Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)
10 20 30 | | | 1 MRDMTEETRKDLPPEALRALAEAEERR....R....R..A.....K....A..L.....DL..P. 2 -RDMTEETRKDLPPEALRALAEAEERR....R....R..A.....K....A..L.....DL..P. 3 -RDMTEETRKDLPPEALRALAEAEERR....R....Q..A.....K....A..L.....DL..P. 4 --SDDTQDMSDLPPAAQRALAEAEARR....K....K..A.....Q....D..I.....NL..P. 5 --SDDTQDISDLPPAAQRALAEAEARR....K....K..A.....K....D..M.....NM..P. 6 --NMTDASDTNLPPAAKRALAEAEERR....K....K..A.....K....A..K.....EL..P. 7 ----PMPMVQELPAAAQRALAEAAERR....K....A..A.....Q....A..L.....DL..P. 8 ------ETKRDLPPAAIRALAEAEERR....K....K..A.....A....A..L.....KL..P. 9 -------VRKDLPPAAQRALAEAEERR....R....A..A.....A....A..E.....AL..P. 10 ---------KDLPAAAQRALAEAEERR....K....K..A.....D....A..Q.....TL..P. 11 ---PTPTPGPDLPAAAQRALAEAAARR....K....A..E.....A....A..L.....DL..P. 12 ---------KDLTPEAERALAEAEERR....K....K..A.....K....A..Q.....EM..P. 13 -------APKDLPPAAQRALAEAAERR....K....A..A.....-....K..L.....DL..P. 14 -----PTDRKDLPPAAQRALAEAEERR....R....L..A.....E....Ae.A.....PL..P. 15 ----------KLPPEALRALEEAAARR....R....A..A.....Q....D..T.....PL..P. 16 ---------PDLPPAAQRALAEAEERR....R....K..A.....E....AetK.....PL..P. 17 -----------LPEPARRALAEADARK....A....K..E.....K....A..R.....EF..P. 18 --DDTQTPSRDLPPAAQRALAEAEARR....K....A..A.....E....A..L.....DL..P. 19 --------ISDLPPAAQRALAEAEERR....R....K..A.....E....A..L.....DL..P. 20 --------ESDLPPAAQRALAEAAERR....A....KpeA.....E....A..K.....AF..P. 21 --------AKDLPAAAQRALAEAEERR....K....A..R.....D....Ae.K.....PL..P. 22 ------TETENLPPAALRALAEAAERR....K....A..A.....Eve..A..A.....NR..P. 23 ------TETENLPPAAQRALAEAAERR....K....A..A.....Eae..A..A.....NR..P. 24 -------KPRDLPPAAQRALAEAEERR....K....L..A.....E....T..L.....AL..P. 25 ----------TLTPAARRALEEAAARR....A....A..E.....A....A..L.....SL..P. 26 -----KRRFEDLPPAAQRALKEAEARR....A....A..E.....K....A..E.....KL..P. 27 -------INPDLPPAAQRALAEAAERR....K....A..A.....D....A..Ka....KP..P. 28 -------RFEDLPPAAQRALKEAEARR....A....A..E.....K....A..E.....KL..P. 29 -----KRRFEDLPPAAQRALKEAEARR....A....A..E.....K....A..E.....KL..P. 30 -----------LSPEARRALAEAEERR....K....I..A.....R....Q..A.....EL..A. 31 ----DKRTFEDLPPAAQRALKEAEARR....A....A..E.....K....A..N.....EA..P. 32 ----------VLTPAARRALEEAAARR....A....E..A.....H....A..A.....AL..P. 33 ------PPRKMLSPAARRALAEAEERR....Q....K..Q.....K....P..L.....EL..P. 34 --------RKMLSAAAQRALAEAEERR....K....N..Q.....K....P..L.....EL..P. 35 --------DPSLPPAAQRALAEAAARR....K....E..A.....Q....T..Ka....PP..P. 36 ----------PLSEAAKRALAEAAERR....Klh..D..A.....Q....H..N.....TL..P. 37 -------DRRELPPAAQRALAEAAERR....R....L..K.....Ela..H..E.....PR..P. 38 -----------LSPAAKRALEEAEDRR....K....RraA.....Q....Q..A.....DA..P. 