Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)
10 20 30 | | | 1 .....MK...IT.K.DMIIADVLQMD....RG.TAPIF....IN.N..GMH.CL....GCPSSMG 2 .....MK...IT.K.DMIIADVLQMD....RG.TAPIF....IN.N..GMH.CL....GCPSSMG 3 .....MQ...IT.K.DMTIGEIVRNF....PN.SIEIL....MS.F..GMG.CV....GCPSAQG 4 m....VQ...IT.K.DTIIGDILDIA....PE.TAPLF....LS.I..GMH.CL....GCPSSRG 5 .....MT...IT.K.EMTITEVVTKY....PK.TIPIF....YK.H..GMG.CL....GCAAAQF 6 .....MQ...IT.K.DMTIGEIVRNF....PS.SIEIL....MS.F..GMG.CV....GCPSAQG 7 ms...EK...VT.K.DMTISEVLKKN....PK.TAEVF....MK.H..GMQ.CL....GCPSAAG 8 .....MK...IT.K.DMIIADIIAID....QN.LIPIL....LD.T..GMH.CI....GCPSAQG 9 .....MK...IS.K.DMTIGEVVRNH....PE.CVEVL....FN.F..GLG.CV....GCPSAQA 10 m....AT...IT.K.EMSITEVVSKY....PQ.TVPVF....ME.H..GMG.CL....GCAAARF 11 .....MK...IT.E.TMGIGECVAKF....PN.TVPVF....MS.F..GMS.CL....GCSAARF 12 m....AK...VT.K.DMIISDVLNMD....KG.TVPIF....LE.S..GMH.CL....GCPSSSG 13 .....M-...IT.K.DMTIGEILRVK....PE.SAQVL....MD.M..GMG.CL....GCPSAQF 14 .....M-...IT.K.DWTITDIVEKY....PK.TTEIL....MN.H..GMH.CF....GCMAARF 15 .....MK...IN.R.DMTIMDVMQLD....RE.VATIF....MK.Y..GLH.CL....GXPGATM 16 .....MT...IT.R.DMLIGDLLRMK....PE.AASIL....MG.F..GMG.CL....GCPSSQM 17 m....PR...IT.T.DTIIADVLRID....RG.TIPIF....LN.N..GLH.CL....GCPSAQG 18 tap..KQ...VT.R.DTIIGDILDMD....QT.TAPYF....ME.I..GMH.CL....GCPASRG 19 m....SK...IT.R.DMTMGYIVKEF....PQ.TVEVF....QR.Y..GMG.CL....SCPTAQL 20 vvp..LQ...IT.K.DLSIMDVLRAY....PQ.VRPVF....IR.H..GMG.CL....ECMGAMD 21 mal..--...IT.K.DMTVGQVLRSY....PQ.TVQTF....LE.L..GMH.CL....GCPSSTM 22 .....M-...IT.K.DMTVGQVLRSY....PQ.TVQTF....LE.L..GMH.CL....GCPSSTM 23 .....M-...IT.K.DMVIQEIVTKY....PQ.TLPVF....GQ.F..NMG.CL....GCSGALF 24 m....EK...IT.K.DTLIGNALKIN....PN.SASIL....MS.F..GMG.CL....GCPSSQM 25 m....AE...FS.K.DTKIGELIDQF....PE.SAPIL....ME.I..GMH.CL....GCPASQM 26 tne..MA...IS.K.DMIIADLIALD....PN.YAAIL....MA.S..GMG.CV....GCPSSQG 27 m....AK...VT.K.DMLIGQLITLD....PN.IAPIL....MR.A..GMH.CL....GCPSSQM 28 .....MQ...IT.K.DMGIMDIVNKY....PQ.AVSVF....QA.Y..GMG.CI....GCMAARF 29 stsd.