# TARGET T0471 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0471.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 15.2655 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.078 0.370 0.013 0.012 0.016 0.068 0.077 0.365 2 W 0.107 0.554 0.007 0.007 0.010 0.040 0.064 0.210 3 N 0.035 0.569 0.006 0.006 0.011 0.046 0.081 0.246 4 D 0.013 0.766 0.005 0.005 0.009 0.026 0.088 0.087 5 L 0.007 0.881 0.006 0.005 0.009 0.013 0.043 0.036 6 A 0.007 0.848 0.010 0.012 0.023 0.010 0.058 0.032 7 V 0.011 0.671 0.040 0.030 0.050 0.017 0.134 0.045 8 Y 0.034 0.423 0.090 0.092 0.117 0.027 0.154 0.063 9 I 0.046 0.076 0.117 0.134 0.201 0.036 0.280 0.110 10 I 0.064 0.025 0.058 0.163 0.171 0.066 0.144 0.310 11 R 0.060 0.008 0.024 0.106 0.146 0.094 0.056 0.506 12 C 0.009 0.001 0.011 0.035 0.065 0.116 0.032 0.731 13 S 0.077 0.001 0.007 0.016 0.024 0.105 0.039 0.730 14 G 0.301 0.002 0.005 0.009 0.010 0.079 0.064 0.529 15 P 0.025 0.002 0.009 0.005 0.012 0.122 0.014 0.811 16 G 0.018 0.004 0.037 0.019 0.086 0.152 0.032 0.653 17 T 0.005 0.003 0.062 0.107 0.152 0.094 0.056 0.521 18 R 0.001 0.003 0.367 0.205 0.275 0.025 0.040 0.085 19 V 0.001 0.003 0.300 0.177 0.257 0.020 0.050 0.191 20 V 0.003 0.003 0.437 0.325 0.164 0.011 0.020 0.038 21 E 0.011 0.007 0.462 0.119 0.201 0.023 0.057 0.120 22 V 0.029 0.016 0.263 0.197 0.222 0.059 0.051 0.162 23 G 0.041 0.039 0.179 0.066 0.125 0.076 0.077 0.398 24 A 0.053 0.113 0.075 0.057 0.100 0.100 0.061 0.442 25 G 0.042 0.172 0.077 0.069 0.100 0.082 0.098 0.360 26 R 0.036 0.462 0.020 0.028 0.045 0.062 0.068 0.278 27 F 0.030 0.404 0.018 0.009 0.014 0.033 0.365 0.126 28 L 0.013 0.685 0.018 0.015 0.010 0.019 0.170 0.069 29 Y 0.015 0.910 0.007 0.004 0.006 0.007 0.020 0.032 30 V 0.017 0.950 0.003 0.001 0.002 0.002 0.013 0.011 31 S 0.025 0.923 0.007 0.002 0.002 0.004 0.019 0.018 32 D 0.033 0.836 0.011 0.005 0.003 0.008 0.031 0.073 33 Y 0.142 0.563 0.034 0.008 0.007 0.022 0.078 0.146 34 I 0.260 0.087 0.059 0.013 0.012 0.044 0.367 0.159 35 R 0.054 0.010 0.043 0.014 0.007 0.050 0.155 0.667 36 K 0.277 0.003 0.006 0.002 0.003 0.025 0.018 0.667 37 H 0.182 0.001 0.006 0.001 0.001 0.056 0.029 0.724 38 S 0.012 0.001 0.023 0.002 0.007 0.205 0.008 0.743 39 K 0.002 0.001 0.017 0.001 0.005 0.066 0.008 0.901 40 V 0.003 0.001 0.183 0.074 0.038 0.185 0.047 0.470 41 D 0.001 0.001 0.733 0.030 0.048 0.025 0.083 0.080 42 L 0.001 0.001 0.618 0.091 0.087 0.014 0.087 0.101 43 V 0.001 0.001 