Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)
10 20 30 40 | | | | 1 .....MK...IT.K.DMIIADVLQMD....RG.TAPIF....IN.NGM.HCLG....CPSSMGES 2 .....MK...IT.K.DMIIADVLQMD....RG.TAPIF....IN.NGM.HCLG....CPSSMGES 3 m....VQ...IT.K.DTIIGDILDIA....PE.TAPLF....LS.IGM.HCLG....CPSSRGET 4 .....MQ...IT.K.DMTIGEIVRNF....PN.SIEIL....MS.FGM.GCVG....CPSAQGES 5 .....MQ...IT.K.DMTIGEIVRNF....PS.SIEIL....MS.FGM.GCVG....CPSAQGES 6 .....MT...IT.K.EMTITEVVTKY....PK.TIPIF....YK.HGM.GCLG....CAAAQFEN 7 ms...EK...VT.K.DMTISEVLKKN....PK.TAEVF....MK.HGM.QCLG....CPSAAGET 8 .....MK...IT.K.DMIIADIIAID....QN.LIPIL....LD.TGM.HCIG....CPSAQGES 9 .....MK...IS.K.DMTIGEVVRNH....PE.CVEVL....FN.FGL.GCVG....CPSAQAET 10 m....AT...IT.K.EMSITEVVSKY....PQ.TVPVF....ME.HGM.GCLG....CAAARFEN 11 .....MK...IT.E.TMGIGECVAKF....PN.TVPVF....MS.FGM.SCLG....CSAARFEN 12 m....AK...VT.K.DMIISDVLNMD....KG.TVPIF....LE.SGM.HCLG....CPSSSGES 13 .....M-...IT.K.DMTIGEILRVK....PE.SAQVL....MD.MGM.GCLG....CPSAQFET 14 .....M-...IT.K.DWTITDIVEKY....PK.TTEIL....MN.HGM.HCFG....CMAARFEN 15 .....MT...IT.R.DMLIGDLLRMK....PE.AASIL....MG.FGM.GCLG....CPSSQMES 16 .....MK...IN.R.DMTIMDVMQLD....RE.VATIF....MK.YGL.HCLG....XPGATMES 17 tap..KQ...VT.R.DTIIGDILDMD....QT.TAPYF....ME.IGM.HCLG....CPASRGET 18 m....PR...IT.T.DTIIADVLRID....RG.TIPIF....LN.NGL.HCLG....CPSAQGES 19 m....SK...IT.R.DMTMGYIVKEF....PQ.TVEVF....QR.YGM.GCLS....CPTAQLES 20 mal..--...IT.K.DMTVGQVLRSY....PQ.TVQTF....LE.LGM.HCLG....CPSSTMES 21 .....M-...IT.K.DMTVGQVLRSY....PQ.TVQTF....LE.LGM.HCLG....CPSSTMES 22 m....EK...IT.K.DTLIGNALKIN....PN.SASIL....MS.FGM.GCLG....CPSSQMET 23 vvp..LQ...IT.K.DLSIMDVLRAY....PQ.VRPVF....IR.HGM.GCLE....CMGAMDET 24 .....M-...IT.K.DMVIQEIVTKY....PQ.TLPVF....GQ.FNM.GCLG....CSGALFET 25 m....AE...FS.K.DTKIGELIDQF....PE.SAPIL....ME.IGM.HCLG....CPASQMET 26 stsd.-E...IT.K.DTVIGDILKIN....PE.SASTL....ME.AGM.HCLG....CPASQMET 27 .....MQ...IT.K.DMGIMDIVNKY....PQ.AVSVF....QA.YGM.GCIG....CMAARFET 28 m....AK...VT.K.DMLIGQLITLD....PN.IAPIL....MR.AGM.HCLG....CPSSQMES 29 mad..-K...IT.K.DMTFFAVMQAY....PQ.SLDVL....RK.HRL.GCVG....CMGAQNES 30 tne..MA...IS.K.DMIIADLIALD....PN.YAAIL....MA.SGM.GCVG....CPSSQGES 31 .....MT...IT.K.DSIIGDILDAY....GEvTAPFF....LE.MGM.HCLG....CPASRGET 32 vqp..GK...IT.K.DSIIGQVIRDN....PR.TIAVF....RA.HGM.GCLG....CPSASGES 33 msd..