-E...IT.K.DTVIGDILKIN....PE.SASTL....ME.A..GMH.CL....GCPASQM 30 .....MT...IT.K.DSIIGDILDAY....GEvTAPFF....LE.M..GMH.CL....GCPASRG 31 mad..-K...IT.K.DMTFFAVMQAY....PQ.SLDVL....RK.H..RLG.CV....GCMGAQN 32 vqpg.-K...IT.K.DSIIGQVIRDN....PR.TIAVF....RA.H..GMG.CL....GCPSASG 33 .....M-...VT.K.DMTIGEVIQKN....PG.AAEIL....MS.F..GMG.CV....CCPSALG 34 .....M-...IT.K.DMTIGEVVKND....SS.KAEVL....MS.F..GMG.CV....GCPSAQA 35 m....AT...VT.K.DTIIGDILDMD....RT.TAPFF....LE.M..GMH.CL....GCPASRG 36 msd..-K...IT.K.DMKFSEILNYG....QP.VVQVF....MK.Y..QMG.CL....GCAVAKF 37 m....AK...IT.K.DMIIKDIININ....MG.CIPIL....LN.E..GMH.CV....GCPASQG 38 .....M-...IT.K.DMTIGEVIRKM....PT.AAEVL....MS.F..GMG.CV....GCPSAQA 39 m....AQ...IS.K.TMTISEILSVD....KV.VIPVL....MN.S..GMH.CL....GCPSAQG 40 m....AQ...VT.K.DMTFAAVMRMH....PD.VVKVL....AK.Y..NLG.CI....GCMGAQN 41 .....MK...IT.K.DMLIGDIIQIH....PD.AVEIL....FN.F..GLS.CV....GCPASQM 42 m....NT...IT.K.DMVIGDLLAID....EN.FAAIL....MA.S..GMH.CV....GCPSSQG 43 .....MK...IT.K.DMTIGEIVRNH....EG.AAEVL....MS.F..GMG.CV....GCPSAQS 44 .....MP...IR.H.DSVVDDLMRTQ....PA.TIRTF....LD.F..RMG.CC....GCPIATF 45 ma...VN...IT.K.EMTMGELLSID....RG.VAVVL....MN.A..GMH.CI....GCPSSIG 46 .....M-...IT.K.DMTIGEVVSAD....QS.KAQVL....MS.F..GMG.CV....GCPSAQA 47 .....MP...FG.S.DDLVDDIMRTA....PH.TIRVF....LA.F..RLA.CV....GCPIATF 48 sengv--...IT.K.DMIIADIVSED....AE.NTKIL....ME.F..GMH.CI....GCPSSQM 49 .....M-...IT.K.DLTIGEIIRIK....EN.APQIL....MS.F..GMG.CV....GCPSAQA 50 .....MK...IK.K.EMLIGQILSEK....PE.SIGTL....MS.F..GMG.CI....MCPSSQM 51 .....MT...IR.D.DLPVDEVMRSW....PA.TIRTF....LD.F..RMQ.CC....GCPIAAF 52 m....SQ...VT.K.DMTFAAVMRMH....PD.VVKVL....AK.Y..NLG.CI....GCMGAQN 53 .....M-...LT.G.AEKITDVVEKY....PQ.SVEVF....QK.Y..GMH.CF....GCMAARF 54 rrki.M-...IT.K.DMTVGEIIRIK....EN.AAEIL....MS.F..GMG.CI....GCPSAQS 55 m....AQ...IT.K.DMTFGELLSKYystcPK.LVDDL....ME.A..GMG.CI....GCPHSQM 56 .....M-...IS.K.EMTIGEIIRRY....PQ.TLPVF....EK.Y..GLD.CH....DCQIADF 57 .....MS...ID.R.TLVVEDVMSRW....PA.TIRVF....LD.F..KLA.CV....GCPIATF 58 ms...QQ...FT.K.DMTFAQALQAN....PE.VAKVL....RK.Y..NLG.CI....GCMGAQN 