# TARGET T0451 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t04-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0451.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 381 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.080 0.036 0.046 0.039 0.087 0.103 0.050 0.559 2 M 0.048 0.017 0.039 0.044 0.063 0.134 0.061 0.593 3 T 0.052 0.030 0.045 0.047 0.082 0.167 0.068 0.510 4 H 0.066 0.022 0.028 0.016 0.033 0.157 0.092 0.585 5 Y 0.046 0.037 0.030 0.019 0.023 0.153 0.195 0.498 6 S 0.095 0.278 0.010 0.012 0.013 0.097 0.091 0.403 7 D 0.098 0.320 0.006 0.005 0.007 0.079 0.057 0.428 8 N 0.023 0.582 0.007 0.008 0.008 0.053 0.063 0.256 9 T 0.036 0.798 0.004 0.003 0.005 0.017 0.058 0.079 10 L 0.070 0.723 0.003 0.006 0.004 0.019 0.094 0.082 11 K 0.052 0.649 0.006 0.006 0.005 0.022 0.137 0.123 12 V 0.034 0.757 0.004 0.002 0.004 0.015 0.067 0.117 13 A 0.033 0.911 0.001 0.001 0.001 0.004 0.022 0.028 14 H 0.020 0.901 0.001 0.001 0.001 0.007 0.024 0.045 15 Q 0.003 0.965 0.001 0.001 0.001 0.003 0.008 0.020 16 G 0.005 0.971 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 0.004 17 F 0.005 0.192 0.004 0.001 0.001 0.003 0.787 0.006 18 E 0.002 0.701 0.009 0.005 0.001 0.007 0.255 0.019 19 F 0.013 0.950 0.004 0.001 0.001 0.002 0.011 0.019 20 F 0.006 0.958 0.003 0.001 0.001 0.003 0.017 0.012 21 T 0.013 0.922 0.003 0.001 0.001 0.006 0.037 0.019 22 Q 0.048 0.133 0.017 0.002 0.002 0.026 0.690 0.082 23 G 0.050 0.136 0.042 0.005 0.002 0.072 0.477 0.215 24 L 0.186 0.079 0.026 0.002 0.001 0.091 0.173 0.443 25 A 0.097 0.110 0.006 0.001 0.001 0.069 0.031 0.686 26 T 0.029 0.112 0.008 0.001 0.001 0.123 0.018 0.709 27 G 0.018 0.285 0.013 0.001 0.001 0.077 0.044 0.562 28 E 0.034 0.743 0.003 0.001 0.001 0.018 0.081 0.120 29 W 0.035 0.860 0.002 0.001 0.001 0.007 0.058 0.038 30 Q 0.009 0.854 0.007 0.002 0.001 0.009 0.060 0.059 31 K 0.030 0.861 0.010 0.001 0.003 0.006 0.023 0.066 32 F 0.047 0.881 0.015 0.002 0.002 0.005 0.030 0.017 33 L 0.206 0.141 0.041 0.009 0.009 0.036 0.415 0.145 34 D 0.099 0.030 0.015 0.010 0.014 0.113 0.136 0.584 35 M 0.014 0.021 0.111 0.008 0.027 0.178 0.077 0.564 36 L 0.065 0.019 0.047 0.009 0.008 0.172 0.052 0.628 37 T 0.520 0.036 0.007 0.002 0.003 0.081 0.101 0.249 38 E 0.010 0.008 0.048 0.005 0.006 0.192 0.035 0.696 39 D 0.012 0.013 0.074 0.007 0.026 0.150 0.049 0.668 40 F 0.008 0.021 0.207 0.067 0.078 0.145 0.084 0.390 41 T 0.005 0.007 0.327 0.071 0.125 0.094 0.044 0.327 42 F 0.003 0.006 0.278 