# TARGET T0467 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t04-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0467.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 47.9873 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.054 0.030 0.021 0.034 0.044 0.094 0.031 0.692 2 D 0.096 0.061 0.019 0.040 0.069 0.087 0.061 0.567 3 L 0.039 0.014 0.030 0.048 0.059 0.098 0.050 0.663 4 N 0.161 0.017 0.039 0.088 0.123 0.061 0.126 0.384 5 R 0.139 0.003 0.033 0.039 0.090 0.074 0.051 0.570 6 M 0.061 0.001 0.050 0.045 0.108 0.090 0.035 0.610 7 G 0.064 0.001 0.014 0.039 0.084 0.093 0.018 0.686 8 K 0.051 0.001 0.012 0.036 0.086 0.101 0.015 0.699 9 D 0.007 0.001 0.023 0.090 0.246 0.115 0.023 0.496 10 E 0.002 0.001 0.031 0.190 0.512 0.057 0.021 0.187 11 Y 0.001 0.001 0.041 0.284 0.525 0.035 0.015 0.099 12 Y 0.001 0.001 0.046 0.461 0.370 0.023 0.017 0.083 13 V 0.001 0.001 0.041 0.445 0.403 0.015 0.015 0.081 14 Q 0.001 0.001 0.063 0.470 0.353 0.019 0.019 0.075 15 I 0.005 0.001 0.052 0.367 0.275 0.048 0.038 0.215 16 T 0.095 0.001 0.033 0.225 0.248 0.068 0.062 0.269 17 V 0.169 0.002 0.014 0.046 0.082 0.104 0.027 0.556 18 D 0.010 0.002 0.005 0.037 0.043 0.105 0.011 0.789 19 G 0.014 0.006 0.006 0.059 0.126 0.093 0.028 0.667 20 K 0.014 0.011 0.023 0.374 0.259 0.045 0.075 0.199 21 E 0.022 0.006 0.020 0.174 0.223 0.060 0.035 0.460 22 V 0.037 0.012 0.022 0.276 0.339 0.041 0.035 0.237 23 H 0.067 0.007 0.014 0.160 0.272 0.051 0.030 0.399 24 S 0.045 0.004 0.016 0.162 0.314 0.060 0.040 0.360 25 K 0.045 0.003 0.016 0.095 0.142 0.078 0.060 0.560 26 A 0.264 0.002 0.011 0.069 0.079 0.056 0.039 0.479 27 D 0.316 0.004 0.007 0.023 0.052 0.053 0.021 0.524 28 N 0.011 0.001 0.006 0.025 0.043 0.093 0.007 0.814 29 G 0.020 0.001 0.004 0.070 0.116 0.084 0.015 0.689 30 Q 0.023 0.002 0.022 0.292 0.283 0.061 0.045 0.272 31 K 0.051 0.001 0.019 0.108 0.197 0.062 0.021 0.540 32 Y 0.105 0.002 0.019 0.135 0.243 0.079 0.049 0.368 33 K 0.022 0.002 0.022 0.153 0.242 0.086 0.019 0.454 34 D 0.014 0.002 0.016 0.163 0.374 0.064 0.022 0.345 35 Y 0.007 0.003 0.030 0.247 0.475 0.045 0.027 0.167 36 E 0.002 0.002 0.056 0.391 0.396 0.032 0.032 0.089 37 Y 0.002 0.002 0.040 0.405 0.436 0.020 0.020 0.076 38 K 0.007 0.004 0.088 0.374 0.378 0.028 0.026 0.095 39 L 0.016 0.008 0.048 0.301 0.327 0.041 0.040 0.219 40 T 0.032 0.007 0.061 0.196 0.321 0.054 0.027 0.302 41 G 0.013 0.002 0.057 0.169 0.391 0.097 0.045 0.225 42 F 0.005 0.001 0.045 0.099 0.104 0.092 0.026 0.627 43 D 0.819 0.003 0.004 0.012 0.020 0.015 0.040 0.087 44 K 0.279 0.007 0.007 0.012 0.017 0.078 0.039 0.560 45 D 0.003 0.001 0.005 0.008 0.025 0.090 0.005 0.864 46 G 0.016 0.003 0.010 0.079 0.202 0.107 0.039 0.543 47 K 0.010 0.003 