# TARGET T0472 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0472.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 26.5762 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.112 0.012 0.012 0.028 0.054 0.096 0.019 0.667 2 S 0.068 0.014 0.018 0.023 0.060 0.101 0.024 0.692 3 G 0.024 0.020 0.036 0.068 0.210 0.109 0.029 0.503 4 W 0.005 0.005 0.055 0.157 0.457 0.050 0.052 0.218 5 Y 0.005 0.004 0.047 0.335 0.372 0.028 0.036 0.172 6 E 0.003 0.002 0.048 0.453 0.392 0.015 0.016 0.070 7 L 0.005 0.001 0.053 0.268 0.308 0.038 0.036 0.291 8 S 0.018 0.004 0.047 0.363 0.329 0.030 0.097 0.111 9 K 0.058 0.003 0.020 0.076 0.124 0.089 0.042 0.587 10 S 0.469 0.005 0.005 0.013 0.017 0.061 0.032 0.398 11 S 0.288 0.012 0.002 0.007 0.011 0.072 0.019 0.589 12 N 0.027 0.018 0.004 0.004 0.029 0.123 0.012 0.783 13 D 0.013 0.034 0.027 0.063 0.253 0.121 0.033 0.456 14 Q 0.005 0.029 0.030 0.299 0.399 0.038 0.034 0.167 15 F 0.003 0.029 0.030 0.353 0.452 0.013 0.027 0.092 16 K 0.002 0.015 0.034 0.363 0.514 0.008 0.019 0.044 17 F 0.002 0.015 0.036 0.469 0.436 0.005 0.012 0.025 18 V 0.002 0.010 0.045 0.389 0.502 0.006 0.014 0.032 19 L 0.006 0.004 0.045 0.434 0.429 0.010 0.037 0.036 20 K 0.040 0.008 0.037 0.341 0.380 0.025 0.076 0.094 21 A 0.298 0.006 0.021 0.037 0.065 0.070 0.034 0.470 22 G 0.221 0.006 0.009 0.021 0.025 0.081 0.019 0.618 23 N 0.012 0.007 0.007 0.006 0.028 0.079 0.008 0.853 24 G 0.007 0.008 0.038 0.035 0.192 0.140 0.041 0.540 25 E 0.003 0.002 0.064 0.401 0.300 0.039 0.076 0.113 26 V 0.004 0.003 0.130 0.376 0.261 0.024 0.069 0.132 27 I 0.006 0.007 0.202 0.216 0.323 0.035 0.033 0.177 28 L 0.005 0.006 0.309 0.225 0.308 0.027 0.023 0.097 29 T 0.059 0.045 0.119 0.134 0.235 0.048 0.107 0.254 30 S 0.131 0.048 0.061 0.079 0.103 0.081 0.218 0.279 31 E 0.038 0.061 0.038 0.061 0.097 0.161 0.116 0.428 32 L 0.082 0.073 0.020 0.013 0.033 0.113 0.050 0.614 33 Y 0.081 0.089 0.019 0.036 0.039 0.121 0.095 0.520 34 T 0.026 0.131 0.013 0.014 0.021 0.096 0.098 0.601 35 G 0.065 0.638 0.005 0.006 0.007 0.039 0.057 0.183 36 K 0.060 0.764 0.005 0.003 0.003 0.023 0.035 0.106 37 S 0.034 0.403 0.015 0.006 0.007 0.036 0.343 0.156 38 G 0.024 0.750 0.006 0.003 0.003 0.017 0.145 0.050 39 A 0.073 0.842 0.003 0.001 0.002 0.009 0.039 0.031 40 M 0.039 0.789 0.008 0.004 0.006 0.017 0.035 0.103 41 N 0.015 0.373 0.019 0.010 0.022 0.057 0.219 0.286 42 G 0.022 0.536 0.017 0.004 0.005 0.038 0.302 0.077 43 I 0.067 0.675 0.022 0.007 0.008 0.028 0.123 0.070 44 E 0.055 0.207 0.053 0.014 0.023 0.074 0.238 0.335 45 S 0.024 0.081 0.067 0.009 0.018 0.056 0.580 0.165 46 V 0.260 0.090 0.091 0.024 0.027 0.077 0.184 0.247 47 Q 0.175 0.019 0.028 0.018 0.022 0.105 0.045 0.588 48 T 0.005 0.007 0.007 0.002 0.005 0.095 0.010 0.869 49 N 0.027 0.047 0.013 0.004 0.008 0.145 0.018 0.738 50 S 0.117 0.178 0.016 0.015 0.008 0.130 0.043 0.493 51 P 0.124 0.464 0.009 0.004 0.004 0.047 0.038 0.310 52 I 0.112 0.756 0.004 0.002 0.003 0.014 0.032 0.077 53 E 0.043 0.756 0.009 0.005 0.006 0.023 0.028 0.129 54 A 0.023 0.738 0.010 