This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA S A 2 2 NATAA A A 3 3 NATAA K A 4 4 NATRO C A 5 5 NATRO P A 6 6 NATAA I A 7 7 NATRO C A 8 8 NATAA G A 9 9 NATAA S A 10 10 NATRO P A 11 11 NATAA L A 12 12 NATAA K A 13 13 NATAA W A 14 14 NATAA E A 15 15 NATAA E A 16 16 NATAA L A 17 17 NATAA I A 18 18 NATAA E A 19 19 NATAA E A 20 20 NATAA M A 21 21 NATAA L A 22 22 NATAA I A 23 23 NATAA I A 24 24 NATAA E A 25 25 NATAA N A 26 26 NATAA F A 27 27 NATAA E A 28 28 NATAA E A 29 29 NATAA I A 30 30 NATAA V A 31 31 NATAA K A 32 32 NATAA D A 33 33 NATAA R A 34 34 NATAA E A 35 35 NATAA R A 36 36 NATAA F A 37 37 NATAA L A 38 38 NATAA A A 39 39 NATAA Q A 40 40 NATAA V A 41 41 NATAA E A 42 42 NATAA E A 43 43 NATAA F A 44 44 NATAA V A 45 45 NATAA F A 46 46 NATAA K A 47 47 NATRO C A 48 48 NATRO P A 49 49 NATAA V A 50 50 NATRO C A 51 51 NATAA G A 52 52 NATAA E A 53 53 NATAA E A 54 54 NATAA F A 55 55 NATAA Y A 56 56 NATAA G A 57 57 NATAA K A 58 58 NATAA T A 59 59 NATAA L A 60 60 NATRO P A 61 61 NATAA R A 62 62 NATAA R A 63 63 NATAA E A 64 64 NATAA A A 65 65 NATAA E A 66 66 NATAA K A 67 67 NATAA V A 68 68 NATAA F A 69 69 NATAA E A 70 70 NATAA L A 71 71 NATAA L A 72 72 NATAA N A 73 73 NATAA D A 74 74 NATAA F A 75 75 NATAA K A 76 76 NATAA G A 77 77 NATAA G A 78 78 NATAA I A 79 79 NATAA D A 80 80 NATAA W A 81 81 NATAA E A 82 82 NATAA N A 83 83 NATAA K A 84 84 NATAA R A 85 85 NATAA V A 86 86 NATAA K A 87 87 NATAA L A 88 88 NATAA K A 89 89 NATAA L A 90 90 NATAA N A 91 91 NATAA D A 92 92 NATAA L A 93 93 NATAA L A 94 94 NATAA A A 95 95 NATAA L A 96 96 NATAA E A 97 97 NATAA T A 98 98 NATAA M A 99 99 NATAA L A 100 100 NATAA E A 101 101 NATAA E A 102 102 NATAA W A 103 103 NATAA D A 104 104 NATAA R A 105 105 NATAA R A 106 106 NATAA V A 107 107 NATAA K A 108 108 NATAA R