0.188 0.128 0.093 0.020 0.009 0.003 0.001 229 F 0.001 0.001 0.005 0.003 0.004 0.012 0.085 0.129 0.248 0.279 0.234 230 R 0.006 0.009 0.048 0.045 0.053 0.107 0.281 0.161 0.140 0.094 0.056 231 R 0.010 0.017 0.601 0.156 0.125 0.039 0.027 0.014 0.006 0.004 0.001 232 K 0.017 0.057 0.147 0.133 0.138 0.190 0.224 0.054 0.025 0.012 0.004 233 A 0.038 0.024 0.022 0.034 0.037 0.101 0.256 0.188 0.149 0.101 0.050 234 G 0.784 0.087 0.053 0.035 0.012 0.010 0.009 0.004 0.003 0.002 0.001 235 R 0.163 0.148 0.161 0.205 0.127 0.087 0.058 0.023 0.014 0.008 0.005 236 L 0.053 0.070 0.032 0.065 0.065 0.074 0.153 0.130 0.148 0.103 0.107 237 P 0.025 0.047 0.028 0.081 0.140 0.198 0.220 0.114 0.077 0.040 0.031 238 S 0.169 0.193 0.329 0.169 0.071 0.031 0.017 0.008 0.007 0.005 0.002 239 R 0.007 0.012 0.018 0.079 0.138 0.265 0.267 0.118 0.059 0.024 0.012 240 V 0.001 0.002 0.004 0.009 0.013 0.019 0.065 0.154 0.228 0.279 0.226 241 L 0.001 0.003 0.010 0.019 0.033 0.048 0.139 0.292 0.213 0.143 0.101 242 L 0.001 0.003 0.032 0.014 0.013 0.019 0.059 0.122 0.222 0.297 0.218 243 L 0.001 0.003 0.011 0.016 0.018 0.043 0.141 0.142 0.222 0.236 0.167 244 R 0.009 0.014 0.025 0.061 0.062 0.120 0.214 0.186 0.154 0.093 0.062 245 D 0.037 0.065 0.034 0.142 0.146 0.155 0.171 0.109 0.073 0.047 0.021 246 G 0.279 0.093 0.040 0.090 0.091 0.086 0.114 0.075 0.061 0.047 0.024 247 R 0.305 0.228 0.046 0.153 0.123 0.051 0.041 0.023 0.015 0.010 0.004 248 V 0.032 0.036 0.018 0.047 0.032 0.065 0.111 0.092 0.185 0.204 0.178 249 P 0.102 0.206 0.046 0.164 0.207 0.102 0.083 0.040 0.026 0.015 0.010 250 Q 0.644 0.179 0.051 0.062 0.031 0.014 0.009 0.005 0.003 0.002 0.001 251 D 0.128 0.083 0.060 0.215 0.210 0.130 0.092 0.043 0.021 0.013 0.006 252 E 0.002 0.013 0.014 0.022 0.024 0.036 0.136 0.209 0.244 0.194 0.105 253 F 0.001 0.003 0.014 0.031 0.058 0.159 0.316 0.209 0.114 0.069 0.026 254 A 0.181 0.052 0.591 0.124 0.021 0.014 0.008 0.004 0.003 0.002 0.001 255 L 0.001 0.006 0.021 0.107 0.153 0.281 0.310 0.080 0.030 0.009 0.003 256 A 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.002 0.016 0.034 0.178 0.326 0.440 257 L 0.001 0.002 0.022 0.051 0.113 0.346 0.336 0.065 0.040 0.017 0.008 258 E 0.002 0.009 0.792 0.120 0.049 0.017 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 259 A 0.001 0.002 0.008 0.008 0.018 0.065 0.274 0.348 0.143 0.085 0.049 260 L 0.002 0.003 0.009 0.004 0.004 0.008 0.047 0.141 0.194 0.362 0.225 261 A 0.051 0.073 0.357 0.224 0.111 0.090 0.051 0.023 0.009 0.009 0.003 262 R 0.219 0.150 0.293 0.187 0.080 0.040 0.019 0.006 0.003 0.002 0.001 263 E 0.189 0.073 0.031 0.075 0.081 0.121 0.172 0.081 0.081 0.066 0.031 264 G 0.373 0.238 0.032 0.112 0.082 0.060 0.054 0.020 0.015 0.008 0.006 265 I 0.018 0.022 0.038 0.040 0.038 0.066 0.113 0.123 0.186 0.175 0.181 266 A 0.098 0.191 0.097 0.265 0.188 0.074 0.052 0.017 0.011 0.006 0.003 267 Y 