# TARGET T0478 # Using neural net t04-2621-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0478.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 23.8807 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.084 0.057 0.039 0.075 0.082 0.100 0.143 0.122 0.125 0.100 0.072 2 S 0.229 0.301 0.077 0.156 0.091 0.050 0.041 0.021 0.015 0.010 0.007 3 L 0.109 0.046 0.029 0.072 0.091 0.106 0.153 0.131 0.120 0.085 0.058 4 D 0.405 0.197 0.063 0.123 0.087 0.051 0.039 0.017 0.010 0.006 0.003 5 T 0.152 0.179 0.096 0.208 0.132 0.087 0.071 0.034 0.022 0.013 0.006 6 G 0.218 0.103 0.041 0.123 0.109 0.101 0.115 0.071 0.058 0.039 0.023 7 V 0.019 0.025 0.024 0.051 0.076 0.108 0.198 0.162 0.155 0.110 0.073 8 T 0.029 0.152 0.080 0.142 0.104 0.097 0.136 0.093 0.078 0.053 0.034 9 S 0.056 0.061 0.039 0.168 0.193 0.170 0.150 0.076 0.048 0.025 0.014 10 V 0.325 0.142 0.098 0.140 0.100 0.073 0.065 0.027 0.017 0.008 0.005 11 M 0.052 0.091 0.107 0.308 0.196 0.117 0.083 0.026 0.013 0.005 0.002 12 F 0.005 0.007 0.019 0.021 0.023 0.037 0.123 0.163 0.221 0.221 0.160 13 V 0.005 0.010 0.050 0.095 0.133 0.182 0.255 0.131 0.078 0.042 0.020 14 E 0.031 0.048 0.458 0.225 0.119 0.063 0.036 0.010 0.005 0.002 0.001 15 R 0.009 0.023 0.067 0.132 0.169 0.214 0.248 0.081 0.035 0.015 0.006 16 S 0.013 0.019 0.034 0.033 0.027 0.043 0.145 0.177 0.221 0.186 0.102 17 L 0.013 0.017 0.072 0.079 0.123 0.170 0.239 0.114 0.089 0.056 0.029 18 N 0.065 0.067 0.416 0.165 0.106 0.079 0.067 0.021 0.010 0.004 0.002 19 E 0.006 0.019 0.064 0.084 0.101 0.138 0.267 0.144 0.099 0.058 0.022 20 I 0.018 0.013 0.068 0.027 0.017 0.024 0.096 0.141 0.212 0.228 0.157 21 R 0.008 0.018 0.119 0.165 0.195 0.180 0.158 0.072 0.045 0.026 0.013 22 F 0.010 0.022 0.296 0.070 0.063 0.069 0.174 0.120 0.098 0.055 0.025 23 W 0.001 0.003 0.027 0.038 0.045 0.064 0.209 0.179 0.197 0.158 0.079 24 S 0.007 0.008 0.087 0.028 0.030 0.056 0.199 0.150 0.187 0.153 0.094 25 R 0.010 0.015 0.160 0.168 0.165 0.158 0.169 0.078 0.043 0.024 0.011 26 I 0.003 0.009 0.054 0.021 0.024 0.038 0.173 0.184 0.229 0.177 0.088 27 M 0.003 0.008 0.038 0.031 0.027 0.033 0.110 0.143 0.229 0.227 0.151 28 K 0.015 0.018 0.072 0.080 0.141 0.163 0.235 0.118 0.089 0.045 0.022 29 E 0.009 0.023 0.098 0.073 0.079 0.120 0.242 0.158 0.112 0.061 0.025 30 H 0.001 0.003 0.016 0.018 0.019 0.029 0.130 0.175 0.261 0.229 0.120 31 S 0.008 0.007 0.037 0.020 0.019 0.038 0.125 0.129 0.184 0.214 0.219 32 F 0.005 0.010 0.081 0.114 0.133 0.137 0.209 0.139 0.093 0.053 0.025 33 F 0.001 0.003 0.041 0.019 0.016 0.021 0.078 0.149 0.243 0.250 0.179 34 L 0.001 0.001 0.008 0.008 0.008 0.014 0.068 0.112 0.211 