# TARGET T0444 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t2k-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0444.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 162.639 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.283 0.112 0.063 0.110 0.088 0.075 0.103 0.069 0.049 0.030 0.018 2 H 0.068 0.056 0.049 0.104 0.095 0.108 0.158 0.117 0.116 0.077 0.052 3 H 0.054 0.055 0.045 0.089 0.088 0.096 0.155 0.134 0.136 0.091 0.057 4 H 0.039 0.040 0.041 0.088 0.094 0.087 0.145 0.148 0.143 0.101 0.072 5 H 0.033 0.034 0.035 0.083 0.090 0.088 0.144 0.157 0.147 0.116 0.071 6 H 0.021 0.022 0.022 0.056 0.067 0.083 0.140 0.156 0.176 0.155 0.103 7 H 0.018 0.018 0.020 0.049 0.071 0.073 0.150 0.185 0.179 0.143 0.093 8 S 0.031 0.037 0.044 0.079 0.083 0.083 0.125 0.120 0.157 0.148 0.094 9 S 0.034 0.041 0.038 0.083 0.092 0.101 0.176 0.140 0.145 0.099 0.052 10 G 0.127 0.102 0.053 0.150 0.117 0.102 0.119 0.075 0.075 0.050 0.029 11 V 0.024 0.015 0.015 0.031 0.042 0.050 0.113 0.156 0.193 0.179 0.180 12 D 0.059 0.136 0.075 0.195 0.166 0.113 0.104 0.059 0.045 0.029 0.018 13 L 0.015 0.009 0.012 0.022 0.039 0.042 0.103 0.140 0.193 0.186 0.239 14 G 0.208 0.245 0.096 0.202 0.111 0.051 0.039 0.020 0.014 0.009 0.005 15 T 0.046 0.053 0.030 0.085 0.089 0.098 0.166 0.122 0.141 0.101 0.068 16 E 0.230 0.146 0.060 0.164 0.122 0.090 0.087 0.047 0.028 0.016 0.008 17 N 0.189 0.142 0.120 0.198 0.111 0.083 0.078 0.037 0.023 0.014 0.006 18 L 0.036 0.034 0.037 0.068 0.082 0.157 0.184 0.126 0.126 0.098 0.054 19 Y 0.039 0.062 0.046 0.121 0.113 0.105 0.160 0.125 0.112 0.078 0.037 20 F 0.021 0.025 0.044 0.076 0.087 0.139 0.212 0.141 0.122 0.094 0.039 21 Q 0.086 0.152 0.254 0.256 0.127 0.054 0.034 0.018 0.010 0.005 0.003 22 S 0.099 0.071 0.068 0.140 0.128 0.125 0.160 0.108 0.053 0.033 0.016 23 M 0.056 0.054 0.036 0.073 0.080 0.110 0.165 0.133 0.127 0.104 0.061 24 S 0.153 0.110 0.077 0.131 0.120 0.103 0.133 0.078 0.051 0.030 0.015 25 D 0.237 0.218 0.153 0.179 0.089 0.047 0.039 0.019 0.010 0.006 0.003 26 T 0.181 0.120 0.056 0.107 0.096 0.099 0.142 0.081 0.059 0.039 0.020 27 N 0.358 0.261 0.064 0.131 0.070 0.039 0.036 0.021 0.011 0.006 0.003 28 E 0.241 0.178 0.080 0.176 0.114 0.075 0.064 0.038 0.019 0.010 0.005 29 S 0.222 0.127 0.074 0.126 0.106 0.093 0.111 0.068 0.038 0.024 0.011 30 E 0.159 0.152 0.110 0.223 0.143 0.080 0.071 0.036 0.015 0.008 0.003 31 I 0.068 0.053 0.075 0.093 0.093 0.148 0.193 0.111 0.083 0.060 0.022 32 K 0.073 0.136 0.144 0.204 0.142 0.103 0.099 0.050 0.028 0.016 0.006 33 S 0.118 0.195 0.127 0.158 0.107 0.087 0.095 0.055 0.030 0.020 0.008 34 N 0.228 0.247 0.111 0.178 0.096 0.048 0.041 0.027 0.013 0.008 0.003 35 E 0.425 0.180 0.069 0.122 0.067 0.046 0.044 0.027 0.012 0.007 0.002 36 E 0.205 0.143 0.116 0.199 0.129 0.081 0.063 0.037 0.015 0.008 0.004 37 P 0.094 0.074 0.076 0.124 0.126 0.153 0.166 0.094 0.050 0.030 0.012 38 L 0.019 0.026 0.031 0.053 0.067 0.125 0.191 0.144 0.160 0.124 0.062 39 L 0.029 0.051 0.071 0.111 0.117 0.115 0.181 