This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATAA F A 3 3 NATAA E A 4 4 NATRO P A 5 5 NATAA G A 6 6 NATAA H A 7 7 NATAA L A 8 8 NATAA H A 9 9 NATAA L A 10 10 NATAA V A 11 11 NATAA S A 12 12 NATAA L A 13 13 NATRO P A 14 14 NATAA G A 15 15 NATAA L A 16 16 NATAA D A 17 17 NATAA Q A 18 18 NATAA Q A 19 19 NATAA D A 20 20 NATAA I A 21 21 NATAA N A 22 22 NATAA I A 23 23 NATAA H A 24 24 NATAA I A 25 25 NATAA R A 26 26 NATAA Y A 27 27 NATAA E A 28 28 NATAA V A 29 29 NATAA R A 30 30 NATAA Q A 31 31 NATAA N A 32 32 NATAA A A 33 33 NATAA E A 34 34 NATAA S A 35 35 NATAA G A 36 36 NATAA A A 37 37 NATAA Y A 38 38 NATAA V A 39 39 NATAA H A 40 40 NATAA F A 41 41 NATAA D A 42 42 NATAA M A 43 43 NATAA D A 44 44 NATAA G A 45 45 NATAA E A 46 46 NATAA I A 47 47 NATAA D A 48 48 NATAA G A 49 49 NATAA K A 50 50 NATRO P A 51 51 NATAA F A 52 52 NATAA S A 53 53 NATAA D A 54 54 NATAA S A 55 55 NATAA F A 56 56 NATAA E A 57 57 NATAA L A 58 58 NATRO P A 59 59 NATAA R A 60 60 NATAA D A 61 61 NATAA T A 62 62 NATAA A A 63 63 NATAA F A 64 64 NATAA N A 65 65 NATAA F A 66 66 NATAA A A 67 67 NATAA S A 68 68 NATAA D A 69 69 NATAA A A 70 70 NATAA T A 71 71 NATAA R A 72 72 NATAA V A 73 73 NATAA A A 74 74 NATAA Q A 75 75 NATAA K A 76 76 NATAA H A 77 77 NATAA G A 78 78 NATAA L A 79 79 NATAA H A 80 80 NATRO P A 81 81 NATAA K A 82 82 NATAA F A 83 83 NATAA G A 84 84 NATAA A A 85 85 NATAA I A 86 86 NATAA T A 87 87 NATAA R A 88 88 NATAA V A 89 89 NATAA H A 90 90 NATAA K A 91 91 NATAA E A 92 92 NATAA Y A 93 93 NATAA D A 94 94 NATAA A A 95 95 NATAA M A 96 96 NATAA F A 97 97 NATAA E A 98 98 NATAA D A 99 99 NATAA I A 100 100 NATAA R A 101 101 NATAA A A 102 102 NATAA K A 103 103 NATAA L A 104 104 NATAA H A 105 105 NATAA A A 106 106 NATAA H A 107 107 NATRO P A 108 108 NATAA G A 109 109 NATAA E A 110 110 NATRO P A 111 111 NATAA V A 112 112 NATAA D A 113 113 NATAA L A 114 114 NATAA E A 115 115 NATAA R A 116 116 NATAA I A 117 117 NATAA I A 118 118 NATAA R A 119 119 NATAA H A 120 120 NATAA E