Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)
10 20 30
| | |
1 .....MK...IT.K.DMIIADVLQMD....RG.TAPIF....IN.N..GMH.CL....GCPSSMG
2 .....MK...IT.K.DMIIADVLQMD....RG.TAPIF....IN.N..GMH.CL....GCPSSMG
3 .....MQ...IT.K.DMTIGEIVRNF....PN.SIEIL....MS.F..GMG.CV....GCPSAQG
4 m....VQ...IT.K.DTIIGDILDIA....PE.TAPLF....LS.I..GMH.CL....GCPSSRG
5 .....MT...IT.K.EMTITEVVTKY....PK.TIPIF....YK.H..GMG.CL....GCAAAQF
6 .....MQ...IT.K.DMTIGEIVRNF....PS.SIEIL....MS.F..GMG.CV....GCPSAQG
7 ms...EK...VT.K.DMTISEVLKKN....PK.TAEVF....MK.H..GMQ.CL....GCPSAAG
8 .....MK...IT.K.DMIIADIIAID....QN.LIPIL....LD.T..GMH.CI....GCPSAQG
9 .....MK...IS.K.DMTIGEVVRNH....PE.CVEVL....FN.F..GLG.CV....GCPSAQA
10 m....AT...IT.K.EMSITEVVSKY....PQ.TVPVF....ME.H..GMG.CL....GCAAARF
11 .....MK...IT.E.TMGIGECVAKF....PN.TVPVF....MS.F..GMS.CL....GCSAARF
12 m....AK...VT.K.DMIISDVLNMD....KG.TVPIF....LE.S..GMH.CL....GCPSSSG
13 .....M-...IT.K.DMTIGEILRVK....PE.SAQVL....MD.M..GMG.CL....GCPSAQF
14 .....M-...IT.K.DWTITDIVEKY....PK.TTEIL....MN.H..GMH.CF....GCMAARF
15 .....MK...IN.R.DMTIMDVMQLD....RE.VATIF....MK.Y..GLH.CL....GXPGATM
16 .....MT...IT.R.DMLIGDLLRMK....PE.AASIL....MG.F..GMG.CL....GCPSSQM
17 m....PR...IT.T.DTIIADVLRID....RG.TIPIF....LN.N..GLH.CL....GCPSAQG
18 tap..KQ...VT.R.DTIIGDILDMD....QT.TAPYF....ME.I..GMH.CL....GCPASRG
19 m....SK...IT.R.DMTMGYIVKEF....PQ.TVEVF....QR.Y..GMG.CL....SCPTAQL
20 vvp..LQ...IT.K.DLSIMDVLRAY....PQ.VRPVF....IR.H..GMG.CL....ECMGAMD
21 mal..--...IT.K.DMTVGQVLRSY....PQ.TVQTF....LE.L..GMH.CL....GCPSSTM
22 .....M-...IT.K.DMTVGQVLRSY....PQ.TVQTF....LE.L..GMH.CL....GCPSSTM
23 .....M-...IT.K.DMVIQEIVTKY....PQ.TLPVF....GQ.F..NMG.CL....GCSGALF
24 m....EK...IT.K.DTLIGNALKIN....PN.SASIL....MS.F..GMG.CL....GCPSSQM
25 m....AE...FS.K.DTKIGELIDQF....PE.SAPIL....ME.I..GMH.CL....GCPASQM
26 tne..MA...IS.K.DMIIADLIALD....PN.YAAIL....MA.S..GMG.CV....GCPSSQG
27 m....AK...VT.K.DMLIGQLITLD....PN.IAPIL....MR.A..GMH.CL....GCPSSQM
28 .....MQ...IT.K.DMGIMDIVNKY....PQ.AVSVF....QA.Y..GMG.CI....GCMAARF
29 stsd.-E...IT.K.DTVIGDILKIN....PE.SASTL....ME.A..GMH.CL....GCPASQM
