# TARGET T0471 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0471.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 15.2811 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.086 0.042 0.034 0.016 0.030 0.131 0.011 0.650 2 W 0.079 0.071 0.047 0.017 0.048 0.133 0.009 0.596 3 N 0.042 0.077 0.015 0.009 0.019 0.154 0.007 0.676 4 D 0.060 0.106 0.007 0.005 0.007 0.144 0.009 0.662 5 L 0.135 0.422 0.014 0.008 0.013 0.108 0.010 0.290 6 A 0.027 0.683 0.020 0.012 0.017 0.078 0.008 0.155 7 V 0.016 0.808 0.010 0.009 0.012 0.022 0.004 0.120 8 Y 0.011 0.917 0.010 0.009 0.010 0.006 0.003 0.034 9 I 0.010 0.911 0.006 0.011 0.020 0.007 0.004 0.031 10 I 0.009 0.925 0.010 0.011 0.018 0.005 0.003 0.020 11 R 0.014 0.926 0.005 0.017 0.011 0.003 0.007 0.018 12 C 0.175 0.563 0.016 0.028 0.023 0.009 0.085 0.101 13 S 0.199 0.322 0.050 0.057 0.056 0.017 0.085 0.215 14 G 0.076 0.068 0.042 0.056 0.074 0.079 0.035 0.570 15 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 16 G 0.047 0.009 0.026 0.050 0.048 0.132 0.040 0.649 17 T 0.635 0.002 0.050 0.025 0.019 0.071 0.028 0.170 18 R 0.052 0.001 0.380 0.165 0.124 0.079 0.004 0.195 19 V 0.005 0.001 0.277 0.206 0.272 0.032 0.001 0.206 20 V 0.001 0.001 0.548 0.206 0.226 0.005 0.001 0.013 21 E 0.001 0.001 0.637 0.139 0.159 0.005 0.001 0.059 22 V 0.001 0.001 0.693 0.103 0.149 0.005 0.001 0.048 23 G 0.001 0.001 0.647 0.096 0.140 0.021 0.001 0.094 24 A 0.001 0.001 0.198 0.045 0.112 0.056 0.001 0.585 25 G 0.006 0.005 0.191 0.047 0.128 0.115 0.004 0.503 26 R 0.038 0.005 0.029 0.013 0.022 0.186 0.005 0.702 27 F 0.058 0.046 0.035 0.028 0.031 0.134 0.010 0.657 28 L 0.069 0.131 0.029 0.023 0.038 0.083 0.007 0.620 29 Y 0.027 0.325 0.016 0.024 0.028 0.125 0.007 0.448 30 V 0.043 0.668 0.009 0.010 0.022 0.054 0.006 0.189 31 S 0.016 0.898 0.005 0.005 0.013 0.013 0.003 0.047 32 D 0.012 0.889 0.002 0.003 0.005 0.012 0.004 0.072 33 Y 0.015 0.944 0.001 0.001 0.002 0.004 0.003 0.029 34 I 0.013 0.969 0.001 0.001 0.002 0.001 0.003 0.010 35 R 0.022 0.938 0.003 0.004 0.004 0.002 0.009 0.017 36 K 0.129 0.713 0.012 0.007 0.009 0.006 0.050 0.074 37 H 0.180 0.600 0.035 0.010 0.012 0.013 0.052 0.098 38 S 0.094 0.280 0.054 0.039 0.021 0.032 0.082 0.397 39 K 0.197 0.021 0.078 0.021 0.020 0.065 0.128 0.470 40 V 0.181 0.004 0.476 0.037 0.025 0.067 0.017 0.192 41 D 0.004 0.001 0.749 0.090 0.055 0.026 0.003 0.073 42 L 0.003 0.001 0.513 0.063 0.135 0.023 0.001 0.260 43 V 0.001 0.001 0.949 