# TARGET T0467 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0467.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 49.5286 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.037 0.020 0.033 0.062 0.080 0.133 0.057 0.578 2 D 0.045 0.029 0.038 0.078 0.137 0.114 0.054 0.504 3 L 0.022 0.013 0.027 0.049 0.072 0.098 0.049 0.669 4 N 0.124 0.026 0.050 0.133 0.131 0.086 0.098 0.352 5 R 0.097 0.009 0.032 0.089 0.124 0.092 0.078 0.479 6 M 0.030 0.002 0.033 0.047 0.092 0.093 0.057 0.645 7 G 0.113 0.002 0.039 0.044 0.106 0.094 0.099 0.502 8 K 0.087 0.001 0.016 0.025 0.047 0.090 0.044 0.691 9 D 0.020 0.001 0.029 0.039 0.126 0.108 0.021 0.656 10 E 0.002 0.001 0.053 0.069 0.369 0.079 0.023 0.406 11 Y 0.001 0.001 0.078 0.267 0.561 0.013 0.016 0.065 12 Y 0.001 0.001 0.064 0.404 0.456 0.005 0.013 0.058 13 V 0.001 0.001 0.080 0.532 0.333 0.005 0.005 0.044 14 Q 0.001 0.001 0.103 0.434 0.385 0.009 0.009 0.060 15 I 0.004 0.001 0.105 0.272 0.241 0.037 0.017 0.323 16 T 0.097 0.004 0.068 0.098 0.099 0.073 0.028 0.533 17 V 0.310 0.018 0.022 0.052 0.048 0.073 0.034 0.443 18 D 0.058 0.038 0.012 0.024 0.053 0.078 0.017 0.720 19 G 0.064 0.047 0.020 0.037 0.099 0.078 0.036 0.619 20 K 0.032 0.043 0.016 0.246 0.189 0.079 0.068 0.327 21 E 0.021 0.034 0.018 0.104 0.152 0.077 0.048 0.547 22 V 0.066 0.063 0.021 0.154 0.214 0.068 0.050 0.364 23 H 0.052 0.031 0.023 0.154 0.197 0.069 0.046 0.428 24 S 0.067 0.033 0.018 0.108 0.144 0.086 0.090 0.453 25 K 0.059 0.021 0.025 0.085 0.121 0.116 0.073 0.501 26 A 0.282 0.009 0.007 0.017 0.025 0.087 0.026 0.546 27 D 0.476 0.012 0.003 0.012 0.012 0.053 0.033 0.398 28 N 0.026 0.009 0.004 0.008 0.033 0.093 0.010 0.817 29 G 0.018 0.004 0.010 0.024 0.111 0.083 0.019 0.731 30 Q 0.020 0.004 0.016 0.362 0.193 0.067 0.036 0.302 31 K 0.011 0.003 0.023 0.122 0.192 0.071 0.023 0.556 32 Y 0.022 0.004 0.042 0.147 0.251 0.059 0.037 0.438 33 K 0.033 0.006 0.038 0.222 0.332 0.047 0.034 0.288 34 D 0.015 0.007 0.035 0.127 0.283 0.049 0.034 0.450 35 Y 0.005 0.006 0.037 0.268 0.502 0.032 0.017 0.133 36 E 0.005 0.004 0.065 0.210 0.472 0.029 0.035 0.180 37 Y 0.003 0.003 0.039 0.364 0.415 0.021 0.038 0.116 38 K 0.016 0.003 0.049 0.332 0.382 0.033 0.026 0.158 39 L 0.006 0.003 0.029 0.272 0.445 0.036 0.011 0.198 40 T 0.011 0.008 0.048 0.222 0.354 0.045 0.011 0.299 41 G 0.003 0.003 0.036 0.342 0.426 0.033 0.032 0.124 42 F 0.007 0.002 0.055 0.198 0.158 0.054 0.047 0.479 43 D 0.946 0.002 0.002 0.009 0.006 0.003 0.021 0.010 44 K 0.490 0.003 0.003 0.007 0.007 0.036 0.011 0.443 45 D 0.005 0.001 0.002 0.001 0.015 0.052 0.002 0.922 46 G 0.008 0.001 0.014 0.017 0.081 0.102 0.024 0.752 47 K 0.013 0.003 0.013 0.418 0.244 0.055 0.030 