59 m....KK...VT.E.DMTIAEVLKMD....RE.VAGIF....MK.Y..GLH.CL....GCPGATM 60 .....MEt..FT.K.NTTIGELLSVY....PE.CAPIL....ME.I..GMH.CL....GCPSAQM 61 avr..QT...LH.D.DMTMDAIMREW....PA.TIRVV....LD.H..GLL.CV....GCPIAPF 62 vmm..AQ...VS.R.DTTIGEALSMN....PG.IAPIL....QE.I..GMH.CL....GCPASQG 63 .....M-...IT.K.DMIIGDIIRKH....PR.TLTVF....VK.Y..GLD.CN....ECQIADY 64 .....M-...IT.K.DMIIGDIIRQH....PA.TVQVF....AR.H..GLE.CY....ECQIADL 65 md...-K...IN.K.DTTVGEVIRMN....PA.NAQKL....MN.F..GMG.CV....GCPSAQS 66 ear..MP...IS.F.DELVDDVMRRR....PE.TIRVF....LA.F..QMR.CV....GCPIACF 67 mpp..PK...LD.DpDLPLDVLMTTW....PE.TVRVF....MD.H..DML.CV....GCMVSPF 68 .....M-...IT.K.TMRIGDIIRTY....PQ.SLKIF....EK.Y..GLD.CY....ECQVADY 69 .....M-...IT.R.DMIIADIIRKY....PE.TLPVF....KK.H..RLE.CY....ECQISDL 70 ms...QQ...VT.K.DMTFAQVMRMH....QD.AVKVL....AK.Y..NLG.CV....GCMGAQN 71 .....MH...LD.P.DMTLEEIMRAW....PP.AISVI....LR.H..HML.CV....GCPITAF 72 mpp..PK...LD.DpDLPLDVLMTTW....PE.TVRVF....MD.H..DML.CV....GCMVSPF 73 .....MK...YT.K.DSLVGEVLDND....ES.LARYF....LE.M..GMH.CL....GCPSSRG 74 m....AR...VT.K.EMTMGELLQTYyeqcPE.IVDVL....TG.L..GMH.CI....GCPSSIG 75 hpq..PD...-D.P.DIPLIELMALW....PQ.TIPVF....VR.H..RML.CV....GCLVSPF 76 m....PE...IDlS.TVTVGEWLRRW....PE.TVRVF....LN.Y..KMN.CP....ACPIAPF 77 mt...QK...FT.K.DMTFAQALQTH....PG.VAGVL....RS.Y..NLG.CI....GCMGAQN 78 m....AK...IS.K.DMLINDILAVD....AG.NAAIL....MA.A..GMH.CI....GCLAAAG 79 qat..AK...IT.K.DMTFLEMLRTY....PE.TAKVL....KK.Y..NLA.CA....GCMGAQS 80 kked.-K...FH.R.DMLVGSIIGMD....PQ.AAQIL....SD.S..GMG.CL....GCPASQS 81 m....EK...VT.K.DMNIMEAVEKY....PI.IAQVL....MR.Y..GLG.CV....GCIISSA 82 m....AK...IS.K.DMLINDILAID....AG.NAAIL....MA.A..GMH.CI....GCLAAAG 83 eke..VL...IT.K.KMSTGEVTKKY....PA.TKEVF....AKyF..GKG.CF....DCPSFGT 84 asp..CE...ID.A.ATLVDDLMRQR....PQ.TIGVF....LR.R..RLY.CV....GCPVGHF 85 .....M-...VT.G.DMNIMEAVEKY....PV.IVEVL....QR.N..GLG.CV....GCMIASG 86 etk..PK...IT.K.KTSIGDVIQNY....PE.TESVV....KKyF..GAG.CY....TCPGSKT 87 .....M-...VT.G.DMNIMEAVEKY....PI.IVEVL....QR.N..GLG.CV....GCMIASG 88 .....M-...VT.G.DMNIMEAVEKY....PV.IVEVL....QR.N..GLG.CV....GCMIASG 89 .....MA...LT.A.DSTIAELLREK....PE.SAQVL....FR.F..GMG.CL....GCAIANN 90 vvk..PR...FY.K.EMTVGEAMAVH....PE.AGLVF....SS.Y..HLGgCS....HCSINEL 91 vvk..PR...FY.K.EMTVGEAMAVH....PE.AGLVF....SS.Y..HLGgCS....HCSINEL 92 .....