# TARGET T0482 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t2k-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0482.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 6.21971 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.028 0.009 0.020 0.014 0.015 0.027 0.004 0.883 2 F 0.062 0.021 0.065 0.050 0.115 0.074 0.010 0.603 3 E 0.091 0.019 0.077 0.074 0.096 0.103 0.006 0.534 4 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 5 G 0.031 0.006 0.045 0.047 0.094 0.163 0.005 0.608 6 H 0.253 0.015 0.036 0.039 0.052 0.061 0.012 0.533 7 L 0.083 0.044 0.088 0.133 0.203 0.040 0.006 0.403 8 H 0.041 0.035 0.071 0.169 0.245 0.079 0.006 0.354 9 L 0.061 0.051 0.063 0.151 0.238 0.057 0.007 0.372 10 V 0.046 0.065 0.054 0.191 0.282 0.061 0.010 0.292 11 S 0.090 0.052 0.036 0.092 0.143 0.079 0.030 0.479 12 L 0.120 0.065 0.055 0.103 0.186 0.082 0.014 0.375 13 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.994 14 G 0.025 0.004 0.008 0.015 0.038 0.152 0.010 0.746 15 L 0.470 0.009 0.024 0.018 0.029 0.060 0.016 0.374 16 D 0.054 0.016 0.022 0.037 0.047 0.221 0.008 0.595 17 Q 0.093 0.009 0.032 0.027 0.051 0.147 0.013 0.628 18 Q 0.102 0.011 0.026 0.028 0.029 0.263 0.013 0.529 19 D 0.112 0.007 0.044 0.038 0.043 0.186 0.017 0.552 20 I 0.089 0.015 0.105 0.123 0.117 0.150 0.010 0.392 21 N 0.024 0.006 0.123 0.143 0.194 0.160 0.005 0.346 22 I 0.013 0.003 0.152 0.238 0.278 0.058 0.003 0.253 23 H 0.006 0.002 0.223 0.234 0.291 0.078 0.002 0.164 24 I 0.006 0.002 0.171 0.259 0.326 0.046 0.002 0.187 25 R 0.003 0.002 0.254 0.217 0.382 0.043 0.002 0.098 26 Y 0.004 0.003 0.186 0.251 0.349 0.036 0.002 0.170 27 E 0.005 0.005 0.165 0.270 0.330 0.070 0.003 0.153 28 V 0.008 0.009 0.090 0.163 0.371 0.049 0.003 0.306 29 R 0.008 0.016 0.067 0.217 0.489 0.048 0.004 0.153 30 Q 0.041 0.031 0.026 0.101 0.139 0.173 0.013 0.478 31 N 0.064 0.070 0.029 0.094 0.154 0.157 0.014 0.418 32 A 0.026 0.054 0.017 0.023 0.062 0.050 0.006 0.762 33 E 0.017 0.024 0.006 0.013 0.019 0.454 0.015 0.452 34 S 0.454 0.024 0.012 0.012 0.018 0.088 0.085 0.306 35 G 0.407 0.138 0.031 0.026 0.046 0.053 0.036 0.263 36 A 0.158 0.019 0.105 0.127 0.087 0.219 0.018 0.266 37 Y 0.016 0.007 0.087 0.121 0.166 0.060 0.005 0.538 38 V 0.006 0.001 0.081 0.380 0.461 0.011 0.001 0.059 39 H 0.006 0.004 0.101 0.243 0.382 0.026 0.002 0.236 40 F 0.005 0.004 0.201 0.330 0.341 0.015 0.002 0.101 41 D 0.008 0.005 0.077 0.258 0.407 0.032 0.003 0.210 42 M 0.023 0.006 0.060 0.209 0.371 0.054 0.007 0.270 43 D 0.019 0.006 0.028 0.101 0.183 0.162 0.011 0.490 44 G 0.116 0.005 0.039 0.096 0.178 0.107 0.022 0.436 45 E 0.081 0.012 0.060 0.093 0.125 0.233 0.010 0.386 46 I 0.029 0.011 0.048 0.178 0.231 0.102 0.005 0.397 47 D 0.015 0.011 0.030 0.076 0.187 0.122 0.006 0.553 48 G 0.071 0.006 0.026 0.041 0.101 0.063 0.027 0.666 49 K 0.231 0.008 0.082 0.130 0.096 0.183 0.011 0.259 50 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.992 51 F 0.005 0.001 0.049 0.117 0.610 0.028 0.001 0.188 52 S 0.019 0.007 0.039 0.052 0.063 0.210 0.005 0.606 53 D 0.141 0.010 0.039 0.042 0.071 0.075 0.022 0.599 54 S 0.172 0.036 0.073 0.034 0.050 0.180 0.015 0.440 55 F 0.236 0.018 0.077 0.052 0.062 0.181 0.022 0.351 56 E 0.073 0.020 0.121 0.060 0.131 0.192 0.016 0.387 57 L 0.048 0.018 0.091 0.049 0.080 0.122 0.005 0.587 58 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.995 