# TARGET T0470 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0470.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 3026 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.032 0.054 0.020 0.036 0.035 0.101 0.047 0.674 2 T 0.124 0.532 0.014 0.017 0.016 0.047 0.062 0.187 3 K 0.067 0.780 0.003 0.003 0.004 0.016 0.020 0.107 4 Q 0.041 0.800 0.008 0.003 0.003 0.015 0.031 0.099 5 E 0.036 0.797 0.006 0.004 0.003 0.021 0.031 0.102 6 K 0.037 0.334 0.008 0.002 0.002 0.021 0.519 0.077 7 I 0.049 0.760 0.002 0.001 0.001 0.009 0.147 0.032 8 E 0.019 0.298 0.003 0.001 0.002 0.016 0.555 0.106 9 K 0.003 0.802 0.002 0.001 0.001 0.013 0.099 0.077 10 T 0.009 0.947 0.001 0.001 0.001 0.005 0.020 0.016 11 I 0.015 0.940 0.002 0.001 0.001 0.005 0.019 0.017 12 T 0.020 0.851 0.010 0.001 0.003 0.012 0.065 0.037 13 F 0.028 0.866 0.011 0.001 0.001 0.010 0.053 0.030 14 V 0.049 0.794 0.040 0.003 0.003 0.014 0.048 0.050 15 K 0.064 0.500 0.080 0.007 0.006 0.035 0.068 0.240 16 H 0.075 0.345 0.059 0.007 0.008 0.065 0.061 0.381 17 I 0.116 0.217 0.103 0.013 0.012 0.077 0.091 0.372 18 L 0.110 0.088 0.027 0.011 0.013 0.097 0.058 0.596 19 E 0.075 0.042 0.016 0.010 0.010 0.092 0.091 0.663 20 K 0.046 0.024 0.017 0.010 0.010 0.102 0.086 0.704 21 D 0.252 0.027 0.014 0.008 0.011 0.107 0.070 0.510 22 A 0.198 0.019 0.009 0.007 0.008 0.098 0.038 0.623 23 S 0.039 0.020 0.008 0.005 0.013 0.109 0.014 0.791 24 G 0.030 0.032 0.018 0.009 0.025 0.124 0.033 0.729 25 H 0.043 0.099 0.033 0.057 0.070 0.132 0.086 0.480 26 D 0.056 0.310 0.033 0.035 0.053 0.068 0.092 0.354 27 W 0.018 0.477 0.029 0.054 0.071 0.050 0.076 0.226 28 Y 0.007 0.496 0.048 0.063 0.121 0.032 0.094 0.139 29 H 0.006 0.863 0.007 0.022 0.030 0.006 0.046 0.022 30 I 0.002 0.907 0.004 0.007 0.010 0.003 0.058 0.009 31 R 0.001 0.957 0.003 0.006 0.005 0.001 0.025 0.004 32 R 0.001 0.980 0.001 0.002 0.002 0.001 0.013 0.002 33 V 0.001 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.001 34 H 0.001 0.977 0.001 0.001 0.001 0.001 0.020 0.001 35 K 0.001 0.228 0.001 0.001 0.001 0.001 0.764 0.003 36 M 0.001 0.817 0.001 0.001 0.001 0.002 0.175 0.003 37 A 0.017 0.677 0.004 0.001 0.001 0.004 0.288 0.007 38 I 0.011 0.810 0.005 0.004 0.002 0.009 0.127 0.034 39 S 0.026 0.807 0.009 0.001 0.003 0.017 0.046 0.091 40 L 0.102 0.577 0.020 0.005 0.003 0.034 0.142 0.116 41 S 0.113 0.114 0.099 0.010 0.008 0.063 0.416 0.177 42 E 0.523 0.041 0.010 0.001 0.001 0.050 0.033 0.341 43 Q 0.213 0.009 0.024 0.002 