0.270 0.301 35 R 0.002 0.006 0.089 0.082 0.114 0.158 0.241 0.132 0.102 0.049 0.025 36 L 0.002 0.007 0.045 0.049 0.079 0.159 0.292 0.161 0.113 0.066 0.028 37 G 0.013 0.019 0.028 0.042 0.045 0.060 0.182 0.169 0.203 0.153 0.085 38 F 0.005 0.005 0.006 0.011 0.013 0.025 0.090 0.127 0.204 0.258 0.256 39 R 0.085 0.223 0.158 0.252 0.149 0.073 0.042 0.011 0.005 0.002 0.001 40 C 0.079 0.066 0.035 0.069 0.083 0.113 0.220 0.143 0.105 0.060 0.027 41 E 0.651 0.227 0.051 0.045 0.016 0.006 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 42 D 0.106 0.156 0.075 0.152 0.130 0.131 0.134 0.052 0.036 0.019 0.009 43 T 0.402 0.126 0.117 0.128 0.082 0.061 0.051 0.017 0.010 0.004 0.002 44 Q 0.329 0.145 0.228 0.205 0.064 0.020 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 45 L 0.006 0.032 0.056 0.068 0.076 0.157 0.267 0.159 0.101 0.054 0.023 46 I 0.014 0.017 0.128 0.091 0.118 0.199 0.238 0.098 0.061 0.025 0.010 47 E 0.077 0.063 0.766 0.067 0.018 0.006 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 48 E 0.003 0.026 0.353 0.242 0.148 0.121 0.080 0.019 0.006 0.002 0.001 49 A 0.004 0.003 0.088 0.013 0.016 0.034 0.145 0.140 0.218 0.200 0.139 50 N 0.028 0.023 0.425 0.217 0.130 0.098 0.061 0.014 0.004 0.001 0.001 51 Q 0.002 0.019 0.565 0.186 0.131 0.064 0.025 0.006 0.002 0.001 0.001 52 F 0.001 0.003 0.039 0.011 0.016 0.046 0.225 0.188 0.201 0.170 0.101 53 Y 0.003 0.008 0.157 0.097 0.124 0.154 0.288 0.095 0.049 0.019 0.006 54 R 0.012 0.031 0.769 0.113 0.049 0.016 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 55 L 0.001 0.012 0.086 0.076 0.093 0.171 0.294 0.135 0.078 0.040 0.014 56 F 0.001 0.002 0.046 0.008 0.012 0.026 0.181 0.183 0.253 0.178 0.110 57 E 0.025 0.033 0.569 0.192 0.096 0.048 0.027 0.007 0.002 0.001 0.001 58 H 0.002 0.015 0.245 0.247 0.239 0.151 0.075 0.017 0.006 0.002 0.001 59 I 0.001 0.001 0.010 0.002 0.002 0.006 0.053 0.105 0.263 0.314 0.245 60 E 0.001 0.001 0.015 0.043 0.105 0.208 0.378 0.141 0.074 0.027 0.008 61 Q 0.004 0.019 0.766 0.131 0.051 0.020 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 62 I 0.001 0.003 0.011 0.023 0.061 0.202 0.411 0.163 0.078 0.036 0.012 63 A 0.001 0.001 0.007 0.003 0.003 0.006 0.052 0.120 0.229 0.303 0.275 64 H 0.008 0.037 0.195 0.191 0.225 0.151 0.115 0.041 0.019 0.012 0.007 65 S 0.036 0.099 0.370 0.208 0.129 0.074 0.048 0.018 0.011 0.006 0.002 66 Y 0.008 0.010 0.011 0.029 0.058 0.102 0.270 0.177 0.156 0.115 0.064 67 T 0.178 0.154 0.063 0.120 0.104 0.093 0.132 0.063 0.049 0.028 0.016 68 N 0.335 0.174 0.090 0.154 0.091 0.062 0.050 0.019 0.013 0.008 0.003 69 E 0.645 0.099 0.035 0.069 0.043 0.034 0.036 0.016 