# TARGET T0467 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor2-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 n_notor2 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0467.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 49.5286 # Pos AA G H I P A B S F J M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.040 0.006 0.003 0.046 0.036 0.061 0.098 0.001 0.001 0.003 0.706 2 D 0.020 0.003 0.001 0.028 0.024 0.039 0.095 0.001 0.001 0.003 0.786 3 L 0.084 0.007 0.003 0.072 0.039 0.082 0.096 0.001 0.001 0.005 0.611 4 N 0.059 0.017 0.002 0.092 0.080 0.100 0.269 0.001 0.001 0.011 0.368 5 R 0.094 0.020 0.002 0.076 0.056 0.082 0.121 0.001 0.001 0.019 0.529 6 M 0.058 0.042 0.005 0.111 0.074 0.106 0.215 0.002 0.001 0.013 0.374 7 G 0.115 0.026 0.003 0.075 0.084 0.136 0.224 0.002 0.001 0.019 0.316 8 K 0.095 0.032 0.006 0.057 0.082 0.121 0.114 0.003 0.001 0.007 0.483 9 D 0.026 0.007 0.002 0.036 0.067 0.098 0.073 0.002 0.001 0.005 0.685 10 E 0.037 0.002 0.003 0.033 0.061 0.089 0.101 0.001 0.001 0.003 0.671 11 Y 0.040 0.003 0.002 0.063 0.279 0.395 0.046 0.001 0.001 0.003 0.168 12 Y 0.026 0.002 0.002 0.109 0.237 0.379 0.034 0.001 0.001 0.003 0.208 13 V 0.003 0.001 0.001 0.052 0.407 0.499 0.006 0.001 0.001 0.001 0.032 14 Q 0.002 0.001 0.001 0.040 0.270 0.630 0.006 0.001 0.001 0.001 0.051 15 I 0.001 0.001 0.001 0.026 0.410 0.469 0.013 0.001 0.001 0.001 0.080 16 T 0.004 0.001 0.001 0.012 0.334 0.576 0.009 0.001 0.001 0.001 0.064 17 V 0.003 0.001 0.001 0.016 0.189 0.303 0.086 0.001 0.001 0.002 0.401 18 D 0.005 0.001 0.001 0.009 0.059 0.126 0.221 0.001 0.001 0.003 0.577 19 G 0.096 0.002 0.001 0.015 0.040 0.083 0.147 0.001 0.001 0.064 0.551 20 K 0.181 0.008 0.003 0.014 0.047 0.054 0.333 0.001 0.001 0.018 0.342 21 E 0.022 0.004 0.001 0.005 0.034 0.048 0.145 0.001 0.001 0.003 0.738 22 V 0.053 0.017 0.002 0.015 0.165 0.403 0.043 0.001 0.001 0.002 0.299 23 H 0.037 0.038 0.001 0.015 0.158 0.309 0.060 0.001 0.001 0.003 0.378 24 S 0.052 0.046 0.002 0.014 0.214 0.268 0.047 0.004 0.001 0.002 0.353 25 K 0.068 0.047 0.002 0.013 0.204 0.321 0.030 0.004 0.001 0.001 0.310 26 A 0.079 0.039 0.003 0.020 0.227 0.303 0.060 0.002 0.001 0.002 0.265 27 D 0.039 0.031 0.002 0.013 0.108 0.150 0.179 0.003 0.001 0.007 0.467 28 N 0.055 0.014 0.002 0.009 0.022 0.043 0.131 0.003 0.001 0.020 0.701 29 G 0.219 0.013 0.010 0.009 0.014 0.025 0.290 0.003 0.001 0.038 0.378 30 Q 0.470 0.007 0.020 0.011 0.016 