0.117 0.204 0.078 0.066 0.248 43 W 0.009 0.004 0.319 0.080 0.119 0.074 0.041 0.353 44 F 0.089 0.011 0.131 0.098 0.120 0.102 0.110 0.339 45 P 0.074 0.014 0.068 0.035 0.059 0.132 0.068 0.550 46 M 0.037 0.009 0.025 0.015 0.031 0.142 0.040 0.702 47 G 0.070 0.017 0.045 0.029 0.050 0.152 0.111 0.528 48 E 0.195 0.022 0.011 0.015 0.017 0.109 0.043 0.589 49 F 0.185 0.026 0.011 0.007 0.013 0.120 0.064 0.574 50 H 0.019 0.025 0.019 0.012 0.018 0.160 0.032 0.715 51 G 0.039 0.097 0.021 0.017 0.041 0.121 0.135 0.528 52 L 0.018 0.108 0.024 0.056 0.036 0.119 0.071 0.567 53 N 0.048 0.351 0.029 0.036 0.054 0.064 0.059 0.360 54 V 0.020 0.509 0.040 0.014 0.024 0.037 0.117 0.240 55 G 0.013 0.911 0.003 0.002 0.003 0.004 0.047 0.019 56 K 0.011 0.960 0.001 0.001 0.001 0.001 0.020 0.005 57 E 0.009 0.918 0.003 0.001 0.001 0.003 0.041 0.024 58 R 0.013 0.896 0.002 0.001 0.002 0.005 0.051 0.030 59 A 0.015 0.947 0.002 0.001 0.001 0.002 0.028 0.005 60 K 0.015 0.144 0.007 0.002 0.001 0.017 0.759 0.053 61 E 0.007 0.715 0.005 0.003 0.002 0.025 0.108 0.134 62 F 0.033 0.822 0.016 0.001 0.001 0.017 0.049 0.060 63 F 0.083 0.193 0.031 0.006 0.002 0.069 0.448 0.167 64 T 0.035 0.329 0.010 0.002 0.003 0.082 0.096 0.443 65 Y 0.039 0.102 0.099 0.003 0.006 0.124 0.191 0.437 66 V 0.073 0.225 0.043 0.012 0.004 0.097 0.201 0.344 67 S 0.192 0.075 0.015 0.003 0.004 0.093 0.068 0.550 68 E 0.042 0.020 0.035 0.005 0.009 0.129 0.071 0.689 69 S 0.030 0.014 0.039 0.006 0.012 0.128 0.072 0.698 70 F 0.221 0.018 0.024 0.007 0.008 0.098 0.055 0.568 71 H 0.071 0.015 0.012 0.008 0.012 0.115 0.036 0.732 72 T 0.017 0.010 0.019 0.008 0.026 0.132 0.019 0.768 73 G 0.038 0.014 0.044 0.046 0.078 0.138 0.119 0.523 74 I 0.009 0.007 0.073 0.121 0.132 0.114 0.088 0.456 75 Q 0.034 0.020 0.142 0.113 0.217 0.071 0.085 0.317 76 I 0.031 0.012 0.065 0.145 0.138 0.086 0.088 0.436 77 S 0.016 0.011 0.102 0.145 0.224 0.081 0.039 0.383 78 S 0.062 0.026 0.063 0.120 0.337 0.067 0.062 0.263 79 L 0.024 0.006 0.042 0.127 0.182 0.093 0.110 0.417 80 D 0.010 0.010 0.065 0.237 0.314 0.068 0.088 0.209 81 R 0.009 0.003 0.070 0.170 0.325 0.072 0.059 0.291 82 V 0.011 0.002 0.102 0.234 0.216 0.098 0.065 0.272 83 T 0.067 0.002 0.031 0.081 0.130 0.131 0.087 0.471 84 S 0.099 0.002 0.027 0.030 0.055 0.143 0.056 0.588 85 N 0.082 0.006 0.013 0.017 0.037 0.159 0.050 0.635 86 E 0.004 0.003 0.005 0.021 0.034 0.184 0.017 0.732 87 T 0.003 0.013 0.032 0.169 0.357 0.115 0.062 0.249 88 T 0.003 0.009 0.046 0.249 