30 .....MT...IT.K.DSIIGDILDAY....GEvTAPFF....LE.M..GMH.CL....GCPASRG
31 mad..-K...IT.K.DMTFFAVMQAY....PQ.SLDVL....RK.H..RLG.CV....GCMGAQN
32 vqpg.-K...IT.K.DSIIGQVIRDN....PR.TIAVF....RA.H..GMG.CL....GCPSASG
33 .....M-...VT.K.DMTIGEVIQKN....PG.AAEIL....MS.F..GMG.CV....CCPSALG
34 .....M-...IT.K.DMTIGEVVKND....SS.KAEVL....MS.F..GMG.CV....GCPSAQA
35 m....AT...VT.K.DTIIGDILDMD....RT.TAPFF....LE.M..GMH.CL....GCPASRG
36 msd..-K...IT.K.DMKFSEILNYG....QP.VVQVF....MK.Y..QMG.CL....GCAVAKF
37 m....AK...IT.K.DMIIKDIININ....MG.CIPIL....LN.E..GMH.CV....GCPASQG
38 .....M-...IT.K.DMTIGEVIRKM....PT.AAEVL....MS.F..GMG.CV....GCPSAQA
39 m....AQ...IS.K.TMTISEILSVD....KV.VIPVL....MN.S..GMH.CL....GCPSAQG
40 m....AQ...VT.K.DMTFAAVMRMH....PD.VVKVL....AK.Y..NLG.CI....GCMGAQN
41 .....MK...IT.K.DMLIGDIIQIH....PD.AVEIL....FN.F..GLS.CV....GCPASQM
42 m....NT...IT.K.DMVIGDLLAID....EN.FAAIL....MA.S..GMH.CV....GCPSSQG
43 .....MK...IT.K.DMTIGEIVRNH....EG.AAEVL....MS.F..GMG.CV....GCPSAQS
44 .....MP...IR.H.DSVVDDLMRTQ....PA.TIRTF....LD.F..RMG.CC....GCPIATF
45 ma...VN...IT.K.EMTMGELLSID....RG.VAVVL....MN.A..GMH.CI....GCPSSIG
46 .....M-...IT.K.DMTIGEVVSAD....QS.KAQVL....MS.F..GMG.CV....GCPSAQA
47 .....MP...FG.S.DDLVDDIMRTA....PH.TIRVF....LA.F..RLA.CV....GCPIATF
48 sengv--...IT.K.DMIIADIVSED....AE.NTKIL....ME.F..GMH.CI....GCPSSQM
49 .....M-...IT.K.DLTIGEIIRIK....EN.APQIL....MS.F..GMG.CV....GCPSAQA
50 .....MK...IK.K.EMLIGQILSEK....PE.SIGTL....MS.F..GMG.CI....MCPSSQM
51 .....MT...IR.D.DLPVDEVMRSW....PA.TIRTF....LD.F..RMQ.CC....GCPIAAF
52 m....SQ...VT.K.DMTFAAVMRMH....PD.VVKVL....AK.Y..NLG.CI....GCMGAQN
53 .....M-...LT.G.AEKITDVVEKY....PQ.SVEVF....QK.Y..GMH.CF....GCMAARF
54 rrki.M-...IT.K.DMTVGEIIRIK....EN.AAEIL....MS.F..GMG.CI....GCPSAQS
55 m....AQ...IT.K.DMTFGELLSKYystcPK.LVDDL....ME.A..GMG.CI....GCPHSQM
56 .....M-...IS.K.EMTIGEIIRRY....PQ.TLPVF....EK.Y..GLD.CH....DCQIADF
57 .....MS...ID.R.TLVVEDVMSRW....PA.TIRVF....LD.F..KLA.CV....GCPIATF
58 ms...QQ...FT.K.DMTFAQALQAN....PE.VAKVL....RK.Y..NLG.CI....GCMGAQN