59 R 0.013 0.012 0.026 0.012 0.053 0.106 0.003 0.775 60 D 0.070 0.085 0.020 0.006 0.015 0.052 0.003 0.749 61 T 0.174 0.265 0.012 0.005 0.013 0.066 0.005 0.459 62 A 0.277 0.434 0.019 0.006 0.016 0.045 0.010 0.193 63 F 0.164 0.630 0.019 0.005 0.012 0.030 0.010 0.130 64 N 0.089 0.569 0.009 0.003 0.006 0.031 0.013 0.281 65 F 0.096 0.545 0.022 0.002 0.005 0.027 0.013 0.290 66 A 0.096 0.672 0.018 0.003 0.004 0.064 0.012 0.130 67 S 0.075 0.574 0.018 0.003 0.004 0.131 0.013 0.181 68 D 0.055 0.729 0.009 0.001 0.003 0.025 0.007 0.171 69 A 0.065 0.768 0.010 0.001 0.003 0.023 0.010 0.120 70 T 0.027 0.732 0.017 0.003 0.005 0.063 0.010 0.142 71 R 0.015 0.842 0.008 0.003 0.004 0.028 0.005 0.096 72 V 0.012 0.929 0.003 0.002 0.003 0.007 0.002 0.042 73 A 0.008 0.963 0.003 0.002 0.002 0.005 0.002 0.015 74 Q 0.027 0.917 0.010 0.005 0.005 0.004 0.008 0.024 75 K 0.054 0.851 0.011 0.005 0.008 0.003 0.026 0.043 76 H 0.237 0.495 0.031 0.011 0.012 0.014 0.086 0.114 77 G 0.174 0.116 0.111 0.028 0.019 0.043 0.082 0.426 78 L 0.064 0.041 0.302 0.043 0.039 0.090 0.020 0.402 79 H 0.053 0.020 0.086 0.034 0.040 0.139 0.006 0.623 80 P 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.003 0.001 0.992 81 K 0.026 0.012 0.039 0.012 0.030 0.249 0.006 0.627 82 F 0.465 0.023 0.034 0.010 0.017 0.073 0.023 0.355 83 G 0.217 0.070 0.047 0.022 0.024 0.163 0.014 0.443 84 A 0.082 0.035 0.040 0.018 0.023 0.151 0.009 0.643 85 I 0.086 0.079 0.071 0.038 0.088 0.108 0.007 0.524 86 T 0.052 0.133 0.073 0.052 0.092 0.154 0.007 0.436 87 R 0.061 0.205 0.036 0.027 0.052 0.097 0.008 0.513 88 V 0.096 0.299 0.052 0.019 0.042 0.077 0.011 0.405 89 H 0.079 0.336 0.038 0.019 0.037 0.125 0.013 0.353 90 K 0.037 0.256 0.023 0.006 0.011 0.094 0.010 0.563 91 E 0.052 0.478 0.016 0.004 0.009 0.063 0.010 0.368 92 Y 0.089 0.665 0.018 0.003 0.008 0.055 0.010 0.152 93 D 0.040 0.778 0.013 0.003 0.005 0.033 0.005 0.124 94 A 0.037 0.801 0.006 0.002 0.003 0.020 0.004 0.127 95 M 0.048 0.834 0.005 0.001 0.002 0.021 0.006 0.083 96 F 0.061 0.814 0.013 0.002 0.004 0.021 0.011 0.073 97 E 0.027 0.773 0.013 0.002 0.003 0.019 0.007 0.155 98 D 0.025 0.764 0.006 0.001 0.002 0.027 0.006 0.169 99 I 0.018 0.915 0.003 0.001 0.001 0.011 0.003 0.048 100 R 0.011 0.948 0.004 0.001 0.001 0.008 0.002 0.024 101 A 0.031 0.901 0.005 0.002 0.002 0.010 0.008 0.042 102 K 0.091 0.833 0.005 0.002 0.003 0.003 0.023 0.040 103 L 0.200 0.700 0.009 0.005 0.004 0.005 0.037 0.041 104 H 0.162 0.255 0.122 0.042 0.022 0.026 0.079 0.292 105 A 0.081 0.092 0.286 0.047 0.044 0.055 0.042 0.353 106 H 0.102 0.039 0.115 0.057 0.050 0.105 0.012 0.520 107 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 108 G 0.017 0.004 0.063 0.014 0.034 0.092 0.006 0.770 109 E 0.554 0.005 0.054 0.027 0.023 0.050 0.007 0.279 110 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 111 V 0.034 0.002 0.143 0.098 0.223 0.118 0.003 0.379 112 D 0.035 0.007 0.029 0.029 0.031 0.325 0.004 0.541 113 L 0.018 0.010 0.056 0.012 0.088 0.022 0.002 0.792 114 E 0.005 0.007 0.008 0.005 0.007 0.611 0.003 0.353 115 R 0.309 0.008 0.008 0.007 0.006 0.473 0.049 0.140 116 I 0.180 0.577 0.013 0.016 0.021 0.051 0.006 0.136 117 I 0.064 0.484 0.035 0.047 0.096 0.065 0.007 0.201 118 R 0.063 0.337 0.025 0.048 0.091 0.060 0.023 0.352 119 H 0.168 0.198 0.024 0.054 0.113 0.037 0.055 0.352 120 E 0.090 0.084 0.021 0.035 0.043 0.053 0.029 0.646