0.893 0.041 0.032 0.003 0.012 0.017 44 L 0.004 0.001 0.644 0.096 0.109 0.018 0.031 0.096 45 T 0.014 0.003 0.514 0.108 0.131 0.042 0.041 0.148 46 D 0.033 0.005 0.177 0.071 0.122 0.139 0.087 0.366 47 I 0.020 0.003 0.067 0.026 0.041 0.168 0.054 0.621 48 K 0.165 0.009 0.033 0.029 0.036 0.128 0.070 0.529 49 P 0.114 0.009 0.018 0.011 0.017 0.113 0.083 0.634 50 S 0.051 0.010 0.017 0.012 0.022 0.147 0.037 0.703 51 H 0.065 0.020 0.020 0.014 0.031 0.123 0.065 0.663 52 G 0.041 0.027 0.028 0.027 0.041 0.137 0.057 0.642 53 G 0.026 0.026 0.114 0.066 0.129 0.110 0.105 0.423 54 I 0.014 0.023 0.156 0.081 0.109 0.107 0.110 0.401 55 V 0.046 0.028 0.199 0.098 0.111 0.082 0.116 0.321 56 R 0.062 0.019 0.110 0.070 0.089 0.091 0.185 0.374 57 D 0.024 0.020 0.100 0.059 0.111 0.102 0.108 0.476 58 D 0.036 0.017 0.108 0.055 0.114 0.123 0.070 0.476 59 I 0.012 0.010 0.112 0.080 0.094 0.128 0.063 0.500 60 T 0.069 0.032 0.076 0.042 0.073 0.094 0.054 0.559 61 S 0.267 0.070 0.029 0.047 0.051 0.100 0.084 0.351 62 P 0.031 0.039 0.015 0.018 0.031 0.125 0.024 0.716 63 R 0.062 0.179 0.020 0.022 0.071 0.092 0.061 0.493 64 M 0.058 0.240 0.018 0.039 0.044 0.085 0.092 0.423 65 E 0.013 0.104 0.129 0.197 0.141 0.057 0.144 0.214 66 I 0.090 0.153 0.043 0.065 0.112 0.060 0.114 0.362 67 Y 0.308 0.043 0.095 0.041 0.030 0.034 0.337 0.113 68 R 0.068 0.063 0.032 0.056 0.074 0.098 0.071 0.538 69 G 0.014 0.024 0.012 0.004 0.020 0.072 0.029 0.826 70 A 0.010 0.050 0.063 0.104 0.129 0.182 0.098 0.364 71 A 0.006 0.016 0.213 0.097 0.234 0.058 0.253 0.124 72 L 0.006 0.018 0.236 0.116 0.183 0.037 0.277 0.126 73 I 0.008 0.006 0.407 0.192 0.230 0.015 0.085 0.057 74 Y 0.038 0.003 0.229 0.304 0.223 0.032 0.042 0.129 75 S 0.007 0.002 0.208 0.094 0.261 0.067 0.041 0.320 76 I 0.012 0.005 0.064 0.052 0.127 0.125 0.023 0.592 77 R 0.012 0.006 0.055 0.089 0.074 0.223 0.024 0.517 78 P 0.027 0.027 0.009 0.010 0.009 0.096 0.020 0.802 79 P 0.521 0.320 0.003 0.003 0.003 0.017 0.056 0.077 80 A 0.247 0.291 0.006 0.003 0.003 0.048 0.166 0.237 81 E 0.038 0.208 0.011 0.005 0.006 0.059 0.308 0.365 82 I 0.023 0.664 0.006 0.002 0.004 0.042 0.061 0.197 83 H 0.030 0.900 0.001 0.001 0.002 0.009 0.020 0.037 84 S 0.022 0.877 0.003 0.002 0.003 0.010 0.034 0.050 85 S 0.006 0.940 0.002 0.001 0.002 0.005 0.021 0.024 86 L 0.008 0.942 0.004 0.001 0.001 0.004 0.029 0.011 87 M 0.007 0.873 0.011 0.004 0.002 0.005 0.082 0.016 88 R 0.015 0.918 0.012 0.002 0.002 0.005 0.023 0.022 