# TARGET T0471 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t04-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0471.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 13.2214 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.117 0.231 0.030 0.011 0.026 0.094 0.015 0.476 2 W 0.108 0.365 0.030 0.017 0.040 0.072 0.013 0.354 3 N 0.060 0.354 0.019 0.013 0.018 0.091 0.010 0.435 4 D 0.095 0.387 0.014 0.004 0.007 0.057 0.016 0.420 5 L 0.078 0.624 0.024 0.004 0.010 0.034 0.011 0.214 6 A 0.025 0.651 0.015 0.013 0.014 0.077 0.006 0.200 7 V 0.033 0.678 0.016 0.011 0.016 0.040 0.006 0.200 8 Y 0.029 0.850 0.041 0.008 0.010 0.008 0.004 0.050 9 I 0.010 0.891 0.038 0.011 0.015 0.003 0.003 0.028 10 I 0.015 0.825 0.038 0.028 0.045 0.004 0.004 0.040 11 R 0.047 0.726 0.030 0.040 0.056 0.006 0.019 0.076 12 C 0.206 0.329 0.033 0.045 0.061 0.011 0.077 0.238 13 S 0.118 0.187 0.082 0.063 0.079 0.048 0.077 0.347 14 G 0.078 0.024 0.061 0.035 0.034 0.106 0.027 0.635 15 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 16 G 0.027 0.001 0.021 0.011 0.016 0.100 0.004 0.819 17 T 0.465 0.002 0.039 0.021 0.018 0.095 0.010 0.351 18 R 0.182 0.003 0.155 0.062 0.083 0.102 0.004 0.409 19 V 0.015 0.001 0.339 0.052 0.091 0.045 0.001 0.456 20 V 0.007 0.001 0.624 0.126 0.140 0.022 0.001 0.081 21 E 0.002 0.001 0.819 0.041 0.059 0.016 0.001 0.062 22 V 0.001 0.001 0.811 0.038 0.058 0.010 0.001 0.082 23 G 0.001 0.001 0.819 0.028 0.054 0.036 0.001 0.062 24 A 0.005 0.001 0.497 0.039 0.064 0.049 0.001 0.344 25 G 0.009 0.003 0.375 0.031 0.083 0.105 0.004 0.391 26 R 0.038 0.004 0.071 0.014 0.033 0.162 0.005 0.672 27 F 0.049 0.021 0.060 0.012 0.035 0.108 0.007 0.709 28 L 0.061 0.047 0.024 0.012 0.031 0.071 0.006 0.748 29 Y 0.051 0.129 0.020 0.014 0.023 0.182 0.005 0.575 30 V 0.064 0.394 0.014 0.004 0.013 0.106 0.006 0.399 31 S 0.032 0.806 0.011 0.006 0.017 0.016 0.004 0.108 32 D 0.014 0.855 0.007 0.003 0.004 0.019 0.003 0.095 33 Y 0.043 0.873 0.003 0.001 0.002 0.012 0.008 0.059 34 I 0.034 0.935 0.004 0.001 0.003 0.001 0.005 0.017 35 R 0.040 0.885 0.008 0.006 0.006 0.008 0.012 0.035 36 K 0.201 0.621 0.009 0.004 0.006 0.006 0.060 0.092 37 H 0.338 0.417 0.043 0.006 0.006 0.009 0.079 0.101 38 S 0.117 0.127 0.048 0.027 0.010 0.081 0.076 0.515 39 K 0.113 0.020 0.145 0.016 0.017 0.102 0.057 0.530 40 V 0.247 0.005 0.528 0.047 0.017 0.048 0.009 0.100 41 D 0.008 0.003 0.441 0.136 0.062 0.078 0.002 0.269 42 L 0.006 0.001 0.629 0.064 0.139 0.021 0.001 