# TARGET T0451 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0451.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 436 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.047 0.033 0.033 0.032 0.071 0.138 0.051 0.595 2 M 0.066 0.024 0.032 0.055 0.074 0.130 0.092 0.528 3 T 0.063 0.043 0.029 0.027 0.049 0.128 0.108 0.552 4 H 0.065 0.039 0.023 0.019 0.033 0.147 0.077 0.596 5 Y 0.058 0.044 0.025 0.018 0.018 0.134 0.109 0.594 6 S 0.131 0.267 0.012 0.007 0.010 0.091 0.086 0.396 7 D 0.073 0.385 0.013 0.005 0.009 0.076 0.038 0.400 8 N 0.040 0.652 0.010 0.005 0.006 0.042 0.030 0.215 9 T 0.041 0.855 0.004 0.001 0.002 0.011 0.037 0.049 10 L 0.025 0.858 0.005 0.002 0.002 0.008 0.061 0.039 11 K 0.037 0.837 0.005 0.002 0.002 0.012 0.049 0.058 12 V 0.025 0.612 0.005 0.001 0.001 0.012 0.286 0.057 13 A 0.004 0.963 0.001 0.001 0.001 0.002 0.020 0.010 14 H 0.002 0.980 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.009 15 Q 0.001 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.003 16 G 0.003 0.976 0.001 0.001 0.001 0.001 0.019 0.001 17 F 0.001 0.159 0.001 0.001 0.001 0.001 0.838 0.001 18 E 0.001 0.784 0.003 0.001 0.001 0.001 0.206 0.004 19 F 0.005 0.961 0.003 0.001 0.001 0.003 0.017 0.011 20 F 0.007 0.922 0.019 0.001 0.001 0.005 0.034 0.011 21 T 0.051 0.848 0.013 0.001 0.002 0.009 0.039 0.038 22 Q 0.069 0.171 0.030 0.003 0.002 0.041 0.492 0.191 23 G 0.060 0.165 0.077 0.007 0.006 0.099 0.394 0.191 24 L 0.438 0.092 0.036 0.003 0.004 0.075 0.066 0.287 25 A 0.113 0.069 0.012 0.001 0.002 0.084 0.075 0.643 26 T 0.011 0.096 0.013 0.001 0.002 0.070 0.025 0.782 27 G 0.016 0.208 0.008 0.003 0.002 0.109 0.078 0.575 28 E 0.027 0.938 0.001 0.001 0.001 0.005 0.013 0.016 29 W 0.030 0.931 0.001 0.001 0.001 0.003 0.023 0.012 30 Q 0.008 0.916 0.007 0.001 0.001 0.003 0.046 0.020 31 K 0.019 0.879 0.013 0.001 0.001 0.006 0.060 0.022 32 F 0.106 0.788 0.014 0.001 0.001 0.008 0.060 0.023 33 L 0.087 0.178 0.024 0.002 0.002 0.015 0.610 0.083 34 D 0.027 0.199 0.016 0.002 0.002 0.041 0.235 0.476 35 M 0.027 0.072 0.081 0.004 0.005 0.130 0.171 0.509 36 L 0.229 0.066 0.087 0.011 0.007 0.117 0.132 0.351 37 T 0.359 0.014 0.017 0.001 0.002 0.071 0.061 0.476 38 E 0.012 0.007 0.039 0.002 0.005 0.182 0.037 0.715 39 D 0.009 0.004 0.270 0.008 0.031 0.140 0.092 0.446 40 F 0.011 0.003 0.364 0.053 0.052 0.119 0.080 0.319 41 T 0.005 0.002 0.601 0.031 0.040 0.049 0.041 0.233 42 F 0.004 0.002 0.534 0.072 0.102 0.056 0.048 0.182 43 