# TARGET T0451 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0451.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 436 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.078 0.018 0.094 0.037 0.062 0.097 0.013 0.600 2 M 0.101 0.024 0.151 0.062 0.124 0.140 0.013 0.384 3 T 0.068 0.024 0.093 0.054 0.093 0.158 0.012 0.498 4 H 0.050 0.018 0.061 0.023 0.041 0.075 0.008 0.725 5 Y 0.125 0.023 0.076 0.025 0.050 0.233 0.010 0.457 6 S 0.076 0.021 0.036 0.016 0.032 0.277 0.012 0.530 7 D 0.049 0.025 0.019 0.007 0.019 0.056 0.006 0.818 8 N 0.048 0.022 0.014 0.005 0.010 0.381 0.008 0.513 9 T 0.118 0.024 0.005 0.003 0.006 0.560 0.009 0.276 10 L 0.111 0.255 0.012 0.005 0.014 0.111 0.005 0.487 11 K 0.024 0.280 0.006 0.004 0.009 0.244 0.004 0.429 12 V 0.052 0.505 0.004 0.003 0.004 0.124 0.006 0.303 13 A 0.029 0.885 0.001 0.001 0.002 0.011 0.003 0.067 14 H 0.018 0.912 0.003 0.002 0.002 0.006 0.004 0.053 15 Q 0.009 0.944 0.003 0.001 0.001 0.007 0.002 0.033 16 G 0.010 0.941 0.001 0.001 0.002 0.006 0.002 0.036 17 F 0.007 0.963 0.002 0.001 0.002 0.003 0.002 0.021 18 E 0.001 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 19 F 0.001 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 20 F 0.005 0.978 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.011 21 T 0.004 0.980 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 22 Q 0.003 0.982 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 23 G 0.019 0.957 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.014 24 L 0.022 0.955 0.003 0.001 0.001 0.001 0.006 0.010 25 A 0.129 0.761 0.011 0.004 0.003 0.008 0.039 0.044 26 T 0.227 0.535 0.065 0.006 0.005 0.010 0.060 0.091 27 G 0.311 0.240 0.045 0.008 0.006 0.024 0.071 0.296 28 E 0.189 0.064 0.088 0.005 0.006 0.216 0.037 0.396 29 W 0.069 0.102 0.122 0.006 0.017 0.135 0.011 0.538 30 Q 0.019 0.121 0.034 0.003 0.011 0.225 0.004 0.582 31 K 0.027 0.152 0.008 0.002 0.004 0.320 0.003 0.485 32 F 0.034 0.724 0.004 0.001 0.004 0.035 0.003 0.195 33 L 0.007 0.943 0.002 0.001 0.003 0.004 0.001 0.040 34 D 0.019 0.937 0.001 0.001 0.002 0.002 0.006 0.031 35 M 0.173 0.744 0.006 0.003 0.003 0.002 0.033 0.036 36 L 0.287 0.571 0.012 0.005 0.010 0.006 0.046 0.064 37 T 0.170 0.451 0.076 0.020 0.029 0.021 0.049 0.185 38 E 0.060 0.154 0.085 0.012 0.015 0.049 0.044 0.581 39 D 0.266 0.070 0.077 0.017 0.012 0.080 0.086 0.392 40 F 0.245 0.055 0.341 0.034 0.024 0.065 0.040 0.195 41 T 0.027 0.021 0.526 0.066 0.076 0.089 0.007 0.187 42 F 0.012 0.010 0.352 0.155 0.168 0.051 0.006 0.246 43 W 0.019 0.019 0.261 0.121 0.220 0.040 0.007 0.312 44 F 0.012 0.009 0.342 0.165 0.169 0.044 0.005 0.254 45 P 0.001 0.001 0.002 0.001 0.002 0.002 0.001 0.992 46 M 0.014 0.003 0.046 0.057 0.213 0.102 0.004 0.561 47 G 0.118 0.007 0.030 0.032 0.046 0.106 0.011 0.650 48 E 0.042 0.006 0.011 0.012 0.018 0.058 0.007 0.846 49 F 0.120 0.018 0.030 0.021 0.035 0.087 0.007 0.682 50 H 0.076 0.029 0.034 0.026 0.035 0.112 0.011 0.676 51 G 0.126 0.035 0.038 0.034 0.043 0.081 0.019 0.624 52 L 0.184 0.044 0.082 0.030 0.051 0.096 0.012 0.502 53 N 0.058 0.053 0.044 0.042 0.058 0.151 0.009 0.583 54 V 0.090 0.062 0.047 0.035 0.050 0.154 0.009 0.554 55 G 0.075 0.117 0.037 0.027 0.044 0.234 0.011 0.454 56 K 0.082 0.120 0.040 0.010 0.044 0.102 0.008 0.594 57 E 0.012 0.122 0.006 0.003 0.008 0.145 0.002 0.701 58 R 0.035 0.342 0.002 0.002 0.004 0.177 0.004 0.433 59 A 0.024 0.840 0.001 0.001 0.002 0.011 0.003 0.118 60 K 0.003 0.967 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.025 61 E 0.004 0.977 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 62 F 0.017 0.956 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.019 63 F 0.013 0.964 0.002 0.001 0.001 0.001 0.003 0.016 64 T 0.007 0.965 0.004 0.001 0.001 