-K...IT.K.DMKFSEILNYG....QP.VVQVF....MK.YQM.GCLG....CAVAKFET 34 .....M-...VT.K.DMTIGEVIQKN....PG.AAEIL....MS.FGM.GCVC....CPSALGET 35 .....M-...IT.K.DMTIGEVVKND....SS.KAEVL....MS.FGM.GCVG....CPSAQAET 36 m....AT...VT.K.DTIIGDILDMD....RT.TAPFF....LE.MGM.HCLG....CPASRGES 37 m....AK...IT.K.DMIIKDIININ....MG.CIPIL....LN.EGM.HCVG....CPASQGET 38 .....M-...IT.K.DMTIGEVIRKM....PT.AAEVL....MS.FGM.GCVG....CPSAQAET 39 .....MK...IT.K.DMLIGDIIQIH....PD.AVEIL....FN.FGL.SCVG....CPASQMET 40 m....AQ...IS.K.TMTISEILSVD....KV.VIPVL....MN.SGM.HCLG....CPSAQGET 41 m....AQ...VT.K.DMTFAAVMRMH....PD.VVKVL....AK.YNL.GCIG....CMGAQNES 42 .....MK...IT.K.DMTIGEIVRNH....EG.AAEVL....MS.FGM.GCVG....CPSAQSET 43 .....M-...IT.K.DMTIGEVVSAD....QS.KAQVL....MS.FGM.GCVG....CPSAQAET 44 .....MP...FG.S.DDLVDDIMRTA....PH.TIRVF....LA.FRL.ACVG....CPIATFHT 45 .....MP...IR.H.DSVVDDLMRTQ....PA.TIRTF....LD.FRM.GCCG....CPIATFHT 46 m....NT...IT.K.DMVIGDLLAID....EN.FAAIL....MA.SGM.HCVG....CPSSQGET 47 ma...VN...IT.K.EMTMGELLSID....RG.VAVVL....MN.AGM.HCIG....CPSSIGES 48 .....MK...IK.K.EMLIGQILSEK....PE.SIGTL....MS.FGM.GCIM....CPSSQMET 49 sengv--...IT.K.DMIIADIVSED....AE.NTKIL....ME.FGM.HCIG....CPSSQMET 50 .....M-...IT.K.DLTIGEIIRIK....EN.APQIL....MS.FGM.GCVG....CPSAQAET 51 .....MT...IR.D.DLPVDEVMRSW....PA.TIRTF....LD.FRM.QCCG....CPIAAFHT 52 m....SQ...VT.K.DMTFAAVMRMH....PD.VVKVL....AK.YNL.GCIG....CMGAQNES 53 .....M-...LT.G.AEKITDVVEKY....PQ.SVEVF....QK.YGM.HCFG....CMAARFEN 54 rrki.M-...IT.K.DMTVGEIIRIK....EN.AAEIL....MS.FGM.GCIG....CPSAQSES 55 .....MEt..FT.K.NTTIGELLSVY....PE.CAPIL....ME.IGM.HCLG....CPSAQMET 56 .....MS...ID.R.TLVVEDVMSRW....PA.TIRVF....LD.FKL.ACVG....CPIATFHT 57 m....AQ...IT.K.DMTFGELLSKYystcPK.LVDDL....ME.AGM.GCIG....CPHSQMES 58 .....M-...IS.K.EMTIGEIIRRY....PQ.TLPVF....EK.YGL.DCHD....CQIADFEA 59 ms...QQ...FT.K.DMTFAQALQAN....PE.VAKVL....RK.YNL.GCIG....CMGAQNES 60 m....KK...VT.E.DMTIAEVLKMD....RE.VAGIF....MK.YGL.HCLG....CPGATMES 61 avr..QT...LH.D.DMTMDAIMREW....PA.TIRVV....LD.HGL.LCVG....CPIAPFHT 62 .....M-...IT.K.DMIIGDIIRQH....PA.TVQVF....AR.HGL.ECYE....CQIADLET 63 ear..MP...IS.F.DELVDDVMRRR....PE.TIRVF....LA.FQM.RCVG....CPIACFHN 64 .....M-...IT.K.DMIIGDIIRKH....PR.TLTVF....VK.YGL.DCNE....CQIADYEE 65 vmm..AQ...VS.R.DTTIGEALSMN....PG.IAPIL....QE.IGM.HCLG....CPASQGES 66 md...