# TARGET T0440 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0440.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1615 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.344 0.077 0.035 0.084 0.083 0.086 0.111 0.071 0.056 0.034 0.022 2 K 0.155 0.107 0.054 0.135 0.139 0.104 0.109 0.070 0.063 0.040 0.024 3 R 0.085 0.084 0.048 0.119 0.116 0.122 0.165 0.100 0.084 0.044 0.032 4 D 0.087 0.061 0.036 0.086 0.120 0.103 0.158 0.130 0.116 0.064 0.039 5 G 0.021 0.021 0.019 0.040 0.059 0.076 0.146 0.156 0.197 0.147 0.118 6 H 0.013 0.017 0.018 0.044 0.063 0.080 0.176 0.158 0.191 0.139 0.102 7 T 0.006 0.007 0.010 0.019 0.030 0.040 0.122 0.187 0.244 0.179 0.156 8 H 0.006 0.006 0.009 0.021 0.034 0.035 0.099 0.154 0.221 0.201 0.215 9 T 0.007 0.008 0.011 0.027 0.037 0.051 0.112 0.138 0.205 0.195 0.211 10 E 0.019 0.024 0.025 0.085 0.115 0.110 0.170 0.159 0.144 0.087 0.063 11 F 0.019 0.017 0.018 0.050 0.064 0.079 0.163 0.180 0.173 0.140 0.097 12 C 0.016 0.016 0.015 0.046 0.048 0.072 0.129 0.152 0.191 0.180 0.135 13 P 0.084 0.076 0.037 0.097 0.101 0.132 0.145 0.106 0.097 0.075 0.050 14 H 0.113 0.078 0.037 0.123 0.130 0.108 0.138 0.098 0.073 0.062 0.041 15 G 0.107 0.057 0.024 0.063 0.062 0.072 0.110 0.111 0.147 0.139 0.108 16 T 0.182 0.319 0.043 0.130 0.109 0.065 0.060 0.030 0.026 0.022 0.012 17 H 0.274 0.139 0.036 0.162 0.144 0.088 0.074 0.039 0.023 0.013 0.010 18 D 0.534 0.123 0.038 0.082 0.072 0.043 0.041 0.026 0.019 0.013 0.010 19 D 0.056 0.419 0.045 0.202 0.153 0.052 0.044 0.013 0.009 0.005 0.002 20 V 0.003 0.004 0.003 0.007 0.015 0.031 0.127 0.260 0.242 0.154 0.154 21 E 0.204 0.110 0.188 0.279 0.103 0.065 0.030 0.010 0.005 0.005 0.001 22 E 0.024 0.049 0.175 0.379 0.161 0.106 0.068 0.026 0.007 0.003 0.001 23 M 0.001 0.001 0.002 0.003 0.004 0.012 0.079 0.131 0.251 0.284 0.233 24 V 0.001 0.001 0.010 0.010 0.018 0.064 0.250 0.151 0.231 0.145 0.120 25 L 0.001 0.004 0.664 0.147 0.092 0.051 0.025 0.008 0.004 0.002 0.001 26 K 0.001 0.003 0.097 0.106 0.194 0.234 0.301 0.042 0.016 0.005 0.002 27 A 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.002 0.018 0.070 0.187 0.345 0.374 28 I 0.002 0.005 0.049 0.057 0.071 0.204 0.361 0.120 0.070 0.044 0.017 29 E 0.009 0.020 0.686 0.160 0.073 0.028 0.014 0.005 0.003 0.002 0.001 30 L 0.017 0.013 0.042 0.054 0.125 0.226 0.370 0.089 0.036 0.019 0.009 31 D 0.378 0.204 0.086 0.115 0.061 0.042 0.048 0.019 0.020 0.015 0.010 32 F 0.002 0.002 0.004 0.005 0.007 0.020 0.056 0.107 0.187 0.185 0.425 33 D 0.079 0.211 0.226 0.264 0.142 0.035 0.022 0.010 0.006 0.003 0.001 34 E 0.036 0.065 0.055 