W 0.017 0.002 0.296 0.055 0.079 0.100 0.042 0.409 44 F 0.225 0.010 0.118 0.079 0.066 0.118 0.085 0.299 45 P 0.035 0.010 0.037 0.019 0.032 0.125 0.031 0.712 46 M 0.042 0.011 0.029 0.014 0.037 0.131 0.031 0.705 47 G 0.106 0.022 0.034 0.048 0.054 0.157 0.094 0.485 48 E 0.147 0.029 0.014 0.021 0.027 0.134 0.045 0.582 49 F 0.088 0.024 0.023 0.026 0.046 0.114 0.083 0.596 50 H 0.059 0.028 0.023 0.028 0.065 0.132 0.047 0.618 51 G 0.039 0.052 0.044 0.052 0.108 0.101 0.066 0.537 52 L 0.037 0.106 0.031 0.042 0.056 0.126 0.031 0.570 53 N 0.066 0.353 0.046 0.047 0.051 0.077 0.046 0.315 54 V 0.017 0.518 0.013 0.014 0.017 0.049 0.050 0.321 55 G 0.014 0.945 0.002 0.001 0.001 0.002 0.025 0.010 56 K 0.006 0.975 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 0.004 57 E 0.003 0.975 0.002 0.001 0.001 0.001 0.010 0.008 58 R 0.008 0.954 0.002 0.001 0.001 0.001 0.029 0.005 59 A 0.041 0.852 0.002 0.001 0.001 0.003 0.094 0.008 60 K 0.006 0.054 0.001 0.001 0.001 0.002 0.924 0.012 61 E 0.004 0.666 0.003 0.001 0.001 0.011 0.227 0.086 62 F 0.043 0.857 0.004 0.001 0.001 0.015 0.022 0.058 63 F 0.055 0.487 0.030 0.006 0.003 0.032 0.266 0.120 64 T 0.096 0.468 0.017 0.002 0.004 0.048 0.110 0.256 65 Y 0.131 0.219 0.037 0.003 0.003 0.092 0.193 0.323 66 V 0.080 0.213 0.081 0.009 0.006 0.103 0.199 0.310 67 S 0.279 0.092 0.028 0.002 0.005 0.069 0.070 0.455 68 E 0.039 0.024 0.038 0.007 0.008 0.120 0.118 0.647 69 S 0.017 0.017 0.091 0.007 0.012 0.136 0.114 0.605 70 F 0.236 0.022 0.024 0.008 0.010 0.120 0.064 0.517 71 H 0.156 0.020 0.020 0.008 0.012 0.100 0.035 0.650 72 T 0.041 0.015 0.025 0.006 0.020 0.092 0.027 0.774 73 G 0.031 0.011 0.054 0.041 0.112 0.139 0.078 0.533 74 I 0.010 0.004 0.078 0.112 0.125 0.097 0.105 0.470 75 Q 0.012 0.010 0.094 0.132 0.142 0.077 0.060 0.473 76 I 0.018 0.014 0.094 0.093 0.151 0.079 0.040 0.510 77 S 0.018 0.015 0.131 0.116 0.138 0.075 0.051 0.454 78 S 0.060 0.052 0.097 0.117 0.170 0.075 0.088 0.340 79 L 0.034 0.025 0.060 0.092 0.136 0.079 0.202 0.372 80 D 0.015 0.014 0.059 0.173 0.239 0.065 0.170 0.264 81 R 0.011 0.006 0.061 0.196 0.320 0.048 0.124 0.233 82 V 0.019 0.003 0.053 0.178 0.243 0.077 0.051 0.376 83 T 0.057 0.002 0.063 0.138 0.235 0.073 0.072 0.359 84 S 0.043 0.002 0.021 0.027 0.059 0.113 0.050 0.686 85 N 0.084 0.009 0.024 0.028 0.076 0.152 0.044 0.584 86 E 0.027 0.016 0.020 0.035 0.106 0.149 0.025 0.622 87 T 0.004 0.019 0.069 0.114 0.461 0.065 0.027 0.242 88 T 0.001 0.009 0.059 0.249 0.571 