# TARGET T0467 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t2k-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor2-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 n_notor2 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0467.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 37.8115 # Pos AA G H I P A B S F J M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.085 0.030 0.015 0.112 0.046 0.084 0.046 0.004 0.001 0.006 0.572 2 D 0.033 0.015 0.004 0.062 0.076 0.087 0.095 0.003 0.001 0.005 0.619 3 L 0.064 0.026 0.046 0.101 0.040 0.107 0.070 0.002 0.001 0.009 0.537 4 N 0.024 0.025 0.002 0.119 0.091 0.101 0.343 0.002 0.001 0.005 0.289 5 R 0.175 0.021 0.004 0.061 0.033 0.048 0.306 0.003 0.001 0.027 0.322 6 M 0.153 0.160 0.008 0.194 0.053 0.075 0.092 0.003 0.001 0.006 0.256 7 G 0.056 0.057 0.006 0.083 0.050 0.089 0.252 0.009 0.001 0.012 0.386 8 K 0.090 0.031 0.016 0.078 0.024 0.035 0.066 0.003 0.001 0.015 0.642 9 D 0.045 0.021 0.004 0.028 0.035 0.047 0.134 0.002 0.001 0.010 0.675 10 E 0.172 0.013 0.013 0.036 0.049 0.087 0.231 0.004 0.001 0.037 0.358 11 Y 0.078 0.027 0.011 0.075 0.208 0.309 0.086 0.001 0.001 0.008 0.196 12 Y 0.016 0.012 0.006 0.061 0.221 0.415 0.040 0.001 0.001 0.004 0.225 13 V 0.012 0.008 0.001 0.055 0.323 0.423 0.014 0.001 0.001 0.001 0.162 14 Q 0.008 0.007 0.001 0.033 0.385 0.443 0.011 0.001 0.001 0.001 0.112 15 I 0.012 0.007 0.001 0.024 0.381 0.418 0.012 0.001 0.001 0.001 0.145 16 T 0.007 0.005 0.001 0.021 0.354 0.526 0.009 0.001 0.001 0.001 0.076 17 V 0.009 0.010 0.001 0.021 0.269 0.387 0.037 0.001 0.001 0.005 0.261 18 D 0.017 0.007 0.002 0.017 0.116 0.269 0.103 0.002 0.001 0.009 0.459 19 G 0.100 0.004 0.009 0.016 0.071 0.145 0.109 0.001 0.001 0.036 0.509 20 K 0.108 0.006 0.020 0.016 0.130 0.128 0.236 0.001 0.001 0.023 0.332 21 E 0.015 0.006 0.004 0.020 0.146 0.173 0.089 0.001 0.001 0.005 0.542 22 V 0.021 0.007 0.001 0.026 0.253 0.432 0.025 0.001 0.001 0.002 0.233 23 H 0.016 0.014 0.001 0.021 0.279 0.372 0.033 0.001 0.001 0.002 0.261 24 S 0.014 0.010 0.001 0.014 0.322 0.310 0.034 0.001 0.001 0.002 0.292 25 K 0.026 0.011 0.002 0.013 0.155 0.237 0.063 0.001 0.001 0.004 0.488 26 A 0.025 0.019 0.002 0.016 0.120 0.190 0.165 0.001 0.001 0.008 0.455 27 D 0.053 0.018 0.002 0.011 0.075 0.098 0.261 0.003 0.001 0.025 0.455 28 N 0.142 0.025 0.007 0.008 0.020 0.031 0.122 0.002 0.001 0.032 0.610 29 G 0.205 0.014 0.015 0.008 0.018 0.017 0.235 