# TARGET T0482 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t2k-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0482.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 6.21971 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.015 0.005 0.021 0.032 0.074 0.150 0.025 0.678 2 F 0.021 0.009 0.029 0.048 0.049 0.144 0.038 0.662 3 E 0.145 0.068 0.031 0.061 0.078 0.117 0.162 0.339 4 P 0.044 0.029 0.030 0.030 0.069 0.117 0.060 0.622 5 G 0.021 0.048 0.067 0.165 0.279 0.074 0.054 0.292 6 H 0.034 0.054 0.073 0.117 0.193 0.080 0.107 0.343 7 L 0.025 0.018 0.116 0.212 0.202 0.076 0.092 0.259 8 H 0.070 0.044 0.069 0.145 0.300 0.052 0.066 0.255 9 L 0.246 0.020 0.024 0.068 0.076 0.076 0.077 0.412 10 V 0.017 0.007 0.044 0.083 0.128 0.118 0.028 0.576 11 S 0.044 0.009 0.012 0.022 0.051 0.073 0.022 0.768 12 L 0.300 0.015 0.006 0.027 0.021 0.071 0.110 0.450 13 P 0.009 0.004 0.005 0.010 0.013 0.113 0.009 0.836 14 G 0.082 0.016 0.006 0.013 0.022 0.066 0.069 0.727 15 L 0.102 0.007 0.010 0.018 0.016 0.128 0.063 0.656 16 D 0.111 0.010 0.013 0.020 0.023 0.096 0.052 0.674 17 Q 0.101 0.005 0.007 0.007 0.016 0.091 0.064 0.709 18 Q 0.029 0.006 0.060 0.043 0.048 0.159 0.041 0.613 19 D 0.012 0.004 0.047 0.028 0.068 0.103 0.042 0.697 20 I 0.008 0.005 0.117 0.201 0.137 0.099 0.057 0.375 21 N 0.005 0.008 0.229 0.075 0.206 0.066 0.061 0.351 22 I 0.003 0.004 0.161 0.334 0.247 0.039 0.041 0.170 23 H 0.004 0.006 0.361 0.148 0.253 0.029 0.048 0.151 24 I 0.006 0.007 0.227 0.287 0.260 0.035 0.035 0.144 25 R 0.008 0.014 0.289 0.123 0.247 0.037 0.077 0.204 26 Y 0.014 0.009 0.125 0.224 0.376 0.050 0.038 0.164 27 E 0.017 0.008 0.122 0.230 0.353 0.043 0.053 0.175 28 V 0.077 0.008 0.036 0.185 0.249 0.060 0.060 0.325 29 R 0.013 0.007 0.020 0.134 0.222 0.100 0.039 0.465 30 Q 0.001 0.002 0.013 0.030 0.066 0.108 0.012 0.768 31 N 0.272 0.034 0.013 0.031 0.025 0.039 0.345 0.242 32 A 0.733 0.009 0.002 0.004 0.004 0.026 0.035 0.188 33 E 0.114 0.006 0.003 0.005 0.006 0.055 0.033 0.776 34 S 0.013 0.006 0.003 0.003 0.010 0.129 0.021 0.815 35 G 0.025 0.011 0.023 0.026 0.038 0.153 0.053 0.670 36 A 0.005 0.005 0.028 0.334 0.340 0.044 0.062 0.182 37 Y 0.010 0.008 0.108 0.100 0.236 0.046 0.089 0.403 38 V 0.006 0.006 0.097 0.344 0.365 0.026 0.032 0.123 39 H 0.006 0.003 0.172 0.237 0.312 0.029 0.065 0.177 40 F 0.004 0.001 0.062 0.376 0.423 0.019 0.023 0.091 41 D 0.011 0.002 0.074 0.307 0.298 0.041 0.037 0.231 42 M 0.014 0.001 0.035 0.309 0.361 0.039 0.026 0.215 43 D 0.022 0.003 0.051 0.093 0.157 0.065 0.043 0.565 44 G 0.012 0.001 0.061 0.320 0.317 0.030 0.019 0.241 45 E 0.021 0.001 0.036 0.075 0.168 0.048 0.023 0.629 46 I 0.536 0.001 0.011 0.062 0.027 0.053 0.021 0.289 47 D 0.004 0.001 0.011 0.019 0.123 0.046 0.005 0.790 48 G 0.024 0.001 0.004 0.026 0.050 0.076 0.011 0.809 49 K 0.002 0.001 0.013 0.460 0.198 0.041 0.006 0.279 50 P 0.025 0.004 0.013 0.040 0.043 0.081 0.048 0.747 51 F 0.052 0.005 0.020 0.100 0.149 0.101 0.046 0.526 52 S 0.152 0.017 0.010 0.028 0.028 0.068 0.049 0.647 53 D 0.080 0.010 0.017 0.044 0.104 0.090 0.040 0.615 54 S 0.023 0.008 0.023 0.059 0.100 0.082 0.043 0.661 55 F 0.014 0.011 0.045 0.119 0.153 0.115 0.025 0.519 56 E 0.019 0.023 0.043 0.122 0.113 0.097 0.046 0.537 57 L 0.042 0.051 0.042 0.069 0.067 0.105 0.202 0.422 58 P 0.082 0.372 0.015 0.013 0.019 0.064 0.153 0.282 