--...--.-.-MTISEILRRY....PE.TLPVF....ER.H..HLD.CY....DCQLADF 93 mr...PD...LD.DpDLPLSRLFDRW....PA.TAAVF....LT.R..RML.CP....GCPIAPF 94 m....AD...LT.A.DSTIYDLLQAK....PE.ATEAL....FK.F..GMG.CV....GCAIARG 95 .....--...--.-.-MTISEILRRY....PE.TLPVF....ER.H..HLD.CY....DCQLADF 96 .....MA...LS.K.DSTILEVLQEK....PD.AGAIF....AR.F..GMG.CV....GCAISRG 97 .....--...--.-.-------MRRK....PE.TIRVF....LA.F..QMR.CV....GCPIACF 98 .....MK...FT.L.EMKLKDIMAAN....PK.TVEAM....QE.L..GLH.CL....GCPFSVN 99 .....MK...LD.S.KMTVGELVTRH....PS.VMEVF....IK.R..RMP.CV....GCPTERF 100 .....MA...IT.L.DSTIADLLREK....PE.SAATL....QS.F..GMG.CL....GCAIANN 101 vfk..MK...FT.L.EMKLKDIMAAN....PK.TVEAM....QE.L..GLH.CL....GCPFSVN 102 kpd..PD...-D.P.DLPLARLLQTW....PA.SAGVF....LE.R..RML.CP....GCPIAPF 103 kpd..PD...-D.P.DLPLARLFQTW....PA.SAGVF....LE.R..RML.CP....GCPIAPF 104 stk..PR...FF.K.EMTVGEAIAIH....PE.AGLVF....SS.Y..HLGgCS....HCSINEV 105 .....MKkhiIN.G.EMKIWDVIQDY....PE.TYGIF....RQ.F..GYP.DIrkgdTAVTSHF 106 prr..PR...FD.DpDLPLSTLFGEW....PD.MVEVF....LA.K..QML.CP....GCPVAPF 107 kaa..TE...IS.R.SMTIEDILGMF....PY.KAQKLsqeiTN.A..GLH.CV....GCHAAVW 108 ms...M-...FD.K.TTKMAAVLKGH....PK.AKEVL....ES.F..GLQ.CS....TCSGAKH 109 genkv--...IT.K.DMIINDVIQKY....SK.TIGIF....KD.F..GVD.--....SCCGGGF 110 mt...IT...LT.A.DTSVLELVEHH....PE.TEAVF....ER.YtkRLGiCI....-CCECLF 111 m....PV...IT.K.EMSIIEVVQKY....PE.TVEVF....RK.Y..GMG.CF....G------ 40 50 60 | | | 1 ESIEDACAVHG.ID..ADKLVKELNEYFEKKEV... 2 ESIEDACAVHG.ID..ADKLVKELNEYFEKKEV... 3 ESLEQAAMVHG.MD..IEKLLEALNKAI-----... 4 ETVEQACMVHG.VD..VDALLAELNKMTAGAAQ... 5 ENIEQGARAHG.IN..IDELIADLNKVVAEQAQs.. 6 ESLEQAAMVHG.MD..IEKLLEALNKAI-----... 7 ETVEQAAMVHG.AD..ADKLLEELNKVFENEE-... 8 ESLEEACMVHG.ID..VDELVAKLNAFEEAK--... 9 ETIEEACSVHG.MD..VNELVEALNKEAK----... 10 ENIEQGALAHG.ID..VDGLIADLNKVANKAE-... 