0.126 0.099 0.068 0.033 40 R 0.115 0.136 0.178 0.210 0.132 0.081 0.073 0.037 0.020 0.012 0.005 41 K 0.253 0.203 0.110 0.184 0.102 0.056 0.046 0.026 0.012 0.006 0.003 42 S 0.258 0.182 0.042 0.121 0.091 0.068 0.090 0.069 0.039 0.026 0.014 43 S 0.148 0.081 0.033 0.102 0.110 0.107 0.130 0.108 0.082 0.062 0.037 44 R 0.195 0.174 0.132 0.194 0.115 0.069 0.057 0.033 0.016 0.009 0.004 45 R 0.028 0.042 0.047 0.135 0.133 0.175 0.191 0.107 0.075 0.047 0.020 46 F 0.010 0.010 0.012 0.022 0.030 0.059 0.114 0.130 0.219 0.211 0.183 47 V 0.026 0.053 0.058 0.188 0.198 0.145 0.149 0.085 0.053 0.028 0.017 48 I 0.011 0.013 0.027 0.031 0.045 0.064 0.100 0.112 0.175 0.225 0.196 49 F 0.029 0.042 0.028 0.089 0.118 0.168 0.219 0.121 0.098 0.061 0.026 50 P 0.217 0.203 0.066 0.184 0.103 0.070 0.070 0.039 0.026 0.015 0.007 51 I 0.101 0.030 0.022 0.054 0.070 0.091 0.157 0.141 0.137 0.110 0.088 52 Q 0.144 0.405 0.069 0.196 0.090 0.041 0.029 0.014 0.007 0.004 0.002 53 Y 0.004 0.009 0.006 0.015 0.029 0.053 0.111 0.133 0.197 0.191 0.251 54 P 0.475 0.184 0.086 0.132 0.077 0.022 0.013 0.007 0.003 0.001 0.001 55 D 0.333 0.138 0.068 0.182 0.110 0.062 0.062 0.026 0.011 0.005 0.002 56 I 0.007 0.017 0.015 0.027 0.037 0.063 0.121 0.124 0.225 0.218 0.147 57 W 0.010 0.013 0.017 0.067 0.128 0.215 0.311 0.122 0.073 0.032 0.014 58 K 0.073 0.087 0.614 0.166 0.042 0.011 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 59 M 0.002 0.004 0.022 0.031 0.062 0.158 0.312 0.165 0.130 0.084 0.031 60 Y 0.001 0.002 0.005 0.010 0.017 0.041 0.129 0.150 0.254 0.278 0.112 61 K 0.007 0.031 0.494 0.202 0.118 0.072 0.045 0.018 0.008 0.004 0.001 62 Q 0.007 0.026 0.498 0.174 0.125 0.078 0.056 0.023 0.007 0.004 0.002 63 A 0.004 0.004 0.017 0.013 0.023 0.045 0.136 0.178 0.208 0.207 0.165 64 Q 0.025 0.027 0.062 0.083 0.111 0.127 0.236 0.154 0.095 0.058 0.022 65 A 0.034 0.056 0.411 0.184 0.105 0.071 0.062 0.034 0.022 0.014 0.007 66 S 0.043 0.043 0.120 0.099 0.113 0.125 0.201 0.116 0.072 0.041 0.029 67 F 0.097 0.065 0.058 0.089 0.093 0.097 0.179 0.129 0.098 0.059 0.037 68 W 0.046 0.035 0.047 0.060 0.082 0.089 0.160 0.150 0.138 0.106 0.086 69 T 0.066 0.177 0.147 0.193 0.144 0.076 0.086 0.050 0.031 0.019 0.010 70 A 0.171 0.068 0.057 0.113 0.114 0.107 0.146 0.091 0.067 0.041 0.025 71 E 0.357 0.213 0.101 0.131 0.064 0.044 0.046 0.023 0.013 0.006 0.003 72 E 0.034 0.055 0.050 0.175 0.171 0.128 0.172 0.111 0.059 0.030 0.016 73 V 0.033 0.012 0.018 0.020 0.031 0.055 0.114 0.129 0.188 0.217 0.183 74 D 0.042 0.218 0.195 0.280 0.148 0.059 0.033 0.014 0.007 0.003 0.001 75 L 0.008 0.008 0.015 0.022 0.040 0.053 0.146 0.195 0.194 0.195 0.124 76 S 0.212 0.165 0.113 0.202 0.109 0.068 0.059 0.031 0.022 0.013 0.006 77 K 0.335 0.214 0.124 0.185 0.078 0.030 0.019 0.009 0.004 0.002 0.001 78 D 0.027 0.094 0.039 0.058 0.072 0.098 0.163 0.141 0.126 0.107 0.075 79 L 0.049 0.057 0.032 0.125 0.185 0.177 0.219 0.087 0.044 0.016 0.010 80 P 0.904 0.040 0.038 0.013 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 81 