-K...IN.K.DTTVGEVIRMN....PA.NAQKL....MN.FGM.GCVG....CPSAQSET 67 mpp..PK...LD.DpDLPLDVLMTTW....PE.TVRVF....MD.HDM.LCVG....CMVSPFHS 68 .....M-...IT.K.TMRIGDIIRTY....PQ.SLKIF....EK.YGL.DCYE....CQVADYEE 69 .....M-...IT.R.DMIIADIIRKY....PE.TLPVF....KK.HRL.ECYE....CQISDLET 70 ms...QQ...VT.K.DMTFAQVMRMH....QD.AVKVL....AK.YNL.GCVG....CMGAQNES 71 .....MH...LD.P.DMTLEEIMRAW....PP.AISVI....LR.HHM.LCVG....CPITAFHT 72 .....MK...YT.K.DSLVGEVLDND....ES.LARYF....LE.MGM.HCLG....CPSSRGET 73 mpp..PK...LD.DpDLPLDVLMTTW....PE.TVRVF....MD.HDM.LCVG....CMVSPFHS 74 m....AR...VT.K.EMTMGELLQTYyeqcPE.IVDVL....TG.LGM.HCIG....CPSSIGES 75 hpq..PD...-D.P.DIPLIELMALW....PQ.TIPVF....VR.HRM.LCVG....CLVSPFHT 76 m....PE...IDlS.TVTVGEWLRRW....PE.TVRVF....LN.YKM.NCPA....CPIAPFMT 77 mt...QK...FT.K.DMTFAQALQTH....PG.VAGVL....RS.YNL.GCIG....CMGAQNES 78 m....AK...IS.K.DMLINDILAVD....AG.NAAIL....MA.AGM.HCIG....CLAAAGET 79 qat..AK...IT.K.DMTFLEMLRTY....PE.TAKVL....KK.YNL.ACAG....CMGAQSEP 80 kked.-K...FH.R.DMLVGSIIGMD....PQ.AAQIL....SD.SGM.GCLG....CPASQSET 81 m....AK...IS.K.DMLINDILAID....AG.NAAIL....MA.AGM.HCIG....CLAAAGES 82 m....EK...VT.K.DMNIMEAVEKY....PI.IAQVL....MR.YGL.GCVG....CIISSAET 83 asp..CE...ID.A.ATLVDDLMRQR....PQ.TIGVF....LR.RRL.YCVG....CPVGHFHT 84 eke..VL...IT.K.KMSTGEVTKKY....PA.TKEVF....AKyFGK.GCFD....CPSFGTED 85 .....M-...VT.G.DMNIMEAVEKY....PV.IVEVL....QR.NGL.GCVG....CMIASGET 86 .....MA...LT.A.DSTIAELLREK....PE.SAQVL....FR.FGM.GCLG....CAIANNET 87 etk..PK...IT.K.KTSIGDVIQNY....PE.TESVV....KKyFGA.GCYT....CPGSKTED 88 .....M-...VT.G.DMNIMEAVEKY....PI.IVEVL....QR.NGL.GCVG....CMIASGET 89 .....M-...VT.G.DMNIMEAVEKY....PV.IVEVL....QR.NGL.GCVG....CMIASGET 90 m....AD...LT.A.DSTIYDLLQAK....PE.ATEAL....FK.FGM.GCVG....CAIARGET 91 .....--...--.-.-MTISEILRRY....PE.TLPVF....ER.HHL.DCYD....CQLADFEQ 92 .....--...--.-.-------MRRK....PE.TIRVF....LA.FQM.RCVG....CPIACFHN 93 .....--...--.-.-MTISEILRRY....PE.TLPVF....ER.HHL.DCYD....CQLADFEQ 94 vvk..PR...FY.K.EMTVGEAMAVH....PE.AGLVF....SS.YHLgGCSH....CSINELET 95 mr...PD...LD.DpDLPLSRLFDRW....PA.TAAVF....LT.RRM.LCPG....CPIAPFHT 96 vvk..PR...FY.K.EMTVGEAMAVH....PE.AGLVF....SS.YHLgGCSH....CSINELET 97 .....MA...LS.K.DSTILEVLQEK....PD.AGAIF....AR.FGM.GCVG....CAISRGET 98 .....MK...FT.L.EMKLKDIMAAN....PK.TVEAM....QE.LGL.HCLG....CPFSVNET 99 .....MA...IT.L.DSTIADLLREK....PE.SAATL....QS.FGM.GCLG....CAIANNET 100 .....MK...LD.S.KMTVGELVTRH....PS.VMEVF....IK.RRM.PCVG....CPTERFHT 101 .....MKkhiIN.G.EMKIWDVIQDY....PE.TYGIF....RQ.FGY.PDIRkgdtAVTSHFMK 102 vfk..MK...FT.L.EMKLKDIMAAN....PK.TVEAM....QE.LGL.HCLG....CPFSVNET 103 kpd..PD...