11 ENIGQGARAHG.ID..VDKLIEELNKVVGKDDDacg 12 ESIEDACAIHG.ID..ADQLIDNLNKYLENK--... 13 ETLEQACEVHG.QD..VEDILAKLNK-------... 14 ENIEQGAMAHG.IN..VDELMKELNDAIKE---... 15 ESISDAGNVHG.ID..VDKLVDDLNKFFEEKGN... 16 ESLEQAAAVHG.IN..IEQLLEKLNA-------... 17 ESIEEACALHG.ID..AQKLVDELNEYLKSKGLld. 18 ETIEEACEVHG.VN..CDELLEKLNTHLAAKKA... 19 ESLEKGAMLHG.LD..VQELLEELNKVVQ----... 20 ETIASGARMHG.LD..LDQLLKDLNEAIKNRDQe.. 21 ESIEGAALTHG.KK..PDELVEKLNKVIAAN--... 22 ESIEGAALTHG.KK..PDELVEKLNKVIAAN--... 23 ETLEQGALAHG.ID..VDAMLKALNDLIKK---... 24 ETIEQAAAVHG.ID..AEALLEKLNA-------... 25 ETLEEAAMVHG.ID..CGLLVEKINAAAKAMGK... 26 ESIEQAAYVHG.MD..LDELLGRLNEYAQTKEA... 27 ESLEEAAMVHG.MD..ADVLVQQINDFLGE---... 28 ETLEEGANAHG.IN..VDDLVDDLNENI-----... 29 ETLEEACSVHG.ID..VEELLNKLNA-------... 30 ETVAQACDVHG.VD..ADELVKKLNEAVGN---... 31 ESLEQGANAHG.ID..VNALLKDLNDAVA----... 32 ESVEKAAGIHG.ID..LEELLSELNKV------... 33 ETIEEAAMVHG.ID..ADEIIKSLNYSKEENN-... 34 ETIEEAAMVHG.IN..LDELIEALNK-------... 35 ESLEQACLVHN.VD..PDELVEKLNEHLAGK--... 36 ETLEQGANAHG.VD..VDALLKDLNAAIDND--... 37 ETLEEACIVHG.LD..ADVLAKKLNDFVVSVDGe.. 38 ETLEEAAIVHG.IN..LDDLIEAINNIEY----... 39 ETLEEACMHHG.LN..ADELETQINDALAGI--... 40 ESLEQGCAAHG.IN..VDEIVADINKLF-----... 41 ETLEEATMVHG.LN..LDLLLDVLNENNT----... 42 ETLEEAAFVHG.MN..VNELLGRLNEYMETKQA... 43 ETLAEAAMVHG.ME..LDALLEALNK-------... 44 HTVDDACREHD.VD..RDVFLVALRDAMADQDSpga 45 ESLEEACMVHG.IE..VDELLKNINEYFANK--... 46 ETIAEAATVHG.LN..LDDLLEALNR-------... 47 HTVEDACREHG.ID..RDKFLAALCDCVPA---... 48 ETLEDACAVHG.LN..VEELIKKLNK-------... 49 ETIEDAVKVHG.IN..LEELLEQLNK-------... 50 ETLEEAAMVHG.ID..PNTIVAALNEDHKEEAEa.. 51 HTMKDACREHG.VD..RDSFVAALEATIAG---... 52 ESLEQGCAAHG.IS..VDEIVADINKLF-----... 53 ENVEQGAMAHG.ID..VPSLIKDLNKAIGNQS-... 54 ESLEDAANVHG.LN..LDDLLKALN--------... 55 ESIEEGAMGHG.ID..PDLLVAKLNATLEASQA... 56 EAVEHGASVHK.VD..IGRLMEDLNRIINA---... 57 HTIEDSCHEHG.IA..EAPFLAALRKAVAKSQEvls 58 ESLEQGCSAHG.LD..VNEVLKDLNAIGQ----... 59 ESISDAGNVHG.ID..VSLLIADLNKHFESN--... 60 ETLGEAAMVHG.ID..ADLLVEKINAARAA---... 