H 0.019 0.062 0.074 0.184 0.150 0.190 0.210 0.062 0.031 0.015 0.003 82 W 0.003 0.004 0.004 0.014 0.029 0.072 0.200 0.178 0.212 0.211 0.073 83 N 0.088 0.090 0.497 0.208 0.073 0.025 0.012 0.005 0.001 0.001 0.001 84 K 0.008 0.059 0.516 0.256 0.103 0.037 0.015 0.005 0.001 0.001 0.001 85 L 0.001 0.001 0.002 0.001 0.003 0.008 0.035 0.070 0.158 0.263 0.459 86 K 0.149 0.349 0.142 0.179 0.122 0.033 0.017 0.006 0.002 0.001 0.001 87 A 0.766 0.057 0.124 0.040 0.009 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 88 D 0.379 0.133 0.106 0.164 0.095 0.044 0.051 0.019 0.006 0.003 0.001 89 E 0.004 0.011 0.010 0.022 0.037 0.098 0.244 0.196 0.202 0.129 0.047 90 K 0.013 0.038 0.244 0.193 0.171 0.162 0.094 0.049 0.019 0.012 0.004 91 Y 0.011 0.035 0.474 0.179 0.100 0.090 0.068 0.027 0.009 0.005 0.002 92 F 0.004 0.006 0.024 0.029 0.048 0.079 0.200 0.200 0.188 0.143 0.078 93 I 0.003 0.004 0.012 0.018 0.030 0.044 0.124 0.154 0.232 0.234 0.146 94 S 0.016 0.037 0.265 0.204 0.163 0.114 0.096 0.048 0.030 0.018 0.009 95 H 0.013 0.023 0.126 0.113 0.140 0.148 0.232 0.110 0.052 0.029 0.015 96 I 0.001 0.004 0.012 0.014 0.025 0.040 0.116 0.148 0.220 0.225 0.196 97 L 0.001 0.002 0.006 0.009 0.020 0.036 0.094 0.122 0.226 0.265 0.219 98 A 0.004 0.011 0.052 0.074 0.105 0.135 0.195 0.129 0.137 0.106 0.053 99 F 0.001 0.003 0.015 0.019 0.036 0.060 0.165 0.183 0.206 0.191 0.121 100 F 0.001 0.001 0.004 0.007 0.013 0.028 0.070 0.105 0.223 0.281 0.268 101 A 0.001 0.002 0.008 0.012 0.022 0.031 0.073 0.106 0.204 0.250 0.291 102 A 0.002 0.005 0.018 0.030 0.064 0.109 0.175 0.151 0.191 0.152 0.104 103 S 0.004 0.010 0.023 0.033 0.051 0.066 0.142 0.148 0.201 0.174 0.148 104 D 0.016 0.025 0.035 0.078 0.097 0.123 0.210 0.153 0.125 0.082 0.056 105 G 0.118 0.093 0.082 0.150 0.118 0.115 0.138 0.074 0.055 0.033 0.023 106 I 0.036 0.030 0.033 0.067 0.088 0.098 0.161 0.150 0.131 0.106 0.100 107 V 0.014 0.029 0.025 0.063 0.086 0.083 0.140 0.154 0.154 0.143 0.109 108 N 0.011 0.019 0.026 0.045 0.062 0.092 0.160 0.137 0.176 0.159 0.112 109 E 0.091 0.081 0.143 0.213 0.161 0.117 0.094 0.046 0.029 0.016 0.010 110 N 0.092 0.065 0.080 0.151 0.136 0.116 0.156 0.095 0.054 0.035 0.020 111 L 0.007 0.017 0.015 0.028 0.037 0.051 0.101 0.119 0.215 0.216 0.194 112 V 0.015 0.019 0.018 0.054 0.094 0.117 0.213 0.158 0.140 0.105 0.067 113 E 0.169 0.126 0.321 0.213 0.087 0.038 0.023 0.011 0.006 0.003 0.002 114 R 0.059 0.049 0.060 0.141 0.162 0.169 0.202 0.087 0.039 0.019 0.012 115 F 0.006 0.014 0.010 0.016 0.020 0.025 0.068 0.108 0.210 0.244 0.279 116 S 0.038 0.044 0.042 0.116 0.186 0.162 0.191 0.101 0.063 0.037 0.020 117 Q 0.341 0.169 0.285 0.139 0.039 0.013 0.008 0.004 0.002 0.001 0.001 118 E 0.104 0.093 0.065 0.189 0.158 0.121 0.152 0.066 0.030 0.014 0.007 119 V 0.025 0.017 0.011 0.019 0.027 0.042 0.101 0.134 0.215 0.218 0.190 120 Q 0.073 0.243 0.186 0.238 0.133 0.061 0.035 0.016 0.008 0.004 0.002 121 V 0.057 0.065 0.134 0.139 0.135 0.128 0.141 0.089 0.056 0.036 0.021 122 P 0.366 0.178 0.081 