0.002 0.076 0.133 0.542 44 E 0.021 0.010 0.010 0.001 0.001 0.103 0.022 0.831 45 G 0.012 0.018 0.004 0.001 0.001 0.081 0.008 0.876 46 G 0.024 0.163 0.009 0.002 0.001 0.074 0.026 0.701 47 N 0.061 0.858 0.002 0.001 0.001 0.008 0.036 0.034 48 R 0.009 0.861 0.004 0.001 0.001 0.012 0.071 0.042 49 F 0.001 0.957 0.004 0.001 0.001 0.002 0.024 0.010 50 I 0.002 0.965 0.002 0.001 0.001 0.001 0.025 0.004 51 I 0.002 0.914 0.005 0.002 0.002 0.002 0.071 0.003 52 E 0.002 0.916 0.004 0.001 0.001 0.001 0.072 0.003 53 M 0.004 0.919 0.005 0.001 0.001 0.002 0.060 0.007 54 A 0.012 0.766 0.016 0.005 0.006 0.008 0.172 0.015 55 A 0.049 0.765 0.021 0.005 0.005 0.015 0.097 0.043 56 L 0.076 0.685 0.038 0.005 0.007 0.033 0.051 0.106 57 L 0.035 0.388 0.089 0.012 0.013 0.056 0.111 0.297 58 H 0.076 0.282 0.075 0.008 0.010 0.100 0.106 0.342 59 D 0.208 0.312 0.073 0.009 0.008 0.075 0.063 0.254 60 V 0.092 0.207 0.076 0.008 0.011 0.093 0.059 0.454 61 A 0.083 0.111 0.058 0.007 0.011 0.085 0.066 0.581 62 D 0.105 0.084 0.039 0.019 0.016 0.100 0.153 0.483 63 E 0.119 0.080 0.023 0.008 0.010 0.100 0.053 0.608 64 K 0.088 0.061 0.015 0.009 0.016 0.130 0.072 0.609 65 L 0.041 0.077 0.009 0.006 0.009 0.126 0.057 0.674 66 N 0.068 0.295 0.012 0.010 0.016 0.082 0.074 0.441 67 E 0.081 0.400 0.010 0.010 0.013 0.076 0.050 0.361 68 S 0.081 0.439 0.017 0.011 0.013 0.048 0.193 0.198 69 E 0.068 0.739 0.005 0.004 0.004 0.026 0.036 0.118 70 E 0.042 0.729 0.006 0.004 0.005 0.029 0.023 0.162 71 A 0.010 0.737 0.007 0.005 0.007 0.033 0.034 0.168 72 G 0.013 0.920 0.001 0.001 0.001 0.004 0.044 0.015 73 M 0.009 0.571 0.002 0.001 0.001 0.006 0.393 0.017 74 K 0.002 0.664 0.004 0.004 0.003 0.005 0.298 0.020 75 K 0.004 0.964 0.001 0.001 0.002 0.003 0.016 0.010 76 V 0.010 0.957 0.003 0.001 0.001 0.002 0.021 0.005 77 S 0.014 0.916 0.006 0.002 0.002 0.004 0.042 0.014 78 D 0.016 0.892 0.014 0.002 0.001 0.007 0.025 0.043 79 W 0.107 0.749 0.039 0.002 0.002 0.015 0.033 0.052 80 L 0.366 0.071 0.226 0.006 0.004 0.027 0.206 0.094 81 E 0.405 0.040 0.013 0.001 0.001 0.035 0.020 0.484 82 E 0.078 0.007 0.015 0.001 0.001 0.036 0.012 0.850 83 L 0.011 0.013 0.011 0.002 0.002 0.135 0.009 0.816 84 H 0.016 0.023 0.008 0.002 0.003 0.087 0.010 0.851 85 V 0.062 0.090 0.009 0.002 0.001 0.086 0.017 0.734 86 E 0.191 0.279 0.006 0.001 0.001 0.018 0.428 0.075 87 E 0.115 0.589 0.004 0.001 0.001 0.024 0.145 0.122 88 E 0.020 0.665 0.006 0.001 0.001 0.033 0.067 0.208 89 E 0.009 0.946 0.001 0.001 