89 V 0.094 0.692 0.024 0.003 0.004 0.011 0.131 0.041 90 A 0.055 0.114 0.120 0.020 0.009 0.027 0.504 0.152 91 D 0.213 0.084 0.013 0.010 0.012 0.043 0.088 0.537 92 A 0.090 0.010 0.029 0.003 0.004 0.085 0.083 0.696 93 V 0.035 0.007 0.046 0.012 0.017 0.228 0.048 0.607 94 G 0.024 0.002 0.013 0.002 0.006 0.083 0.032 0.839 95 A 0.007 0.003 0.046 0.023 0.023 0.178 0.050 0.670 96 R 0.003 0.001 0.557 0.046 0.122 0.064 0.080 0.127 97 L 0.004 0.001 0.376 0.103 0.149 0.039 0.072 0.254 98 I 0.001 0.001 0.793 0.087 0.066 0.008 0.012 0.033 99 I 0.003 0.001 0.536 0.105 0.116 0.034 0.041 0.165 100 K 0.012 0.002 0.441 0.164 0.148 0.059 0.069 0.106 101 P 0.127 0.004 0.160 0.028 0.049 0.142 0.054 0.437 102 L 0.185 0.009 0.070 0.023 0.029 0.150 0.058 0.477 103 T 0.034 0.011 0.021 0.009 0.028 0.090 0.030 0.776 104 G 0.091 0.021 0.020 0.017 0.048 0.114 0.052 0.635 105 E 0.038 0.013 0.028 0.128 0.133 0.123 0.100 0.437 106 D 0.021 0.013 0.025 0.061 0.090 0.103 0.053 0.634 107 I 0.023 0.013 0.034 0.123 0.184 0.104 0.042 0.477 108 V 0.018 0.006 0.038 0.076 0.090 0.089 0.053 0.631 109 T 0.268 0.050 0.018 0.065 0.067 0.051 0.119 0.363 110 E 0.219 0.032 0.015 0.024 0.038 0.078 0.051 0.544 111 R 0.031 0.018 0.020 0.038 0.075 0.109 0.031 0.678 112 K 0.028 0.014 0.025 0.039 0.117 0.101 0.037 0.639 113 M 0.020 0.011 0.030 0.099 0.129 0.087 0.067 0.556 114 K 0.014 0.011 0.084 0.263 0.254 0.064 0.050 0.261 115 L 0.010 0.005 0.075 0.090 0.156 0.068 0.060 0.536 116 V 0.056 0.006 0.117 0.174 0.128 0.076 0.056 0.386 117 N 0.317 0.011 0.044 0.042 0.063 0.057 0.087 0.379 118 Y 0.040 0.011 0.020 0.021 0.043 0.104 0.029 0.732 119 G 0.021 0.016 0.029 0.029 0.101 0.099 0.022 0.684 120 R 0.034 0.038 0.029 0.087 0.186 0.097 0.053 0.475 121 T 0.009 0.038 0.052 0.204 0.280 0.055 0.039 0.323 122 Y 0.005 0.039 0.066 0.251 0.447 0.028 0.031 0.133 123 F 0.006 0.069 0.079 0.255 0.385 0.023 0.041 0.141 124 Y 0.008 0.101 0.093 0.392 0.301 0.012 0.029 0.064 125 E 0.016 0.185 0.077 0.253 0.274 0.024 0.045 0.128 126 Y 0.044 0.285 0.067 0.157 0.168 0.031 0.090 0.158 127 I 0.150 0.321 0.030 0.086 0.092 0.032 0.108 0.180 128 A 0.086 0.097 0.026 0.067 0.070 0.052 0.187 0.416 129 E 0.046 0.054 0.017 0.053 0.072 0.082 0.137 0.539 130 V 0.119 0.024 0.014 0.033 0.043 0.087 0.087 0.593 131 R 0.078 0.011 0.008 0.026 0.031 0.103 0.040 0.704 132 S 0.031 0.009 0.006 0.010 0.020 0.079 0.030 0.815 133 R 0.040 0.014 0.011 0.022 0.036 0.128 0.040 0.709