59 m....KK...VT.E.DMTIAEVLKMD....RE.VAGIF....MK.Y..GLH.CL....GCPGATM
60 .....MEt..FT.K.NTTIGELLSVY....PE.CAPIL....ME.I..GMH.CL....GCPSAQM
61 avr..QT...LH.D.DMTMDAIMREW....PA.TIRVV....LD.H..GLL.CV....GCPIAPF
62 vmm..AQ...VS.R.DTTIGEALSMN....PG.IAPIL....QE.I..GMH.CL....GCPASQG
63 .....M-...IT.K.DMIIGDIIRKH....PR.TLTVF....VK.Y..GLD.CN....ECQIADY
64 .....M-...IT.K.DMIIGDIIRQH....PA.TVQVF....AR.H..GLE.CY....ECQIADL
65 md...-K...IN.K.DTTVGEVIRMN....PA.NAQKL....MN.F..GMG.CV....GCPSAQS
66 ear..MP...IS.F.DELVDDVMRRR....PE.TIRVF....LA.F..QMR.CV....GCPIACF
67 mpp..PK...LD.DpDLPLDVLMTTW....PE.TVRVF....MD.H..DML.CV....GCMVSPF
68 .....M-...IT.K.TMRIGDIIRTY....PQ.SLKIF....EK.Y..GLD.CY....ECQVADY
69 .....M-...IT.R.DMIIADIIRKY....PE.TLPVF....KK.H..RLE.CY....ECQISDL
70 ms...QQ...VT.K.DMTFAQVMRMH....QD.AVKVL....AK.Y..NLG.CV....GCMGAQN
71 .....MH...LD.P.DMTLEEIMRAW....PP.AISVI....LR.H..HML.CV....GCPITAF
72 mpp..PK...LD.DpDLPLDVLMTTW....PE.TVRVF....MD.H..DML.CV....GCMVSPF
73 .....MK...YT.K.DSLVGEVLDND....ES.LARYF....LE.M..GMH.CL....GCPSSRG
74 m....AR...VT.K.EMTMGELLQTYyeqcPE.IVDVL....TG.L..GMH.CI....GCPSSIG
75 hpq..PD...-D.P.DIPLIELMALW....PQ.TIPVF....VR.H..RML.CV....GCLVSPF
76 m....PE...IDlS.TVTVGEWLRRW....PE.TVRVF....LN.Y..KMN.CP....ACPIAPF
77 mt...QK...FT.K.DMTFAQALQTH....PG.VAGVL....RS.Y..NLG.CI....GCMGAQN
78 m....AK...IS.K.DMLINDILAVD....AG.NAAIL....MA.A..GMH.CI....GCLAAAG
79 qat..AK...IT.K.DMTFLEMLRTY....PE.TAKVL....KK.Y..NLA.CA....GCMGAQS
80 kked.-K...FH.R.DMLVGSIIGMD....PQ.AAQIL....SD.S..GMG.CL....GCPASQS
81 m....EK...VT.K.DMNIMEAVEKY....PI.IAQVL....MR.Y..GLG.CV....GCIISSA
82 m....AK...IS.K.DMLINDILAID....AG.NAAIL....MA.A..GMH.CI....GCLAAAG
83 eke..VL...IT.K.KMSTGEVTKKY....PA.TKEVF....AKyF..GKG.CF....DCPSFGT
84 asp..CE...ID.A.ATLVDDLMRQR....PQ.TIGVF....LR.R..RLY.CV....GCPVGHF
85 .....M-...VT.G.DMNIMEAVEKY....PV.IVEVL....QR.N..GLG.CV....GCMIASG
86 etk..PK...IT.K.KTSIGDVIQNY....PE.TESVV....KKyF..GAG.CY....TCPGSKT
87 .....M-...VT.G.DMNIMEAVEKY....PI.IVEVL....QR.N..GLG.CV....GCMIASG