0.001 0.004 0.012 0.028 90 S 0.008 0.938 0.001 0.001 0.001 0.004 0.037 0.013 91 K 0.002 0.866 0.001 0.001 0.001 0.005 0.110 0.015 92 H 0.001 0.966 0.001 0.001 0.001 0.002 0.026 0.004 93 V 0.001 0.985 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.002 94 L 0.004 0.877 0.011 0.001 0.003 0.003 0.096 0.005 95 H 0.006 0.567 0.046 0.005 0.005 0.007 0.351 0.013 96 I 0.058 0.554 0.110 0.007 0.010 0.023 0.193 0.044 97 I 0.193 0.142 0.234 0.024 0.026 0.067 0.177 0.137 98 A 0.056 0.041 0.066 0.011 0.015 0.111 0.086 0.614 99 N 0.030 0.025 0.035 0.006 0.013 0.105 0.037 0.748 100 M 0.032 0.018 0.046 0.028 0.038 0.233 0.060 0.546 101 S 0.042 0.009 0.038 0.019 0.027 0.180 0.053 0.631 102 Y 0.279 0.012 0.020 0.020 0.020 0.117 0.057 0.475 103 K 0.086 0.008 0.019 0.011 0.016 0.128 0.056 0.676 104 G 0.029 0.005 0.020 0.008 0.018 0.140 0.024 0.756 105 G 0.142 0.009 0.017 0.010 0.015 0.103 0.042 0.662 106 H 0.165 0.015 0.015 0.016 0.017 0.111 0.042 0.619 107 G 0.055 0.012 0.014 0.011 0.032 0.103 0.026 0.747 108 G 0.029 0.011 0.016 0.023 0.047 0.104 0.063 0.707 109 K 0.032 0.040 0.028 0.058 0.061 0.132 0.078 0.571 110 V 0.027 0.087 0.029 0.034 0.050 0.102 0.066 0.606 111 E 0.027 0.239 0.025 0.042 0.052 0.074 0.081 0.458 112 S 0.033 0.578 0.021 0.021 0.026 0.040 0.114 0.167 113 I 0.011 0.877 0.005 0.009 0.011 0.011 0.036 0.041 114 E 0.010 0.893 0.004 0.006 0.013 0.006 0.040 0.028 115 G 0.008 0.806 0.006 0.009 0.015 0.011 0.117 0.029 116 K 0.006 0.778 0.019 0.020 0.026 0.010 0.117 0.025 117 L 0.019 0.818 0.020 0.010 0.018 0.012 0.076 0.027 118 V 0.035 0.579 0.068 0.025 0.020 0.019 0.200 0.055 119 Q 0.041 0.646 0.043 0.014 0.018 0.027 0.099 0.110 120 D 0.051 0.703 0.009 0.004 0.005 0.023 0.077 0.127 121 A 0.031 0.653 0.015 0.005 0.005 0.037 0.094 0.160 122 D 0.019 0.872 0.006 0.003 0.003 0.012 0.020 0.066 123 R 0.044 0.816 0.011 0.002 0.002 0.016 0.030 0.079 124 L 0.100 0.415 0.113 0.010 0.007 0.038 0.208 0.109 125 D 0.447 0.297 0.019 0.005 0.004 0.027 0.062 0.137 126 A 0.195 0.103 0.043 0.003 0.004 0.057 0.080 0.516 127 L 0.020 0.058 0.062 0.007 0.014 0.126 0.063 0.648 128 G 0.124 0.066 0.029 0.009 0.011 0.083 0.066 0.611 129 A 0.078 0.130 0.016 0.010 0.009 0.087 0.048 0.621 130 I 0.047 0.128 0.037 0.009 0.021 0.118 0.051 0.588 131 G 0.051 0.148 0.035 0.026 0.031 0.111 0.158 0.440 132 I 0.036 0.337 0.045 0.020 0.022 0.082 0.125 0.334 133 A 0.054 0.577 0.041 0.015 0.022 0.041 0.068 0.182 134 R 0.057 0.537 0.037 