# TARGET T0482 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t04-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0482.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 5.74721 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.003 0.002 0.026 0.032 0.063 0.143 0.020 0.711 2 F 0.015 0.005 0.050 0.083 0.117 0.129 0.041 0.559 3 E 0.197 0.032 0.041 0.074 0.080 0.100 0.137 0.338 4 P 0.024 0.006 0.026 0.028 0.036 0.118 0.042 0.719 5 G 0.026 0.033 0.104 0.076 0.220 0.085 0.061 0.396 6 H 0.035 0.021 0.114 0.118 0.250 0.084 0.040 0.338 7 L 0.012 0.003 0.068 0.145 0.142 0.100 0.062 0.468 8 H 0.037 0.017 0.075 0.236 0.301 0.052 0.083 0.197 9 L 0.153 0.005 0.043 0.048 0.129 0.073 0.047 0.501 10 V 0.009 0.005 0.065 0.139 0.128 0.128 0.029 0.497 11 S 0.052 0.010 0.014 0.032 0.066 0.110 0.015 0.701 12 L 0.241 0.026 0.012 0.055 0.038 0.077 0.069 0.481 13 P 0.069 0.017 0.021 0.027 0.037 0.079 0.034 0.716 14 G 0.043 0.007 0.018 0.021 0.049 0.089 0.027 0.747 15 L 0.055 0.003 0.038 0.040 0.049 0.112 0.039 0.663 16 D 0.155 0.004 0.013 0.028 0.035 0.065 0.027 0.672 17 Q 0.126 0.002 0.016 0.008 0.021 0.090 0.045 0.693 18 Q 0.028 0.002 0.026 0.020 0.032 0.120 0.036 0.736 19 D 0.013 0.001 0.025 0.017 0.046 0.144 0.031 0.723 20 I 0.007 0.004 0.100 0.111 0.167 0.145 0.045 0.423 21 N 0.007 0.004 0.067 0.108 0.196 0.113 0.043 0.462 22 I 0.003 0.004 0.210 0.215 0.266 0.064 0.063 0.176 23 H 0.005 0.006 0.193 0.255 0.325 0.037 0.059 0.119 24 I 0.006 0.006 0.153 0.306 0.328 0.034 0.067 0.101 25 R 0.005 0.009 0.094 0.396 0.307 0.032 0.042 0.116 26 Y 0.009 0.013 0.066 0.343 0.355 0.037 0.040 0.137 27 E 0.022 0.028 0.064 0.264 0.401 0.036 0.055 0.130 28 V 0.055 0.009 0.019 0.165 0.168 0.097 0.023 0.465 29 R 0.024 0.010 0.030 0.127 0.280 0.127 0.051 0.351 30 Q 0.010 0.007 0.023 0.035 0.087 0.085 0.022 0.733 31 N 0.258 0.037 0.012 0.026 0.025 0.057 0.287 0.296 32 A 0.280 0.015 0.005 0.013 0.009 0.065 0.085 0.528 33 E 0.083 0.009 0.018 0.006 0.023 0.073 0.036 0.754 34 S 0.031 0.006 0.013 0.015 0.031 0.124 0.024 0.757 35 G 0.016 0.003 0.009 0.032 0.053 0.130 0.028 0.728 36 A 0.012 0.009 0.067 0.193 0.297 0.088 0.080 0.255 37 Y 0.016 0.004 0.055 0.073 0.290 0.069 0.038 0.454 38 V 0.004 0.002 0.101 0.340 0.379 0.038 0.027 0.109 39 H 0.005 0.001 0.066 0.229 0.452 0.041 0.017 0.189 40 F 0.008 0.002 0.101 0.328 0.403 0.024 0.047 0.087 41 D 0.052 0.003 0.052 0.202 0.265 0.058 0.055 0.313 42 M 0.046 0.005 0.077 0.178 0.352 0.055 0.046 0.241 43 D 0.008 0.001 0.015 0.171 0.262 0.059 0.013 0.471 44 G 0.005 0.001 0.044 0.200 0.362 0.054 0.029 0.305 45 E 0.054 0.001 0.032 0.387 0.220 0.042 0.034 0.230 46 I 0.212 0.001 0.022 0.042 0.116 0.055 0.030 0.523 47 D 0.018 0.001 0.040 0.080 0.119 0.098 0.012 0.632 48 G 0.004 0.001 0.001 0.007 0.012 0.063 0.002 0.911 49 K 0.010 0.002 0.028 0.276 0.179 0.100 0.044 0.362 50 P 0.096 0.002 0.007 0.031 0.049 0.074 0.023 0.719 51 F 0.097 0.005 0.022 0.173 0.068 0.096 0.054 0.485 52 S 0.217 0.007 0.016 0.033 0.063 0.070 0.020 0.574 53 D 0.081 0.011 0.039 0.097 0.183 0.073 0.035 0.480 54 S 0.021 0.002 0.026 0.041 0.100 0.109 0.027 0.673 55 F 0.006 0.006 0.052 0.192 0.254 0.106 0.021 0.363 56 E 0.025 0.017 0.059 0.068 0.188 0.101 0.021 0.521 57 L 0.030 0.011 0.066 0.110 0.070 0.127 0.171 0.415 58 P 0.038 0.195 0.064 0.064 0.068 0.101 0.154 0.316 