0.102 0.115 0.137 0.180 0.111 0.099 0.059 0.041 35 Y 0.002 0.003 0.003 0.006 0.011 0.026 0.071 0.140 0.220 0.229 0.288 36 S 0.002 0.005 0.005 0.010 0.015 0.029 0.103 0.187 0.231 0.207 0.207 37 I 0.001 0.001 0.005 0.004 0.005 0.006 0.030 0.078 0.185 0.329 0.357 38 V 0.003 0.004 0.007 0.013 0.018 0.029 0.097 0.118 0.190 0.214 0.307 39 E 0.008 0.011 0.012 0.045 0.062 0.084 0.164 0.199 0.179 0.128 0.108 40 H 0.017 0.016 0.012 0.051 0.072 0.092 0.154 0.183 0.159 0.136 0.109 41 A 0.021 0.020 0.017 0.055 0.070 0.095 0.145 0.152 0.159 0.154 0.111 42 P 0.138 0.117 0.043 0.126 0.112 0.133 0.117 0.079 0.061 0.046 0.028 43 L 0.051 0.045 0.032 0.082 0.085 0.104 0.143 0.115 0.124 0.133 0.088 44 S 0.053 0.039 0.028 0.069 0.073 0.085 0.128 0.116 0.138 0.141 0.131 45 S 0.179 0.144 0.062 0.135 0.115 0.096 0.093 0.058 0.050 0.040 0.028 46 E 0.131 0.123 0.077 0.168 0.129 0.109 0.102 0.060 0.047 0.033 0.020 47 F 0.014 0.015 0.018 0.045 0.054 0.069 0.143 0.156 0.178 0.164 0.144 48 M 0.029 0.040 0.047 0.120 0.120 0.154 0.191 0.118 0.087 0.061 0.033 49 K 0.085 0.115 0.185 0.267 0.161 0.072 0.058 0.026 0.016 0.011 0.004 50 N 0.014 0.016 0.022 0.041 0.046 0.080 0.176 0.179 0.187 0.134 0.106 51 T 0.051 0.053 0.046 0.113 0.113 0.127 0.188 0.101 0.096 0.069 0.042 52 A 0.223 0.160 0.144 0.164 0.091 0.066 0.065 0.032 0.024 0.018 0.012 53 G 0.149 0.101 0.065 0.149 0.120 0.132 0.130 0.065 0.044 0.025 0.019 54 D 0.249 0.158 0.047 0.135 0.110 0.067 0.084 0.049 0.044 0.031 0.027 55 K 0.092 0.073 0.031 0.110 0.134 0.153 0.162 0.096 0.066 0.041 0.042 56 E 0.166 0.191 0.086 0.221 0.140 0.088 0.059 0.023 0.015 0.007 0.004 57 A 0.013 0.011 0.010 0.024 0.027 0.040 0.112 0.194 0.206 0.182 0.180 58 V 0.003 0.004 0.004 0.008 0.013 0.021 0.073 0.137 0.204 0.260 0.272 59 T 0.008 0.017 0.019 0.035 0.045 0.071 0.142 0.121 0.182 0.180 0.181 60 T 0.004 0.005 0.009 0.013 0.022 0.037 0.111 0.127 0.216 0.221 0.235 61 A 0.004 0.004 0.006 0.016 0.025 0.038 0.106 0.150 0.215 0.222 0.215 62 S 0.002 0.004 0.005 0.014 0.021 0.028 0.069 0.160 0.199 0.208 0.291 63 M 0.003 0.007 0.012 0.024 0.033 0.056 0.108 0.155 0.196 0.222 0.183 64 A 0.012 0.021 0.033 0.072 0.081 0.107 0.171 0.141 0.142 0.118 0.103 65 M 0.012 0.011 0.015 0.035 0.044 0.074 0.153 0.169 0.180 0.162 0.144 66 S 0.120 0.090 0.067 0.155 0.143 0.106 0.112 0.073 0.058 0.049 0.027 67 D 0.166 0.162 0.068 0.155 0.115 0.089 0.094 0.056 0.041 0.034 0.019 68 L 0.054 0.045 0.023 0.075 0.081 0.126 0.165 0.134 0.123 0.099 0.074 69 P 0.395 0.163 0.073 0.141 0.079 0.052 0.040 0.021 0.016 0.012 0.007 70 Y 0.087 0.090 0.063 0.148 