0.039 0.442 0.267 0.050 0.029 0.161 48 E 0.023 0.002 0.029 0.090 0.175 0.066 0.022 0.593 49 K 0.007 0.003 0.074 0.254 0.423 0.045 0.053 0.143 50 E 0.004 0.001 0.070 0.156 0.302 0.066 0.030 0.370 51 L 0.002 0.002 0.104 0.380 0.339 0.033 0.032 0.108 52 E 0.011 0.011 0.100 0.262 0.254 0.065 0.036 0.260 53 F 0.013 0.017 0.089 0.268 0.187 0.070 0.037 0.319 54 T 0.065 0.047 0.082 0.119 0.146 0.091 0.120 0.329 55 A 0.122 0.151 0.040 0.057 0.058 0.091 0.084 0.397 56 Q 0.212 0.336 0.012 0.013 0.016 0.050 0.081 0.279 57 K 0.111 0.371 0.007 0.018 0.018 0.047 0.057 0.370 58 N 0.071 0.252 0.018 0.024 0.028 0.070 0.105 0.432 59 L 0.119 0.178 0.014 0.023 0.028 0.069 0.044 0.525 60 R 0.425 0.180 0.008 0.013 0.023 0.040 0.062 0.248 61 K 0.083 0.142 0.008 0.024 0.032 0.084 0.055 0.571 62 E 0.045 0.134 0.026 0.045 0.152 0.096 0.095 0.407 63 A 0.018 0.075 0.076 0.118 0.435 0.055 0.072 0.150 64 F 0.009 0.024 0.101 0.128 0.526 0.043 0.067 0.101 65 L 0.001 0.010 0.067 0.330 0.450 0.027 0.041 0.073 66 R 0.001 0.004 0.092 0.336 0.478 0.014 0.034 0.042 67 V 0.001 0.001 0.066 0.577 0.254 0.013 0.036 0.050 68 Y 0.005 0.001 0.098 0.320 0.454 0.016 0.047 0.060 69 H 0.064 0.001 0.052 0.284 0.268 0.055 0.059 0.217 70 S 0.039 0.001 0.021 0.087 0.105 0.090 0.031 0.626 71 D 0.071 0.001 0.006 0.030 0.049 0.078 0.015 0.750 72 K 0.073 0.001 0.004 0.023 0.029 0.081 0.022 0.766 73 K 0.009 0.001 0.013 0.033 0.048 0.109 0.020 0.766 74 G 0.017 0.004 0.010 0.067 0.080 0.101 0.026 0.695 75 V 0.015 0.005 0.007 0.155 0.080 0.112 0.019 0.607 76 S 0.028 0.023 0.018 0.092 0.149 0.081 0.021 0.589 77 A 0.129 0.291 0.017 0.094 0.144 0.049 0.076 0.202 78 W 0.128 0.276 0.014 0.072 0.085 0.051 0.120 0.255 79 E 0.016 0.275 0.032 0.263 0.141 0.032 0.067 0.173 80 E 0.110 0.172 0.037 0.087 0.258 0.032 0.058 0.246 81 V 0.054 0.080 0.108 0.262 0.102 0.059 0.062 0.273 82 K 0.575 0.060 0.014 0.017 0.027 0.031 0.022 0.253 83 K 0.473 0.074 0.005 0.005 0.008 0.031 0.029 0.377 84 D 0.014 0.051 0.014 0.008 0.009 0.075 0.015 0.814 85 E 0.030 0.135 0.024 0.010 0.025 0.092 0.054 0.630 86 L 0.033 0.594 0.009 0.010 0.005 0.039 0.033 0.277 87 P 0.092 0.772 0.003 0.002 0.002 0.012 0.044 0.073 88 A 0.009 0.874 0.003 0.003 0.001 0.008 0.039 0.063 89 K 0.036 0.847 0.010 0.001 0.003 0.006 0.045 0.052 90 V 0.073 0.707 0.023 0.009 0.007 0.014 0.089 0.078 91 K 0.135 0.242 0.091 0.023 0.019 0.038 0.282 0.169 92 E 0.184 0.084 0.021 0.016 0.015 0.044 0.051 0.586 93 K 0.237 0.025 0.040 0.010 0.019 0.057 0.047 0.565 94 L 0.066 0.012 0.056 0.020 0.020 0.087 0.031 0.708 95 G 0.060 0.004 0.016 0.005 0.010 0.079 0.015 0.810 96 V 0.030 0.004 0.028 0.016 0.013 0.104 0.019 0.786 97 K 0.053 0.008 0.044 0.020 0.030 0.100 0.033 0.711