0.018 0.268 0.001 0.001 0.013 0.176 31 K 0.043 0.008 0.007 0.016 0.047 0.051 0.133 0.002 0.001 0.002 0.692 32 Y 0.027 0.006 0.003 0.025 0.177 0.522 0.032 0.001 0.001 0.001 0.206 33 K 0.024 0.010 0.001 0.027 0.236 0.398 0.057 0.001 0.001 0.001 0.245 34 D 0.018 0.006 0.001 0.011 0.143 0.200 0.071 0.001 0.001 0.001 0.547 35 Y 0.024 0.005 0.001 0.016 0.322 0.494 0.016 0.001 0.001 0.001 0.122 36 E 0.011 0.005 0.001 0.034 0.193 0.313 0.129 0.001 0.001 0.003 0.312 37 Y 0.016 0.005 0.001 0.034 0.395 0.398 0.028 0.001 0.001 0.004 0.120 38 K 0.012 0.006 0.001 0.044 0.245 0.492 0.033 0.001 0.001 0.002 0.164 39 L 0.012 0.005 0.001 0.071 0.358 0.438 0.018 0.001 0.001 0.003 0.093 40 T 0.010 0.004 0.001 0.071 0.248 0.394 0.050 0.001 0.001 0.002 0.220 41 G 0.017 0.005 0.001 0.034 0.319 0.482 0.017 0.001 0.001 0.002 0.123 42 F 0.017 0.009 0.007 0.057 0.252 0.289 0.085 0.005 0.001 0.003 0.276 43 D 0.051 0.001 0.001 0.006 0.287 0.627 0.004 0.001 0.001 0.001 0.022 44 K 0.008 0.003 0.001 0.019 0.044 0.114 0.261 0.001 0.001 0.010 0.539 45 D 0.008 0.001 0.001 0.003 0.004 0.004 0.913 0.001 0.001 0.012 0.054 46 G 0.168 0.002 0.001 0.002 0.004 0.004 0.016 0.001 0.001 0.752 0.050 47 K 0.152 0.007 0.129 0.010 0.011 0.010 0.566 0.001 0.001 0.017 0.097 48 E 0.007 0.001 0.002 0.003 0.011 0.014 0.145 0.001 0.001 0.001 0.816 49 K 0.026 0.001 0.001 0.008 0.228 0.686 0.006 0.001 0.001 0.001 0.044 50 E 0.009 0.001 0.001 0.015 0.024 0.045 0.072 0.001 0.001 0.001 0.832 51 L 0.022 0.001 0.001 0.033 0.381 0.465 0.010 0.001 0.001 0.001 0.086 52 E 0.007 0.003 0.001 0.050 0.237 0.386 0.041 0.001 0.001 0.001 0.276 53 F 0.004 0.002 0.001 0.027 0.372 0.441 0.017 0.001 0.001 0.001 0.137 54 T 0.007 0.002 0.001 0.028 0.241 0.485 0.039 0.001 0.001 0.001 0.198 55 A 0.007 0.004 0.001 0.027 0.134 0.290 0.071 0.001 0.001 0.002 0.464 56 Q 0.009 0.009 0.001 0.014 0.040 0.101 0.250 0.001 0.001 0.005 0.571 57 K 0.208 0.019 0.001 0.011 0.024 0.034 0.360 0.001 0.001 0.023 0.320 58 N 0.207 0.076 0.003 0.009 0.014 0.022 0.138 0.004 0.001 0.009 0.518 59 L 0.159 0.125 0.025 0.023 0.052 0.099 0.106 0.003 0.001 0.008 0.400 60 R 0.060 0.151 0.014 0.024 0.104 0.082 0.122 0.002 0.001 0.005 0.435 61 K 0.022 0.053 0.001 0.007 0.028 0.059 0.048 0.003 0.001 0.002 0.778 62 E 0.135 0.134 0.003 0.020 0.061 0.114 0.071 0.005 0.001 0.004 0.452 63 A 0.291 0.133 0.007 0.028 0.122 0.125 0.089 0.005 0.001 0.006 0.194 64 F 0.171 0.136 0.014 0.052 