88 .....M-...VT.G.DMNIMEAVEKY....PV.IVEVL....QR.N..GLG.CV....GCMIASG
89 .....MA...LT.A.DSTIAELLREK....PE.SAQVL....FR.F..GMG.CL....GCAIANN
90 vvk..PR...FY.K.EMTVGEAMAVH....PE.AGLVF....SS.Y..HLGgCS....HCSINEL
91 vvk..PR...FY.K.EMTVGEAMAVH....PE.AGLVF....SS.Y..HLGgCS....HCSINEL
92 .....--...--.-.-MTISEILRRY....PE.TLPVF....ER.H..HLD.CY....DCQLADF
93 mr...PD...LD.DpDLPLSRLFDRW....PA.TAAVF....LT.R..RML.CP....GCPIAPF
94 m....AD...LT.A.DSTIYDLLQAK....PE.ATEAL....FK.F..GMG.CV....GCAIARG
95 .....--...--.-.-MTISEILRRY....PE.TLPVF....ER.H..HLD.CY....DCQLADF
96 .....MA...LS.K.DSTILEVLQEK....PD.AGAIF....AR.F..GMG.CV....GCAISRG
97 .....--...--.-.-------MRRK....PE.TIRVF....LA.F..QMR.CV....GCPIACF
98 .....MK...FT.L.EMKLKDIMAAN....PK.TVEAM....QE.L..GLH.CL....GCPFSVN
99 .....MK...LD.S.KMTVGELVTRH....PS.VMEVF....IK.R..RMP.CV....GCPTERF
100 .....MA...IT.L.DSTIADLLREK....PE.SAATL....QS.F..GMG.CL....GCAIANN
101 vfk..MK...FT.L.EMKLKDIMAAN....PK.TVEAM....QE.L..GLH.CL....GCPFSVN
102 kpd..PD...-D.P.DLPLARLLQTW....PA.SAGVF....LE.R..RML.CP....GCPIAPF
103 kpd..PD...-D.P.DLPLARLFQTW....PA.SAGVF....LE.R..RML.CP....GCPIAPF
104 stk..PR...FF.K.EMTVGEAIAIH....PE.AGLVF....SS.Y..HLGgCS....HCSINEV
105 .....MKkhiIN.G.EMKIWDVIQDY....PE.TYGIF....RQ.F..GYP.DIrkgdTAVTSHF
106 prr..PR...FD.DpDLPLSTLFGEW....PD.MVEVF....LA.K..QML.CP....GCPVAPF
107 kaa..TE...IS.R.SMTIEDILGMF....PY.KAQKLsqeiTN.A..GLH.CV....GCHAAVW
108 ms...M-...FD.K.TTKMAAVLKGH....PK.AKEVL....ES.F..GLQ.CS....TCSGAKH
109 genkv--...IT.K.DMIINDVIQKY....SK.TIGIF....KD.F..GVD.--....SCCGGGF
110 mt...IT...LT.A.DTSVLELVEHH....PE.TEAVF....ER.YtkRLGiCI....-CCECLF
111 m....PV...IT.K.EMSIIEVVQKY....PE.TVEVF....RK.Y..GMG.CF....G------
40 50 60
| | |
1 ESIEDACAVHG.ID..ADKLVKELNEYFEKKEV...
2 ESIEDACAVHG.ID..ADKLVKELNEYFEKKEV...
3 ESLEQAAMVHG.MD..IEKLLEALNKAI-----...
4 ETVEQACMVHG.VD..VDALLAELNKMTAGAAQ...
5 ENIEQGARAHG.IN..IDELIADLNKVVAEQAQs..
6 ESLEQAAMVHG.MD..IEKLLEALNKAI-----...
7 ETVEQAAMVHG.AD..ADKLLEELNKVFENEE-...
8 ESLEEACMVHG.ID..VDELVAKLNAFEEAK--...
9 ETIEEACSVHG.MD..VNELVEALNKEAK----...
10 ENIEQGALAHG.ID..VDGLIADLNKVANKAE-...