0.025 0.021 0.001 0.001 0.003 44 L 0.001 0.001 0.704 0.074 0.067 0.016 0.001 0.137 45 T 0.001 0.001 0.864 0.043 0.068 0.004 0.001 0.020 46 D 0.002 0.001 0.415 0.086 0.169 0.072 0.001 0.255 47 I 0.007 0.001 0.266 0.044 0.150 0.059 0.004 0.469 48 K 0.010 0.001 0.046 0.037 0.074 0.512 0.002 0.319 49 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 50 S 0.009 0.002 0.024 0.040 0.080 0.284 0.005 0.556 51 H 0.164 0.003 0.016 0.013 0.015 0.105 0.017 0.667 52 G 0.127 0.013 0.071 0.047 0.062 0.104 0.009 0.567 53 G 0.069 0.007 0.107 0.100 0.113 0.133 0.008 0.463 54 I 0.034 0.005 0.114 0.041 0.062 0.069 0.004 0.670 55 V 0.020 0.008 0.391 0.130 0.178 0.069 0.004 0.201 56 R 0.009 0.011 0.216 0.116 0.146 0.058 0.002 0.442 57 D 0.006 0.025 0.214 0.126 0.255 0.055 0.003 0.317 58 D 0.026 0.021 0.107 0.073 0.146 0.122 0.009 0.495 59 I 0.070 0.016 0.051 0.026 0.062 0.554 0.011 0.211 60 T 0.120 0.021 0.017 0.012 0.028 0.685 0.022 0.094 61 S 0.297 0.138 0.028 0.036 0.033 0.162 0.017 0.290 62 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.996 63 R 0.022 0.013 0.011 0.021 0.062 0.411 0.010 0.449 64 M 0.410 0.067 0.025 0.024 0.051 0.072 0.017 0.334 65 E 0.080 0.161 0.058 0.115 0.129 0.116 0.013 0.328 66 I 0.080 0.080 0.030 0.038 0.094 0.096 0.007 0.574 67 Y 0.085 0.333 0.095 0.105 0.190 0.055 0.007 0.129 68 R 0.056 0.263 0.043 0.180 0.170 0.076 0.020 0.192 69 G 0.137 0.121 0.039 0.073 0.097 0.038 0.070 0.425 70 A 0.280 0.030 0.121 0.064 0.118 0.093 0.030 0.264 71 A 0.021 0.032 0.152 0.263 0.139 0.097 0.014 0.284 72 L 0.015 0.013 0.122 0.069 0.183 0.086 0.009 0.503 73 I 0.011 0.014 0.615 0.153 0.157 0.022 0.003 0.024 74 Y 0.010 0.040 0.525 0.214 0.145 0.016 0.003 0.046 75 S 0.006 0.011 0.643 0.111 0.142 0.008 0.008 0.071 76 I 0.013 0.007 0.431 0.074 0.116 0.025 0.010 0.324 77 R 0.011 0.006 0.212 0.108 0.157 0.047 0.006 0.452 78 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.997 79 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 80 A 0.008 0.001 0.002 0.002 0.007 0.047 0.001 0.932 81 E 0.168 0.011 0.003 0.002 0.003 0.146 0.004 0.663 82 I 0.265 0.263 0.008 0.004 0.006 0.069 0.004 0.382 83 H 0.065 0.689 0.010 0.003 0.007 0.024 0.002 0.199 84 S 0.015 0.702 0.006 0.002 0.004 0.018 0.003 0.250 85 S 0.035 0.737 0.003 0.001 0.003 0.029 0.008 0.184 86 L 0.029 0.928 0.002 0.001 0.002 0.006 0.005 0.027 87 M 0.006 0.968 0.004 0.001 0.002 0.005 0.003 0.012 88 R 0.009 0.962 0.002 0.001 0.001 0.005 