This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATAA S A 3 3 NATAA G A 4 4 NATAA W A 5 5 NATAA Y A 6 6 NATAA E A 7 7 NATAA L A 8 8 NATAA S A 9 9 NATAA K A 10 10 NATAA S A 11 11 NATAA S A 12 12 NATAA N A 13 13 NATAA D A 14 14 NATAA Q A 15 15 NATAA F A 16 16 NATAA K A 17 17 NATAA F A 18 18 NATAA V A 19 19 NATAA L A 20 20 NATAA K A 21 21 NATAA A A 22 22 NATAA G A 23 23 NATAA N A 24 24 NATAA G A 25 25 NATAA E A 26 26 NATAA V A 27 27 NATAA I A 28 28 NATAA L A 29 29 NATAA T A 30 30 NATAA S A 31 31 NATAA E A 32 32 NATAA L A 33 33 NATAA Y A 34 34 NATAA T A 35 35 NATAA G A 36 36 NATAA K A 37 37 NATAA S A 38 38 NATAA G A 39 39 NATAA A A 40 40 NATAA M A 41 41 NATAA N A 42 42 NATAA G A 43 43 NATAA I A 44 44 NATAA E A 45 45 NATAA S A 46 46 NATAA V A 47 47 NATAA Q A 48 48 NATAA T A 49 49 NATAA N A 50 50 NATAA S A 51 51 NATRO P A 52 52 NATAA I A 53 53 NATAA E A 54 54 NATAA A A 55 55 NATAA R A 56 56 NATAA Y A 57 57 NATAA A A 58 58 NATAA K A 59 59 NATAA E A 60 60 NATAA V A 61 61 NATAA A A 62 62 NATAA K A 63 63 NATAA N A 64 64 NATAA D A 65 65 NATAA K A 66 66 NATRO P A 67 67 NATAA Y A 68 68 NATAA F A 69 69 NATAA N A 70 70 NATAA L A 71 71 NATAA K A 72 72 NATAA A A 73 73 NATAA A A 74 74 NATAA N A 75 75 NATAA H A 76 76 NATAA Q A 77 77 NATAA I A 78 78 NATAA I A 79 79 NATAA G A 80 80 NATAA T A 81 81 NATAA S A 82 82 NATAA Q A 83 83 NATAA M A 84 84 NATAA Y A 85 85 NATAA S A 86 86 NATAA S A 87 87 NATAA T A 88 88 NATAA A A 89 89 NATAA A A 90 90 NATAA R A 91 91 NATAA D A 92 92 NATAA N A 93 93 NATAA G A 94 94 NATAA I A 95 95 NATAA K A 96 96 NATAA S A 97 97 NATAA V A 98 98 NATAA M A 99 99 NATAA E A 100 100 NATAA N A 101 101 NATAA G A 102 102 NATAA K A 103 103 NATAA T A 104 104 NATAA T A 105 105 NATAA T A 106 106 NATAA I A 107 107 NATAA K A 108 108 NATAA D A 109 109 NATAA L A 110 110 NATAA T