This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATAA S A 3 3 NATAA G A 4 4 NATAA W A 5 5 NATAA Y A 6 6 NATAA E A 7 7 NATAA L A 8 8 NATAA S A 9 9 NATAA K A 10 10 NATAA S A 11 11 NATAA S A 12 12 NATAA N A 13 13 NATAA D A 14 14 NATAA Q A 15 15 NATAA F A 16 16 NATAA K A 17 17 NATAA F A 18 18 NATAA V A 19 19 NATAA L A 20 20 NATAA K A 21 21 NATAA A A 22 22 NATAA G A 23 23 NATAA N A 24 24 NATAA G A 25 25 NATAA E A 26 26 NATAA V A 27 27 NATAA I A 28 28 NATAA L A 29 29 NATAA T A 30 30 NATAA S A 31 31 NATAA E A 32 32 NATAA L A 33 33 NATAA Y A 34 34 NATAA T A 35 35 NATAA G A 36 36 NATAA K A 37 37 NATAA S A 38 38 NATAA G A 39 39 NATAA A A 40 40 NATAA M A 41 41 NATAA N A 42 42 NATAA G A 43 43 NATAA I A 44 44 NATAA E A 45 45 NATAA S A 46 46 NATAA V A 47 47 NATAA Q A 48 48 NATAA T A 49 49 NATAA N A 50 50 NATAA S A 51 51 NATRO P A 52 52 NATAA I A 53 53 NATAA E A 54 54 NATAA A A 55 55 NATAA R A 56 56 NATAA Y A 57 57 NATAA A A 58 58 NATAA K A 59 59 NATAA E A 60 60 NATAA V A 61 61 NATAA A A 62 62 NATAA K A 63 63 NATAA N A 64 64 NATAA D A 65 65 NATAA K A 66 66 NATRO P A 67 67 NATAA Y A 68 68 NATAA F A 69 69 NATAA N A 70 70 NATAA L A 71 71 NATAA K A 72 72 NATAA A A 73 73 NATAA A A 74 74 NATAA N A 75 75 NATAA H A 76 76 NATAA Q A 77 77 NATAA I A 78 78 NATAA I A 79 79 NATAA G A 80 80 NATAA T A 81 81 NATAA S A 82 82 NATAA Q A 83 83 NATAA M A 84 84 NATAA Y A 85 85 NATAA S A 86 86 NATAA S A 87 87 NATAA T A 88 88 NATAA A A 89 89 NATAA A A 90 90 NATAA R A 91 91 NATAA D A 92 92 NATAA N A 93 93 NATAA G A 94 94 NATAA I A 95 95 NATAA K A 96 96 NATAA S A 97 97 NATAA V A 98 98 NATAA M A 99 99 NATAA E A 100 100 NATAA N A 101 101 NATAA G A 102 102 NATAA K A 103 103 NATAA T A 104 104 NATAA T A 105 105 NATAA T A 106 106 NATAA I A 107 107 NATAA K A 108 108 NATAA D A 109 109 NATAA L A 110 110 NATAA T A 111 111 NATAA M A 112 112 NATAA S A 113 113 NATAA G A 114 114 NATAA W A 115 115 NATAA Y A 116 116 NATAA E A 117 117 NATAA L A 118 118 NATAA S A 119 119 NATAA K A 120 120 NATAA S A 121 121 NATAA S A 122 122 NATAA N A 123 123 NATAA D A 124 124 NATAA Q A 125 125 NATAA F A 126 126 NATAA K A 127 127 NATAA F A 128 128 NATAA V A 129 129 NATAA L A 130 130 NATAA K A 131 131 NATAA A A 132 132 NATAA G A 133 133 NATAA N A 134 134 NATAA G A 135 135 NATAA E A 136 136 NATAA V A 137 137 NATAA I A 138 138 NATAA L A 139 139 NATAA T A 140 140 NATAA S A 141 141 NATAA E A 142 142 NATAA L A 143 143 NATAA Y A 144 144 NATAA T A 145 145 NATAA G A 146 146 NATAA K A 147 147 NATAA S A 148 148 NATAA G A 149 149 NATAA A A 150 150 NATAA M A 151 151 NATAA N A 152 152 NATAA G A 153 153 NATAA I A 154 154 NATAA E A 155 155 NATAA S A 156 156 NATAA V A 157 157 NATAA Q A 158 158 NATAA T A 159 159 NATAA N A 160 160 NATAA S A 161 161 NATRO P A 162 162 NATAA I A 163 163 NATAA E A 164 164 NATAA A A 165 165 NATAA R A 166 166 NATAA Y A 167 167 NATAA A A 168 168 NATAA K A 169 169 NATAA E A 170 170 NATAA V A 171 171 NATAA A A 172 172 NATAA K A 173 173 NATAA N A 174 174 NATAA D A 175 175 NATAA K A 176 176 NATRO P A 177 177 NATAA Y A 178 178 NATAA F A 179 179 NATAA N A 180 180 NATAA L A 181 181 NATAA K A 182 182 NATAA A A 183 183 NATAA A A 184 184 NATAA N A 185 185 NATAA H A 186 186 NATAA Q A 187 187 NATAA I A 188 188 NATAA I A 189 189 NATAA G A 190 190 NATAA T A 191 191 NATAA S A 192 192 NATAA Q A 193 193 NATAA M A 194 194 NATAA Y A 195 195 NATAA S A 196 196 NATAA S A 197 197 NATAA T A 198 198 NATAA A A 199 199 NATAA A A 200 200 NATAA R A 201 201 NATAA D A 202 202 NATAA N A 203 203 NATAA G A 204 204 NATAA I A 205 205 NATAA K A 206 206 NATAA S A 207 207 NATAA V A 208 208 NATAA M A 209 209 NATAA E A 210 210 NATAA N A 211 211 NATAA G A 212 212 NATAA K A 213 213 NATAA T A 214 214 NATAA T A 215 215 NATAA T A 216 216 NATAA I A 217 217 NATAA K A 218 218 NATAA D A 219 219 NATAA L A 220 220 NATAA T