0.003 0.017 89 V 0.024 0.946 0.003 0.001 0.001 0.002 0.003 0.018 90 A 0.010 0.968 0.002 0.001 0.002 0.002 0.003 0.012 91 D 0.041 0.893 0.003 0.002 0.002 0.003 0.021 0.035 92 A 0.138 0.736 0.017 0.003 0.002 0.005 0.050 0.048 93 V 0.151 0.634 0.041 0.021 0.010 0.008 0.068 0.067 94 G 0.211 0.092 0.141 0.041 0.031 0.049 0.173 0.262 95 A 0.062 0.015 0.563 0.053 0.050 0.056 0.011 0.190 96 R 0.012 0.008 0.500 0.138 0.091 0.055 0.007 0.189 97 L 0.014 0.003 0.385 0.051 0.076 0.049 0.004 0.420 98 I 0.001 0.001 0.908 0.045 0.035 0.003 0.001 0.007 99 I 0.003 0.002 0.636 0.089 0.111 0.012 0.002 0.146 100 K 0.001 0.001 0.778 0.084 0.096 0.005 0.001 0.037 101 P 0.001 0.001 0.005 0.002 0.003 0.002 0.001 0.988 102 L 0.004 0.001 0.282 0.065 0.258 0.123 0.004 0.263 103 T 0.035 0.001 0.045 0.018 0.028 0.161 0.006 0.706 104 G 0.087 0.006 0.039 0.025 0.041 0.083 0.021 0.699 105 E 0.262 0.004 0.037 0.019 0.033 0.200 0.009 0.436 106 D 0.022 0.004 0.016 0.021 0.020 0.065 0.005 0.847 107 I 0.067 0.013 0.041 0.092 0.142 0.087 0.008 0.550 108 V 0.063 0.020 0.064 0.111 0.181 0.140 0.006 0.416 109 T 0.033 0.031 0.035 0.145 0.250 0.085 0.005 0.416 110 E 0.026 0.034 0.027 0.058 0.158 0.083 0.007 0.607 111 R 0.057 0.031 0.019 0.052 0.073 0.272 0.018 0.477 112 K 0.191 0.027 0.019 0.028 0.033 0.189 0.042 0.471 113 M 0.274 0.044 0.073 0.065 0.079 0.111 0.023 0.329 114 K 0.054 0.017 0.240 0.275 0.202 0.059 0.012 0.141 115 L 0.007 0.004 0.058 0.055 0.114 0.021 0.002 0.738 116 V 0.009 0.006 0.307 0.230 0.327 0.020 0.003 0.097 117 N 0.009 0.008 0.102 0.129 0.149 0.089 0.005 0.509 118 Y 0.026 0.010 0.147 0.095 0.231 0.073 0.010 0.408 119 G 0.033 0.004 0.045 0.031 0.055 0.271 0.011 0.550 120 R 0.070 0.003 0.029 0.023 0.026 0.165 0.022 0.662 121 T 0.085 0.008 0.052 0.043 0.041 0.175 0.012 0.585 122 Y 0.062 0.006 0.076 0.085 0.142 0.204 0.008 0.417 123 F 0.030 0.010 0.100 0.242 0.352 0.083 0.003 0.180 124 Y 0.013 0.016 0.105 0.267 0.442 0.032 0.002 0.123 125 E 0.006 0.029 0.097 0.282 0.331 0.032 0.003 0.219 126 Y 0.011 0.060 0.088 0.203 0.353 0.052 0.004 0.228 127 I 0.015 0.131 0.052 0.153 0.368 0.050 0.004 0.226 128 A 0.015 0.196 0.032 0.065 0.154 0.064 0.010 0.464 129 E 0.097 0.251 0.019 0.030 0.058 0.108 0.029 0.407 130 V 0.237 0.386 0.015 0.020 0.025 0.054 0.033 0.229 131 R 0.175 0.423 0.029 0.035 0.035 0.054 0.041 0.208 132 S 0.098 0.293 0.034 0.031 0.035 0.048 0.031 0.430 133 R 0.113 0.159 0.036 0.025 0.044 0.056 0.025 0.543