# TARGET T0471 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t2k-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0471.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 19.0751 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.046 0.326 0.018 0.017 0.029 0.080 0.049 0.435 2 W 0.058 0.470 0.017 0.016 0.019 0.068 0.059 0.294 3 N 0.044 0.696 0.007 0.008 0.011 0.034 0.061 0.141 4 D 0.040 0.742 0.005 0.006 0.011 0.024 0.062 0.109 5 L 0.020 0.797 0.008 0.007 0.013 0.025 0.045 0.085 6 A 0.029 0.711 0.015 0.013 0.035 0.028 0.070 0.098 7 V 0.029 0.596 0.028 0.027 0.065 0.027 0.081 0.148 8 Y 0.032 0.459 0.044 0.087 0.171 0.029 0.060 0.119 9 I 0.065 0.074 0.076 0.117 0.157 0.054 0.262 0.195 10 I 0.072 0.021 0.057 0.158 0.241 0.059 0.143 0.249 11 R 0.045 0.005 0.031 0.135 0.189 0.083 0.057 0.454 12 C 0.012 0.001 0.023 0.087 0.116 0.106 0.033 0.621 13 S 0.041 0.001 0.012 0.023 0.040 0.103 0.038 0.742 14 G 0.445 0.002 0.003 0.007 0.007 0.061 0.085 0.389 15 P 0.033 0.003 0.010 0.006 0.012 0.139 0.022 0.775 16 G 0.006 0.001 0.038 0.022 0.086 0.110 0.034 0.703 17 T 0.003 0.002 0.085 0.129 0.158 0.109 0.051 0.462 18 R 0.001 0.003 0.337 0.212 0.271 0.027 0.049 0.101 19 V 0.002 0.002 0.224 0.164 0.292 0.024 0.118 0.174 20 V 0.002 0.002 0.401 0.321 0.189 0.011 0.022 0.052 21 E 0.004 0.002 0.623 0.109 0.165 0.013 0.034 0.051 22 V 0.010 0.004 0.368 0.157 0.121 0.059 0.063 0.218 23 G 0.035 0.016 0.369 0.076 0.158 0.085 0.045 0.215 24 A 0.063 0.047 0.102 0.059 0.064 0.128 0.068 0.469 25 G 0.057 0.104 0.090 0.044 0.061 0.141 0.095 0.409 26 R 0.031 0.432 0.023 0.018 0.027 0.095 0.064 0.309 27 F 0.055 0.565 0.019 0.007 0.013 0.053 0.148 0.141 28 L 0.033 0.578 0.012 0.007 0.009 0.038 0.226 0.097 29 Y 0.013 0.878 0.005 0.003 0.005 0.011 0.048 0.036 30 V 0.009 0.958 0.002 0.001 0.002 0.003 0.008 0.017 31 S 0.019 0.942 0.003 0.001 0.002 0.004 0.013 0.017 32 D 0.016 0.914 0.003 0.002 0.003 0.006 0.024 0.033 33 Y 0.072 0.611 0.030 0.007 0.010 0.024 0.147 0.100 34 I 0.189 0.074 0.083 0.007 0.006 0.039 0.477 0.125 35 R 0.365 0.030 0.012 0.005 0.005 0.068 0.052 0.464 36 K 0.036 0.008 0.004 0.001 0.002 0.063 0.011 0.874 37 H 0.027 0.010 0.012 0.003 0.004 0.197 0.022 0.725 38 S 0.019 0.018 0.030 0.010 0.029 0.164 0.059 0.671 39 K 0.014 0.030 0.049 0.026 0.045 0.115 0.050 0.673 40 V 0.013 0.055 0.253 0.058 0.134 0.084 0.077 0.326 41 D 0.007 0.015 0.374 0.056 0.148 0.039 0.196 0.165 42 L 0.004 0.016 0.467 0.121 0.175 