# TARGET T0472 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t04-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0472.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 26.1173 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.059 0.045 0.039 0.057 0.101 0.057 0.012 0.631 2 S 0.047 0.035 0.030 0.044 0.072 0.197 0.016 0.559 3 G 0.125 0.032 0.043 0.068 0.094 0.154 0.027 0.457 4 W 0.210 0.034 0.084 0.071 0.115 0.108 0.031 0.346 5 Y 0.027 0.019 0.076 0.410 0.281 0.043 0.003 0.142 6 E 0.008 0.012 0.039 0.292 0.461 0.051 0.002 0.136 7 L 0.010 0.011 0.020 0.341 0.492 0.019 0.001 0.107 8 S 0.005 0.014 0.013 0.333 0.573 0.018 0.002 0.043 9 K 0.020 0.018 0.011 0.210 0.368 0.041 0.006 0.326 10 S 0.022 0.023 0.013 0.257 0.430 0.066 0.012 0.177 11 S 0.043 0.021 0.013 0.073 0.123 0.113 0.017 0.596 12 N 0.027 0.016 0.009 0.038 0.041 0.410 0.045 0.414 13 D 0.450 0.009 0.008 0.018 0.021 0.125 0.168 0.202 14 Q 0.207 0.013 0.024 0.032 0.030 0.533 0.037 0.124 15 F 0.014 0.006 0.019 0.426 0.406 0.034 0.002 0.093 16 K 0.003 0.003 0.014 0.280 0.637 0.022 0.001 0.040 17 F 0.001 0.001 0.003 0.542 0.440 0.002 0.001 0.010 18 V 0.001 0.003 0.012 0.348 0.618 0.004 0.001 0.014 19 L 0.001 0.003 0.006 0.450 0.528 0.002 0.001 0.010 20 K 0.001 0.005 0.008 0.255 0.701 0.003 0.001 0.026 21 A 0.007 0.012 0.012 0.243 0.610 0.017 0.002 0.098 22 G 0.029 0.019 0.025 0.145 0.343 0.123 0.019 0.296 23 N 0.118 0.011 0.023 0.043 0.076 0.110 0.052 0.566 24 G 0.221 0.011 0.083 0.080 0.099 0.085 0.081 0.341 25 E 0.100 0.006 0.128 0.139 0.103 0.318 0.011 0.195 26 V 0.011 0.003 0.130 0.208 0.270 0.046 0.002 0.331 27 I 0.004 0.002 0.164 0.270 0.486 0.021 0.001 0.050 28 L 0.004 0.003 0.266 0.293 0.341 0.017 0.001 0.075 29 T 0.004 0.005 0.266 0.204 0.345 0.037 0.001 0.138 30 S 0.008 0.007 0.133 0.176 0.318 0.087 0.003 0.269 31 E 0.017 0.008 0.082 0.064 0.147 0.202 0.007 0.473 32 L 0.058 0.011 0.033 0.015 0.032 0.421 0.016 0.413 33 Y 0.198 0.050 0.037 0.019 0.034 0.208 0.022 0.431 34 T 0.086 0.103 0.034 0.013 0.030 0.217 0.009 0.507 35 G 0.110 0.076 0.016 0.005 0.018 0.122 0.016 0.637 36 K 0.222 0.181 0.021 0.007 0.018 0.084 0.016 0.451 37 S 0.034 0.177 0.008 0.004 0.004 0.199 0.006 0.568 38 G 0.080 0.263 0.008 0.002 0.004 0.115 0.014 0.513 39 A 0.192 0.604 0.030 0.001 0.004 0.020 0.011 0.139 40 M 0.038 0.765 0.010 0.003 0.003 0.047 0.005 0.129 41 N 0.040 0.781 0.004 0.002 0.002 0.026 0.009 0.136 42 G 0.128 0.757 0.018 0.001 0.001 0.005 0.019 0.072 43 I 0.053 0.772 0.043 0.004 0.004 0.012 0.010 0.103 44 E 0.023 0.709 0.030 0.018 0.014 0.047 0.008 0.150 45 S 0.069 0.679 0.032 0.005 0.008 0.014 0.011 0.182 46 V 0.083 0.741 0.065 0.005 0.007 0.009 0.012 0.078 47 Q 0.032 0.729 0.057 0.017 0.015 0.024 0.009 0.118 48 T 0.088 0.565 0.046 0.014 0.021 0.038 0.025 0.203 49 N 0.299 0.336 0.034 0.007 0.017 0.017 0.080 0.209 50 S 0.324 0.125 0.051 0.014 0.012 0.093 0.049 0.332 51 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.993 52 I 0.033 0.026 0.026 0.012 0.029 0.220 0.006 0.649 53 E 0.118 0.056 0.022 0.009 0.009 0.121 0.005 