59 R 0.167 0.421 0.030 0.008 0.020 0.041 0.077 0.237 60 D 0.032 0.320 0.033 0.028 0.011 0.048 0.343 0.186 61 T 0.013 0.654 0.020 0.022 0.039 0.035 0.059 0.158 62 A 0.074 0.810 0.012 0.003 0.020 0.010 0.021 0.050 63 F 0.023 0.397 0.026 0.035 0.023 0.042 0.342 0.112 64 N 0.011 0.676 0.014 0.019 0.026 0.030 0.160 0.064 65 F 0.072 0.808 0.009 0.002 0.006 0.012 0.053 0.037 66 A 0.043 0.119 0.012 0.006 0.003 0.035 0.709 0.073 67 S 0.010 0.623 0.008 0.006 0.005 0.054 0.128 0.167 68 D 0.024 0.826 0.007 0.001 0.002 0.017 0.040 0.084 69 A 0.004 0.950 0.001 0.001 0.001 0.005 0.018 0.020 70 T 0.002 0.961 0.001 0.001 0.001 0.003 0.018 0.014 71 R 0.011 0.913 0.004 0.002 0.002 0.004 0.044 0.020 72 V 0.061 0.501 0.030 0.007 0.011 0.015 0.311 0.066 73 A 0.098 0.204 0.137 0.031 0.014 0.061 0.270 0.185 74 Q 0.545 0.045 0.016 0.004 0.008 0.038 0.060 0.284 75 K 0.072 0.014 0.026 0.004 0.006 0.089 0.026 0.763 76 H 0.018 0.010 0.036 0.005 0.009 0.116 0.017 0.789 77 G 0.013 0.012 0.025 0.011 0.015 0.146 0.024 0.753 78 L 0.031 0.016 0.035 0.011 0.011 0.104 0.020 0.772 79 H 0.333 0.057 0.021 0.014 0.010 0.065 0.113 0.387 80 P 0.138 0.033 0.025 0.005 0.006 0.080 0.034 0.679 81 K 0.199 0.082 0.026 0.003 0.011 0.062 0.030 0.586 82 F 0.071 0.036 0.022 0.009 0.015 0.124 0.128 0.596 83 G 0.021 0.123 0.033 0.058 0.040 0.130 0.104 0.491 84 A 0.159 0.227 0.025 0.015 0.052 0.070 0.074 0.377 85 I 0.072 0.310 0.030 0.062 0.029 0.076 0.085 0.338 86 T 0.109 0.189 0.025 0.031 0.040 0.093 0.083 0.431 87 R 0.105 0.353 0.036 0.018 0.034 0.058 0.078 0.318 88 V 0.073 0.386 0.021 0.011 0.018 0.056 0.105 0.330 89 H 0.060 0.611 0.010 0.018 0.009 0.039 0.102 0.152 90 K 0.069 0.747 0.003 0.004 0.005 0.017 0.023 0.132 91 E 0.056 0.811 0.007 0.002 0.004 0.013 0.032 0.076 92 Y 0.025 0.844 0.005 0.004 0.003 0.013 0.050 0.055 93 D 0.102 0.691 0.008 0.007 0.008 0.021 0.079 0.083 94 A 0.047 0.705 0.016 0.006 0.017 0.025 0.050 0.135 95 M 0.033 0.750 0.012 0.004 0.010 0.023 0.059 0.108 96 F 0.016 0.901 0.003 0.003 0.003 0.009 0.040 0.025 97 E 0.015 0.858 0.005 0.003 0.003 0.011 0.042 0.064 98 D 0.037 0.831 0.004 0.003 0.003 0.008 0.067 0.046 99 I 0.054 0.708 0.016 0.010 0.008 0.021 0.090 0.093 100 R 0.210 0.291 0.051 0.018 0.027 0.047 0.165 0.192 101 A 0.077 0.121 0.027 0.019 0.034 0.077 0.108 0.537 102 K 0.032 0.055 0.087 0.035 0.077 0.104 0.086 0.524 103 L 0.061 0.014 0.090 0.069 0.124 0.105 0.085 0.453 104 H 0.006 0.003 0.078 0.046 0.068 0.140 0.045 0.615 105 A 0.016 0.001 0.058 0.045 0.050 0.085 0.021 0.724 106 H 0.391 0.005 0.078 0.032 0.043 0.061 0.122 0.268 107 P 0.029 0.001 0.042 0.007 0.006 0.116 0.015 0.783 108 G 0.009 0.001 0.028 0.004 0.014 0.089 0.025 0.830 109 E 0.018 0.009 0.232 0.080 0.072 0.122 0.058 0.409 110 P 0.002 0.001 0.007 0.009 0.009 0.080 0.004 0.890 111 V 0.006 0.014 0.108 0.048 0.060 0.105 0.042 0.617 112 D 0.288 0.435 0.018 0.013 0.022 0.027 0.085 0.113 113 L 0.240 0.430 0.010 0.014 0.012 0.037 0.078 0.178 114 E 0.033 0.473 0.021 0.033 0.038 0.039 0.095 0.269 115 R 0.074 0.145 0.065 0.062 0.243 0.042 0.132 0.238 116 I 0.085 0.042 0.124 0.152 0.154 0.069 0.161 0.214 117 I 0.122 0.010 0.036 0.068 0.098 0.081 0.060 0.525 118 R 0.272 0.009 0.011 0.016 0.037 0.056 0.026 0.572 119 H 0.052 0.007 0.012 0.015 0.024 0.091 0.021 0.777 120 E 0.025 0.005 0.011 0.017 0.029 0.122 0.023 0.769