# TARGET T0482 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t04-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor2-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 o_notor2 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0482.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 5.74721 # Pos AA G H I P A B S F J M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.005 0.020 0.004 0.046 0.041 0.069 0.186 0.002 0.001 0.026 0.599 2 F 0.024 0.068 0.010 0.030 0.086 0.063 0.102 0.014 0.003 0.048 0.552 3 E 0.490 0.103 0.004 0.021 0.051 0.050 0.060 0.022 0.002 0.067 0.130 4 P 0.042 0.090 0.003 0.034 0.036 0.036 0.089 0.004 0.001 0.044 0.622 5 G 0.036 0.158 0.004 0.082 0.066 0.135 0.099 0.007 0.001 0.051 0.361 6 H 0.062 0.126 0.004 0.082 0.097 0.228 0.054 0.012 0.001 0.070 0.264 7 L 0.019 0.037 0.007 0.074 0.238 0.163 0.080 0.006 0.001 0.093 0.282 8 H 0.043 0.027 0.004 0.077 0.178 0.291 0.062 0.009 0.001 0.054 0.252 9 L 0.100 0.010 0.003 0.105 0.121 0.123 0.063 0.007 0.002 0.074 0.393 10 V 0.018 0.004 0.004 0.083 0.095 0.094 0.134 0.002 0.002 0.023 0.541 11 S 0.043 0.012 0.002 0.023 0.024 0.049 0.104 0.006 0.001 0.014 0.723 12 L 0.437 0.012 0.002 0.016 0.023 0.025 0.069 0.019 0.001 0.024 0.372 13 P 0.140 0.012 0.001 0.015 0.017 0.020 0.125 0.004 0.001 0.016 0.649 14 G 0.090 0.011 0.001 0.024 0.013 0.039 0.099 0.004 0.001 0.025 0.693 15 L 0.065 0.005 0.003 0.024 0.036 0.040 0.157 0.005 0.001 0.033 0.630 16 D 0.133 0.009 0.003 0.021 0.039 0.059 0.103 0.005 0.001 0.031 0.597 17 Q 0.120 0.003 0.001 0.013 0.029 0.037 0.093 0.003 0.001 0.032 0.669 18 Q 0.028 0.003 0.001 0.025 0.072 0.089 0.146 0.001 0.001 0.031 0.604 19 D 0.007 0.002 0.001 0.034 0.049 0.133 0.134 0.001 0.001 0.038 0.602 20 I 0.003 0.002 0.001 0.115 0.242 0.298 0.089 0.001 0.001 0.029 0.220 21 N 0.001 0.001 0.001 0.087 0.184 0.468 0.052 0.001 0.001 0.041 0.166 22 I 0.001 0.003 0.001 0.154 0.434 0.269 0.029 0.001 0.001 0.019 0.092 23 H 0.002 0.003 0.001 0.138 0.226 0.519 0.018 0.001 0.001 0.031 0.063 24 I 0.006 0.014 0.001 0.094 0.334 0.377 0.023 0.001 0.001 0.026 0.124 25 R 0.005 0.009 0.001 0.077 0.238 0.481 0.023 0.001 0.001 0.026 0.142 26 Y 0.004 0.015 0.001 0.054 0.269 0.454 0.029 0.001 0.001 0.053 0.121 27 E 0.006 0.008 0.001 0.045 0.281 0.438 0.025 0.001 0.001 0.058 0.137 28 V 0.020 0.015 0.001 0.046 0.238 0.258 0.043 0.001 0.001 0.079 0.299 29 R 0.015 0.011 0.001 0.066 0.190 0.260 0.070 0.001 0.001 0.044 0.341 30 Q 0.010 0.008 0.001 0.022 0.056 0.093 0.104 0.001 0.001 0.074 0.630 31 N 0.239 0.056 0.010 0.012 0.043 0.053 0.116 0.008 0.005 0.141 0.316 32 A 0.365 0.025 0.004 0.005 0.011 0.015 0.077 0.004 0.001 0.055 0.437 33 E 0.136 0.018 0.002 0.008 0.008 0.012 0.100 0.003 0.001 0.046 0.668 34 S 0.029 0.013 0.001 0.008 0.015 0.039 0.135 0.002 0.001 0.030 0.729 35 G 0.010 0.015 0.002 0.021 0.066 0.103 0.191 0.001 0.001 0.054 0.537 36 A 0.008 0.010 0.001 0.067 0.216 0.458 0.069 0.001 0.001 0.038 0.131 37 Y 0.005 0.005 0.001 0.055 0.316 0.366 0.049 0.001 0.001 