-D.P.DLPLARLLQTW....PA.SAGVF....LE.RRM.LCPG....CPIAPFHT 104 kpd..PD...-D.P.DLPLARLFQTW....PA.SAGVF....LE.RRM.LCPG....CPIAPFHT 105 stk..PR...FF.K.EMTVGEAIAIH....PE.AGLVF....SS.YHLgGCSH....CSINEVET 106 prr..PR...FD.DpDLPLSTLFGEW....PD.MVEVF....LA.KQM.LCPG....CPVAPFHA 107 kaa..TE...IS.R.SMTIEDILGMF....PY.KAQKLsqeiTN.AGL.HCVG....CHAAVWET 108 ms...M-...FD.K.TTKMAAVLKGH....PK.AKEVL....ES.FGL.QCST....CSGAKHES 109 genkv--...IT.K.DMIINDVIQKY....SK.TIGIF....KD.FGV.D--S....CCGGGF-S 110 m....PV...IT.K.EMSIIEVVQKY....PE.TVEVF....RK.YGM.GCFG....-------- 50 60 | | 1 IEDACAVHG.ID..ADKLVKELNEYFEKKEV... 2 IEDACAVHG.ID..ADKLVKELNEYFEKKEV... 3 VEQACMVHG.VD..VDALLAELNKMTAGAAQ... 4 LEQAAMVHG.MD..IEKLLEALNKAI-----... 5 LEQAAMVHG.MD..IEKLLEALNKAI-----... 6 IEQGARAHG.IN..IDELIADLNKVVAEQAQs.. 7 VEQAAMVHG.AD..ADKLLEELNKVFENEE-... 8 LEEACMVHG.ID..VDELVAKLNAFEEAK--... 9 IEEACSVHG.MD..VNELVEALNKEAK----... 10 IEQGALAHG.ID..VDGLIADLNKVANKAE-... 11 IGQGARAHG.ID..VDKLIEELNKVVGKDDDacg 12 IEDACAIHG.ID..ADQLIDNLNKYLENK--... 13 LEQACEVHG.QD..VEDILAKLNK-------... 14 IEQGAMAHG.IN..VDELMKELNDAIKE---... 15 LEQAAAVHG.IN..IEQLLEKLNA-------... 16 ISDAGNVHG.ID..VDKLVDDLNKFFEEKGN... 17 IEEACEVHG.VN..CDELLEKLNTHLAAKKA... 18 IEEACALHG.ID..AQKLVDELNEYLKSKGLld. 19 LEKGAMLHG.LD..VQELLEELNKVVQ----... 20 IEGAALTHG.KK..PDELVEKLNKVIAAN--... 21 IEGAALTHG.KK..PDELVEKLNKVIAAN--... 22 IEQAAAVHG.ID..AEALLEKLNA-------... 23 IASGARMHG.LD..LDQLLKDLNEAIKNRDQe.. 24 LEQGALAHG.ID..VDAMLKALNDLIKK---... 25 LEEAAMVHG.ID..CGLLVEKINAAAKAMGK... 26 LEEACSVHG.ID..VEELLNKLNA-------... 27 LEEGANAHG.IN..VDDLVDDLNENI-----... 28 LEEAAMVHG.MD..ADVLVQQINDFLGE---... 29 LEQGANAHG.ID..VNALLKDLNDAVA----... 30 IEQAAYVHG.MD..LDELLGRLNEYAQTKEA... 31 VAQACDVHG.VD..ADELVKKLNEAVGN---... 32 VEKAAGIHG.ID..LEELLSELNKV------... 33 LEQGANAHG.VD..VDALLKDLNAAIDND--... 34 IEEAAMVHG.ID..ADEIIKSLNYSKEENN-... 35 IEEAAMVHG.IN..LDELIEALNK-------... 36 LEQACLVHN.VD..PDELVEKLNEHLAGK--... 37 LEEACIVHG.LD..ADVLAKKLNDFVVSVDGe.. 38 LEEAAIVHG.IN..LDDLIEAINNIEY----... 39 LEEATMVHG.LN..LDLLLDVLNENNT----... 40 LEEACMHHG.LN..ADELETQINDALAGI--... 41 LEQGCAAHG.IN..VDEIVADINKLF-----... 42 LAEAAMVHG.ME..LDALLEALNK-------... 43 IAEAATVHG.LN..LDDLLEALNR-------... 44 VEDACREHG.ID..RDKFLAALCDCVPA---... 45 VDDACREHD.VD..RDVFLVALRDAMADQDSpga 46 LEEAAFVHG.MN..VNELLGRLNEYMETKQA... 47 LEEACMVHG.IE..VDELLKNINEYFANK--... 48 LEEAAMVHG.ID..PNTIVAALNEDHKEEAEa.. 