# TARGET T0473 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0473.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 23.2886 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.012 0.010 0.028 0.077 0.109 0.131 0.056 0.579 2 K 0.012 0.020 0.044 0.086 0.151 0.116 0.043 0.526 3 I 0.022 0.026 0.027 0.043 0.044 0.085 0.036 0.718 4 T 0.266 0.293 0.032 0.037 0.033 0.042 0.139 0.158 5 K 0.080 0.421 0.017 0.017 0.025 0.048 0.085 0.307 6 D 0.027 0.312 0.052 0.017 0.041 0.078 0.083 0.389 7 M 0.016 0.324 0.072 0.079 0.070 0.074 0.137 0.227 8 I 0.022 0.698 0.036 0.023 0.035 0.031 0.048 0.107 9 I 0.050 0.802 0.019 0.009 0.014 0.013 0.042 0.051 10 A 0.030 0.500 0.063 0.042 0.038 0.029 0.152 0.147 11 D 0.106 0.451 0.052 0.038 0.048 0.041 0.073 0.192 12 V 0.228 0.145 0.092 0.036 0.049 0.076 0.132 0.242 13 L 0.112 0.079 0.058 0.052 0.062 0.088 0.115 0.434 14 Q 0.027 0.024 0.018 0.018 0.035 0.074 0.046 0.759 15 M 0.023 0.005 0.017 0.012 0.011 0.097 0.081 0.755 16 D 0.540 0.033 0.010 0.014 0.013 0.054 0.136 0.200 17 R 0.092 0.015 0.006 0.002 0.004 0.094 0.024 0.763 18 G 0.009 0.028 0.021 0.009 0.021 0.148 0.013 0.751 19 T 0.021 0.149 0.018 0.010 0.024 0.077 0.038 0.662 20 A 0.053 0.401 0.039 0.041 0.030 0.079 0.132 0.224 21 P 0.029 0.133 0.205 0.052 0.063 0.038 0.347 0.134 22 I 0.018 0.056 0.153 0.060 0.068 0.039 0.488 0.117 23 F 0.020 0.048 0.474 0.048 0.076 0.041 0.164 0.130 24 I 0.224 0.054 0.140 0.069 0.101 0.071 0.072 0.270 25 N 0.048 0.016 0.044 0.021 0.031 0.083 0.077 0.681 26 N 0.021 0.017 0.063 0.018 0.048 0.164 0.034 0.634 27 G 0.078 0.018 0.067 0.024 0.049 0.163 0.087 0.515 28 M 0.029 0.007 0.081 0.057 0.035 0.127 0.053 0.611 29 H 0.095 0.017 0.089 0.032 0.067 0.103 0.055 0.542 30 C 0.117 0.014 0.045 0.026 0.036 0.110 0.071 0.581 31 L 0.017 0.007 0.105 0.034 0.047 0.143 0.045 0.602 32 G 0.020 0.015 0.049 0.015 0.030 0.114 0.073 0.684 33 C 0.137 0.096 0.046 0.028 0.022 0.140 0.091 0.440 34 P 0.147 0.200 0.056 0.019 0.030 0.092 0.106 0.351 35 S 0.187 0.151 0.015 0.006 0.018 0.080 0.055 0.488 36 S 0.090 0.092 0.033 0.026 0.027 0.105 0.274 0.353 37 M 0.028 0.341 0.013 0.009 0.018 0.099 0.101 0.392 38 G 0.037 0.604 0.011 0.005 0.013 0.047 0.060 0.222 39 E 0.013 0.526 0.031 0.035 0.024 0.062 0.100 0.210 40 S 0.018 0.873 0.006 0.003 0.005 0.011 0.051 0.034 41 I 0.031 0.919 0.003 0.002 0.002 0.004 0.029 0.012 42 E 0.014 0.833 0.011 0.006 0.008 0.013 0.067 0.049 43 D 0.021 0.846 0.008 0.005 0.008 0.010 0.038 0.063 44 A 0.074 0.566 0.043 0.014 0.025 0.043 0.149 0.087 45 C 0.064 0.097 0.167 0.064 0.066 0.056 0.325 0.161 46 A 0.479 0.033 0.016 0.020 0.026 0.049 0.023 0.354 47 V 0.105 0.006 0.020 0.012 0.018 0.076 0.032 0.730 48 H 0.014 0.019 0.021 0.008 0.023 0.189 0.017 0.710 49 G 0.007 0.024 0.011 0.008 0.016 0.105 0.013 0.815 50 I 0.007 0.065 0.013 0.014 0.004 0.071 0.015 0.810 51 D 0.054 0.925 0.001 0.001 0.001 0.002 0.013 0.005 52 A 0.027 0.962 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.005 53 D 0.005 0.974 0.002 0.001 0.001 0.001 0.008 0.010 54 K 0.004 0.984 0.002 0.001 0.001 0.001 0.005 0.005 55 L 0.042 0.922 0.003 0.001 0.001 0.002 0.027 0.004 56 V 0.059 0.152 0.013 0.001 0.001 0.002 0.765 0.008 57 K 0.038 0.707 0.005 0.001 0.001 0.009 0.101 0.140 58 E 0.049 0.697 0.006 0.001 0.001 0.013 0.021 0.215 59 L 0.033 0.822 0.005 0.001 0.001 0.013 0.030 0.096 60 N 0.056 0.820 0.004 0.001 0.001 0.008 0.016 0.095 61 E 0.054 0.803 0.008 0.001 0.001 0.011 0.018 0.105 62 Y 0.148 0.553 0.082 0.002 0.001 0.029 0.088 0.095 63 F 0.276 0.212 0.082 0.003 0.002 0.044 0.118 0.264 64 E 0.134 0.074 0.051 0.002 0.002 0.048 0.073 0.616 65 K 0.096 0.027 0.040 0.002 0.002 0.070 0.072 0.690 66 K 0.052 0.014 0.012 0.004 0.005 0.099 0.044 0.768 67 E 0.027 0.008 0.010 0.004 0.007 0.085 0.024 0.836 68 V 0.030 0.012 0.018 0.012 0.017 0.125 0.038 0.750