39 -------PRKDLSPAAQRALAEAEARR....A....Ai.D.....A....A..A.....NL..P. 40 --------QPSLSPAAQRALKEAEERR....K....D..A.....T....T..K.....EQ..P. 41 ---------RPLPPAAQRALAEAEARR....T....A..A.....Q....AqaV.....TA..P. 42 ---------QPLSPAAQRALNEAEERR....K....H..E.....T....N..E.....EK..P. 43 ---------KPLTPAAQRALAEAEERR....R....I..Aae...Q....A..K.....PM..P. 44 -----DEPRKPLSEAAKRALAEAEERR....R....Q..A.....E....Ad.A.....ER..E. 45 -------PKRPLSPAALRALKEAEERR....R....A..E.....A....P..K.....DM..P. 46 --------QQPLSSEAQRALNEAEERR....K....H..E.....K....N..K.....DK..P. 47 ---------SSLSPAAQRALQEAAERR....K....R..E.....I....H..E.....KK..P. 48 ---------KPLTPAAQRALAEAEERR....R....R..A.....A....E..E.....AMprP. 49 -------SRKMLSPAARRALAEAEERR....K....N..Q.....K....P..L.....EL..P. 50 --------FEDLPPAAQRALMEAEERR....K....EidA.....R....Q..Q.....NL..P. 51 --------VRRLSPAAQRALEEAEERR....R....Q..Q.....A....D..L.....QL..P. 52 --------PKDLTPAARRALAEAEARR....Aay..R..E.....K....E..A.....AL..P. 53 ---------KELTPAARRALAEAEERR....K....A..A.....D....A..Ap....AR..P. 54 --------RKPLSEAAKRALAEAEARR....A....AidA.....A....T..K.....AR..P. 55 -------DRKPLSPAAQRALAEAEARR....Q....A..Aai6edD....A..K.....AT..P. 56 --------RKMLSPAAQRALAEAEERR....K....N..Q.....K....P..L.....EL..A. 57 ------HPRRPLSPAALRALKEAEERR....G....A..K.....A....P..K.....EI..P. 58 --------RKMLSPAAKRALAEAEERR....K....N..Q.....K....P..L.....EL..P. 59 --------RRRLPPAAERALAEAEARR....A....A..Rt....D....A..S.....AR..P. 60 ------------KAAAHRALEEAHNRK....K....E..L.....E....E..T.....KL..D. 61 ---------KALTPAARRALAEAEARR....A....A..A.....Qta..A..S.....AG..P. 62 -----ETSVKTLSPAAKRALAEAEERR....R....T..R.....T....A..FkvdpdSL..P. 63 -------DRKDLPPAAQRALAEAAERR....A....A..A.....EeaarE..A.....PT..P. 64 --------RKDLPEAAKRALAEAEARR....V....E..A.....Akh..A..E.....AR..A. 65 --------KRELSPAAKRALAEADERR....K....A..R.....D....T..A.....KIstE. 66 --------RKDLPEAAKRALAEAEARR....V....E..A.....Akh..A..E.....AR..A. 67 -------PRKELPDAAKRALAEAEARR....A....E..A.....Akh..A..A.....AH..A. 68 ------PPRRELPDAAKRALAEADARR....V....E..A.....Aqh..A..A.....AR..A. 69 --------RKTLSPAAQRALAEAQARR....AaidaR..A.....A....E..I.....RR..A. 70 -------SRKQLSPEARRALAEAEARR....A....A..Q.....T....D..As....AP..P. 71 -----------LSPAAQRALAEAAERR....AaidaR..A.....A....E..I.....GA..K. 72 ---------KPLSPAAERALAEAQARR....AaidaR..A.....A....E..I.....RR..A. 73 -----------LSPAAQRALAEAAERR....A....K..A.....A....AeaH.....AA..A. 74 --------RKELPPAAQRALAEAAARR....A....A..A.....D....A..K.....AL..Ag 75 -----DETRRPLSPAAQRALAEAAERR....AsidaR..A.....A....K..I.....AE..R. 76 ---------------------------....-....-..-.....-....