0.008 0.009 0.007 0.015 0.018 0.035 0.081 0.126 0.211 0.243 0.245 268 D 0.033 0.077 0.039 0.186 0.195 0.180 0.133 0.055 0.048 0.033 0.020 269 L 0.004 0.008 0.012 0.022 0.021 0.032 0.073 0.125 0.197 0.248 0.257 270 V 0.005 0.007 0.013 0.026 0.038 0.055 0.126 0.192 0.197 0.193 0.148 271 S 0.011 0.036 0.065 0.138 0.133 0.095 0.135 0.126 0.111 0.093 0.057 272 V 0.002 0.003 0.008 0.012 0.012 0.026 0.074 0.110 0.222 0.261 0.270 273 R 0.035 0.049 0.075 0.202 0.202 0.104 0.127 0.067 0.066 0.047 0.026 274 K 0.030 0.040 0.051 0.102 0.098 0.139 0.174 0.117 0.114 0.081 0.053 275 S 0.134 0.114 0.075 0.195 0.163 0.107 0.092 0.045 0.035 0.025 0.014 276 G 0.139 0.110 0.056 0.116 0.106 0.094 0.133 0.089 0.078 0.050 0.029 277 G 0.163 0.104 0.042 0.135 0.123 0.099 0.113 0.076 0.073 0.045 0.027 278 G 0.056 0.043 0.036 0.077 0.080 0.092 0.158 0.117 0.150 0.114 0.078 279 R 0.027 0.047 0.033 0.119 0.128 0.111 0.169 0.131 0.123 0.068 0.044 280 V 0.015 0.018 0.017 0.035 0.034 0.051 0.126 0.132 0.212 0.174 0.186 281 Y 0.020 0.022 0.024 0.061 0.067 0.077 0.165 0.146 0.168 0.127 0.124 282 P 0.062 0.074 0.054 0.138 0.116 0.115 0.147 0.107 0.087 0.060 0.040 283 V 0.102 0.076 0.039 0.146 0.131 0.134 0.145 0.090 0.065 0.043 0.030 284 Q 0.262 0.163 0.041 0.151 0.115 0.075 0.075 0.048 0.035 0.021 0.014 285 G 0.348 0.141 0.033 0.100 0.088 0.072 0.081 0.049 0.043 0.027 0.018 286 R 0.141 0.124 0.045 0.156 0.142 0.108 0.111 0.061 0.052 0.036 0.025 287 L 0.035 0.025 0.020 0.065 0.058 0.085 0.144 0.135 0.159 0.125 0.149 288 A 0.134 0.190 0.050 0.180 0.157 0.094 0.084 0.043 0.033 0.020 0.016 289 D 0.231 0.217 0.046 0.172 0.130 0.067 0.057 0.032 0.025 0.014 0.009 290 G 0.096 0.041 0.017 0.065 0.078 0.095 0.144 0.136 0.142 0.102 0.084 291 L 0.017 0.025 0.014 0.057 0.061 0.079 0.166 0.172 0.172 0.145 0.092 292 Y 0.010 0.017 0.013 0.038 0.036 0.053 0.138 0.163 0.203 0.173 0.155 293 V 0.007 0.010 0.010 0.022 0.031 0.049 0.120 0.164 0.216 0.196 0.174 294 P 0.046 0.077 0.041 0.132 0.129 0.117 0.154 0.103 0.082 0.070 0.049 295 L 0.045 0.032 0.015 0.062 0.083 0.107 0.153 0.162 0.128 0.107 0.106 296 E 0.352 0.320 0.047 0.124 0.079 0.030 0.020 0.012 0.008 0.006 0.004 297 D 0.376 0.194 0.033 0.141 0.122 0.047 0.039 0.022 0.013 0.008 0.005 298 K 0.109 0.083 0.032 0.115 0.149 0.124 0.130 0.089 0.080 0.054 0.034 299 T 0.035 0.074 0.056 0.196 0.226 0.154 0.135 0.055 0.041 0.019 0.008 300 F 0.003 0.006 0.015 0.022 0.033 0.065 0.163 0.200 0.226 0.159 0.108 301 L 0.003 0.009 0.021 0.043 0.066 0.086 0.175 0.186 0.193 0.143 0.075 302 L 0.001 0.004 0.014 0.013 0.018 0.024 0.078 0.178 0.240 0.238 0.192 303 L 0.003 0.006 0.026 0.027 0.032 0.044 0.117 0.142 0.213 0.230 0.159 304 T 0.007 0.009 0.028 0.032 0.036 0.060 0.145 0.164 0.207 0.179 0.134 305 V 0.016 0.021 0.038 0.096 0.109 0.134 0.201 0.150 0.118 0.073 0.044 306 H 0.035 0.027 0.038 0.074 