0.035 0.167 38 V 0.005 0.005 0.001 0.136 0.360 0.368 0.027 0.001 0.001 0.019 0.080 39 H 0.002 0.002 0.001 0.149 0.212 0.453 0.037 0.001 0.001 0.030 0.115 40 F 0.003 0.004 0.002 0.132 0.315 0.396 0.036 0.001 0.001 0.017 0.093 41 D 0.059 0.004 0.001 0.090 0.204 0.423 0.035 0.005 0.001 0.031 0.147 42 M 0.129 0.008 0.001 0.126 0.154 0.170 0.078 0.003 0.001 0.033 0.299 43 D 0.006 0.002 0.001 0.145 0.082 0.159 0.107 0.001 0.001 0.026 0.472 44 G 0.009 0.002 0.002 0.098 0.117 0.242 0.165 0.001 0.001 0.033 0.331 45 E 0.168 0.001 0.001 0.042 0.084 0.274 0.041 0.004 0.001 0.022 0.364 46 I 0.141 0.001 0.001 0.019 0.035 0.035 0.045 0.001 0.001 0.013 0.712 47 D 0.003 0.001 0.001 0.019 0.023 0.032 0.074 0.001 0.001 0.003 0.845 48 G 0.002 0.001 0.001 0.007 0.016 0.042 0.153 0.001 0.001 0.011 0.768 49 K 0.026 0.002 0.001 0.046 0.147 0.142 0.100 0.001 0.001 0.038 0.499 50 P 0.020 0.004 0.001 0.025 0.066 0.095 0.129 0.001 0.001 0.027 0.634 51 F 0.049 0.024 0.001 0.029 0.057 0.107 0.074 0.001 0.001 0.027 0.632 52 S 0.205 0.031 0.001 0.043 0.058 0.115 0.069 0.002 0.001 0.050 0.426 53 D 0.089 0.053 0.001 0.025 0.053 0.127 0.082 0.002 0.001 0.037 0.531 54 S 0.015 0.012 0.001 0.016 0.070 0.120 0.082 0.001 0.001 0.041 0.644 55 F 0.013 0.017 0.001 0.052 0.144 0.249 0.088 0.002 0.001 0.059 0.375 56 E 0.008 0.048 0.001 0.049 0.121 0.114 0.104 0.001 0.001 0.042 0.513 57 L 0.023 0.054 0.001 0.032 0.097 0.086 0.093 0.005 0.001 0.211 0.396 58 P 0.079 0.329 0.004 0.031 0.036 0.031 0.070 0.006 0.002 0.163 0.249 59 R 0.080 0.527 0.002 0.018 0.011 0.015 0.049 0.003 0.001 0.064 0.230 60 D 0.041 0.234 0.003 0.018 0.012 0.022 0.047 0.006 0.001 0.282 0.334 61 T 0.043 0.444 0.008 0.027 0.016 0.025 0.052 0.007 0.003 0.200 0.175 62 A 0.026 0.659 0.003 0.015 0.011 0.013 0.046 0.003 0.001 0.056 0.168 63 F 0.026 0.180 0.002 0.024 0.018 0.015 0.043 0.007 0.001 0.507 0.177 64 N 0.021 0.394 0.009 0.014 0.014 0.013 0.035 0.006 0.007 0.325 0.163 65 F 0.036 0.820 0.005 0.006 0.005 0.003 0.009 0.003 0.002 0.036 0.074 66 A 0.076 0.104 0.003 0.009 0.005 0.007 0.029 0.011 0.003 0.614 0.140 67 S 0.015 0.579 0.010 0.005 0.005 0.005 0.038 0.004 0.007 0.152 0.178 68 D 0.015 0.930 0.002 0.001 0.001 0.001 0.004 0.002 0.002 0.008 0.035 69 A 0.005 0.974 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.004 0.013 70 T 0.005 0.943 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.002 0.001 0.022 0.019 71 R 0.004 0.955 0.003 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.023 0.009 72 V 0.015 0.782 0.044 0.004 0.003 0.002 0.008 0.003 0.008 0.101 0.029 73 A 0.117 0.140 0.270 0.009 0.006 0.013 0.024 0.027 0.106 0.182 0.103 74 Q 0.589 0.060 0.030 0.006 0.004 0.008 0.030 0.015 0.026 0.029 0.203 75 K 0.108 0.007 0.002 0.012 0.006 0.007 0.040 0.007 0.002 0.021 0.787 76 H 0.013 0.004 0.001 0.030 0.007 0.010 0.169 0.002 0.001 0.023 0.739 77 G 0.013 0.003 0.001 0.036 0.009 0.026 0.163 0.003 0.001 0.027 0.717 78 L 0.022 0.014 0.002 0.021 0.014 0.007 0.194 0.004 0.001 0.018 0.704 79 H 0.271 0.023 0.002 0.053 