0.127 0.076 0.051 0.059 0.032 0.017 0.009 0.004 123 E 0.095 0.074 0.065 0.161 0.128 0.109 0.153 0.099 0.065 0.037 0.015 124 A 0.020 0.022 0.042 0.064 0.069 0.122 0.187 0.151 0.148 0.121 0.054 125 R 0.018 0.051 0.111 0.175 0.155 0.147 0.161 0.083 0.057 0.028 0.014 126 C 0.010 0.012 0.051 0.046 0.059 0.088 0.167 0.162 0.158 0.141 0.106 127 F 0.004 0.007 0.026 0.032 0.049 0.078 0.146 0.140 0.209 0.183 0.127 128 Y 0.008 0.011 0.026 0.041 0.059 0.073 0.164 0.167 0.201 0.155 0.096 129 G 0.025 0.032 0.080 0.099 0.108 0.099 0.156 0.127 0.125 0.085 0.064 130 F 0.017 0.022 0.045 0.071 0.095 0.116 0.217 0.156 0.124 0.083 0.054 131 Q 0.010 0.013 0.032 0.048 0.071 0.083 0.188 0.201 0.165 0.118 0.071 132 I 0.014 0.022 0.054 0.068 0.078 0.087 0.162 0.145 0.159 0.126 0.085 133 L 0.007 0.012 0.038 0.047 0.064 0.078 0.165 0.152 0.187 0.141 0.109 134 I 0.013 0.024 0.063 0.075 0.088 0.096 0.177 0.132 0.156 0.110 0.066 135 E 0.005 0.009 0.033 0.040 0.058 0.067 0.155 0.179 0.182 0.153 0.120 136 N 0.018 0.022 0.057 0.070 0.086 0.102 0.155 0.141 0.145 0.122 0.082 137 V 0.014 0.021 0.049 0.055 0.076 0.083 0.181 0.161 0.162 0.118 0.078 138 H 0.010 0.017 0.042 0.063 0.091 0.086 0.170 0.177 0.157 0.117 0.071 139 S 0.036 0.034 0.068 0.082 0.074 0.100 0.172 0.120 0.140 0.108 0.065 140 E 0.041 0.064 0.107 0.168 0.150 0.133 0.163 0.076 0.053 0.027 0.018 141 M 0.006 0.010 0.028 0.032 0.054 0.049 0.128 0.179 0.188 0.179 0.147 142 Y 0.002 0.006 0.016 0.029 0.049 0.081 0.162 0.154 0.198 0.193 0.110 143 S 0.018 0.030 0.099 0.112 0.101 0.131 0.170 0.101 0.107 0.082 0.048 144 L 0.004 0.007 0.026 0.041 0.076 0.122 0.247 0.186 0.141 0.098 0.051 145 L 0.001 0.003 0.009 0.013 0.020 0.021 0.058 0.106 0.223 0.293 0.252 146 I 0.001 0.001 0.003 0.004 0.010 0.022 0.065 0.098 0.233 0.298 0.265 147 D 0.009 0.028 0.089 0.154 0.179 0.167 0.157 0.081 0.069 0.043 0.023 148 T 0.006 0.007 0.030 0.033 0.062 0.086 0.192 0.208 0.151 0.141 0.083 149 Y 0.005 0.009 0.014 0.031 0.043 0.105 0.176 0.133 0.199 0.197 0.088 150 I 0.012 0.012 0.015 0.025 0.035 0.066 0.173 0.126 0.214 0.191 0.131 151 R 0.059 0.188 0.156 0.209 0.150 0.102 0.072 0.029 0.018 0.010 0.005 152 D 0.162 0.286 0.095 0.131 0.088 0.074 0.088 0.037 0.021 0.011 0.006 153 P 0.700 0.128 0.025 0.055 0.032 0.019 0.021 0.010 0.005 0.002 0.001 154 K 0.663 0.182 0.034 0.070 0.025 0.010 0.008 0.004 0.002 0.001 0.001 155 K 0.048 0.091 0.046 0.124 0.124 0.140 0.150 0.111 0.077 0.063 0.026 156 R 0.016 0.040 0.039 0.094 0.133 0.212 0.226 0.120 0.066 0.040 0.014 157 E 0.068 0.070 0.341 0.235 0.121 0.072 0.048 0.027 0.009 0.005 0.002 158 F 0.009 0.017 0.064 0.097 0.101 0.233 0.258 0.106 0.065 0.038 0.012 159 L 0.001 0.003 0.007 0.011 0.016 0.026 0.072 0.102 0.244 0.257 0.260 160 F 0.005 0.006 0.023 0.040 0.093 0.144 0.244 0.168 0.132 0.097 0.048 161 N 0.026 0.062 0.481 0.207 0.108 0.053 0.034 0.015 0.008 0.004 0.002 162 A 0.011 0.013 0.031 0.058 0.094 0.142 0.282 0.179 0.096 0.060 0.033 163 I 0.011 0.011 0.013 0.021 0.030 0.058 0.133 