0.081 0.111 0.176 0.139 0.139 0.108 0.072 307 R 0.114 0.101 0.074 0.173 0.144 0.115 0.117 0.064 0.048 0.032 0.018 308 D 0.151 0.082 0.058 0.121 0.093 0.103 0.118 0.083 0.085 0.066 0.040 309 F 0.061 0.042 0.037 0.075 0.074 0.100 0.136 0.114 0.129 0.127 0.105 310 R 0.121 0.135 0.064 0.155 0.125 0.111 0.113 0.060 0.054 0.038 0.024 311 G 0.116 0.066 0.041 0.068 0.069 0.085 0.138 0.122 0.123 0.097 0.075 312 T 0.058 0.047 0.034 0.083 0.087 0.083 0.140 0.122 0.128 0.118 0.099 313 P 0.032 0.021 0.017 0.038 0.040 0.061 0.118 0.130 0.177 0.179 0.188 314 R 0.070 0.107 0.060 0.207 0.194 0.115 0.103 0.057 0.043 0.027 0.016 315 P 0.035 0.027 0.028 0.059 0.061 0.075 0.130 0.120 0.173 0.155 0.138 316 L 0.011 0.011 0.012 0.033 0.041 0.070 0.131 0.133 0.191 0.179 0.186 317 K 0.024 0.054 0.052 0.164 0.152 0.155 0.147 0.095 0.077 0.048 0.032 318 L 0.006 0.008 0.015 0.026 0.034 0.051 0.123 0.184 0.213 0.188 0.152 319 V 0.022 0.033 0.046 0.113 0.103 0.088 0.152 0.116 0.140 0.111 0.074 320 H 0.008 0.011 0.018 0.033 0.029 0.057 0.112 0.133 0.216 0.206 0.177 321 E 0.034 0.051 0.057 0.160 0.146 0.144 0.160 0.087 0.075 0.051 0.035 322 A 0.036 0.057 0.038 0.092 0.088 0.099 0.156 0.135 0.130 0.106 0.064 323 G 0.261 0.207 0.055 0.150 0.109 0.070 0.063 0.034 0.023 0.018 0.009 324 D 0.364 0.177 0.046 0.146 0.102 0.050 0.050 0.027 0.019 0.012 0.007 325 T 0.205 0.107 0.037 0.090 0.089 0.083 0.113 0.084 0.083 0.063 0.045 326 P 0.209 0.402 0.053 0.151 0.095 0.035 0.030 0.012 0.008 0.004 0.002 327 L 0.033 0.029 0.015 0.045 0.055 0.101 0.181 0.182 0.166 0.109 0.084 328 E 0.450 0.193 0.090 0.135 0.067 0.027 0.019 0.009 0.005 0.004 0.001 329 A 0.115 0.123 0.088 0.260 0.157 0.108 0.087 0.035 0.016 0.007 0.003 330 L 0.006 0.007 0.014 0.021 0.029 0.049 0.123 0.126 0.229 0.209 0.188 331 A 0.005 0.011 0.049 0.089 0.122 0.197 0.265 0.109 0.084 0.047 0.024 332 H 0.011 0.027 0.441 0.215 0.157 0.064 0.047 0.019 0.011 0.006 0.002 333 Q 0.003 0.007 0.053 0.045 0.073 0.143 0.282 0.176 0.122 0.064 0.032 334 I 0.005 0.006 0.032 0.019 0.020 0.032 0.120 0.133 0.233 0.235 0.166 335 F 0.006 0.009 0.085 0.070 0.097 0.126 0.204 0.126 0.129 0.100 0.048 336 H 0.007 0.021 0.193 0.166 0.211 0.125 0.147 0.068 0.040 0.015 0.006 337 L 0.005 0.007 0.027 0.019 0.022 0.054 0.183 0.144 0.238 0.182 0.119 338 T 0.005 0.004 0.012 0.012 0.012 0.026 0.102 0.116 0.244 0.197 0.270 339 R 0.009 0.018 0.066 0.086 0.111 0.118 0.187 0.152 0.135 0.069 0.050 340 L 0.004 0.008 0.028 0.025 0.032 0.065 0.169 0.188 0.204 0.146 0.131 341 Y 0.013 0.012 0.029 0.038 0.038 0.055 0.155 0.155 0.203 0.175 0.126 342 P 0.027 0.020 0.027 0.050 0.054 0.091 0.169 0.163 0.166 0.128 0.106 343 A 0.030 0.047 0.051 0.133 0.139 0.139 0.152 0.113 0.089 0.061 0.045 344 S 0.033 0.022 0.023 0.041 0.040 0.064 0.135 0.154 0.192 0.161 0.135 345 G 0.071 0.045 0.035 0.084 0.077 0.080 0.135 