0.012 0.022 0.076 89 V 0.001 0.004 0.044 0.502 0.407 0.005 0.014 0.023 90 V 0.002 0.007 0.076 0.404 0.448 0.006 0.024 0.033 91 F 0.002 0.007 0.049 0.489 0.408 0.005 0.020 0.020 92 E 0.003 0.011 0.063 0.283 0.561 0.011 0.026 0.041 93 F 0.010 0.014 0.036 0.292 0.529 0.017 0.045 0.058 94 R 0.051 0.026 0.030 0.285 0.375 0.035 0.058 0.139 95 D 0.050 0.031 0.025 0.187 0.251 0.054 0.043 0.359 96 E 0.029 0.020 0.024 0.102 0.203 0.086 0.040 0.497 97 G 0.015 0.006 0.066 0.155 0.214 0.077 0.076 0.391 98 L 0.105 0.004 0.035 0.127 0.137 0.077 0.037 0.478 99 F 0.420 0.003 0.016 0.060 0.044 0.051 0.047 0.359 100 L 0.011 0.001 0.008 0.023 0.055 0.107 0.010 0.785 101 G 0.007 0.001 0.006 0.008 0.035 0.055 0.009 0.879 102 K 0.042 0.004 0.016 0.217 0.124 0.092 0.060 0.445 103 P 0.033 0.006 0.028 0.076 0.102 0.092 0.065 0.598 104 Y 0.069 0.009 0.040 0.115 0.187 0.081 0.080 0.418 105 K 0.063 0.006 0.039 0.070 0.132 0.074 0.042 0.573 106 N 0.035 0.010 0.040 0.084 0.185 0.077 0.078 0.490 107 R 0.003 0.003 0.100 0.148 0.412 0.064 0.036 0.235 108 V 0.002 0.001 0.090 0.190 0.568 0.027 0.043 0.079 109 A 0.002 0.001 0.065 0.364 0.402 0.015 0.032 0.120 110 V 0.001 0.001 0.080 0.428 0.453 0.007 0.008 0.023 111 S 0.001 0.001 0.062 0.272 0.544 0.012 0.014 0.095 112 F 0.001 0.001 0.074 0.459 0.424 0.007 0.008 0.028 113 D 0.004 0.001 0.100 0.267 0.476 0.022 0.027 0.104 114 V 0.244 0.002 0.054 0.150 0.131 0.066 0.050 0.302 115 R 0.316 0.006 0.021 0.048 0.056 0.059 0.021 0.472 116 G 0.021 0.006 0.009 0.008 0.054 0.078 0.007 0.816 117 D 0.004 0.004 0.048 0.073 0.290 0.084 0.033 0.463 118 K 0.004 0.007 0.030 0.506 0.332 0.022 0.030 0.069 119 I 0.009 0.015 0.052 0.314 0.293 0.030 0.026 0.261 120 C 0.004 0.011 0.090 0.373 0.390 0.017 0.016 0.099 121 S 0.009 0.026 0.071 0.247 0.483 0.015 0.054 0.095 122 Y 0.043 0.051 0.069 0.239 0.320 0.033 0.090 0.154 123 R 0.023 0.030 0.048 0.335 0.346 0.029 0.061 0.128 124 E 0.038 0.026 0.046 0.102 0.193 0.096 0.071 0.427 125 Y 0.034 0.028 0.059 0.103 0.168 0.124 0.104 0.379 126 F 0.033 0.029 0.039 0.058 0.088 0.121 0.045 0.586 127 G 0.251 0.068 0.022 0.031 0.040 0.087 0.077 0.425 128 S 0.132 0.046 0.017 0.028 0.026 0.106 0.109 0.537 129 D 0.061 0.023 0.023 0.016 0.027 0.128 0.103 0.620 130 G 0.178 0.019 0.015 0.015 0.022 0.120 0.081 0.550 131 K 0.154 0.012 0.009 0.015 0.019 0.113 0.048 0.631 132 S 0.038 0.009 0.007 0.007 0.020 0.098 0.031 0.791 133 N 0.038 0.012 0.014 0.019 0.046 0.133 0.048 0.689