0.224 48 E 0.009 0.002 0.046 0.141 0.240 0.034 0.024 0.503 49 K 0.002 0.001 0.040 0.344 0.460 0.015 0.014 0.124 50 E 0.001 0.001 0.082 0.263 0.466 0.014 0.021 0.152 51 L 0.002 0.002 0.061 0.426 0.345 0.018 0.018 0.126 52 E 0.003 0.005 0.082 0.311 0.469 0.019 0.015 0.097 53 F 0.020 0.015 0.052 0.212 0.252 0.043 0.029 0.376 54 T 0.092 0.050 0.065 0.258 0.166 0.043 0.123 0.202 55 A 0.116 0.112 0.020 0.062 0.075 0.072 0.049 0.494 56 Q 0.120 0.116 0.018 0.035 0.047 0.064 0.045 0.555 57 K 0.083 0.132 0.013 0.036 0.032 0.087 0.056 0.562 58 N 0.071 0.107 0.016 0.034 0.040 0.086 0.090 0.557 59 L 0.134 0.087 0.012 0.023 0.031 0.107 0.079 0.527 60 R 0.231 0.132 0.015 0.021 0.023 0.060 0.152 0.366 61 K 0.149 0.137 0.008 0.018 0.048 0.095 0.046 0.499 62 E 0.022 0.069 0.019 0.023 0.084 0.078 0.056 0.650 63 A 0.007 0.039 0.066 0.184 0.445 0.066 0.029 0.165 64 F 0.005 0.018 0.065 0.156 0.502 0.034 0.057 0.162 65 L 0.006 0.012 0.051 0.478 0.312 0.019 0.025 0.098 66 R 0.003 0.002 0.075 0.392 0.450 0.010 0.028 0.039 67 V 0.002 0.001 0.064 0.318 0.415 0.026 0.057 0.118 68 Y 0.017 0.002 0.105 0.339 0.367 0.024 0.035 0.111 69 H 0.132 0.002 0.045 0.130 0.166 0.052 0.042 0.432 70 S 0.026 0.002 0.016 0.035 0.053 0.074 0.028 0.765 71 D 0.042 0.003 0.015 0.022 0.065 0.096 0.029 0.728 72 K 0.030 0.002 0.016 0.048 0.059 0.097 0.053 0.694 73 K 0.006 0.003 0.063 0.124 0.174 0.082 0.027 0.522 74 G 0.008 0.007 0.050 0.065 0.144 0.071 0.023 0.633 75 V 0.012 0.013 0.060 0.209 0.133 0.074 0.014 0.484 76 S 0.022 0.061 0.078 0.081 0.099 0.053 0.045 0.560 77 A 0.101 0.627 0.013 0.040 0.040 0.020 0.048 0.111 78 W 0.107 0.473 0.037 0.043 0.042 0.034 0.056 0.208 79 E 0.043 0.505 0.025 0.056 0.051 0.033 0.040 0.246 80 E 0.100 0.271 0.030 0.038 0.056 0.069 0.063 0.372 81 V 0.124 0.079 0.052 0.053 0.045 0.105 0.111 0.431 82 K 0.391 0.119 0.005 0.014 0.017 0.034 0.054 0.367 83 K 0.278 0.044 0.004 0.003 0.005 0.043 0.088 0.534 84 D 0.017 0.091 0.004 0.007 0.008 0.090 0.026 0.758 85 E 0.008 0.057 0.005 0.003 0.004 0.057 0.010 0.856 86 L 0.068 0.592 0.005 0.005 0.003 0.044 0.028 0.255 87 P 0.128 0.831 0.002 0.001 0.001 0.005 0.016 0.017 88 A 0.033 0.906 0.003 0.001 0.001 0.005 0.011 0.040 89 K 0.012 0.942 0.006 0.001 0.001 0.003 0.004 0.032 90 V 0.119 0.822 0.010 0.001 0.001 0.005 0.016 0.026 91 K 0.167 0.237 0.196 0.006 0.003 0.026 0.264 0.100 92 E 0.356 0.171 0.021 0.002 0.002 0.023 0.034 0.390 93 K 0.328 0.015 0.025 0.002 0.002 0.044 0.033 0.551 94 L 0.023 0.004 0.011 0.003 0.004 0.090 0.025 0.841 95 G 0.027 0.003 0.003 0.002 0.003 0.045 0.014 0.902 96 V 0.020 0.003 0.004 0.003 0.003 0.086 0.016 0.864 97 K 0.070 0.010 0.030 0.021 0.026 0.165 0.058 0.620