0.135 0.211 0.234 0.145 164 E 0.082 0.096 0.134 0.211 0.179 0.111 0.098 0.047 0.023 0.012 0.005 165 T 0.037 0.294 0.225 0.173 0.092 0.066 0.058 0.027 0.014 0.009 0.004 166 M 0.025 0.026 0.022 0.052 0.100 0.177 0.276 0.136 0.098 0.051 0.039 167 P 0.900 0.052 0.026 0.015 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 168 Y 0.029 0.040 0.055 0.157 0.166 0.200 0.219 0.071 0.039 0.016 0.007 169 V 0.002 0.003 0.007 0.007 0.013 0.016 0.063 0.102 0.223 0.280 0.285 170 K 0.012 0.021 0.180 0.204 0.225 0.174 0.121 0.039 0.015 0.007 0.002 171 K 0.003 0.034 0.762 0.136 0.042 0.015 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 172 K 0.001 0.004 0.015 0.028 0.063 0.105 0.227 0.242 0.150 0.112 0.053 173 A 0.004 0.004 0.007 0.012 0.024 0.078 0.248 0.199 0.202 0.165 0.056 174 D 0.028 0.042 0.687 0.173 0.048 0.013 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 175 W 0.009 0.010 0.082 0.062 0.117 0.181 0.304 0.130 0.056 0.033 0.016 176 A 0.001 0.003 0.009 0.009 0.013 0.020 0.067 0.102 0.255 0.278 0.244 177 L 0.004 0.004 0.020 0.033 0.078 0.168 0.318 0.161 0.113 0.073 0.028 178 R 0.009 0.036 0.628 0.200 0.076 0.028 0.013 0.005 0.002 0.001 0.001 179 W 0.006 0.007 0.028 0.033 0.064 0.124 0.284 0.190 0.123 0.087 0.054 180 I 0.004 0.006 0.008 0.013 0.020 0.048 0.122 0.127 0.240 0.251 0.161 181 A 0.069 0.086 0.195 0.204 0.165 0.099 0.102 0.042 0.022 0.011 0.005 182 D 0.146 0.141 0.303 0.197 0.098 0.049 0.035 0.016 0.007 0.004 0.002 183 R 0.082 0.120 0.054 0.087 0.087 0.114 0.187 0.111 0.078 0.053 0.027 184 K 0.261 0.186 0.053 0.125 0.096 0.080 0.089 0.057 0.029 0.017 0.007 185 S 0.362 0.138 0.145 0.152 0.079 0.050 0.036 0.019 0.009 0.005 0.003 186 T 0.151 0.151 0.127 0.174 0.123 0.097 0.094 0.043 0.022 0.012 0.007 187 F 0.016 0.024 0.021 0.048 0.071 0.090 0.168 0.162 0.170 0.133 0.095 188 G 0.034 0.047 0.072 0.140 0.164 0.147 0.174 0.108 0.059 0.039 0.017 189 E 0.019 0.048 0.237 0.220 0.151 0.120 0.104 0.050 0.028 0.017 0.007 190 R 0.003 0.008 0.033 0.055 0.082 0.155 0.265 0.156 0.122 0.080 0.041 191 V 0.001 0.004 0.013 0.018 0.030 0.052 0.136 0.141 0.230 0.207 0.166 192 V 0.001 0.001 0.009 0.011 0.023 0.036 0.088 0.106 0.212 0.243 0.272 193 A 0.001 0.001 0.009 0.010 0.026 0.046 0.108 0.123 0.211 0.237 0.228 194 F 0.001 0.001 0.011 0.013 0.035 0.051 0.160 0.181 0.233 0.181 0.133 195 A 0.001 0.001 0.007 0.006 0.012 0.014 0.052 0.106 0.212 0.246 0.344 196 A 0.001 0.001 0.003 0.003 0.008 0.014 0.039 0.063 0.203 0.259 0.407 197 V 0.001 0.001 0.008 0.010 0.023 0.034 0.085 0.108 0.217 0.234 0.281 198 E 0.001 0.002 0.020 0.021 0.058 0.067 0.173 0.259 0.168 0.140 0.093 199 G 0.002 0.007 0.043 0.041 0.053 0.069 0.162 0.175 0.189 0.168 0.089 200 V 0.002 0.003 0.015 0.016 0.023 0.041 0.128 0.146 0.213 0.199 0.214 201 F 0.003 0.008 0.030 0.043 0.071 0.096 0.187 0.173 0.170 0.130 0.089 202 F 0.002 0.004 0.033 0.020 0.031 0.048 0.126 0.141 0.206 0.207 0.182 203 S 0.004 0.009 0.046 0.050 0.091 0.076 0.186 0.200 0.142 0.112 0.086 204 G 0.002 