0.139 43 V 0.002 0.001 0.898 0.029 0.047 0.011 0.001 0.012 44 L 0.001 0.001 0.807 0.074 0.071 0.006 0.001 0.040 45 T 0.001 0.001 0.893 0.042 0.041 0.010 0.001 0.014 46 D 0.002 0.001 0.525 0.096 0.145 0.029 0.001 0.202 47 I 0.005 0.001 0.561 0.071 0.174 0.077 0.002 0.108 48 K 0.013 0.001 0.103 0.038 0.067 0.219 0.003 0.556 49 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 50 S 0.015 0.001 0.028 0.027 0.086 0.112 0.002 0.730 51 H 0.174 0.003 0.021 0.019 0.035 0.066 0.009 0.672 52 G 0.312 0.008 0.033 0.024 0.052 0.047 0.025 0.499 53 G 0.210 0.008 0.065 0.043 0.055 0.121 0.015 0.483 54 I 0.074 0.008 0.153 0.075 0.086 0.100 0.005 0.498 55 V 0.022 0.011 0.128 0.161 0.259 0.091 0.003 0.324 56 R 0.014 0.008 0.099 0.115 0.227 0.057 0.002 0.478 57 D 0.016 0.011 0.060 0.104 0.202 0.146 0.004 0.458 58 D 0.121 0.018 0.054 0.088 0.111 0.137 0.022 0.448 59 I 0.245 0.036 0.094 0.089 0.097 0.103 0.019 0.317 60 T 0.045 0.041 0.045 0.076 0.096 0.478 0.012 0.207 61 S 0.133 0.039 0.059 0.058 0.100 0.217 0.019 0.374 62 P 0.003 0.001 0.003 0.001 0.004 0.010 0.001 0.976 63 R 0.014 0.007 0.026 0.012 0.023 0.435 0.006 0.478 64 M 0.205 0.017 0.019 0.021 0.027 0.072 0.012 0.628 65 E 0.063 0.073 0.053 0.048 0.063 0.261 0.006 0.433 66 I 0.075 0.131 0.065 0.064 0.093 0.097 0.006 0.469 67 Y 0.042 0.446 0.094 0.059 0.212 0.023 0.005 0.118 68 R 0.080 0.355 0.045 0.076 0.119 0.049 0.010 0.267 69 G 0.064 0.242 0.032 0.019 0.051 0.044 0.036 0.512 70 A 0.459 0.116 0.072 0.066 0.080 0.021 0.042 0.144 71 A 0.024 0.104 0.230 0.188 0.148 0.049 0.012 0.245 72 L 0.018 0.036 0.299 0.151 0.220 0.028 0.005 0.242 73 I 0.016 0.048 0.567 0.132 0.170 0.017 0.002 0.047 74 Y 0.008 0.032 0.425 0.249 0.200 0.014 0.002 0.068 75 S 0.008 0.021 0.469 0.122 0.182 0.022 0.004 0.171 76 I 0.034 0.022 0.237 0.135 0.258 0.033 0.011 0.270 77 R 0.035 0.012 0.213 0.123 0.189 0.108 0.009 0.311 78 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 79 P 0.001 0.001 0.002 0.001 0.005 0.007 0.001 0.985 80 A 0.021 0.003 0.003 0.001 0.003 0.052 0.001 0.916 81 E 0.104 0.030 0.003 0.002 0.003 0.257 0.003 0.598 82 I 0.483 0.212 0.006 0.001 0.004 0.053 0.008 0.233 83 H 0.152 0.699 0.012 0.001 0.004 0.018 0.005 0.109 84 S 0.044 0.663 0.004 0.001 0.001 0.025 0.005 0.258 85 S 0.023 0.755 0.002 0.001 0.001 0.028 0.004 0.188 86 L 0.027 0.874 0.003 0.001 0.001 0.013 0.004 0.078 87 M 0.012 0.913 0.006 0.001 0.001 0.010 0.002 0.055 88 R 0.005 0.958 0.003 0.001 0.001 0.010 0.001 0.023 