# TARGET T0472 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t2k-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0472.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 12.7033 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 P 0.051 0.274 0.014 0.022 0.033 0.083 0.060 0.462 2 I 0.079 0.476 0.011 0.017 0.023 0.051 0.073 0.271 3 E 0.064 0.640 0.008 0.010 0.014 0.032 0.052 0.180 4 A 0.039 0.625 0.013 0.014 0.025 0.033 0.051 0.200 5 R 0.034 0.572 0.015 0.023 0.046 0.033 0.071 0.205 6 Y 0.053 0.528 0.018 0.041 0.060 0.039 0.070 0.191 7 A 0.047 0.489 0.021 0.049 0.091 0.036 0.052 0.215 8 K 0.041 0.390 0.015 0.065 0.121 0.037 0.048 0.284 9 E 0.058 0.045 0.079 0.105 0.139 0.067 0.180 0.328 10 V 0.065 0.005 0.059 0.113 0.129 0.059 0.133 0.437 11 A 0.386 0.001 0.006 0.013 0.017 0.041 0.030 0.507 12 K 0.229 0.001 0.002 0.004 0.004 0.054 0.023 0.684 13 N 0.004 0.001 0.001 0.001 0.002 0.089 0.003 0.899 14 D 0.020 0.002 0.009 0.013 0.025 0.105 0.023 0.803 15 K 0.004 0.003 0.031 0.161 0.201 0.082 0.042 0.476 16 P 0.004 0.009 0.117 0.136 0.259 0.050 0.092 0.333 17 Y 0.003 0.011 0.080 0.212 0.421 0.031 0.074 0.168 18 F 0.003 0.016 0.138 0.323 0.391 0.013 0.036 0.081 19 N 0.003 0.015 0.073 0.339 0.453 0.011 0.032 0.074 20 L 0.008 0.005 0.192 0.302 0.301 0.023 0.075 0.093 21 K 0.089 0.004 0.124 0.186 0.202 0.058 0.122 0.215 22 A 0.265 0.003 0.026 0.053 0.087 0.078 0.048 0.440 23 A 0.072 0.003 0.019 0.021 0.031 0.140 0.037 0.676 24 N 0.015 0.006 0.017 0.006 0.020 0.147 0.036 0.754 25 H 0.012 0.007 0.053 0.059 0.090 0.154 0.080 0.545 26 Q 0.007 0.012 0.230 0.151 0.184 0.069 0.091 0.257 27 I 0.010 0.011 0.319 0.086 0.136 0.057 0.107 0.273 28 I 0.010 0.013 0.324 0.151 0.132 0.055 0.096 0.220 29 G 0.036 0.092 0.274 0.077 0.149 0.067 0.058 0.247 30 T 0.087 0.128 0.110 0.046 0.066 0.082 0.167 0.314 31 S 0.110 0.102 0.080 0.034 0.051 0.104 0.259 0.260 32 Q 0.103 0.052 0.083 0.029 0.047 0.130 0.277 0.279 33 M 0.062 0.032 0.064 0.024 0.032 0.107 0.286 0.394 34 Y 0.034 0.124 0.029 0.026 0.042 0.151 0.078 0.515 35 S 0.026 0.322 0.013 0.012 0.022 0.082 0.038 0.484 36 S 0.084 0.777 0.003 0.003 0.004 0.015 0.053 0.062 37 T 0.043 0.810 0.002 0.003 0.005 0.015 0.061 0.060 38 A 0.036 0.341 0.025 0.007 0.010 0.037 0.419 0.124 39 A 0.088 0.174 0.055 0.007 0.009 0.043 0.512 0.112 40 R 0.331 0.300 0.017 0.006 0.005 0.032 0.114 0.195 41 D 0.058 0.288 0.005 0.004 0.007 0.040 0.033 0.566 42 N 0.011 0.244 0.009 0.004 0.006 0.105 0.055 0.566 43 G 0.021 0.615 0.015 0.008 0.014 0.039 0.122 0.166 44 I 0.014 0.906 0.002 0.003 0.003 0.008 0.007 0.057 45 K 0.009 0.928 0.003 0.002 0.006 0.004 0.006 0.043 46 S 0.037 0.251 0.091 0.010 0.013 0.027 0.469 0.101 47 V 0.177 0.170 0.144 0.022 0.026 0.040 0.277 0.144 48 M 0.428 0.042 0.032 0.013 0.012 0.042 0.083 0.346 49 E 0.034 0.008 0.015 0.006 0.008 0.087 0.028 0.814 50 N 0.023 0.008 0.011 0.003 0.006 0.099 0.046 0.804 51 G 0.043 0.008 0.019 0.016 0.011 0.149 0.106 0.646 52 K 0.032 0.038 0.023 0.017 0.025 0.099 0.031 0.734 53 T 0.170 0.056 0.013 0.007 0.013 0.075 0.047 0.620 54 T 0.020 0.054 0.106 0.044 0.049 0.108 0.036 0.582 55 T 0.069 0.184 0.043 0.018 0.052 0.082 0.057 0.496 56 I 0.158 0.026 0.073 0.032 0.030 0.095 0.205 0.381 57 K 0.063 0.019 0.075 0.030 0.042 0.125 0.071 0.575 58 D 0.064 0.013 0.024 0.022 0.045 0.098 0.044 0.690 59 L 0.027 0.006 0.043 0.023 0.028 0.131 0.044 0.698 60 T 0.067 0.013 0.038 0.025 0.036 0.137 0.095 0.589