49 LEDACAVHG.LN..VEELIKKLNK-------... 50 IEDAVKVHG.IN..LEELLEQLNK-------... 51 MKDACREHG.VD..RDSFVAALEATIAG---... 52 LEQGCAAHG.IS..VDEIVADINKLF-----... 53 VEQGAMAHG.ID..VPSLIKDLNKAIGNQS-... 54 LEDAANVHG.LN..LDDLLKALN--------... 55 LGEAAMVHG.ID..ADLLVEKINAARAAK--... 56 IEDSCHEHG.IA..EAPFLAALRKAVAKSQEvls 57 IEEGAMGHG.ID..PDLLVAKLNATLEASQA... 58 VEHGASVHK.VD..IGRLMEDLNRIINA---... 59 LEQGCSAHG.LD..VNEVLKDLNAIGQ----... 60 ISDAGNVHG.ID..VSLLIADLNKHFESN--... 61 IIDAAREHD.LD..PASLARDLKRAVAEEDTgts 62 LEHGAGHHK.LD..IEALLEELNRTVITP--... 63 VADACREHG.VD..ADTFLSALCACT-----... 64 LEHGAGVHK.VN..IEQLLSELNEHIGSGTE... 65 LAEAAMVHG.ID..AELLVEKINAFLNA---... 66 LREASLVHG.ID..LDRLIKALSEDKN----... 67 VSEACAEYH.LD..EEVFRAALAEAVEAAHRrwg 68 LEHGAGVHK.TD..LEKLLKELNELIQS---... 69 LEHGAEVHR.VG..IDGLLEELNRSIA----... 70 LEQGCGAHG.LN..VDDVVRDLNALF-----... 71 VNDACREHM.ID..EGAFLEELRAAIAAVEGaii 72 IEQACEVHG.AD..CARLLEQLNGTA-----... 73 VSEACAEYH.LD..EVVFRAALADAVEAAHRrwg 74 LADAAYVHG.ID..SDLLVEKLNATINAKLGe.. 75 VTDACAEYD.LD..EGEFLAELKMAIGMA--... 76 IDEAASEYR.VD..ANLLKRDLMQMLKERAPqer 77 LEQGANAHG.LN..VEDILRDLNALA-----... 78 LEEAAAVHG.LD..AAELEVEINDYLAKKEEqqa 79 IDLGAINHG.LD..PEQLLADLNAAVK----... 80 LADACLVHG.LD..VEEILKQLNQ-------... 81 LEEAAAVHG.LD..AVELEQEINDYLAKKEAe.. 82 LGEGIAVHG.LN..PDIIIEEVNMILEKQEE... 83 IEEAAREHG.LE..PKALLAELRFIPCL---... 84 INLACMMHN.TD..VDKFVQELNEAAYKEINkt. 85 LAEGIEAHG.LD..TKAILAEINSLIKE---... 86 IREAAQAHG.IP..LEEMLSALGVAE-----... 87 IAFGATMHN.VD..PEVIIKELNEIIEKHK-s.. 88 LAEGIEAHG.LD..AKAILDEINSLIKE---... 89 LAEGIEAHG.LD..TKAILDEINSLIKE---... 90 IREAAEAHG.IP..LAELLNALG--IKE---... 91 LEHGATVHK.ID..VESLLCELNCSIKK---... 92 VADACREHG.VD..PDLFLSALSAAT-----... 93 LEHGATVHK.ID..VESLLCELNCNIKK---... 94 IEQVCMGYG.VE..VDVLVESLNNLLEDSED... 95 VVEACAEYG.LD..EDEFRRALRLLAGI---... 96 IEQVCMGYG.VE..VDVLIESLNNLLEDSQD... 97 VAEAAAAHG.IP..LEELMSALGISA-----... 98 LLNAAQMHK.LD..PEKLLEAVNSVEQGEMSeaa 99 IREAAMVHG.IP..LEELAKKLGL-------... 100 IEDIARING.IV..LEHLLKDLLDAIGVGEEt.. 101 LRTAAHAYH.ID..LDKLLEALNDAIAGHDRgac 102 LLNAAQMHK.LD..PEKLLEAVNSVEQGEMSeaa 103 VIEACAEYG.LD..EGEVRRALRLVVMP---... 104 VIEACAEYG.LD..EGEVRRALRLVVMP---... 105 IEQVCMGYG.VE..VDTLIDSLNNLFAEE--... 106 ITDACEEYE.LD..EEVFRAELRRAARL---... 107 LEAGMMTHGkTDaqIDELVRRLNALLQEPVDqss 108 IELGATNHG.LD..VNELLTHLNALFDEPPGk.. 109 IEKTAAMSG.GD..MEKLLEKLNKAIDE---... 110 ---------.--..-----------------...