0.002 0.003 0.018 65 Y 0.030 0.906 0.006 0.001 0.001 0.003 0.012 0.042 66 V 0.043 0.875 0.015 0.002 0.003 0.004 0.013 0.046 67 S 0.027 0.810 0.019 0.005 0.007 0.015 0.012 0.105 68 E 0.071 0.640 0.023 0.008 0.007 0.025 0.026 0.199 69 S 0.278 0.409 0.019 0.007 0.007 0.040 0.051 0.189 70 F 0.285 0.361 0.051 0.015 0.016 0.029 0.045 0.198 71 H 0.055 0.204 0.094 0.024 0.031 0.105 0.028 0.459 72 T 0.059 0.090 0.032 0.019 0.024 0.089 0.033 0.654 73 G 0.324 0.063 0.036 0.018 0.015 0.062 0.053 0.429 74 I 0.140 0.027 0.112 0.023 0.028 0.141 0.015 0.515 75 Q 0.033 0.027 0.133 0.129 0.119 0.130 0.011 0.418 76 I 0.048 0.020 0.089 0.095 0.184 0.082 0.007 0.476 77 S 0.029 0.024 0.139 0.198 0.226 0.069 0.006 0.309 78 S 0.024 0.017 0.089 0.157 0.193 0.100 0.007 0.413 79 L 0.023 0.013 0.072 0.100 0.215 0.070 0.006 0.500 80 D 0.027 0.019 0.079 0.214 0.294 0.122 0.007 0.239 81 R 0.050 0.020 0.054 0.215 0.295 0.091 0.008 0.267 82 V 0.048 0.025 0.064 0.190 0.329 0.069 0.007 0.268 83 T 0.034 0.023 0.055 0.304 0.346 0.059 0.008 0.171 84 S 0.038 0.021 0.049 0.221 0.273 0.072 0.014 0.311 85 N 0.038 0.013 0.030 0.090 0.183 0.171 0.026 0.447 86 E 0.084 0.008 0.023 0.061 0.059 0.138 0.063 0.564 87 T 0.196 0.005 0.024 0.049 0.049 0.401 0.037 0.240 88 T 0.160 0.002 0.046 0.130 0.178 0.300 0.014 0.170 89 V 0.023 0.001 0.045 0.393 0.449 0.053 0.002 0.034 90 V 0.003 0.001 0.042 0.321 0.580 0.014 0.001 0.039 91 F 0.001 0.001 0.039 0.449 0.497 0.003 0.001 0.010 92 E 0.001 0.001 0.036 0.329 0.596 0.006 0.001 0.032 93 F 0.001 0.001 0.052 0.362 0.550 0.007 0.001 0.027 94 R 0.002 0.002 0.062 0.229 0.585 0.029 0.001 0.090 95 D 0.004 0.005 0.047 0.208 0.414 0.056 0.003 0.262 96 E 0.039 0.008 0.044 0.132 0.380 0.126 0.007 0.264 97 G 0.081 0.028 0.030 0.240 0.207 0.081 0.017 0.315 98 L 0.073 0.025 0.077 0.172 0.210 0.073 0.021 0.349 99 F 0.041 0.040 0.044 0.238 0.208 0.065 0.010 0.354 100 L 0.024 0.025 0.034 0.079 0.156 0.049 0.012 0.620 101 G 0.074 0.035 0.036 0.080 0.133 0.066 0.063 0.514 102 K 0.277 0.006 0.040 0.056 0.055 0.115 0.010 0.441 103 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 104 Y 0.017 0.004 0.028 0.123 0.439 0.111 0.004 0.274 105 K 0.101 0.007 0.030 0.080 0.087 0.089 0.010 0.596 106 N 0.076 0.016 0.032 0.123 0.165 0.087 0.013 0.488 107 R 0.192 0.010 0.067 0.167 0.164 0.120 0.012 0.269 108 V 0.093 0.007 0.080 0.195 0.282 0.129 0.013 0.200 109 A 0.022 0.002 0.066 0.349 0.493 0.031 0.005 0.031 110 V 0.007 0.001 0.052 0.461 0.455 0.010 0.001 0.013 111 S 0.002 0.001 0.019 0.273 0.562 0.010 0.001 0.134 112 F 0.001 0.001 0.032 0.497 0.463 0.002 0.001 0.006 113 D 0.001 0.001 0.015 0.341 0.398 0.012 0.001 0.232 114 V 0.001 0.001 0.034 0.349 0.574 0.010 0.001 0.031 115 R 0.006 0.001 0.025 0.154 0.337 0.128 0.003 0.348 116 G 0.009 0.001 0.013 0.047 0.082 0.116 0.019 0.713 117 D 0.144 0.003 0.021 0.080 0.034 0.188 0.061 0.470 118 K 0.510 0.001 0.008 0.018 0.055 0.364 0.004 0.040 119 I 0.016 0.001 0.014 0.398 0.354 0.070 0.001 0.147 120 C 0.003 0.001 0.009 0.329 0.646 0.007 0.001 0.006 121 S 0.002 0.001 0.010 0.401 0.526 0.008 0.001 0.051 122 Y 0.001 0.001 0.016 0.247 0.694 0.006 0.001 0.034 123 R 0.002 0.003 0.015 0.364 0.570 0.013 0.001 0.034 124 E 0.005 0.012 0.032 0.209 0.523 0.031 0.003 0.186 125 Y 0.031 0.023 0.064 0.149 0.472 0.070 0.008 0.184 126 F 0.086 0.052 0.074 0.185 0.202 0.069 0.017 0.315 127 G 0.063 0.030 0.049 0.067 0.103 0.075 0.027 0.585 128 S 0.097 0.014 0.029 0.025 0.048 0.059 0.013 0.715 129 D 0.022 0.007 0.011 0.008 0.019 0.086 0.005 0.842 130 G 0.051 0.010 0.009 0.010 0.024 0.214 0.011 0.672 131 K 0.072 0.018 0.012 0.007 0.013 0.149 0.008 0.720 132 S 0.060 0.029 0.010 0.009 0.016 0.104 0.007 0.765 133 N 0.074 0.028 0.013 0.012 0.022 0.092 0.009 0.750