0.012 0.007 0.004 70 T 0.102 0.149 0.045 0.116 0.111 0.099 0.135 0.096 0.071 0.050 0.025 71 D 0.051 0.425 0.054 0.137 0.099 0.086 0.064 0.034 0.025 0.016 0.008 72 P 0.096 0.082 0.038 0.167 0.245 0.196 0.109 0.038 0.019 0.007 0.003 73 E 0.773 0.132 0.041 0.036 0.012 0.004 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 74 Q 0.005 0.041 0.043 0.284 0.272 0.191 0.119 0.030 0.011 0.003 0.001 75 I 0.002 0.001 0.002 0.003 0.005 0.012 0.070 0.160 0.248 0.278 0.220 76 K 0.014 0.019 0.150 0.302 0.258 0.165 0.073 0.013 0.004 0.001 0.001 77 R 0.005 0.031 0.549 0.235 0.102 0.048 0.022 0.005 0.002 0.001 0.001 78 F 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.033 0.187 0.194 0.190 0.214 0.173 79 N 0.001 0.003 0.016 0.017 0.035 0.075 0.345 0.251 0.154 0.073 0.031 80 A 0.077 0.069 0.718 0.104 0.024 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 81 E 0.006 0.027 0.172 0.208 0.228 0.208 0.124 0.019 0.005 0.002 0.001 82 V 0.001 0.001 0.007 0.001 0.002 0.005 0.054 0.114 0.280 0.296 0.241 83 Q 0.001 0.002 0.039 0.095 0.185 0.334 0.257 0.058 0.021 0.007 0.002 84 Q 0.006 0.018 0.791 0.132 0.039 0.011 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 85 A 0.001 0.001 0.012 0.008 0.020 0.085 0.369 0.213 0.155 0.093 0.045 86 A 0.001 0.001 0.006 0.002 0.002 0.006 0.070 0.132 0.238 0.281 0.263 87 T 0.002 0.010 0.520 0.203 0.149 0.073 0.030 0.008 0.003 0.001 0.001 88 N 0.001 0.016 0.312 0.166 0.214 0.171 0.090 0.019 0.007 0.003 0.001 89 I 0.001 0.001 0.007 0.002 0.002 0.004 0.038 0.086 0.237 0.317 0.304 90 W 0.003 0.005 0.016 0.033 0.067 0.153 0.364 0.170 0.109 0.056 0.025 91 G 0.023 0.042 0.655 0.144 0.069 0.033 0.021 0.007 0.003 0.001 0.001 92 F 0.001 0.008 0.031 0.038 0.063 0.139 0.318 0.166 0.114 0.079 0.043 93 K 0.003 0.004 0.020 0.013 0.013 0.021 0.104 0.162 0.255 0.235 0.170 94 R 0.023 0.032 0.150 0.231 0.219 0.182 0.108 0.031 0.015 0.006 0.002 95 K 0.041 0.064 0.419 0.214 0.129 0.080 0.041 0.008 0.003 0.001 0.001 96 I 0.005 0.006 0.049 0.029 0.029 0.046 0.158 0.155 0.204 0.187 0.131 97 L 0.003 0.004 0.024 0.023 0.029 0.057 0.225 0.199 0.179 0.150 0.107 98 G 0.014 0.048 0.556 0.223 0.104 0.035 0.012 0.004 0.002 0.001 0.001 99 L 0.018 0.032 0.099 0.095 0.141 0.215 0.247 0.083 0.040 0.021 0.009 100 I 0.030 0.042 0.076 0.102 0.089 0.088 0.157 0.125 0.131 0.100 0.059 101 L 0.006 0.008 0.018 0.021 0.031 0.061 0.166 0.152 0.185 0.183 0.167 102 T 0.040 0.139 0.210 0.317 0.171 0.065 0.034 0.013 0.006 0.003 0.002 103 C 0.026 0.023 0.023 0.030 0.042 0.065 0.163 0.162 0.187 0.162 0.117 104 K 0.145 0.220 0.126 0.277 0.133 0.052 0.030 0.008 0.005 0.002 0.001 105 L 