0.032 0.042 0.044 0.071 0.181 135 T 0.065 0.414 0.046 0.021 0.034 0.051 0.142 0.228 136 F 0.041 0.352 0.071 0.046 0.063 0.069 0.138 0.220 137 A 0.126 0.294 0.043 0.044 0.063 0.076 0.068 0.286 138 Y 0.122 0.189 0.035 0.037 0.044 0.081 0.094 0.398 139 G 0.033 0.124 0.045 0.035 0.075 0.105 0.090 0.493 140 G 0.119 0.114 0.041 0.043 0.063 0.095 0.104 0.421 141 A 0.141 0.091 0.029 0.042 0.037 0.103 0.069 0.487 142 K 0.056 0.038 0.034 0.029 0.061 0.101 0.078 0.602 143 G 0.118 0.027 0.019 0.036 0.063 0.098 0.047 0.591 144 R 0.049 0.012 0.038 0.070 0.109 0.099 0.052 0.571 145 L 0.034 0.015 0.034 0.040 0.066 0.144 0.029 0.638 146 M 0.005 0.004 0.064 0.088 0.133 0.126 0.066 0.515 147 Y 0.022 0.004 0.021 0.021 0.019 0.086 0.026 0.802 148 D 0.890 0.013 0.003 0.004 0.003 0.009 0.053 0.025 149 P 0.063 0.014 0.007 0.005 0.008 0.113 0.031 0.759 150 T 0.009 0.012 0.005 0.002 0.008 0.076 0.012 0.875 151 I 0.041 0.105 0.010 0.011 0.011 0.152 0.029 0.642 152 P 0.116 0.384 0.012 0.015 0.017 0.086 0.074 0.295 153 P 0.303 0.440 0.008 0.004 0.008 0.029 0.050 0.159 154 R 0.066 0.116 0.031 0.016 0.023 0.060 0.420 0.268 155 E 0.046 0.196 0.042 0.019 0.031 0.090 0.229 0.347 156 V 0.063 0.200 0.036 0.023 0.039 0.113 0.070 0.455 157 M 0.025 0.182 0.034 0.018 0.024 0.107 0.034 0.575 158 T 0.078 0.613 0.012 0.007 0.011 0.038 0.047 0.194 159 K 0.089 0.656 0.011 0.006 0.006 0.035 0.042 0.155 160 D 0.084 0.639 0.016 0.009 0.010 0.029 0.058 0.154 161 E 0.127 0.247 0.038 0.015 0.016 0.062 0.210 0.285 162 Y 0.111 0.111 0.043 0.019 0.022 0.091 0.228 0.374 163 R 0.192 0.072 0.029 0.014 0.020 0.072 0.091 0.510 164 K 0.068 0.021 0.008 0.005 0.008 0.103 0.023 0.763 165 N 0.012 0.017 0.009 0.005 0.008 0.107 0.048 0.795 166 N 0.060 0.115 0.006 0.004 0.006 0.111 0.098 0.601 167 D 0.121 0.288 0.013 0.006 0.006 0.074 0.223 0.270 168 P 0.032 0.504 0.016 0.008 0.009 0.066 0.091 0.275 169 S 0.028 0.821 0.008 0.002 0.004 0.017 0.040 0.081 170 L 0.015 0.918 0.004 0.002 0.002 0.008 0.023 0.029 171 N 0.008 0.888 0.006 0.002 0.003 0.007 0.057 0.029 172 H 0.005 0.938 0.004 0.001 0.001 0.005 0.032 0.013 173 F 0.008 0.964 0.004 0.001 0.001 0.002 0.016 0.005 174 Y 0.023 0.889 0.009 0.001 0.001 0.003 0.061 0.013 175 E 0.021 0.818 0.020 0.003 0.002 0.008 0.068 0.059 176 K 0.040 0.826 0.013 0.002 0.002 0.010 0.031 0.077 177 L 0.191 0.553 0.026 0.002 0.002 0.026 0.077 0.124 178 L 0.051 0.416 0.030 0.006 0.003 0.047 0.078 0.368 179 K 0.025 0.471 0.009 0.001 0.001 