0.012 0.029 0.109 0.011 0.001 0.071 0.418 80 P 0.093 0.018 0.002 0.035 0.008 0.009 0.074 0.003 0.001 0.028 0.729 81 K 0.065 0.055 0.001 0.041 0.009 0.015 0.063 0.004 0.001 0.025 0.723 82 F 0.047 0.025 0.001 0.023 0.010 0.019 0.123 0.004 0.001 0.118 0.631 83 G 0.021 0.107 0.003 0.065 0.041 0.041 0.101 0.004 0.001 0.107 0.510 84 A 0.047 0.240 0.002 0.036 0.036 0.049 0.066 0.006 0.001 0.062 0.456 85 I 0.069 0.375 0.004 0.029 0.042 0.038 0.049 0.011 0.001 0.070 0.312 86 T 0.067 0.339 0.004 0.028 0.030 0.049 0.053 0.006 0.002 0.075 0.346 87 R 0.051 0.516 0.005 0.016 0.019 0.023 0.042 0.004 0.002 0.058 0.264 88 V 0.038 0.496 0.007 0.010 0.015 0.014 0.052 0.008 0.003 0.060 0.296 89 H 0.069 0.634 0.008 0.006 0.008 0.010 0.037 0.010 0.004 0.067 0.147 90 K 0.080 0.727 0.004 0.004 0.005 0.006 0.017 0.006 0.002 0.029 0.121 91 E 0.024 0.688 0.004 0.004 0.005 0.004 0.020 0.006 0.002 0.039 0.204 92 Y 0.038 0.695 0.009 0.006 0.005 0.007 0.024 0.013 0.006 0.057 0.140 93 D 0.066 0.720 0.004 0.003 0.003 0.004 0.017 0.008 0.003 0.052 0.120 94 A 0.035 0.668 0.006 0.004 0.005 0.004 0.020 0.012 0.005 0.069 0.173 95 M 0.012 0.892 0.003 0.001 0.001 0.001 0.006 0.004 0.003 0.013 0.062 96 F 0.026 0.917 0.003 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.002 0.015 0.029 97 E 0.024 0.786 0.009 0.002 0.002 0.002 0.013 0.007 0.005 0.073 0.078 98 D 0.013 0.907 0.006 0.001 0.001 0.001 0.009 0.002 0.003 0.026 0.031 99 I 0.080 0.701 0.019 0.003 0.003 0.002 0.016 0.009 0.007 0.082 0.078 100 R 0.133 0.314 0.062 0.010 0.007 0.010 0.035 0.014 0.023 0.163 0.229 101 A 0.273 0.068 0.021 0.014 0.008 0.023 0.077 0.014 0.012 0.109 0.382 102 K 0.073 0.008 0.004 0.021 0.012 0.017 0.070 0.006 0.002 0.065 0.724 103 L 0.015 0.001 0.001 0.070 0.022 0.020 0.131 0.001 0.001 0.058 0.679 104 H 0.007 0.001 0.001 0.049 0.018 0.048 0.243 0.001 0.001 0.026 0.606 105 A 0.024 0.001 0.001 0.022 0.012 0.014 0.078 0.001 0.001 0.011 0.835 106 H 0.412 0.001 0.001 0.039 0.011 0.023 0.079 0.002 0.001 0.045 0.387 107 P 0.009 0.001 0.001 0.018 0.004 0.008 0.102 0.001 0.001 0.008 0.850 108 G 0.011 0.001 0.001 0.028 0.011 0.021 0.102 0.001 0.001 0.020 0.806 109 E 0.039 0.001 0.001 0.102 0.039 0.072 0.090 0.001 0.001 0.023 0.632 110 P 0.001 0.001 0.001 0.088 0.027 0.034 0.184 0.001 0.001 0.012 0.653 111 V 0.004 0.024 0.001 0.056 0.042 0.048 0.227 0.002 0.001 0.011 0.584 112 D 0.275 0.673 0.001 0.004 0.003 0.003 0.004 0.010 0.001 0.003 0.025 113 L 0.407 0.560 0.001 0.002 0.001 0.001 0.002 0.004 0.001 0.004 0.019 114 E 0.029 0.673 0.001 0.008 0.006 0.014 0.024 0.003 0.001 0.041 0.203 115 R 0.117 0.280 0.016 0.031 0.025 0.080 0.047 0.013 0.005 0.238 0.149 116 I 0.172 0.031 0.037 0.024 0.080 0.084 0.082 0.018 0.009 0.174 0.289 117 I 0.171 0.006 0.005 0.013 0.051 0.046 0.054 0.007 0.002 0.039 0.606 118 R 0.077 0.001 0.001 0.007 0.018 0.016 0.042 0.002 0.001 0.013 0.822 119 H 0.012 0.001 0.001 0.005 0.007 0.009 0.096 0.001 0.001 0.011 0.859 120 E 0.007 0.002 0.001 0.005 0.007 0.013 0.158 0.001 0.001 0.016 0.790