0.014 0.010 0.006 0.019 0.024 0.035 0.093 0.119 0.204 0.243 0.233 106 P 0.146 0.220 0.101 0.247 0.135 0.068 0.045 0.017 0.012 0.005 0.003 107 G 0.247 0.133 0.051 0.101 0.077 0.079 0.119 0.072 0.060 0.038 0.023 108 Q 0.248 0.143 0.044 0.157 0.116 0.101 0.083 0.044 0.032 0.020 0.013 109 N 0.120 0.141 0.048 0.168 0.149 0.121 0.100 0.059 0.047 0.029 0.020 110 N 0.047 0.070 0.022 0.088 0.096 0.099 0.153 0.130 0.129 0.095 0.072 111 F 0.024 0.020 0.008 0.052 0.085 0.103 0.212 0.188 0.158 0.101 0.048 112 P 0.041 0.042 0.032 0.107 0.144 0.170 0.170 0.104 0.096 0.060 0.035 113 L 0.013 0.017 0.026 0.079 0.097 0.129 0.229 0.169 0.122 0.072 0.046 114 L 0.001 0.003 0.007 0.011 0.011 0.021 0.079 0.152 0.240 0.267 0.208 115 V 0.004 0.005 0.021 0.020 0.022 0.037 0.136 0.178 0.222 0.209 0.147 116 D 0.021 0.035 0.178 0.203 0.159 0.121 0.109 0.070 0.050 0.031 0.023 117 H 0.001 0.005 0.017 0.021 0.035 0.074 0.238 0.207 0.183 0.139 0.082 118 T 0.001 0.001 0.004 0.006 0.005 0.006 0.041 0.102 0.241 0.320 0.275 119 S 0.002 0.005 0.033 0.043 0.096 0.209 0.331 0.117 0.089 0.048 0.029 120 R 0.026 0.035 0.334 0.237 0.161 0.096 0.071 0.023 0.010 0.004 0.002 121 E 0.001 0.001 0.003 0.009 0.014 0.041 0.195 0.232 0.231 0.182 0.091 122 A 0.001 0.001 0.007 0.005 0.007 0.014 0.079 0.126 0.233 0.268 0.260 123 D 0.049 0.039 0.365 0.228 0.153 0.084 0.055 0.016 0.006 0.002 0.001 124 Y 0.002 0.017 0.095 0.168 0.195 0.239 0.202 0.056 0.019 0.006 0.001 125 F 0.001 0.001 0.003 0.002 0.002 0.005 0.047 0.110 0.245 0.329 0.258 126 R 0.001 0.001 0.008 0.034 0.085 0.212 0.392 0.145 0.072 0.033 0.016 127 K 0.010 0.028 0.659 0.188 0.078 0.025 0.009 0.003 0.001 0.001 0.001 128 R 0.001 0.002 0.006 0.023 0.051 0.147 0.363 0.200 0.123 0.064 0.021 129 L 0.001 0.001 0.006 0.003 0.003 0.005 0.042 0.105 0.220 0.285 0.331 130 I 0.002 0.011 0.263 0.186 0.226 0.158 0.106 0.030 0.011 0.005 0.002 131 Q 0.004 0.035 0.398 0.211 0.167 0.110 0.056 0.012 0.004 0.002 0.001 132 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.017 0.104 0.146 0.244 0.268 0.212 133 N 0.079 0.083 0.050 0.120 0.128 0.137 0.198 0.098 0.063 0.028 0.016 134 E 0.291 0.235 0.222 0.159 0.059 0.021 0.009 0.002 0.001 0.001 0.001 135 G 0.236 0.132 0.066 0.126 0.109 0.112 0.113 0.050 0.029 0.019 0.010 136 K 0.246 0.276 0.091 0.165 0.092 0.052 0.043 0.016 0.010 0.006 0.004 137 L 0.057 0.035 0.023 0.052 0.065 0.086 0.167 0.139 0.160 0.128 0.088 138 D 0.196 0.188 0.102 0.174 0.105 0.075 0.075 0.035 0.026 0.015 0.008 139 A 0.324 0.132 0.074 0.107 0.080 0.067 0.083 0.051 0.038 0.027 0.017 140 L 0.086 0.089 0.033 0.097 0.104 0.125 0.151 0.104 0.091 0.073 0.046 