61 HTIIDAAREHD.LD..PASLARDLKRAVAEEDTgts 62 ESLAEAAMVHG.ID..AELLVEKINAFLNA---... 63 EELEHGAGVHK.VN..IEQLLSELNEHIGSGTE... 64 ETLEHGAGHHK.LD..IEALLEELNRTVITP--... 65 ETLREASLVHG.ID..LDRLIKALSEDKN----... 66 HNVADACREHG.VD..ADTFLSALCACT-----... 67 HSVSEACAEYH.LD..EEVFRAALAEAVEAAHRrwg 68 EELEHGAGVHK.TD..LEKLLKELNELIQS---... 69 ETLEHGAEVHR.VG..IDGLLEELNRSIA----... 70 ESLEQGCGAHG.LN..VDDVVRDLNALF-----... 71 HTVNDACREHM.ID..EGAFLEELRAAIAAVEGaii 72 HSVSEACAEYH.LD..EVVFRAALADAVEAAHRrwg 73 ETIEQACEVHG.AD..CARLLEQLNGTA-----... 74 ESLADAAYVHG.ID..SDLLVEKLNATINAKLGe.. 75 HTVTDACAEYD.LD..EGEFLAELKMAIGMA--... 76 MTIDEAASEYR.VD..ANLLKRDLMQMLKERAPqer 77 ESLEQGANAHG.LN..VEDILRDLNALA-----... 78 ETLEEAAAVHG.LD..AAELEVEINDYLAKKEEqqa 79 EPIDLGAINHG.LD..PEQLLADLNAAVK----... 80 ETLADACLVHG.LD..VEEILKQLNQ-------... 81 ETLGEGIAVHG.LN..PDIIIEEVNMILEKQEE... 82 ESLEEAAAVHG.LD..AVELEQEINDYLAKKEAe.. 83 EDINLACMMHN.TD..VDKFVQELNEAAYKEINkt. 84 HTIEEAAREHG.LE..PKALLAELRFIP-----... 85 ETLAEGIEAHG.LD..TKAILAEINSLIKE---... 86 EDIAFGATMHN.VD..PEVIIKELNEIIEKHK-s.. 87 ETLAEGIEAHG.LD..AKAILDEINSLIKE---... 88 ETLAEGIEAHG.LD..TKAILDEINSLIKE---... 89 ETIREAAQAHG.IP..LEEMLSALGVAE-----... 90 ETIEQVCMGYG.VE..VDVLVESLNNLLEDSED... 91 ETIEQVCMGYG.VE..VDVLIESLNNLLEDSQD... 92 EQLEHGATVHK.ID..VESLLCELNCSIKK---... 93 HTVVEACAEYG.LD..EDEFRRALRLLAGI---... 94 ETIREAAEAHG.IP..LAELLNALG--IKE---... 95 EQLEHGATVHK.ID..VESLLCELNCNIKK---... 96 ETVAEAAAAHG.IP..LEELMSALGISA-----... 97 HNVADACREHG.VD..PDLFLSALSAAT-----... 98 ETLLNAAQMHK.LD..PEKLLEAVNSVEQGEMSeaa 99 HTIEDIARING.IV..LEHLLKDLLDAIGVGEEt.. 100 ETIREAAMVHG.IP..LEELAKKLGL-------... 101 ETLLNAAQMHK.LD..PEKLLEAVNSVEQGEMSeaa 102 HTVIEACAEYG.LD..EGEVRRALRLVVMP---... 103 HTVIEACAEYG.LD..EGEVRRALRLVVMP---... 104 ETIEQVCMGYG.VE..VDTLIDSLNNLFAEE--... 105 MKLRTAAHAYH.ID..LDKLLEALNDAIAGHDRgac 106 HAITDACEEYE.LD..EEVFRAELRRAARL---... 107 ETLEAGMMTHGkTDaqIDELVRRLNALLQEPVDqss 108 ESIELGATNHG.LD..VNELLTHLNALFDEPPGk.. 109 -SIEKTAAMSG.GD..MEKLLEKLNKAIDE---... 110 CSLKDVAARYE.LD..LDELMARLNSAIESDLKesp 111 -----------.--..-----------------...