0.008 0.015 0.024 0.024 0.158 55 R 0.044 0.664 0.014 0.018 0.031 0.037 0.050 0.141 56 Y 0.058 0.650 0.013 0.022 0.032 0.036 0.058 0.131 57 A 0.032 0.664 0.011 0.021 0.032 0.027 0.046 0.168 58 K 0.042 0.424 0.020 0.047 0.053 0.047 0.070 0.299 59 E 0.089 0.120 0.036 0.126 0.088 0.065 0.237 0.239 60 V 0.122 0.025 0.034 0.055 0.048 0.074 0.208 0.434 61 A 0.622 0.005 0.006 0.007 0.008 0.034 0.028 0.291 62 K 0.205 0.001 0.002 0.003 0.003 0.051 0.012 0.722 63 N 0.003 0.001 0.001 0.001 0.003 0.065 0.002 0.923 64 D 0.011 0.003 0.008 0.006 0.022 0.113 0.015 0.824 65 K 0.037 0.011 0.030 0.133 0.071 0.128 0.076 0.513 66 P 0.015 0.031 0.088 0.113 0.178 0.059 0.047 0.470 67 Y 0.008 0.032 0.100 0.124 0.276 0.048 0.036 0.376 68 F 0.003 0.025 0.190 0.380 0.292 0.015 0.017 0.078 69 N 0.011 0.065 0.201 0.223 0.286 0.020 0.051 0.142 70 L 0.014 0.021 0.233 0.311 0.186 0.017 0.147 0.070 71 K 0.121 0.033 0.149 0.169 0.159 0.047 0.144 0.179 72 A 0.366 0.012 0.040 0.023 0.034 0.057 0.062 0.406 73 A 0.051 0.008 0.018 0.017 0.027 0.091 0.019 0.769 74 N 0.018 0.011 0.010 0.011 0.044 0.080 0.022 0.804 75 H 0.012 0.009 0.028 0.046 0.107 0.131 0.046 0.621 76 Q 0.008 0.004 0.095 0.321 0.255 0.056 0.076 0.185 77 I 0.009 0.006 0.103 0.150 0.179 0.065 0.094 0.394 78 I 0.014 0.013 0.258 0.155 0.174 0.072 0.052 0.261 79 G 0.031 0.050 0.179 0.122 0.158 0.073 0.047 0.339 80 T 0.091 0.191 0.048 0.043 0.070 0.068 0.084 0.404 81 S 0.134 0.180 0.043 0.036 0.057 0.084 0.170 0.296 82 Q 0.045 0.060 0.028 0.033 0.053 0.099 0.443 0.239 83 M 0.022 0.064 0.020 0.018 0.034 0.093 0.459 0.288 84 Y 0.032 0.333 0.017 0.034 0.059 0.095 0.067 0.362 85 S 0.037 0.454 0.010 0.018 0.038 0.059 0.032 0.352 86 S 0.029 0.794 0.006 0.007 0.009 0.021 0.043 0.091 87 T 0.041 0.832 0.008 0.005 0.005 0.015 0.039 0.055 88 A 0.070 0.426 0.032 0.013 0.010 0.042 0.265 0.143 89 A 0.110 0.479 0.032 0.007 0.006 0.047 0.197 0.123 90 R 0.388 0.369 0.006 0.002 0.002 0.021 0.097 0.115 91 D 0.098 0.284 0.008 0.003 0.004 0.039 0.054 0.510 92 N 0.008 0.076 0.015 0.005 0.012 0.101 0.107 0.676 93 G 0.020 0.440 0.015 0.006 0.008 0.072 0.229 0.210 94 I 0.047 0.809 0.010 0.006 0.005 0.020 0.031 0.072 95 K 0.066 0.550 0.040 0.008 0.012 0.041 0.051 0.232 96 S 0.034 0.185 0.085 0.014 0.016 0.037 0.511 0.118 97 V 0.180 0.243 0.114 0.015 0.014 0.055 0.207 0.172 98 M 0.271 0.076 0.058 0.013 0.015 0.072 0.068 0.427 99 E 0.013 0.014 0.015 0.004 0.007 0.077 0.045 0.825 100 N 0.038 0.029 0.014 0.005 0.011 0.113 0.123 0.667 101 G 0.065 0.045 0.017 0.018 0.014 0.149 0.129 0.562 102 K 0.061 0.145 0.015 0.014 0.023 0.087 0.050 0.606 103 T 0.082 0.237 0.013 0.012 0.022 0.074 0.041 0.520 104 T 0.024 0.150 0.089 0.078 0.069 0.102 0.074 0.415 105 T 0.085 0.188 0.053 0.043 0.071 0.077 0.096 0.388 106 I 0.130 0.042 0.070 0.050 0.047 0.064 0.342 0.255 107 K 0.057 0.030 0.050 0.053 0.066 0.100 0.165 0.480 108 D 0.078 0.022 0.017 0.018 0.035 0.067 0.067 0.697 109 L 0.022 0.010 0.017 0.027 0.040 0.127 0.030 0.728 110 T 0.047 0.016 0.021 0.033 0.066 0.101 0.055 0.661