141 P 0.215 0.196 0.066 0.132 0.103 0.088 0.075 0.046 0.039 0.025 0.014 142 D 0.298 0.140 0.069 0.185 0.125 0.074 0.057 0.024 0.016 0.008 0.004 143 A 0.374 0.140 0.086 0.135 0.078 0.056 0.059 0.029 0.023 0.013 0.008 144 I 0.036 0.027 0.028 0.087 0.089 0.126 0.210 0.146 0.128 0.077 0.046 145 I 0.016 0.019 0.037 0.070 0.091 0.136 0.231 0.162 0.128 0.074 0.037 146 K 0.023 0.062 0.269 0.234 0.162 0.117 0.076 0.030 0.017 0.007 0.003 147 E 0.011 0.025 0.072 0.101 0.138 0.168 0.220 0.120 0.083 0.043 0.019 148 N 0.008 0.014 0.024 0.056 0.065 0.103 0.207 0.185 0.165 0.116 0.058 149 V 0.006 0.010 0.036 0.055 0.076 0.123 0.237 0.171 0.151 0.092 0.043 150 F 0.008 0.013 0.106 0.055 0.049 0.054 0.141 0.147 0.165 0.138 0.123 151 F 0.001 0.003 0.016 0.023 0.025 0.040 0.145 0.185 0.223 0.207 0.132 152 L 0.001 0.003 0.028 0.021 0.025 0.043 0.144 0.164 0.237 0.200 0.134 153 R 0.018 0.016 0.136 0.117 0.135 0.162 0.212 0.094 0.060 0.032 0.017 154 I 0.002 0.011 0.057 0.073 0.096 0.139 0.263 0.151 0.108 0.067 0.034 155 M 0.001 0.002 0.010 0.009 0.009 0.017 0.086 0.137 0.254 0.269 0.206 156 A 0.016 0.015 0.069 0.080 0.117 0.178 0.272 0.113 0.081 0.039 0.019 157 D 0.045 0.046 0.353 0.226 0.141 0.091 0.068 0.019 0.007 0.003 0.002 158 H 0.001 0.003 0.024 0.024 0.029 0.048 0.157 0.174 0.227 0.200 0.114 159 A 0.002 0.001 0.017 0.007 0.007 0.016 0.089 0.136 0.225 0.251 0.248 160 K 0.010 0.017 0.244 0.258 0.207 0.133 0.074 0.030 0.015 0.008 0.004 161 F 0.002 0.010 0.060 0.043 0.085 0.170 0.315 0.150 0.093 0.051 0.022 162 I 0.002 0.003 0.014 0.011 0.008 0.009 0.043 0.089 0.211 0.280 0.330 163 G 0.018 0.017 0.024 0.040 0.068 0.131 0.276 0.158 0.124 0.087 0.058 164 H 0.041 0.065 0.200 0.181 0.138 0.114 0.108 0.068 0.046 0.026 0.012 165 L 0.032 0.031 0.042 0.047 0.069 0.101 0.213 0.160 0.137 0.106 0.061 166 L 0.011 0.014 0.016 0.019 0.014 0.020 0.059 0.090 0.172 0.252 0.332 167 D 0.013 0.065 0.057 0.118 0.144 0.144 0.196 0.111 0.086 0.044 0.023 168 P 0.441 0.148 0.123 0.102 0.056 0.044 0.046 0.021 0.012 0.006 0.003 169 S 0.065 0.121 0.116 0.179 0.141 0.121 0.134 0.056 0.032 0.020 0.014 170 E 0.002 0.004 0.013 0.018 0.030 0.075 0.248 0.190 0.191 0.132 0.098 171 R 0.147 0.066 0.216 0.287 0.146 0.078 0.043 0.011 0.004 0.001 0.001 172 K 0.043 0.086 0.446 0.270 0.109 0.034 0.010 0.002 0.001 0.001 0.001 173 L 0.001 0.002 0.016 0.008 0.009 0.030 0.148 0.178 0.246 0.213 0.150 174 V 0.001 0.001 0.020 0.034 0.094 0.180 0.382 0.149 0.083 0.039 0.017 175 D 0.033 0.024 0.910 0.028 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 176 T 0.001 0.003 0.051 0.109 0.214 0.317 0.245 0.043 0.012 0.004 