-..K.....QL..P. 77 ---------RELSPAAQRALAEAAERR....AaidaR..A.....A....R..I.....AE..R. 78 -----------LSPAAQRALAEAAERR....AaidaR..A.....A....K..I.....AE..R. 79 ---------------------------....-....-..-.....-....K..K.....PL..P. 80 ---------------------------....-....-..-.....-....K..K.....PL..P. 81 ---------------------------....-....-..-.....-....K..K.....PL..P. 82 ---------------------------....-....-..-.....-....K..K.....PL..P. 83 ----------ALPETARRALEEAEARK....A....KdaA.....D....A..A.....AL..P. 84 ---------------------------....-....-..-.....-....K..K.....PL..P. 85 ---------------------------....-....-..-.....-....K..K.....PL..P. 86 ---------------------------....-....-..-.....-....K..K.....PL..P. 87 ---------------------------....-....-..-.....-....K..K.....PL..P. 88 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....-W..P. 89 -----------LSPAAQRALAEAAERRaaid-t...R..A.....A....K..I.....AE..R. 90 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 91 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....-L..T. 92 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....-I..T. 93 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 94 ---------------------------....-....-..-.....-....-..S.....DM..P. 95 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..P. 96 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..P. 97 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 98 ---------------------------....-....-..-.....-....-..K.....EM..P. 99 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..T. 100 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 101 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..T. 102 ---------------------------....-....-..A.....A....T..Q.....DL..P. 103 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..T. 104 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 105 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 106 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 107 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 108 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 109 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 110 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 111 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 112 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 113 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 114 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..T. 115 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 116 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 117 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 118 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 119 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 