0.107 0.129 0.117 0.119 346 F 0.040 0.034 0.026 0.058 0.052 0.092 0.135 0.115 0.161 0.145 0.143 347 A 0.078 0.065 0.042 0.137 0.114 0.134 0.153 0.088 0.085 0.058 0.048 348 F 0.049 0.033 0.026 0.062 0.064 0.065 0.125 0.138 0.143 0.138 0.157 349 P 0.047 0.032 0.019 0.061 0.061 0.113 0.158 0.124 0.133 0.121 0.131 350 R 0.102 0.113 0.065 0.186 0.149 0.112 0.099 0.053 0.051 0.040 0.029 351 L 0.011 0.008 0.010 0.019 0.026 0.042 0.100 0.177 0.193 0.205 0.209 352 P 0.052 0.055 0.048 0.113 0.111 0.122 0.138 0.086 0.093 0.107 0.076 353 A 0.004 0.007 0.010 0.018 0.028 0.045 0.105 0.179 0.210 0.221 0.174 354 P 0.006 0.010 0.022 0.026 0.038 0.051 0.126 0.141 0.190 0.223 0.166 355 L 0.003 0.003 0.012 0.013 0.016 0.029 0.078 0.090 0.191 0.289 0.277 356 H 0.010 0.019 0.055 0.108 0.126 0.144 0.205 0.152 0.091 0.053 0.037 357 L 0.001 0.003 0.016 0.018 0.022 0.049 0.131 0.127 0.219 0.245 0.168 358 A 0.001 0.001 0.004 0.003 0.004 0.010 0.053 0.069 0.228 0.248 0.380 359 D 0.006 0.009 0.097 0.164 0.198 0.178 0.186 0.067 0.051 0.031 0.013 360 R 0.002 0.009 0.082 0.108 0.144 0.217 0.280 0.096 0.038 0.015 0.006 361 L 0.001 0.001 0.005 0.002 0.002 0.005 0.039 0.073 0.206 0.304 0.364 362 V 0.002 0.002 0.015 0.013 0.014 0.050 0.194 0.151 0.226 0.172 0.160 363 K 0.005 0.012 0.398 0.226 0.199 0.077 0.045 0.022 0.009 0.005 0.002 364 E 0.002 0.009 0.052 0.054 0.077 0.226 0.365 0.116 0.056 0.028 0.013 365 V 0.003 0.002 0.010 0.006 0.005 0.010 0.052 0.121 0.223 0.312 0.256 366 G 0.058 0.046 0.108 0.124 0.129 0.157 0.186 0.091 0.053 0.035 0.013 367 R 0.029 0.063 0.306 0.214 0.134 0.092 0.070 0.035 0.029 0.019 0.010 368 L 0.014 0.014 0.022 0.025 0.028 0.060 0.173 0.185 0.204 0.165 0.110 369 G 0.049 0.070 0.046 0.072 0.066 0.084 0.181 0.124 0.133 0.110 0.065 370 I 0.026 0.047 0.072 0.109 0.106 0.153 0.166 0.116 0.093 0.066 0.045 371 R 0.357 0.151 0.169 0.148 0.077 0.036 0.029 0.014 0.009 0.006 0.003 372 H 0.111 0.127 0.056 0.142 0.130 0.106 0.148 0.082 0.050 0.034 0.015 373 L 0.031 0.046 0.024 0.057 0.063 0.105 0.180 0.165 0.143 0.111 0.075 374 K 0.281 0.189 0.182 0.155 0.080 0.048 0.036 0.016 0.008 0.005 0.001 375 E 0.405 0.165 0.174 0.128 0.054 0.032 0.023 0.010 0.005 0.003 0.001 376 V 0.134 0.076 0.046 0.093 0.103 0.136 0.179 0.100 0.066 0.043 0.024 377 D 0.147 0.206 0.114 0.135 0.103 0.089 0.102 0.045 0.031 0.019 0.009 378 R 0.120 0.100 0.190 0.150 0.127 0.131 0.101 0.049 0.019 0.009 0.004 379 E 0.465 0.108 0.222 0.110 0.039 0.025 0.015 0.007 0.004 0.003 0.001 380 K 0.032 0.030 0.054 0.126 0.149 0.203 0.205 0.096 0.058 0.032 0.014 381 L 0.022 0.031 0.078 0.088 0.104 0.119 0.171 0.126 0.122 0.090 0.048 382 F 0.012 0.028 0.142 0.108 0.139 0.149 0.184 0.104 0.073 0.043 0.018 383 F 0.013 0.030 0.177 0.080 0.074 0.079 0.141 0.122 0.129 0.102 0.053 384 V 0.018 0.017 0.046 0.046 0.050 0.087 0.189 0.138 0.175 0.146 0.087