0.001 177 A 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.003 0.044 0.102 0.258 0.301 0.282 178 R 0.006 0.011 0.256 0.327 0.233 0.114 0.042 0.007 0.002 0.001 0.001 179 N 0.010 0.029 0.862 0.061 0.027 0.009 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 180 F 0.001 0.001 0.005 0.007 0.015 0.071 0.331 0.215 0.170 0.120 0.067 181 S 0.005 0.009 0.028 0.029 0.060 0.125 0.396 0.175 0.107 0.046 0.019 182 N 0.099 0.104 0.688 0.085 0.019 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 183 D 0.006 0.058 0.123 0.174 0.181 0.213 0.177 0.044 0.016 0.006 0.002 184 F 0.001 0.001 0.007 0.004 0.007 0.018 0.100 0.143 0.263 0.241 0.214 185 D 0.144 0.071 0.297 0.225 0.131 0.085 0.039 0.006 0.002 0.001 0.001 186 E 0.005 0.029 0.401 0.330 0.147 0.062 0.021 0.004 0.001 0.001 0.001 187 L 0.001 0.001 0.006 0.002 0.003 0.012 0.093 0.157 0.244 0.271 0.211 188 M 0.001 0.001 0.014 0.025 0.045 0.119 0.322 0.194 0.141 0.091 0.047 189 Y 0.001 0.008 0.665 0.111 0.089 0.055 0.039 0.017 0.008 0.005 0.002 190 Q 0.001 0.007 0.050 0.102 0.162 0.231 0.267 0.098 0.047 0.026 0.010 191 A 0.002 0.002 0.017 0.005 0.005 0.008 0.063 0.118 0.260 0.299 0.221 192 I 0.005 0.008 0.066 0.112 0.158 0.194 0.211 0.111 0.070 0.044 0.020 193 D 0.010 0.055 0.458 0.155 0.110 0.075 0.073 0.031 0.019 0.009 0.004 194 L 0.004 0.009 0.031 0.034 0.046 0.094 0.224 0.159 0.176 0.145 0.079 195 E 0.120 0.060 0.063 0.105 0.093 0.097 0.171 0.113 0.101 0.054 0.023 196 S 0.142 0.166 0.144 0.192 0.125 0.090 0.069 0.033 0.022 0.011 0.005 197 M 0.068 0.049 0.053 0.089 0.086 0.112 0.152 0.122 0.121 0.097 0.051 198 K 0.153 0.155 0.045 0.133 0.115 0.097 0.128 0.075 0.053 0.032 0.015 199 P 0.197 0.124 0.082 0.112 0.104 0.097 0.100 0.075 0.062 0.035 0.014 200 Q 0.330 0.194 0.071 0.167 0.104 0.055 0.040 0.018 0.012 0.007 0.003 201 S 0.262 0.121 0.063 0.123 0.084 0.077 0.091 0.062 0.054 0.038 0.024 202 Q 0.165 0.083 0.047 0.115 0.123 0.120 0.126 0.091 0.071 0.041 0.018 203 T 0.113 0.227 0.080 0.144 0.094 0.082 0.098 0.063 0.050 0.031 0.017 204 A 0.025 0.027 0.020 0.058 0.087 0.122 0.186 0.155 0.152 0.104 0.065 205 P 0.425 0.172 0.085 0.137 0.078 0.040 0.030 0.014 0.010 0.006 0.004 206 L 0.005 0.022 0.020 0.080 0.112 0.153 0.249 0.150 0.112 0.064 0.034 207 L 0.005 0.004 0.007 0.014 0.021 0.040 0.109 0.154 0.229 0.217 0.202 208 D 0.071 0.068 0.148 0.274 0.197 0.121 0.073 0.026 0.014 0.006 0.002 209 Q 0.015 0.056 0.216 0.223 0.180 0.146 0.101 0.036 0.017 0.007 0.003 210 F 0.001 0.002 0.005 0.007 0.008 0.016 0.066 0.117 0.211 0.279 0.285 211 L 0.007 0.009 0.015 0.039 0.072 0.127 0.292 0.181 0.141 0.077 0.040 212 D 0.104 