11 ENIGQGARAHG.ID..VDKLIEELNKVVGKDDDacg
12 ESIEDACAIHG.ID..ADQLIDNLNKYLENK--...
13 ETLEQACEVHG.QD..VEDILAKLNK-------...
14 ENIEQGAMAHG.IN..VDELMKELNDAIKE---...
15 ESISDAGNVHG.ID..VDKLVDDLNKFFEEKGN...
16 ESLEQAAAVHG.IN..IEQLLEKLNA-------...
17 ESIEEACALHG.ID..AQKLVDELNEYLKSKGLld.
18 ETIEEACEVHG.VN..CDELLEKLNTHLAAKKA...
19 ESLEKGAMLHG.LD..VQELLEELNKVVQ----...
20 ETIASGARMHG.LD..LDQLLKDLNEAIKNRDQe..
21 ESIEGAALTHG.KK..PDELVEKLNKVIAAN--...
22 ESIEGAALTHG.KK..PDELVEKLNKVIAAN--...
23 ETLEQGALAHG.ID..VDAMLKALNDLIKK---...
24 ETIEQAAAVHG.ID..AEALLEKLNA-------...
25 ETLEEAAMVHG.ID..CGLLVEKINAAAKAMGK...
26 ESIEQAAYVHG.MD..LDELLGRLNEYAQTKEA...
27 ESLEEAAMVHG.MD..ADVLVQQINDFLGE---...
28 ETLEEGANAHG.IN..VDDLVDDLNENI-----...
29 ETLEEACSVHG.ID..VEELLNKLNA-------...
30 ETVAQACDVHG.VD..ADELVKKLNEAVGN---...
31 ESLEQGANAHG.ID..VNALLKDLNDAVA----...
32 ESVEKAAGIHG.ID..LEELLSELNKV------...
33 ETIEEAAMVHG.ID..ADEIIKSLNYSKEENN-...
34 ETIEEAAMVHG.IN..LDELIEALNK-------...
35 ESLEQACLVHN.VD..PDELVEKLNEHLAGK--...
36 ETLEQGANAHG.VD..VDALLKDLNAAIDND--...
37 ETLEEACIVHG.LD..ADVLAKKLNDFVVSVDGe..
38 ETLEEAAIVHG.IN..LDDLIEAINNIEY----...
39 ETLEEACMHHG.LN..ADELETQINDALAGI--...
40 ESLEQGCAAHG.IN..VDEIVADINKLF-----...
41 ETLEEATMVHG.LN..LDLLLDVLNENNT----...
42 ETLEEAAFVHG.MN..VNELLGRLNEYMETKQA...
43 ETLAEAAMVHG.ME..LDALLEALNK-------...
44 HTVDDACREHD.VD..RDVFLVALRDAMADQDSpga
45 ESLEEACMVHG.IE..VDELLKNINEYFANK--...
46 ETIAEAATVHG.LN..LDDLLEALNR-------...
47 HTVEDACREHG.ID..RDKFLAALCDCVPA---...
48 ETLEDACAVHG.LN..VEELIKKLNK-------...
49 ETIEDAVKVHG.IN..LEELLEQLNK-------...
50 ETLEEAAMVHG.ID..PNTIVAALNEDHKEEAEa..
51 HTMKDACREHG.VD..RDSFVAALEATIAG---...
52 ESLEQGCAAHG.IS..VDEIVADINKLF-----...
53 ENVEQGAMAHG.ID..VPSLIKDLNKAIGNQS-...
54 ESLEDAANVHG.LN..LDDLLKALN--------...
55 ESIEEGAMGHG.ID..PDLLVAKLNATLEASQA...
56 EAVEHGASVHK.VD..IGRLMEDLNRIINA---...
57 HTIEDSCHEHG.IA..EAPFLAALRKAVAKSQEvls
58 ESLEQGCSAHG.LD..VNEVLKDLNAIGQ----...
59 ESISDAGNVHG.ID..VSLLIADLNKHFESN--...
60 ETLGEAAMVHG.ID..ADLLVEKINAARAA---...