0.022 0.095 0.100 43 V 0.012 0.017 0.311 0.205 0.261 0.029 0.050 0.115 44 L 0.030 0.010 0.245 0.195 0.199 0.045 0.087 0.189 45 T 0.065 0.012 0.081 0.133 0.254 0.074 0.098 0.283 46 D 0.017 0.003 0.041 0.118 0.160 0.132 0.054 0.475 47 I 0.009 0.002 0.042 0.073 0.106 0.116 0.034 0.618 48 K 0.306 0.006 0.017 0.031 0.033 0.071 0.145 0.391 49 P 0.160 0.003 0.006 0.008 0.011 0.090 0.030 0.693 50 S 0.050 0.003 0.010 0.012 0.016 0.116 0.023 0.770 51 H 0.047 0.005 0.011 0.007 0.027 0.106 0.062 0.735 52 G 0.019 0.007 0.044 0.056 0.052 0.146 0.037 0.640 53 G 0.008 0.007 0.158 0.124 0.219 0.067 0.052 0.365 54 I 0.013 0.006 0.176 0.123 0.105 0.080 0.073 0.424 55 V 0.019 0.011 0.320 0.147 0.222 0.051 0.044 0.186 56 R 0.026 0.008 0.165 0.092 0.137 0.085 0.073 0.415 57 D 0.030 0.013 0.179 0.104 0.163 0.092 0.069 0.349 58 D 0.079 0.019 0.117 0.063 0.064 0.133 0.102 0.424 59 I 0.020 0.008 0.125 0.049 0.059 0.170 0.055 0.514 60 T 0.028 0.015 0.068 0.031 0.071 0.129 0.036 0.622 61 S 0.335 0.073 0.012 0.018 0.019 0.087 0.135 0.321 62 P 0.037 0.088 0.014 0.016 0.022 0.173 0.044 0.606 63 R 0.037 0.237 0.013 0.021 0.074 0.083 0.080 0.456 64 M 0.074 0.178 0.029 0.055 0.090 0.096 0.127 0.351 65 E 0.024 0.042 0.115 0.182 0.185 0.061 0.171 0.220 66 I 0.096 0.014 0.058 0.088 0.142 0.073 0.118 0.413 67 Y 0.516 0.008 0.036 0.028 0.042 0.060 0.075 0.236 68 R 0.035 0.008 0.054 0.040 0.105 0.143 0.041 0.574 69 G 0.009 0.007 0.044 0.021 0.080 0.153 0.024 0.661 70 A 0.002 0.003 0.111 0.246 0.291 0.092 0.048 0.208 71 A 0.001 0.004 0.301 0.157 0.270 0.032 0.126 0.109 72 L 0.003 0.003 0.221 0.206 0.415 0.015 0.058 0.079 73 I 0.009 0.003 0.244 0.325 0.213 0.022 0.077 0.107 74 Y 0.015 0.002 0.234 0.237 0.372 0.022 0.035 0.084 75 S 0.012 0.002 0.152 0.161 0.261 0.071 0.039 0.301 76 I 0.012 0.002 0.088 0.159 0.196 0.143 0.027 0.373 77 R 0.008 0.007 0.046 0.077 0.097 0.159 0.029 0.578 78 P 0.118 0.162 0.017 0.019 0.025 0.100 0.132 0.427 79 P 0.317 0.278 0.006 0.005 0.006 0.046 0.124 0.218 80 A 0.145 0.199 0.010 0.008 0.010 0.070 0.136 0.423 81 E 0.036 0.187 0.019 0.010 0.017 0.102 0.249 0.379 82 I 0.017 0.548 0.015 0.007 0.009 0.053 0.101 0.250 83 H 0.024 0.911 0.002 0.002 0.002 0.006 0.016 0.037 84 S 0.020 0.871 0.003 0.002 0.003 0.010 0.028 0.062 85 S 0.006 0.917 0.004 0.002 0.003 0.007 0.033 0.029 86 L 0.004 0.970 0.002 0.001 0.001 0.003 0.009 0.011 87 M 0.017 0.890 0.013 0.002 0.002 0.007 0.040 0.029 88 R 0.023 0.911 0.005 0.002 0.003 