This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATAA D A 3 3 NATAA L A 4 4 NATAA N A 5 5 NATAA R A 6 6 NATAA M A 7 7 NATAA G A 8 8 NATAA K A 9 9 NATAA D A 10 10 NATAA E A 11 11 NATAA Y A 12 12 NATAA Y A 13 13 NATAA V A 14 14 NATAA Q A 15 15 NATAA I A 16 16 NATAA T A 17 17 NATAA V A 18 18 NATAA D A 19 19 NATAA G A 20 20 NATAA K A 21 21 NATAA E A 22 22 NATAA V A 23 23 NATAA H A 24 24 NATAA S A 25 25 NATAA K A 26 26 NATAA A A 27 27 NATAA D A 28 28 NATAA N A 29 29 NATAA G A 30 30 NATAA Q A 31 31 NATAA K A 32 32 NATAA Y A 33 33 NATAA K A 34 34 NATAA D A 35 35 NATAA Y A 36 36 NATAA E A 37 37 NATAA Y A 38 38 NATAA K A 39 39 NATAA L A 40 40 NATAA T A 41 41 NATAA G A 42 42 NATAA F A 43 43 NATAA D A 44 44 NATAA K A 45 45 NATAA D A 46 46 NATAA G A 47 47 NATAA K A 48 48 NATAA E A 49 49 NATAA K A 50 50 NATAA E A 51 51 NATAA L A 52 52 NATAA E A 53 53 NATAA F A 54 54 NATAA T A 55 55 NATAA A A 56 56 NATAA Q A 57 57 NATAA K A 58 58 NATAA N A 59 59 NATAA L A 60 60 NATAA R A 61 61 NATAA K A 62 62 NATAA E A 63 63 NATAA A A 64 64 NATAA F A 65 65 NATAA L A 66 66 NATAA R A 67 67 NATAA V A 68 68 NATAA Y A 69 69 NATAA H A 70 70 NATAA S A 71 71 NATAA D A 72 72 NATAA K A 73 73 NATAA K A 74 74 NATAA G A 75 75 NATAA V A 76 76 NATAA S A 77 77 NATAA A A 78 78 NATAA W A 79 79 NATAA E A 80 80 NATAA E A 81 81 NATAA V A 82 82 NATAA K A 83 83 NATAA K A 84 84 NATAA D A 85 85 NATAA E A 86 86 NATAA L A 87 87 NATRO P A 88 88 NATAA A A 89 89 NATAA K A 90 90 NATAA V A 91 91 NATAA K A 92 92 NATAA E A 93 93 NATAA K A 94 94 NATAA L A 95 95 NATAA G A 96 96 NATAA V A 97 97 NATAA K