89 V 0.007 0.982 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 90 A 0.006 0.986 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 91 D 0.033 0.944 0.003 0.001 0.001 0.001 0.009 0.009 92 A 0.070 0.890 0.005 0.001 0.001 0.001 0.019 0.013 93 V 0.131 0.624 0.026 0.003 0.002 0.011 0.119 0.085 94 G 0.230 0.191 0.159 0.016 0.010 0.022 0.112 0.260 95 A 0.021 0.012 0.858 0.027 0.010 0.009 0.003 0.061 96 R 0.010 0.017 0.625 0.129 0.044 0.045 0.005 0.127 97 L 0.014 0.007 0.716 0.047 0.060 0.012 0.002 0.142 98 I 0.003 0.002 0.948 0.012 0.016 0.008 0.001 0.011 99 I 0.002 0.001 0.870 0.044 0.048 0.005 0.001 0.031 100 K 0.001 0.001 0.911 0.025 0.030 0.014 0.001 0.019 101 P 0.001 0.001 0.008 0.001 0.003 0.001 0.001 0.988 102 L 0.006 0.001 0.307 0.051 0.184 0.226 0.003 0.223 103 T 0.095 0.001 0.045 0.015 0.024 0.133 0.007 0.679 104 G 0.119 0.003 0.040 0.016 0.039 0.066 0.019 0.699 105 E 0.137 0.005 0.031 0.021 0.028 0.206 0.011 0.562 106 D 0.025 0.004 0.012 0.018 0.028 0.072 0.004 0.838 107 I 0.065 0.019 0.031 0.130 0.218 0.074 0.006 0.456 108 V 0.060 0.056 0.052 0.131 0.239 0.104 0.006 0.351 109 T 0.064 0.062 0.026 0.157 0.247 0.074 0.008 0.361 110 E 0.051 0.050 0.022 0.052 0.093 0.051 0.009 0.672 111 R 0.083 0.044 0.034 0.073 0.089 0.196 0.026 0.455 112 K 0.232 0.019 0.024 0.034 0.040 0.146 0.041 0.464 113 M 0.084 0.030 0.103 0.106 0.121 0.059 0.017 0.480 114 K 0.038 0.010 0.119 0.169 0.192 0.156 0.005 0.310 115 L 0.009 0.002 0.042 0.064 0.126 0.013 0.001 0.742 116 V 0.011 0.006 0.128 0.258 0.412 0.048 0.001 0.135 117 N 0.017 0.006 0.056 0.163 0.157 0.077 0.002 0.524 118 Y 0.017 0.011 0.088 0.114 0.213 0.072 0.004 0.480 119 G 0.039 0.006 0.035 0.048 0.100 0.214 0.010 0.548 120 R 0.122 0.008 0.033 0.061 0.078 0.153 0.020 0.525 121 T 0.088 0.013 0.048 0.092 0.132 0.111 0.015 0.500 122 Y 0.029 0.009 0.050 0.143 0.276 0.043 0.004 0.444 123 F 0.012 0.010 0.065 0.253 0.519 0.024 0.002 0.114 124 Y 0.007 0.007 0.039 0.422 0.455 0.012 0.001 0.057 125 E 0.006 0.012 0.055 0.364 0.428 0.023 0.001 0.112 126 Y 0.003 0.016 0.029 0.302 0.540 0.020 0.001 0.089 127 I 0.005 0.028 0.019 0.259 0.621 0.015 0.001 0.053 128 A 0.016 0.095 0.020 0.141 0.361 0.041 0.004 0.321 129 E 0.056 0.157 0.015 0.077 0.247 0.059 0.020 0.369 130 V 0.220 0.201 0.014 0.048 0.132 0.038 0.031 0.314 131 R 0.081 0.306 0.029 0.072 0.118 0.053 0.022 0.318 132 S 0.087 0.159 0.025 0.032 0.056 0.052 0.026 0.562 133 R 0.179 0.116 0.036 0.026 0.037 0.054 0.027 0.525