61 HTIIDAAREHD.LD..PASLARDLKRAVAEEDTgts
62 ESLAEAAMVHG.ID..AELLVEKINAFLNA---...
63 EELEHGAGVHK.VN..IEQLLSELNEHIGSGTE...
64 ETLEHGAGHHK.LD..IEALLEELNRTVITP--...
65 ETLREASLVHG.ID..LDRLIKALSEDKN----...
66 HNVADACREHG.VD..ADTFLSALCACT-----...
67 HSVSEACAEYH.LD..EEVFRAALAEAVEAAHRrwg
68 EELEHGAGVHK.TD..LEKLLKELNELIQS---...
69 ETLEHGAEVHR.VG..IDGLLEELNRSIA----...
70 ESLEQGCGAHG.LN..VDDVVRDLNALF-----...
71 HTVNDACREHM.ID..EGAFLEELRAAIAAVEGaii
72 HSVSEACAEYH.LD..EVVFRAALADAVEAAHRrwg
73 ETIEQACEVHG.AD..CARLLEQLNGTA-----...
74 ESLADAAYVHG.ID..SDLLVEKLNATINAKLGe..
75 HTVTDACAEYD.LD..EGEFLAELKMAIGMA--...
76 MTIDEAASEYR.VD..ANLLKRDLMQMLKERAPqer
77 ESLEQGANAHG.LN..VEDILRDLNALA-----...
78 ETLEEAAAVHG.LD..AAELEVEINDYLAKKEEqqa
79 EPIDLGAINHG.LD..PEQLLADLNAAVK----...
80 ETLADACLVHG.LD..VEEILKQLNQ-------...
81 ETLGEGIAVHG.LN..PDIIIEEVNMILEKQEE...
82 ESLEEAAAVHG.LD..AVELEQEINDYLAKKEAe..
83 EDINLACMMHN.TD..VDKFVQELNEAAYKEINkt.
84 HTIEEAAREHG.LE..PKALLAELRFIP-----...
85 ETLAEGIEAHG.LD..TKAILAEINSLIKE---...
86 EDIAFGATMHN.VD..PEVIIKELNEIIEKHK-s..
87 ETLAEGIEAHG.LD..AKAILDEINSLIKE---...
88 ETLAEGIEAHG.LD..TKAILDEINSLIKE---...
89 ETIREAAQAHG.IP..LEEMLSALGVAE-----...
90 ETIEQVCMGYG.VE..VDVLVESLNNLLEDSED...
91 ETIEQVCMGYG.VE..VDVLIESLNNLLEDSQD...
92 EQLEHGATVHK.ID..VESLLCELNCSIKK---...
93 HTVVEACAEYG.LD..EDEFRRALRLLAGI---...
94 ETIREAAEAHG.IP..LAELLNALG--IKE---...
95 EQLEHGATVHK.ID..VESLLCELNCNIKK---...
96 ETVAEAAAAHG.IP..LEELMSALGISA-----...
97 HNVADACREHG.VD..PDLFLSALSAAT-----...
98 ETLLNAAQMHK.LD..PEKLLEAVNSVEQGEMSeaa
99 HTIEDIARING.IV..LEHLLKDLLDAIGVGEEt..
100 ETIREAAMVHG.IP..LEELAKKLGL-------...
101 ETLLNAAQMHK.LD..PEKLLEAVNSVEQGEMSeaa
102 HTVIEACAEYG.LD..EGEVRRALRLVVMP---...
103 HTVIEACAEYG.LD..EGEVRRALRLVVMP---...
104 ETIEQVCMGYG.VE..VDTLIDSLNNLFAEE--...
105 MKLRTAAHAYH.ID..LDKLLEALNDAIAGHDRgac
106 HAITDACEEYE.LD..EEVFRAELRRAARL---...
107 ETLEAGMMTHGkTDaqIDELVRRLNALLQEPVDqss
108 ESIELGATNHG.LD..VNELLTHLNALFDEPPGk..
109 -SIEKTAAMSG.GD..MEKLLEKLNKAIDE---...
110 CSLKDVAARYE.LD..LDELMARLNSAIESDLKesp
111 -----------.--..-----------------...