0.005 0.020 0.031 89 V 0.137 0.558 0.028 0.008 0.012 0.024 0.100 0.133 90 A 0.124 0.073 0.105 0.009 0.011 0.068 0.371 0.239 91 D 0.338 0.015 0.017 0.010 0.013 0.095 0.048 0.464 92 A 0.046 0.002 0.006 0.001 0.003 0.063 0.016 0.862 93 V 0.015 0.002 0.035 0.007 0.009 0.251 0.025 0.656 94 G 0.011 0.002 0.060 0.006 0.025 0.134 0.041 0.722 95 A 0.004 0.002 0.138 0.039 0.033 0.145 0.040 0.599 96 R 0.001 0.001 0.696 0.031 0.074 0.029 0.059 0.109 97 L 0.003 0.001 0.592 0.053 0.087 0.036 0.049 0.179 98 I 0.001 0.001 0.713 0.079 0.116 0.014 0.017 0.059 99 I 0.005 0.001 0.562 0.091 0.080 0.037 0.045 0.181 100 K 0.011 0.001 0.527 0.069 0.101 0.058 0.074 0.158 101 P 0.049 0.004 0.165 0.033 0.050 0.135 0.059 0.505 102 L 0.150 0.006 0.064 0.042 0.040 0.119 0.062 0.518 103 T 0.075 0.021 0.018 0.014 0.024 0.114 0.070 0.664 104 G 0.098 0.035 0.010 0.010 0.020 0.130 0.058 0.640 105 E 0.048 0.038 0.021 0.082 0.080 0.121 0.128 0.483 106 D 0.048 0.066 0.030 0.055 0.076 0.111 0.114 0.501 107 I 0.075 0.076 0.031 0.083 0.109 0.094 0.080 0.454 108 V 0.109 0.072 0.030 0.049 0.063 0.084 0.086 0.507 109 T 0.107 0.102 0.020 0.059 0.090 0.087 0.072 0.462 110 E 0.052 0.062 0.020 0.032 0.072 0.090 0.051 0.620 111 R 0.051 0.050 0.042 0.114 0.103 0.104 0.066 0.469 112 K 0.051 0.039 0.037 0.079 0.166 0.079 0.069 0.480 113 M 0.073 0.018 0.033 0.060 0.080 0.099 0.069 0.568 114 K 0.024 0.010 0.082 0.127 0.169 0.089 0.047 0.451 115 L 0.042 0.009 0.029 0.035 0.066 0.092 0.046 0.681 116 V 0.173 0.012 0.028 0.045 0.039 0.120 0.066 0.516 117 N 0.058 0.018 0.024 0.020 0.040 0.119 0.101 0.621 118 Y 0.028 0.031 0.018 0.024 0.048 0.138 0.067 0.645 119 G 0.018 0.086 0.045 0.100 0.124 0.129 0.074 0.425 120 R 0.008 0.071 0.074 0.125 0.293 0.057 0.113 0.259 121 T 0.006 0.094 0.070 0.154 0.376 0.032 0.102 0.167 122 Y 0.005 0.113 0.074 0.277 0.371 0.016 0.064 0.080 123 F 0.008 0.214 0.072 0.216 0.262 0.017 0.102 0.109 124 Y 0.013 0.216 0.061 0.213 0.329 0.016 0.065 0.087 125 E 0.018 0.156 0.078 0.246 0.246 0.030 0.080 0.145 126 Y 0.054 0.175 0.053 0.181 0.278 0.029 0.079 0.151 127 I 0.115 0.170 0.024 0.088 0.117 0.047 0.105 0.336 128 A 0.052 0.066 0.044 0.084 0.107 0.086 0.096 0.465 129 E 0.050 0.028 0.045 0.056 0.101 0.077 0.109 0.532 130 V 0.204 0.010 0.023 0.052 0.048 0.089 0.059 0.515 131 R 0.093 0.004 0.025 0.033 0.054 0.087 0.030 0.673 132 S 0.021 0.002 0.010 0.009 0.023 0.091 0.026 0.818 133 R 0.024 0.003 0.026 0.018 0.029 0.130 0.036 0.735