0.028 0.015 0.450 180 L 0.201 0.610 0.015 0.001 0.001 0.024 0.041 0.107 181 K 0.217 0.193 0.021 0.003 0.003 0.055 0.267 0.242 182 D 0.063 0.048 0.009 0.001 0.001 0.037 0.555 0.285 183 L 0.023 0.109 0.021 0.003 0.003 0.097 0.333 0.411 184 M 0.031 0.249 0.027 0.005 0.008 0.124 0.044 0.512 185 N 0.069 0.447 0.012 0.004 0.006 0.062 0.054 0.345 186 T 0.040 0.699 0.010 0.002 0.003 0.037 0.042 0.166 187 N 0.028 0.794 0.007 0.003 0.003 0.028 0.046 0.090 188 A 0.017 0.895 0.005 0.001 0.001 0.011 0.032 0.038 189 A 0.010 0.955 0.002 0.001 0.001 0.003 0.017 0.011 190 K 0.008 0.944 0.005 0.001 0.001 0.003 0.022 0.016 191 Q 0.008 0.948 0.002 0.001 0.001 0.003 0.022 0.014 192 E 0.015 0.909 0.006 0.001 0.001 0.004 0.045 0.018 193 A 0.018 0.877 0.004 0.001 0.001 0.006 0.063 0.031 194 E 0.031 0.807 0.007 0.001 0.001 0.010 0.085 0.058 195 V 0.019 0.855 0.004 0.001 0.001 0.010 0.045 0.066 196 R 0.016 0.904 0.001 0.001 0.001 0.004 0.042 0.032 197 H 0.015 0.929 0.001 0.001 0.001 0.004 0.024 0.027 198 R 0.006 0.847 0.003 0.001 0.001 0.009 0.088 0.046 199 Y 0.005 0.953 0.001 0.001 0.001 0.003 0.027 0.011 200 M 0.004 0.977 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 0.002 201 E 0.004 0.962 0.002 0.001 0.001 0.001 0.024 0.007 202 Q 0.004 0.881 0.003 0.001 0.001 0.003 0.096 0.012 203 F 0.005 0.966 0.002 0.001 0.001 0.001 0.023 0.003 204 I 0.008 0.974 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.004 205 E 0.006 0.950 0.002 0.001 0.001 0.002 0.016 0.023 206 Q 0.019 0.835 0.008 0.001 0.001 0.009 0.090 0.039 207 F 0.059 0.729 0.011 0.001 0.001 0.009 0.159 0.033 208 M 0.089 0.509 0.013 0.001 0.001 0.021 0.222 0.145 209 K 0.027 0.555 0.012 0.001 0.001 0.031 0.065 0.309 210 E 0.061 0.425 0.025 0.002 0.002 0.069 0.072 0.343 211 W 0.105 0.358 0.038 0.005 0.003 0.069 0.097 0.326 212 N 0.139 0.481 0.009 0.001 0.002 0.037 0.053 0.278 213 A 0.084 0.366 0.023 0.002 0.003 0.057 0.048 0.416 214 Q 0.036 0.340 0.033 0.011 0.008 0.093 0.052 0.427 215 I 0.100 0.470 0.021 0.004 0.005 0.051 0.050 0.300 216 L 0.123 0.468 0.026 0.006 0.007 0.056 0.081 0.233 217 E 0.080 0.289 0.047 0.015 0.017 0.064 0.111 0.377 218 H 0.132 0.145 0.043 0.018 0.023 0.082 0.126 0.431 219 H 0.188 0.051 0.062 0.031 0.038 0.115 0.095 0.420 220 H 0.146 0.013 0.026 0.016 0.028 0.095 0.054 0.623 221 H 0.038 0.006 0.011 0.009 0.016 0.091 0.029 0.800 222 H 0.024 0.006 0.013 0.011 0.023 0.123 0.030 0.771 223 H 0.045 0.008 0.018 0.023 0.037 0.129 0.043 0.697