59 R 0.091 0.479 0.014 0.009 0.014 0.049 0.071 0.272 60 D 0.066 0.331 0.033 0.014 0.020 0.064 0.209 0.262 61 T 0.029 0.477 0.034 0.015 0.025 0.052 0.149 0.219 62 A 0.018 0.752 0.017 0.008 0.014 0.023 0.041 0.127 63 F 0.069 0.313 0.044 0.014 0.013 0.055 0.347 0.146 64 N 0.037 0.349 0.022 0.006 0.007 0.035 0.423 0.121 65 F 0.042 0.715 0.011 0.004 0.005 0.025 0.096 0.102 66 A 0.043 0.277 0.042 0.004 0.004 0.036 0.500 0.094 67 S 0.039 0.551 0.014 0.003 0.005 0.046 0.186 0.157 68 D 0.011 0.872 0.004 0.002 0.003 0.010 0.021 0.077 69 A 0.009 0.916 0.006 0.003 0.003 0.009 0.017 0.039 70 T 0.023 0.870 0.007 0.003 0.006 0.012 0.035 0.044 71 R 0.018 0.900 0.006 0.003 0.005 0.006 0.018 0.044 72 V 0.074 0.642 0.048 0.013 0.017 0.024 0.074 0.107 73 A 0.183 0.113 0.166 0.020 0.022 0.055 0.210 0.231 74 Q 0.461 0.034 0.017 0.010 0.015 0.051 0.037 0.375 75 K 0.112 0.009 0.008 0.007 0.013 0.076 0.027 0.748 76 H 0.010 0.004 0.006 0.005 0.006 0.150 0.011 0.810 77 G 0.011 0.008 0.013 0.017 0.031 0.129 0.028 0.763 78 L 0.016 0.012 0.020 0.024 0.026 0.110 0.021 0.771 79 H 0.527 0.044 0.014 0.006 0.007 0.047 0.116 0.238 80 P 0.163 0.044 0.020 0.009 0.012 0.108 0.041 0.603 81 K 0.082 0.056 0.021 0.005 0.011 0.105 0.038 0.682 82 F 0.091 0.050 0.023 0.010 0.018 0.124 0.138 0.546 83 G 0.036 0.114 0.036 0.032 0.040 0.125 0.124 0.492 84 A 0.043 0.224 0.030 0.044 0.068 0.084 0.074 0.433 85 I 0.070 0.251 0.053 0.039 0.049 0.074 0.117 0.348 86 T 0.065 0.318 0.044 0.033 0.052 0.065 0.115 0.308 87 R 0.026 0.444 0.032 0.027 0.046 0.050 0.072 0.303 88 V 0.024 0.599 0.026 0.013 0.021 0.039 0.068 0.210 89 H 0.095 0.626 0.018 0.008 0.009 0.028 0.092 0.125 90 K 0.019 0.836 0.008 0.004 0.006 0.014 0.025 0.089 91 E 0.011 0.843 0.007 0.003 0.005 0.013 0.036 0.081 92 Y 0.019 0.837 0.012 0.002 0.003 0.010 0.065 0.051 93 D 0.052 0.806 0.006 0.003 0.003 0.012 0.059 0.058 94 A 0.019 0.775 0.018 0.004 0.006 0.020 0.051 0.106 95 M 0.007 0.918 0.004 0.001 0.002 0.007 0.013 0.046 96 F 0.027 0.844 0.010 0.002 0.002 0.010 0.067 0.039 97 E 0.031 0.823 0.008 0.002 0.003 0.019 0.045 0.068 98 D 0.045 0.812 0.011 0.002 0.004 0.015 0.047 0.064 99 I 0.129 0.549 0.045 0.009 0.013 0.039 0.095 0.122 100 R 0.216 0.190 0.047 0.009 0.015 0.075 0.135 0.314 101 A 0.293 0.064 0.017 0.011 0.020 0.089 0.056 0.448 102 K 0.060 0.017 0.016 0.014 0.039 0.107 0.041 0.705 103 L 0.045 0.010 0.020 0.018 0.022 0.157 0.036 0.693 104 H 0.010 0.002 0.053 0.084 0.149 0.098 0.038 0.566 105 A 0.011 0.001 0.015 0.009 0.021 0.070 0.010 0.863 106 H 0.834 0.002 0.006 0.006 0.003 0.014 0.077 0.059 107 P 0.025 0.003 0.007 0.002 0.008 0.078 0.011 0.867 108 G 0.041 0.002 0.008 0.008 0.016 0.073 0.012 0.840 109 E 0.019 0.002 0.048 0.203 0.146 0.092 0.027 0.463 110 P 0.007 0.002 0.028 0.047 0.051 0.143 0.021 0.700 111 V 0.003 0.004 0.025 0.087 0.118 0.108 0.013 0.642 112 D 0.381 0.226 0.008 0.010 0.009 0.042 0.151 0.172 113 L 0.265 0.282 0.007 0.011 0.017 0.055 0.065 0.298 114 E 0.040 0.168 0.017 0.035 0.049 0.069 0.052 0.570 115 R 0.077 0.101 0.042 0.053 0.122 0.085 0.097 0.423 116 I 0.134 0.015 0.060 0.109 0.093 0.084 0.124 0.381 117 I 0.202 0.003 0.023 0.085 0.090 0.067 0.040 0.492 118 R 0.069 0.001 0.006 0.008 0.018 0.072 0.019 0.808 119 H 0.032 0.002 0.009 0.007 0.011 0.139 0.022 0.778 120 E 0.013 0.002 0.021 0.016 0.035 0.111 0.022 0.781