0.109 0.503 0.182 0.062 0.023 0.010 0.003 0.002 0.001 0.001 213 Q 0.029 0.054 0.063 0.129 0.151 0.200 0.220 0.077 0.043 0.023 0.011 214 N 0.020 0.022 0.026 0.027 0.022 0.036 0.117 0.164 0.229 0.200 0.136 215 R 0.052 0.043 0.089 0.166 0.171 0.206 0.165 0.056 0.031 0.015 0.008 216 V 0.069 0.081 0.450 0.154 0.092 0.064 0.055 0.019 0.010 0.004 0.002 217 S 0.004 0.016 0.053 0.083 0.090 0.141 0.259 0.151 0.103 0.065 0.035 218 V 0.006 0.005 0.039 0.020 0.022 0.043 0.149 0.155 0.204 0.198 0.159 219 A 0.033 0.044 0.433 0.213 0.130 0.074 0.049 0.015 0.006 0.002 0.001 220 S 0.005 0.040 0.218 0.206 0.195 0.171 0.117 0.031 0.012 0.004 0.001 221 L 0.002 0.004 0.066 0.017 0.016 0.028 0.126 0.132 0.212 0.223 0.175 222 R 0.052 0.033 0.284 0.181 0.129 0.112 0.149 0.038 0.015 0.005 0.001 223 D 0.017 0.043 0.617 0.210 0.078 0.024 0.008 0.002 0.001 0.001 0.001 224 F 0.002 0.009 0.082 0.027 0.033 0.101 0.294 0.179 0.137 0.096 0.042 225 K 0.003 0.007 0.122 0.062 0.089 0.147 0.354 0.128 0.062 0.020 0.006 226 K 0.047 0.039 0.826 0.064 0.017 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 227 T 0.006 0.027 0.256 0.245 0.226 0.159 0.065 0.011 0.003 0.001 0.001 228 A 0.003 0.007 0.187 0.012 0.010 0.020 0.132 0.138 0.220 0.170 0.101 229 R 0.007 0.012 0.424 0.265 0.163 0.079 0.040 0.007 0.002 0.001 0.001 230 D 0.009 0.026 0.901 0.048 0.013 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 231 L 0.004 0.008 0.087 0.034 0.057 0.186 0.404 0.126 0.061 0.024 0.009 232 I 0.009 0.013 0.173 0.051 0.064 0.092 0.289 0.139 0.098 0.053 0.019 233 E 0.021 0.043 0.745 0.109 0.049 0.019 0.010 0.002 0.001 0.001 0.001 234 Q 0.037 0.085 0.448 0.250 0.120 0.042 0.014 0.003 0.001 0.001 0.001 235 C 0.028 0.025 0.091 0.041 0.056 0.098 0.235 0.156 0.138 0.087 0.044 236 K 0.039 0.079 0.277 0.281 0.184 0.090 0.039 0.007 0.003 0.001 0.001 237 I 0.006 0.010 0.068 0.023 0.025 0.030 0.124 0.153 0.213 0.212 0.136 238 K 0.009 0.051 0.123 0.263 0.228 0.138 0.102 0.043 0.024 0.011 0.006 239 S 0.049 0.049 0.066 0.055 0.061 0.077 0.182 0.143 0.150 0.102 0.065 240 I 0.032 0.055 0.090 0.183 0.186 0.159 0.147 0.067 0.043 0.024 0.014 241 I 0.018 0.020 0.029 0.030 0.027 0.029 0.097 0.125 0.208 0.227 0.190 242 H 0.043 0.044 0.040 0.119 0.141 0.140 0.180 0.112 0.096 0.052 0.032 243 P 0.062 0.057 0.081 0.089 0.076 0.106 0.173 0.117 0.116 0.077 0.047 244 L 0.030 0.024 0.031 0.058 0.067 0.089 0.188 0.172 0.149 0.115 0.078 245 L 0.018 0.021 0.030 0.035 0.028 0.037 0.103 0.137 0.201 0.207 0.183 246 A 0.020 0.024 0.047 0.053 0.053 0.063 0.123 0.138 0.177 0.163 0.139 247 D 0.043 0.054 0.073 0.118 0.108 0.124 0.164 0.122 0.097 