0.005 0.021 0.017 0.021 0.038 0.105 0.110 0.238 0.257 0.186 205 S 0.002 0.006 0.022 0.033 0.067 0.064 0.170 0.199 0.169 0.136 0.133 206 F 0.001 0.004 0.019 0.019 0.031 0.049 0.117 0.165 0.214 0.234 0.146 207 A 0.001 0.003 0.018 0.021 0.043 0.038 0.123 0.192 0.200 0.198 0.164 208 A 0.001 0.001 0.006 0.006 0.013 0.017 0.053 0.114 0.225 0.305 0.259 209 I 0.001 0.002 0.007 0.012 0.025 0.040 0.090 0.122 0.227 0.251 0.224 210 F 0.004 0.006 0.027 0.034 0.069 0.082 0.181 0.205 0.167 0.136 0.089 211 W 0.005 0.008 0.038 0.054 0.090 0.090 0.193 0.189 0.147 0.115 0.072 212 L 0.001 0.002 0.008 0.007 0.012 0.019 0.053 0.071 0.207 0.266 0.354 213 K 0.022 0.036 0.067 0.144 0.189 0.138 0.186 0.092 0.067 0.037 0.023 214 K 0.042 0.151 0.202 0.181 0.110 0.107 0.106 0.043 0.030 0.019 0.009 215 R 0.058 0.068 0.066 0.143 0.148 0.165 0.163 0.081 0.050 0.033 0.024 216 G 0.559 0.169 0.056 0.076 0.038 0.028 0.032 0.021 0.011 0.008 0.004 217 L 0.049 0.081 0.047 0.134 0.117 0.147 0.158 0.087 0.085 0.055 0.037 218 M 0.024 0.025 0.019 0.029 0.041 0.058 0.111 0.117 0.174 0.187 0.216 219 P 0.142 0.182 0.120 0.247 0.149 0.071 0.043 0.024 0.013 0.007 0.004 220 G 0.100 0.059 0.048 0.092 0.097 0.097 0.163 0.134 0.102 0.068 0.041 221 L 0.010 0.014 0.011 0.045 0.060 0.069 0.126 0.158 0.184 0.168 0.155 222 T 0.026 0.025 0.035 0.076 0.093 0.112 0.147 0.136 0.139 0.123 0.088 223 F 0.021 0.032 0.061 0.108 0.135 0.171 0.195 0.114 0.084 0.053 0.027 224 S 0.006 0.015 0.024 0.049 0.072 0.052 0.133 0.179 0.190 0.157 0.123 225 N 0.007 0.008 0.011 0.027 0.039 0.075 0.153 0.128 0.214 0.212 0.126 226 E 0.069 0.115 0.189 0.258 0.139 0.088 0.072 0.029 0.023 0.011 0.007 227 L 0.005 0.009 0.022 0.039 0.063 0.108 0.196 0.177 0.155 0.134 0.091 228 I 0.002 0.004 0.007 0.011 0.017 0.027 0.059 0.089 0.224 0.266 0.294 229 S 0.014 0.018 0.037 0.062 0.082 0.105 0.192 0.133 0.152 0.121 0.083 230 R 0.008 0.017 0.075 0.097 0.121 0.144 0.177 0.126 0.111 0.077 0.047 231 D 0.007 0.015 0.031 0.045 0.057 0.094 0.191 0.159 0.178 0.148 0.076 232 E 0.005 0.010 0.018 0.039 0.056 0.076 0.181 0.196 0.186 0.137 0.098 233 G 0.021 0.022 0.048 0.061 0.066 0.093 0.149 0.124 0.159 0.146 0.112 234 L 0.005 0.009 0.027 0.037 0.061 0.095 0.199 0.163 0.178 0.139 0.086 235 H 0.003 0.010 0.023 0.034 0.054 0.057 0.132 0.169 0.198 0.187 0.131 236 C 0.002 0.003 0.008 0.012 0.021 0.035 0.090 0.133 0.221 0.246 0.229 237 D 0.019 0.035 0.078 0.129 0.144 0.126 0.182 0.112 0.089 0.053 0.034 238 F 0.002 0.004 0.014 0.023 0.047 0.044 0.128 0.211 0.198 0.186 0.144 239 A 0.001 0.003 0.007 0.011 0.019 0.031 0.072 0.108 0.220 0.285 0.244 240 C 0.003 0.005 0.017 0.030 0.059 0.101 0.196 0.138 0.182 0.157 0.112 241 L 0.005 0.008 0.044 0.051 0.082 0.116 0.195 0.157 0.146 0.128 0.069 242 M 0.001 0.004 0.013 0.021 0.036 0.062 0.145 0.144 0.225 0.232 0.119 243 F 0.001 0.001 0.003 0.005 0.011 0.036 0.097 0.093 0.251 0.283 0.219 244 Q 0.022 0.049 0.216 0.231 0.180 0.120 0.102 0.040 0.023 0.011 0.006 245 Y 0.016 0.020 0.088 0.102 0.127 