0.003 0.001 0.053 0.433 30 Q 0.321 0.007 0.051 0.009 0.019 0.017 0.276 0.001 0.001 0.045 0.256 31 K 0.017 0.010 0.005 0.016 0.040 0.079 0.144 0.001 0.001 0.008 0.682 32 Y 0.017 0.008 0.003 0.020 0.162 0.358 0.057 0.001 0.001 0.007 0.368 33 K 0.024 0.013 0.002 0.025 0.188 0.263 0.086 0.001 0.001 0.005 0.394 34 D 0.037 0.011 0.002 0.025 0.143 0.229 0.077 0.002 0.001 0.006 0.469 35 Y 0.078 0.009 0.003 0.052 0.274 0.342 0.050 0.001 0.001 0.004 0.188 36 E 0.018 0.010 0.003 0.061 0.282 0.372 0.051 0.001 0.001 0.006 0.195 37 Y 0.013 0.004 0.001 0.056 0.342 0.473 0.014 0.001 0.001 0.002 0.095 38 K 0.008 0.005 0.001 0.054 0.238 0.545 0.016 0.001 0.001 0.001 0.132 39 L 0.006 0.003 0.001 0.039 0.351 0.510 0.009 0.001 0.001 0.001 0.080 40 T 0.005 0.003 0.001 0.048 0.317 0.416 0.022 0.001 0.001 0.001 0.187 41 G 0.017 0.002 0.001 0.029 0.319 0.471 0.018 0.001 0.001 0.001 0.141 42 F 0.014 0.003 0.001 0.036 0.243 0.466 0.036 0.001 0.001 0.002 0.199 43 D 0.009 0.003 0.001 0.017 0.414 0.398 0.048 0.001 0.001 0.004 0.105 44 K 0.020 0.011 0.003 0.019 0.044 0.097 0.072 0.001 0.001 0.008 0.723 45 D 0.006 0.005 0.001 0.006 0.020 0.038 0.662 0.002 0.001 0.008 0.254 46 G 0.432 0.002 0.004 0.004 0.014 0.019 0.097 0.001 0.001 0.196 0.231 47 K 0.245 0.013 0.030 0.007 0.021 0.024 0.307 0.001 0.001 0.018 0.334 48 E 0.006 0.007 0.006 0.010 0.078 0.105 0.143 0.001 0.001 0.008 0.638 49 K 0.022 0.005 0.001 0.013 0.294 0.489 0.037 0.001 0.001 0.004 0.135 50 E 0.038 0.020 0.001 0.021 0.213 0.344 0.038 0.001 0.001 0.002 0.323 51 L 0.022 0.005 0.001 0.023 0.440 0.422 0.007 0.001 0.001 0.001 0.080 52 E 0.007 0.010 0.001 0.047 0.319 0.495 0.016 0.001 0.001 0.002 0.102 53 F 0.011 0.007 0.002 0.064 0.277 0.433 0.016 0.001 0.001 0.001 0.188 54 T 0.005 0.008 0.001 0.063 0.235 0.448 0.062 0.001 0.001 0.004 0.174 55 A 0.012 0.008 0.006 0.036 0.050 0.141 0.071 0.001 0.001 0.005 0.670 56 Q 0.010 0.010 0.001 0.025 0.031 0.070 0.414 0.001 0.001 0.005 0.432 57 K 0.268 0.011 0.005 0.021 0.018 0.031 0.207 0.001 0.001 0.023 0.414 58 N 0.129 0.133 0.003 0.016 0.021 0.027 0.156 0.002 0.001 0.007 0.506 59 L 0.097 0.157 0.016 0.026 0.050 0.080 0.085 0.002 0.001 0.006 0.479 60 R 0.054 0.232 0.002 0.017 0.032 0.064 0.153 0.008 0.001 0.005 0.433 61 K 0.086 0.162 0.008 0.012 0.022 0.053 0.056 0.007 0.001 0.004 0.589 62 E 0.124 0.214 0.003 0.013 0.051 0.083 0.073 0.015 0.001 0.008 0.416 63 A 0.259 0.085 0.037 0.022 0.113 0.186 0.046 0.007 