120 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 121 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 122 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 123 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 124 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 125 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 126 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 127 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 128 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 129 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 130 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....PI..T. 131 ---------------------------....-....E..K.....E....N..L.....PK..E. 132 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..T. 133 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 134 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 135 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 136 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 137 ---------------------------....-....-..-.....-....-..-.....--..-. 138 ---------------------------....-....E..K.....E....N..L.....PK..E. 139 ---------------------------....-....-..-.....E....N..L.....PK..E. 40 50 60 | | | 1 ....K.EIGGR.NGPEPVRFGDWEKKGIAIDF 2 ....K.EIGGR.NGPEPVRFGDWEKKGIAIDF 3 ....K.EIGGR.NGPEPVRFGDWEKKGIAIDF 4 ....P.ELGGR.EGPEPVRYGDWERKGIAVDF 5 ....P.ELGGR.EGPEPVRYGDWERKGIAVDF 6 ....L.ELGGR.EGPEPVRYGDWEKKGIAVDF 7 ....T.ELGGR.DGPEPVRYGDWEKKGIAVDF 8 ....E.ELGGR.DGPEPVRYGDWEKKGLAIDF 9 ....P.ELGGR.DGPEPVRYGDWEKKGIAVDF 10 ....P.ELGGR.DGPEPVRYGDWEKKGLAIDF 11 ....A.ELGGR.DGPEPVRYGDWEKKGIAVDF 12 ....I.ELGGR.DGPEPVRYGDWERKGIAVDF 13 ....P.ELGGR.DGPEPVRFGDWEKKGIAIDF 14 ....K.ELGGR.KGPEPVRYGDWEKKGIAVDF 15 ....T.ELGGR.DGPEPVRYGDWERKGIAVDF 16 ....K.ELGGR.DGPDPARYGDWEKKGIAIDF 17 ....P.ELGGR.NGPEPVRYGDWEKKGIAIDF 18 ....R.ELGGRrEGLEPVRYGDWEKKGLAIDF 19 ....K.ELGGRrEGLEPVRYGDWEKKGLAIDF 20 ....K.EYGGR.DGPEPVRYGDWEKKGLAIDF 21 ....T.ELGGR.DGPDPARYGDWEKKGIAIDF 22 ....V.ELGGR.DGPDPARYGDWEKKGIAIDF 23 ....V.ELGGR.DGPDPARYGDWEKKGIAIDF 24 ....K.ELGGRqEGLEPVRYGDWEKKGLAIDF 25 ....P.EEGGR.DGPEPTRFGDWEKKGVAVDF 26 ....R.EIGGR.GGKDPARYGDWEIKGRTIDF 27 ....V.ELGGR.DGLDPARYGDWEKKGIAIDF 28 ....R.EIGGR.GGKDPARYGDWEIKGRTIDF 29 ....R.EIGGR.GGKDPARYGDWEIKGRTIDF 30 ....P.ETGGR.KGPEPTRFGDWEKKGIICDF 31 ....R.EIGGR.GGKDPARFGDWEIKGRSIDF 32 ....T.EEGGR.DGPEPTRFGDWERKGVAVDF 33 ....P.EIGGR.GGAEPARFGDYEINGRAIDF 34 ....P.EIGGR.GGAEPARFGDYEINGRAIDF 35 ....T.EYGGR.DGLDPARYGDWEKKGIAIDF 36 ....K.EINGR.DGPEPVRYGDWEKNGIASDF 37 ....K.EINGR.DGPEPARYGDWEVKGIASDF 38 ....R.EIGGR.DGPDPARYGDWEVKGIATDF 39 ....K.EINGR.GGKEPVRYGDWEVGGIASDF 40 ....L.ENGGR.GGKDPSRYGDWEIKGRAIDF 