0.198 0.251 0.104 0.049 0.031 0.013 246 L 0.004 0.007 0.012 0.014 0.019 0.046 0.099 0.098 0.219 0.260 0.222 247 V 0.025 0.033 0.034 0.086 0.115 0.136 0.248 0.136 0.093 0.066 0.027 248 N 0.063 0.145 0.309 0.212 0.104 0.073 0.051 0.021 0.012 0.007 0.003 249 K 0.180 0.210 0.168 0.177 0.110 0.062 0.054 0.024 0.008 0.004 0.002 250 P 0.383 0.210 0.033 0.076 0.059 0.056 0.069 0.053 0.028 0.021 0.011 251 S 0.138 0.634 0.039 0.073 0.040 0.027 0.025 0.013 0.006 0.004 0.002 252 E 0.562 0.136 0.040 0.090 0.076 0.046 0.031 0.012 0.004 0.002 0.001 253 E 0.946 0.026 0.015 0.009 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 254 R 0.016 0.062 0.042 0.221 0.195 0.208 0.176 0.050 0.021 0.007 0.002 255 V 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.007 0.032 0.084 0.210 0.287 0.372 256 R 0.002 0.011 0.196 0.190 0.265 0.192 0.099 0.031 0.009 0.004 0.001 257 E 0.002 0.013 0.835 0.112 0.027 0.006 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 258 I 0.001 0.001 0.005 0.009 0.028 0.118 0.266 0.195 0.177 0.140 0.061 259 I 0.001 0.001 0.002 0.002 0.005 0.014 0.065 0.104 0.278 0.315 0.214 260 V 0.008 0.011 0.531 0.182 0.139 0.063 0.042 0.015 0.005 0.002 0.001 261 D 0.006 0.025 0.498 0.169 0.135 0.077 0.068 0.016 0.004 0.002 0.001 262 A 0.001 0.001 0.002 0.002 0.004 0.009 0.045 0.098 0.238 0.271 0.330 263 V 0.002 0.002 0.006 0.015 0.050 0.125 0.320 0.183 0.146 0.106 0.044 264 K 0.005 0.019 0.801 0.130 0.032 0.008 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 265 I 0.002 0.003 0.031 0.022 0.060 0.180 0.366 0.152 0.093 0.062 0.029 266 E 0.001 0.001 0.003 0.004 0.007 0.017 0.067 0.109 0.284 0.308 0.200 267 Q 0.012 0.016 0.127 0.113 0.148 0.187 0.241 0.087 0.041 0.022 0.007 268 E 0.007 0.023 0.647 0.168 0.080 0.041 0.022 0.007 0.003 0.001 0.001 269 F 0.003 0.004 0.015 0.016 0.037 0.080 0.233 0.231 0.167 0.138 0.076 270 L 0.001 0.002 0.004 0.006 0.011 0.024 0.077 0.114 0.239 0.312 0.209 271 T 0.019 0.050 0.299 0.217 0.177 0.106 0.070 0.031 0.017 0.009 0.004 272 E 0.068 0.061 0.316 0.204 0.144 0.084 0.073 0.031 0.011 0.005 0.003 273 A 0.017 0.027 0.029 0.037 0.046 0.088 0.178 0.144 0.168 0.151 0.115 274 L 0.010 0.011 0.007 0.020 0.035 0.066 0.147 0.148 0.206 0.188 0.160 275 P 0.240 0.219 0.183 0.196 0.087 0.032 0.021 0.010 0.006 0.004 0.002 276 V 0.109 0.061 0.067 0.124 0.125 0.134 0.164 0.093 0.061 0.038 0.025 277 G 0.189 0.147 0.044 0.135 0.106 0.088 0.117 0.076 0.049 0.031 0.017 278 L 0.014 0.022 0.013 0.042 0.054 0.091 0.133 0.139 0.182 0.175 0.133 279 I 0.034 0.038 0.034 0.078 0.096 0.144 0.176 0.132 0.125 0.091 0.053 280 G 0.158 0.123 0.085 0.199 0.133 0.087 0.097 0.050 0.035 0.020 0.013 281 M 0.011 0.008 0.009 0.020 0.035 0.048 0.095 0.128 0.200 0.204 0.242 282 N 0.040 0.129 0.049 0.160 0.162 0.103 0.130 0.092 0.068 0.046 0.021 283 C 0.019 0.015 0.023 0.068 0.104 0.166 0.233 0.144 0.116 0.072 0.040 284 I 0.307 0.145 0.189 0.184 0.080 0.041 0.030 0.013 0.006 0.003 0.002 285 L 0.008 0.021 0.027 0.078 0.100 0.137 0.239 