0.060 0.037 248 H 0.028 0.029 0.042 0.058 0.077 0.098 0.207 0.162 0.140 0.099 0.062 249 V 0.010 0.012 0.024 0.035 0.026 0.028 0.084 0.116 0.202 0.236 0.226 250 F 0.015 0.019 0.034 0.058 0.094 0.149 0.223 0.129 0.137 0.086 0.055 251 R 0.044 0.035 0.098 0.102 0.094 0.120 0.199 0.119 0.092 0.060 0.038 252 E 0.003 0.012 0.028 0.035 0.044 0.077 0.204 0.192 0.182 0.146 0.078 253 A 0.010 0.018 0.081 0.043 0.032 0.040 0.121 0.136 0.185 0.181 0.154 254 D 0.098 0.070 0.201 0.209 0.152 0.100 0.083 0.040 0.025 0.015 0.008 255 R 0.010 0.026 0.141 0.120 0.121 0.145 0.223 0.105 0.064 0.031 0.013 256 F 0.001 0.003 0.035 0.018 0.015 0.020 0.091 0.131 0.228 0.256 0.202 257 L 0.002 0.003 0.038 0.037 0.063 0.141 0.324 0.151 0.122 0.076 0.043 258 E 0.016 0.028 0.503 0.205 0.119 0.065 0.041 0.014 0.006 0.003 0.001 259 I 0.002 0.009 0.045 0.039 0.057 0.121 0.309 0.182 0.130 0.075 0.031 260 I 0.003 0.005 0.054 0.021 0.014 0.017 0.073 0.122 0.233 0.266 0.193 261 D 0.026 0.051 0.311 0.199 0.181 0.112 0.080 0.024 0.010 0.004 0.002 262 M 0.017 0.054 0.361 0.163 0.123 0.107 0.093 0.039 0.025 0.013 0.005 263 Y 0.021 0.029 0.057 0.054 0.070 0.101 0.231 0.155 0.138 0.094 0.050 264 D 0.165 0.153 0.135 0.167 0.112 0.090 0.096 0.039 0.024 0.012 0.006 265 V 0.164 0.123 0.195 0.152 0.122 0.080 0.072 0.038 0.027 0.018 0.009 266 H 0.148 0.129 0.106 0.138 0.118 0.102 0.117 0.059 0.043 0.026 0.015 267 L 0.059 0.063 0.070 0.086 0.089 0.109 0.194 0.120 0.098 0.068 0.043 268 T 0.213 0.220 0.163 0.159 0.103 0.057 0.043 0.020 0.013 0.007 0.003 269 N 0.382 0.180 0.124 0.136 0.078 0.043 0.030 0.013 0.007 0.004 0.002 270 I 0.253 0.178 0.087 0.137 0.109 0.075 0.078 0.035 0.026 0.014 0.008 271 Q 0.086 0.078 0.053 0.109 0.120 0.124 0.161 0.105 0.083 0.052 0.029 272 S 0.309 0.262 0.073 0.132 0.086 0.048 0.046 0.021 0.013 0.007 0.003 273 Q 0.273 0.108 0.055 0.096 0.087 0.078 0.110 0.075 0.062 0.038 0.017 274 P 0.622 0.180 0.041 0.075 0.036 0.018 0.015 0.006 0.004 0.002 0.001 275 R 0.205 0.150 0.062 0.147 0.117 0.099 0.097 0.055 0.039 0.021 0.008 276 E 0.487 0.194 0.052 0.094 0.059 0.040 0.032 0.019 0.013 0.007 0.003 277 G 0.385 0.178 0.065 0.108 0.082 0.061 0.056 0.031 0.020 0.010 0.004 278 H 0.219 0.163 0.060 0.127 0.100 0.080 0.100 0.068 0.045 0.027 0.011 279 H 0.229 0.170 0.076 0.172 0.125 0.078 0.068 0.037 0.025 0.014 0.006 280 H 0.259 0.162 0.098 0.168 0.104 0.068 0.063 0.037 0.023 0.012 0.005 281 H 0.194 0.120 0.080 0.153 0.117 0.092 0.100 0.063 0.044 0.025 0.011 282 H 0.157 0.150 0.078 0.145 0.118 0.097 0.101 0.065 0.049 0.026 0.012 283 H 0.236 0.167 0.066 0.139 0.107 0.079 0.079 0.053 0.039 0.023 0.011