This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATRO C A 3 3 NATAA Q A 4 4 NATAA S A 5 5 NATAA N A 6 6 NATAA Q A 7 7 NATAA I A 8 8 NATAA V A 9 9 NATAA S A 10 10 NATAA H A 11 11 NATAA F A 12 12 NATAA L A 13 13 NATAA S A 14 14 NATAA H A 15 15 NATAA R A 16 16 NATAA N A 17 17 NATAA V A 18 18 NATAA T A 19 19 NATAA N A 20 20 NATAA E A 21 21 NATAA L A 22 22 NATAA A A 23 23 NATAA E A 24 24 NATAA K A 25 25 NATAA I A 26 26 NATAA S A 27 27 NATAA K A 28 28 NATAA D A 29 29 NATAA H A 30 30 NATAA Y A 31 31 NATAA S A 32 32 NATAA Y A 33 33 NATAA K A 34 34 NATRO P A 35 35 NATAA A A 36 36 NATAA E A 37 37 NATAA T A 38 38 NATAA S A 39 39 NATAA M A 40 40 NATAA S A 41 41 NATAA A A 42 42 NATAA E A 43 43 NATAA E A 44 44 NATAA L A 45 45 NATAA V A 46 46 NATAA K A 47 47 NATAA H A 48 48 NATAA I A 49 49 NATAA L A 50 50 NATAA T A 51 51 NATAA S A 52 52 NATAA F A 53 53 NATAA H A 54 54 NATAA L A 55 55 NATAA F A 56 56 NATAA A A 57 57 NATAA N A 58 58 NATAA V A 59 59 NATAA I A 60 60 NATAA K A 61 61 NATAA E A 62 62 NATAA G A 63 63 NATAA N A 64 64 NATAA A A 65 65 NATAA S A 66 66 NATRO P A 67 67 NATAA F A 68 68 NATAA Q A 69 69 NATAA N A 70 70 NATAA K A 71 71 NATAA Q A 72 72 NATAA E A 73 73 NATAA E A 74 74 NATAA T A 75 75 NATAA E A 76 76 NATAA T A 77 77 NATAA D A 78 78 NATAA L A 79 79 NATAA N A 80 80 NATAA V A 81 81 NATAA L A 82 82 NATAA A A 83 83 NATAA K A 84 84 NATAA T A 85 85 NATAA Y A 86 86 NATAA T A 87 87 NATAA E A 88 88 NATAA K A 89 89 NATAA T A 90 90 NATAA V A 91 91 NATAA A A 92 92 NATAA I A 93 93 NATAA L A 94 94 NATAA E A 95 95 NATAA Q A 96 96 NATAA L A 97 97 NATAA T A 98 98 NATAA E A 99 99 NATAA E A 100 100 NATAA Q A 101 101 NATAA L A 102 102 NATAA D A 103 103 NATAA R A 104 104 NATAA E A 105 105 NATAA I A 106 106 NATAA D A 107 107 NATAA L A 108 108 NATAA T A 109 109 NATAA S A 110 110 NATAA A A 111 111 NATAA F A 112 112 NATAA G A 113 113 NATAA R A 114 114 NATAA K A 115 115 NATAA V A 116 116 NATAA T A 117 117 NATAA G A 118 118 NATAA R A 119 119 NATAA A A 120 120 NATAA L A 121 121 NATAA L A 122 122 NATAA Q A 123 123 NATAA L A 124 124 NATAA A A 125 125 NATAA M A 126 126 NATAA E A 127 127 NATAA H A 128 128 NATAA E A 129 129 NATAA I A 130 130 NATAA H A 131 131 NATAA H A 132 132 NATAA K A 133 133 NATAA G A 134 134 NATAA N A 135 135 NATAA L A 136 136 NATAA F A 137 137 NATAA V A 138 138 NATAA Y A 139 139 NATAA V A 140 140 NATAA R A 141 141 NATAA E A 142 142 NATAA M A 143 143 NATAA G A 144 144 NATAA H A 145 145 NATAA T A 146 146 NATAA E A 147 147 NATAA L A 148 148 NATRO P A 149 149 NATAA F A 150 150 NATAA Y A 151 151 NATAA Q A 152 152 NATAA Q A 153 153 NATAA R A 154 154 NATAA M