0.146 0.125 0.080 0.040 286 M 0.001 0.003 0.005 0.008 0.016 0.028 0.071 0.094 0.226 0.271 0.276 287 K 0.022 0.032 0.185 0.205 0.206 0.154 0.118 0.041 0.021 0.011 0.005 288 Q 0.011 0.037 0.408 0.197 0.116 0.105 0.081 0.025 0.011 0.006 0.002 289 Y 0.001 0.002 0.009 0.015 0.029 0.061 0.168 0.173 0.225 0.208 0.108 290 I 0.001 0.001 0.002 0.003 0.007 0.028 0.097 0.110 0.262 0.332 0.157 291 E 0.006 0.034 0.408 0.236 0.144 0.087 0.046 0.018 0.012 0.006 0.004 292 F 0.003 0.003 0.034 0.020 0.052 0.104 0.262 0.240 0.123 0.105 0.055 293 V 0.001 0.003 0.009 0.014 0.023 0.043 0.100 0.139 0.241 0.259 0.166 294 A 0.001 0.001 0.003 0.004 0.011 0.021 0.088 0.125 0.235 0.267 0.244 295 D 0.007 0.026 0.204 0.209 0.211 0.136 0.099 0.048 0.031 0.018 0.010 296 R 0.012 0.016 0.104 0.085 0.122 0.139 0.251 0.147 0.066 0.039 0.020 297 L 0.007 0.015 0.027 0.055 0.068 0.126 0.229 0.154 0.146 0.114 0.061 298 L 0.002 0.003 0.007 0.011 0.021 0.035 0.084 0.105 0.209 0.252 0.271 299 V 0.013 0.023 0.093 0.106 0.137 0.159 0.193 0.105 0.084 0.060 0.027 300 E 0.016 0.078 0.205 0.203 0.152 0.132 0.119 0.044 0.027 0.017 0.008 301 L 0.009 0.005 0.009 0.010 0.020 0.054 0.113 0.132 0.216 0.212 0.220 302 G 0.249 0.271 0.065 0.178 0.099 0.045 0.043 0.024 0.015 0.008 0.005 303 F 0.011 0.012 0.014 0.025 0.037 0.049 0.119 0.136 0.198 0.191 0.210 304 S 0.246 0.249 0.104 0.188 0.117 0.046 0.025 0.012 0.006 0.003 0.002 305 K 0.272 0.170 0.093 0.193 0.105 0.062 0.054 0.030 0.012 0.006 0.003 306 V 0.073 0.064 0.032 0.091 0.101 0.136 0.159 0.121 0.096 0.076 0.050 307 F 0.020 0.024 0.011 0.040 0.054 0.089 0.182 0.161 0.181 0.144 0.094 308 Q 0.166 0.363 0.157 0.185 0.072 0.026 0.015 0.008 0.005 0.003 0.001 309 A 0.238 0.093 0.047 0.119 0.104 0.093 0.129 0.075 0.051 0.033 0.018 310 E 0.597 0.205 0.036 0.085 0.033 0.017 0.012 0.007 0.004 0.003 0.001 311 N 0.082 0.066 0.022 0.096 0.110 0.154 0.157 0.122 0.099 0.058 0.035 312 P 0.102 0.151 0.054 0.120 0.107 0.088 0.109 0.099 0.074 0.058 0.039 313 F 0.020 0.017 0.016 0.054 0.084 0.141 0.221 0.154 0.143 0.092 0.057 314 D 0.394 0.223 0.135 0.154 0.054 0.018 0.011 0.006 0.003 0.001 0.001 315 F 0.017 0.020 0.017 0.074 0.102 0.106 0.184 0.161 0.145 0.096 0.077 316 M 0.011 0.011 0.009 0.026 0.043 0.048 0.098 0.140 0.191 0.205 0.218 317 E 0.064 0.098 0.142 0.231 0.174 0.106 0.092 0.049 0.026 0.014 0.005 318 N 0.054 0.055 0.105 0.182 0.152 0.151 0.144 0.076 0.043 0.025 0.012 319 I 0.024 0.016 0.018 0.033 0.042 0.055 0.123 0.140 0.200 0.178 0.170 320 S 0.067 0.086 0.067 0.163 0.159 0.103 0.142 0.094 0.064 0.034 0.022 321 L 0.052 0.073 0.100 0.100 0.103 0.097 0.140 0.100 0.100 0.079 0.056 322 E 0.248 0.187 0.110 0.196 0.118 0.052 0.046 0.023 0.012 0.006 0.003 323 G 0.531 0.188 0.061 0.095 0.043 0.024 0.027 0.015 0.009 0.005 0.002 324 K 0.124 0.102 0.053 0.135 0.128 0.109 0.139 0.095 0.058 0.036 0.021 325 T 0.189 0.318 0.116 0.147 0.081 0.054 0.045 0.025 0.013 0.008 0.003 326 N 0.273 0.179 0.098 0.161 0.107 0.068 0.058 0.031 0.015 0.007 0.004