0.217 0.184 0.047 0.005 0.001 0.005 0.167 65 L 0.038 0.050 0.008 0.054 0.368 0.408 0.012 0.001 0.001 0.001 0.060 66 R 0.011 0.011 0.001 0.046 0.373 0.500 0.010 0.001 0.001 0.001 0.045 67 V 0.003 0.007 0.001 0.025 0.414 0.462 0.010 0.001 0.001 0.001 0.075 68 Y 0.002 0.003 0.001 0.029 0.348 0.585 0.005 0.001 0.001 0.001 0.028 69 H 0.002 0.005 0.001 0.023 0.404 0.464 0.015 0.001 0.001 0.001 0.085 70 S 0.005 0.005 0.001 0.031 0.235 0.494 0.034 0.001 0.001 0.001 0.195 71 D 0.022 0.003 0.001 0.027 0.066 0.135 0.096 0.001 0.001 0.009 0.639 72 K 0.164 0.007 0.005 0.034 0.039 0.076 0.243 0.001 0.001 0.011 0.421 73 K 0.055 0.007 0.002 0.018 0.028 0.032 0.263 0.001 0.001 0.015 0.579 74 G 0.118 0.009 0.006 0.046 0.069 0.091 0.114 0.002 0.001 0.017 0.527 75 V 0.115 0.010 0.011 0.042 0.064 0.109 0.088 0.001 0.001 0.003 0.555 76 S 0.029 0.008 0.002 0.054 0.207 0.292 0.103 0.001 0.001 0.004 0.300 77 A 0.008 0.007 0.001 0.018 0.064 0.125 0.098 0.001 0.001 0.002 0.677 78 W 0.035 0.022 0.001 0.046 0.070 0.208 0.051 0.001 0.001 0.004 0.562 79 E 0.038 0.040 0.001 0.047 0.170 0.165 0.298 0.001 0.001 0.008 0.233 80 E 0.045 0.062 0.001 0.014 0.058 0.082 0.098 0.002 0.001 0.003 0.635 81 V 0.079 0.155 0.004 0.036 0.117 0.260 0.030 0.002 0.001 0.002 0.315 82 K 0.025 0.137 0.003 0.017 0.112 0.129 0.106 0.002 0.001 0.002 0.466 83 K 0.022 0.094 0.001 0.012 0.039 0.066 0.016 0.002 0.001 0.002 0.745 84 D 0.048 0.156 0.002 0.005 0.015 0.038 0.068 0.004 0.001 0.003 0.661 85 E 0.572 0.045 0.004 0.004 0.002 0.005 0.108 0.007 0.001 0.010 0.242 86 L 0.386 0.221 0.058 0.008 0.006 0.009 0.058 0.006 0.001 0.002 0.245 87 P 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.001 0.001 0.001 0.982 88 A 0.002 0.022 0.001 0.002 0.002 0.004 0.041 0.001 0.001 0.001 0.925 89 K 0.025 0.171 0.001 0.004 0.004 0.005 0.056 0.001 0.001 0.002 0.731 90 V 0.128 0.434 0.002 0.003 0.001 0.007 0.019 0.003 0.001 0.001 0.402 91 K 0.027 0.899 0.001 0.004 0.002 0.003 0.004 0.001 0.001 0.001 0.058 92 E 0.020 0.919 0.001 0.001 0.002 0.002 0.003 0.003 0.001 0.001 0.050 93 K 0.096 0.852 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.013 0.001 0.001 0.034 94 L 0.089 0.811 0.006 0.001 0.001 0.002 0.003 0.028 0.001 0.001 0.058 95 G 0.270 0.338 0.047 0.008 0.005 0.009 0.015 0.081 0.001 0.005 0.223 96 V 0.115 0.180 0.153 0.015 0.009 0.008 0.056 0.028 0.001 0.001 0.435 97 K 0.042 0.048 0.007 0.022 0.013 0.014 0.053 0.008 0.001 0.003 0.791