0.480 0.045 0.050 0.119 89 V 0.001 0.006 0.091 0.411 0.346 0.028 0.042 0.076 90 V 0.001 0.004 0.079 0.422 0.383 0.017 0.041 0.052 91 F 0.002 0.004 0.103 0.410 0.376 0.014 0.039 0.052 92 E 0.004 0.005 0.080 0.334 0.433 0.023 0.034 0.088 93 F 0.017 0.009 0.123 0.270 0.320 0.050 0.056 0.155 94 R 0.063 0.024 0.063 0.174 0.227 0.071 0.087 0.291 95 D 0.070 0.028 0.049 0.091 0.152 0.082 0.066 0.462 96 E 0.031 0.013 0.039 0.112 0.189 0.074 0.040 0.504 97 G 0.022 0.006 0.077 0.102 0.189 0.090 0.081 0.432 98 L 0.083 0.006 0.048 0.134 0.134 0.079 0.057 0.459 99 F 0.302 0.004 0.027 0.024 0.070 0.076 0.059 0.438 100 L 0.014 0.003 0.020 0.035 0.051 0.118 0.016 0.743 101 G 0.015 0.002 0.004 0.011 0.022 0.102 0.012 0.833 102 K 0.034 0.012 0.024 0.134 0.086 0.119 0.121 0.470 103 P 0.082 0.014 0.026 0.039 0.060 0.096 0.052 0.632 104 Y 0.112 0.027 0.033 0.070 0.098 0.095 0.070 0.496 105 K 0.022 0.012 0.030 0.057 0.096 0.119 0.038 0.625 106 N 0.014 0.028 0.063 0.145 0.382 0.060 0.073 0.236 107 R 0.007 0.017 0.080 0.179 0.392 0.055 0.099 0.171 108 V 0.002 0.007 0.111 0.289 0.449 0.028 0.046 0.068 109 A 0.003 0.004 0.097 0.213 0.526 0.029 0.047 0.082 110 V 0.002 0.003 0.094 0.356 0.449 0.014 0.044 0.039 111 S 0.001 0.001 0.063 0.257 0.574 0.013 0.020 0.071 112 F 0.001 0.001 0.084 0.536 0.317 0.009 0.025 0.028 113 D 0.004 0.001 0.076 0.295 0.405 0.031 0.055 0.134 114 V 0.124 0.001 0.057 0.227 0.290 0.049 0.058 0.195 115 R 0.114 0.001 0.016 0.037 0.082 0.103 0.017 0.630 116 G 0.003 0.001 0.001 0.013 0.012 0.096 0.003 0.873 117 D 0.003 0.001 0.004 0.078 0.116 0.096 0.024 0.679 118 K 0.018 0.012 0.061 0.336 0.338 0.032 0.095 0.108 119 I 0.018 0.004 0.010 0.207 0.113 0.058 0.023 0.567 120 C 0.007 0.009 0.037 0.394 0.324 0.036 0.025 0.169 121 S 0.037 0.024 0.023 0.223 0.502 0.021 0.033 0.136 122 Y 0.056 0.030 0.044 0.275 0.293 0.047 0.056 0.200 123 R 0.079 0.063 0.054 0.171 0.281 0.052 0.094 0.206 124 E 0.042 0.016 0.053 0.124 0.286 0.060 0.064 0.354 125 Y 0.015 0.021 0.096 0.150 0.276 0.093 0.053 0.297 126 F 0.020 0.016 0.066 0.067 0.127 0.107 0.032 0.565 127 G 0.286 0.082 0.025 0.046 0.049 0.072 0.094 0.346 128 S 0.258 0.020 0.019 0.017 0.025 0.099 0.129 0.432 129 D 0.024 0.006 0.050 0.024 0.038 0.129 0.096 0.633 130 G 0.106 0.004 0.021 0.012 0.024 0.104 0.042 0.687 131 K 0.209 0.006 0.012 0.017 0.017 0.105 0.040 0.594 132 S 0.017 0.002 0.010 0.009 0.019 0.131 0.012 0.800 133 N 0.030 0.005 0.009 0.015 0.036 0.128 0.023 0.753