0.660 54 A 0.076 0.183 0.020 0.009 0.014 0.132 0.009 0.557 55 R 0.177 0.336 0.027 0.010 0.017 0.083 0.013 0.336 56 Y 0.073 0.634 0.034 0.026 0.043 0.031 0.008 0.150 57 A 0.044 0.595 0.018 0.031 0.060 0.047 0.011 0.193 58 K 0.070 0.581 0.018 0.034 0.051 0.026 0.013 0.207 59 E 0.057 0.600 0.024 0.048 0.073 0.024 0.017 0.156 60 V 0.065 0.444 0.020 0.060 0.084 0.024 0.019 0.283 61 A 0.055 0.454 0.021 0.073 0.098 0.040 0.027 0.233 62 K 0.161 0.271 0.019 0.032 0.033 0.056 0.053 0.375 63 N 0.164 0.090 0.023 0.024 0.020 0.073 0.107 0.499 64 D 0.341 0.028 0.033 0.013 0.019 0.046 0.213 0.307 65 K 0.297 0.006 0.081 0.036 0.025 0.263 0.020 0.271 66 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 67 Y 0.008 0.001 0.026 0.139 0.473 0.154 0.001 0.197 68 F 0.159 0.003 0.048 0.329 0.258 0.049 0.001 0.152 69 N 0.024 0.016 0.081 0.261 0.382 0.045 0.002 0.189 70 L 0.014 0.009 0.072 0.367 0.439 0.028 0.001 0.069 71 K 0.009 0.015 0.047 0.276 0.463 0.038 0.002 0.150 72 A 0.022 0.033 0.045 0.187 0.395 0.060 0.006 0.252 73 A 0.041 0.055 0.045 0.057 0.134 0.267 0.024 0.379 74 N 0.190 0.042 0.035 0.037 0.065 0.106 0.077 0.449 75 H 0.273 0.027 0.087 0.033 0.044 0.057 0.066 0.412 76 Q 0.090 0.020 0.154 0.115 0.074 0.276 0.014 0.257 77 I 0.040 0.014 0.172 0.093 0.136 0.100 0.005 0.440 78 I 0.017 0.015 0.224 0.213 0.312 0.048 0.002 0.168 79 G 0.011 0.018 0.285 0.143 0.233 0.061 0.002 0.247 80 T 0.022 0.021 0.187 0.095 0.163 0.088 0.004 0.421 81 S 0.018 0.029 0.099 0.076 0.161 0.131 0.006 0.480 82 Q 0.040 0.031 0.057 0.047 0.089 0.170 0.010 0.557 83 M 0.064 0.069 0.044 0.027 0.048 0.328 0.015 0.405 84 Y 0.129 0.193 0.047 0.040 0.067 0.181 0.019 0.324 85 S 0.091 0.349 0.047 0.025 0.052 0.126 0.013 0.296 86 S 0.088 0.353 0.029 0.018 0.036 0.077 0.015 0.383 87 T 0.085 0.441 0.023 0.008 0.016 0.046 0.013 0.368 88 A 0.040 0.350 0.008 0.007 0.012 0.233 0.010 0.340 89 A 0.114 0.398 0.005 0.003 0.007 0.272 0.021 0.181 90 R 0.146 0.777 0.010 0.001 0.004 0.008 0.012 0.041 91 D 0.045 0.815 0.013 0.001 0.002 0.016 0.009 0.099 92 N 0.040 0.697 0.006 0.002 0.001 0.051 0.028 0.175 93 G 0.474 0.265 0.011 0.001 0.002 0.013 0.060 0.174 94 I 0.056 0.511 0.189 0.009 0.006 0.052 0.007 0.170 95 K 0.023 0.366 0.044 0.025 0.019 0.156 0.008 0.359 96 S 0.065 0.483 0.032 0.003 0.008 0.026 0.004 0.379 97 V 0.032 0.842 0.041 0.002 0.004 0.014 0.004 0.062 98 M 0.014 0.914 0.011 0.003 0.006 0.006 0.003 0.042 99 E 0.040 0.868 0.010 0.002 0.005 0.016 0.010 0.049 100 N 0.280 0.501 0.007 0.002 0.004 0.007 0.124 0.076 101 G 0.622 0.134 0.033 0.004 0.004 0.009 0.102 0.093 102 K 0.039 0.110 0.055 0.013 0.007 0.126 0.022 0.627 103 T 0.066 0.053 0.030 0.014 0.022 0.139 0.023 0.653 104 T 0.298 0.053 0.101 0.020 0.018 0.074 0.014 0.422 105 T 0.069 0.061 0.081 0.038 0.028 0.263 0.010 0.450 106 I 0.071 0.086 0.124 0.088 0.108 0.081 0.008 0.435 107 K 0.050 0.147 0.124 0.081 0.106 0.146 0.008 0.336 108 D 0.076 0.079 0.047 0.059 0.089 0.104 0.015 0.531 109 L 0.149 0.123 0.105 0.054 0.090 0.088 0.024 0.367 110 T 0.059 0.073 0.034 0.063 0.057 0.368 0.018 0.328