0.001 0.012 0.234 64 F 0.050 0.111 0.021 0.042 0.159 0.310 0.040 0.005 0.001 0.005 0.257 65 L 0.013 0.021 0.007 0.022 0.442 0.455 0.005 0.001 0.001 0.001 0.035 66 R 0.006 0.029 0.001 0.022 0.420 0.424 0.008 0.001 0.001 0.001 0.090 67 V 0.011 0.004 0.001 0.012 0.446 0.468 0.002 0.001 0.001 0.001 0.056 68 Y 0.005 0.005 0.001 0.013 0.408 0.521 0.003 0.001 0.001 0.001 0.047 69 H 0.004 0.007 0.001 0.012 0.442 0.458 0.008 0.001 0.001 0.001 0.067 70 S 0.004 0.007 0.001 0.019 0.260 0.471 0.051 0.001 0.001 0.003 0.183 71 D 0.043 0.003 0.004 0.015 0.078 0.188 0.078 0.002 0.001 0.023 0.565 72 K 0.089 0.004 0.005 0.008 0.018 0.026 0.170 0.001 0.001 0.020 0.660 73 K 0.050 0.004 0.008 0.012 0.022 0.027 0.268 0.001 0.001 0.020 0.588 74 G 0.132 0.006 0.005 0.026 0.041 0.079 0.190 0.003 0.001 0.025 0.493 75 V 0.091 0.013 0.024 0.039 0.061 0.126 0.094 0.001 0.001 0.006 0.547 76 S 0.009 0.008 0.002 0.038 0.191 0.187 0.125 0.001 0.001 0.004 0.434 77 A 0.010 0.004 0.001 0.013 0.028 0.073 0.055 0.001 0.001 0.003 0.812 78 W 0.025 0.023 0.001 0.046 0.068 0.137 0.102 0.001 0.001 0.002 0.596 79 E 0.052 0.028 0.002 0.027 0.074 0.101 0.201 0.001 0.001 0.005 0.507 80 E 0.115 0.091 0.002 0.026 0.033 0.048 0.139 0.003 0.001 0.004 0.541 81 V 0.153 0.211 0.003 0.025 0.081 0.085 0.031 0.001 0.001 0.002 0.409 82 K 0.043 0.319 0.002 0.009 0.046 0.067 0.131 0.010 0.001 0.005 0.369 83 K 0.061 0.205 0.009 0.009 0.021 0.037 0.045 0.005 0.001 0.002 0.606 84 D 0.069 0.349 0.002 0.006 0.017 0.027 0.132 0.010 0.001 0.003 0.385 85 E 0.361 0.125 0.021 0.005 0.004 0.007 0.116 0.025 0.001 0.013 0.324 86 L 0.223 0.302 0.036 0.007 0.005 0.009 0.101 0.010 0.001 0.002 0.305 87 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 88 A 0.007 0.029 0.001 0.003 0.002 0.006 0.025 0.001 0.001 0.001 0.925 89 K 0.082 0.244 0.004 0.004 0.005 0.005 0.069 0.002 0.001 0.002 0.583 90 V 0.121 0.467 0.001 0.002 0.002 0.004 0.029 0.002 0.001 0.001 0.372 91 K 0.046 0.803 0.001 0.002 0.003 0.006 0.031 0.002 0.001 0.001 0.104 92 E 0.069 0.836 0.001 0.001 0.002 0.002 0.010 0.004 0.001 0.001 0.075 93 K 0.094 0.852 0.002 0.001 0.001 0.002 0.005 0.010 0.001 0.001 0.033 94 L 0.095 0.827 0.020 0.002 0.003 0.003 0.002 0.014 0.001 0.001 0.033 95 G 0.197 0.396 0.029 0.014 0.015 0.024 0.018 0.080 0.001 0.002 0.223 96 V 0.075 0.128 0.498 0.020 0.015 0.022 0.011 0.010 0.001 0.002 0.219 97 K 0.031 0.073 0.015 0.058 0.068 0.062 0.101 0.012 0.001 0.003 0.576