41 ....K.EVNGP.KGPEPTRYGDWENKGIASDF 42 ....L.ENGGR.GGKDPSRYGDWEIKGRAIDF 43 ....K.ELQGP.KGPEPTRYGDWENKGIISDF 44 ....K.ELGGP.KGPEPTRFGDWEKKGITYDF 45 ....A.ELGGR.GGLDPARFGDWEIKGRAIDF 46 ....L.ENGGR.GGKDPSRYGDWEIKGRAIDF 47 ....L.ESGGR.GGKDPARYGDWEIKGRAIDF 48 ....K.ELQGP.KGPEPTRYGDWENKGIISDF 49 ....P.EIGGR.GGAEPARFGDYEINGRAIDF 50 ....E.EVNGR.GGLEPTRYDDWEIKGLTSDF 51 ....P.ETGGR.GGAEPVRFGDYEIKGRAIDF 52 ....K.EVGGR.GGKEPGRYGDWEVKGLTSDF 53 ....R.EIAGR.GGNEPTRYGDWEVKGITSDF 54 ....K.EINGR.DGPEPVRYGDWEVGGIASDF 55 ....K.ELQGP.KGPEPTRYGDWERKGIASDF 56 ....P.EIGGR.GGAEPARFGDYEINGRAIDF 57 ....A.EVGGR.GGLDPARFGDWEIKGRAIDF 58 ....P.ETGGR.GGAEPARFGDYEINGRAIDF 59 ....K.EILGP.KGPEPTRFGDWERNGVASDF 60 ....L.ELGGP.KGLEPTRFGDWERKGIASDF 61 ....K.EIQGP.KGPEPTRFGDWERNGIASDF 62 ....S.EVDGRkSGVEPVRYGDWEKDGIVSDF 63 ....K.EYGGR.DGLDPARYGDWEKKGIAIDF 64 ....K.EVQGP.KGPEPTRYGDWEVKGIASDF 65 ....K.EIGGR.GGADPARFGDWEIDGRAIDF 66 ....K.EVQGP.KGPEPTRYGDWEVKGIASDF 67 ....K.EYQGP.KGPEPTRYGDWEVKGIASDF 68 ....K.EYQGP.KGPEPTRYGDWEVKGIASDF 69 ....R.EIDGR.GGLEPVRYDDWEVKGLATDF 70 ....K.EIQGP.EGPEPTRFGDWERGGIASDF 71 ....P.ERQGR.GGLEPVRYDDWEVKGLAVDF 72 ....R.EIDGR.GGLEPVRYDDWEVKGLATDF 73 ....K.EVDGP.KGLEPTRYGDWERKGIASDF 74 s7ptQ.EVNGP.KGPEPTRYGDWETKGIASDF 75 ....R.ETLGR.GGLEPVRYEDWEVKGLASDF 76 ....K.EIGGR.DGPEPTRYGDWEKNGRCIDF 77 ....P.ESLGR.GGLEPVRYEDWEVKGLASDF 78 ....P.ETLGR.GGLEPVRYEDWEVKGLASDF 79 ....K.EIGGR.DGPEPTRYGDWEKNGRCIDF 80 ....K.EIGGR.DGPEPTRYGDWEKNGRCIDF 81 ....K.EIGGR.DGPEPTRYGDWEKNGRCIDF 82 ....K.EIGGR.DGPEPTRYGDWEKNGRCIDF 83 ....KdEFGGP.KSIEPTRYGDWERKGIAYDF 84 ....K.EIGGR.DGPEPTRYGDWEKNGRCIDF 85 ....K.EIGGR.DGPEPTRYGDWEKNGRCIDF 86 ....K.EIGGR.DGPEPTRYGDWEKNGRCIDF 87 ....K.EIGGR.DGPEPTRYGDWEKNGRCVDF 88 ....K.EIGGP.KGPEPTRYGDWERNGRCTDF 89 ....P.ETLGR.GGLEPVRYEDWEVKGLASDF 90 ....-.EIGGP.RGPEPTRYGDWERKGRVTDF 91 ....K.EKGGP.KGPEPTRYGDWERKGRCVDF 92 ....K.EKGGP.KGPEPTRYGDWERKGRCVDF 93 ....G.EIGGP.AGPEPTRFGDWERKGRCIDF 94 ....R.EYNGP.KGPEPTRYGDWERKGRVSDF 95 ....V.EHGGP.KGPEPTRFGDWERNGRCIDF 96 ....K.EIGGP.KGPEPTRYGDWERNGRCSDF 97 ....K.EKGGP.RGPEPTRYGDWERKGRCIDF 98 ....K.EIGGA.KGLEPTRYGDWQHKGKVTDF 99 ....K.EKGGP.KGPEPTRYGDWERKGRCIDF 100 ....K.EKGGP.KGPEPTRYGDWERKGRCIDF 101 ....K.EKGGP.KGPEPTRYGDWERKGRCIDF 102 ....P.ERGGY.TGPEPTRFGDWEHKGRCTDF 103 ....K.EKGGP.KGPEPTRYGDWERKGRCIDF 104 ....G.EIGGQ.AGPEPTRYGDWERKGRVTDF 105 ....K.EKGGP.RGPEPTRYGDWERKGRCIDF 106 ....K.EKGGP.RGPEPTRYGDWERKGRCIDF 107 ....-.ERGGP.KGPEPTRFGDWERKGRCIDF 108 ....-.EVGGP.RGPEPTRYGDWERKGRVTDF 109 ....-.EIGGP.KGPEPTRYGDWERKGRVTDF 110 ....G.EIGGQ.AGPEPTRYGDWERKGRVTDF 111 ....K.EKGGP.RGPEPTRYGDWERKGRCIDF 112 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....K.EIGGV.KGLEPTRYGDWQHKGKVTDF