0.131 0.147 0.141 0.079 0.055 0.040 0.019 71 Y 0.018 0.037 0.034 0.082 0.089 0.108 0.178 0.147 0.136 0.103 0.069 72 F 0.004 0.006 0.015 0.027 0.036 0.072 0.150 0.187 0.186 0.176 0.140 73 K 0.048 0.075 0.240 0.225 0.145 0.102 0.077 0.038 0.024 0.019 0.007 74 K 0.010 0.033 0.071 0.127 0.114 0.146 0.198 0.107 0.093 0.067 0.035 75 M 0.003 0.003 0.007 0.012 0.016 0.031 0.104 0.167 0.243 0.221 0.193 76 N 0.047 0.053 0.159 0.216 0.180 0.118 0.110 0.050 0.033 0.025 0.008 77 H 0.021 0.053 0.220 0.195 0.143 0.118 0.115 0.054 0.040 0.028 0.013 78 I 0.006 0.013 0.022 0.030 0.032 0.063 0.188 0.177 0.198 0.164 0.107 79 K 0.019 0.039 0.058 0.102 0.121 0.145 0.226 0.134 0.081 0.053 0.021 80 K 0.256 0.120 0.316 0.162 0.063 0.036 0.024 0.011 0.006 0.005 0.002 81 K 0.181 0.091 0.133 0.186 0.143 0.112 0.091 0.031 0.017 0.011 0.004 82 Y 0.057 0.064 0.037 0.071 0.062 0.095 0.186 0.131 0.135 0.097 0.066 83 A 0.044 0.075 0.068 0.124 0.149 0.168 0.169 0.087 0.058 0.036 0.022 84 S 0.262 0.173 0.282 0.132 0.063 0.036 0.026 0.012 0.007 0.005 0.002 85 D 0.098 0.108 0.079 0.251 0.189 0.139 0.084 0.027 0.015 0.006 0.003 86 L 0.004 0.003 0.005 0.009 0.013 0.023 0.078 0.141 0.231 0.229 0.263 87 L 0.014 0.040 0.069 0.175 0.202 0.161 0.163 0.075 0.053 0.030 0.017 88 I 0.004 0.013 0.080 0.053 0.043 0.070 0.118 0.126 0.191 0.181 0.121 89 H 0.008 0.018 0.039 0.065 0.076 0.098 0.189 0.159 0.150 0.117 0.081 90 I 0.010 0.015 0.020 0.039 0.045 0.087 0.162 0.188 0.183 0.160 0.092 91 G 0.182 0.126 0.115 0.182 0.110 0.084 0.069 0.042 0.037 0.035 0.017 92 F 0.020 0.023 0.029 0.078 0.094 0.123 0.200 0.168 0.130 0.088 0.047 93 E 0.012 0.015 0.020 0.038 0.036 0.046 0.104 0.129 0.207 0.222 0.171 94 V 0.008 0.013 0.028 0.058 0.073 0.123 0.201 0.160 0.150 0.110 0.076 95 D 0.053 0.101 0.201 0.177 0.112 0.102 0.094 0.057 0.048 0.036 0.017 96 Y 0.012 0.013 0.021 0.050 0.059 0.102 0.209 0.180 0.156 0.122 0.076 97 L 0.036 0.038 0.040 0.076 0.076 0.095 0.166 0.149 0.142 0.112 0.069 98 I 0.109 0.097 0.123 0.166 0.134 0.110 0.111 0.061 0.042 0.032 0.015 99 G 0.165 0.132 0.121 0.165 0.108 0.097 0.097 0.046 0.034 0.024 0.012 100 Y 0.020 0.026 0.022 0.053 0.063 0.103 0.180 0.169 0.160 0.122 0.082 101 E 0.166 0.150 0.100 0.185 0.136 0.094 0.082 0.038 0.025 0.017 0.007 102 D 0.271 0.125 0.159 0.160 0.104 0.062 0.057 0.028 0.017 0.012 0.006 103 F 0.026 0.042 0.043 0.106 0.117 0.145 0.203 0.130 0.096 0.059 0.032 104 T 0.006 0.011 0.019 0.025 0.027 0.048 0.152 0.138 0.217 0.207 0.150 105 R 0.012 0.024 0.076 0.149 0.177 0.221 0.189 0.076 0.042 0.025 0.010 106 D 0.121 0.084 0.358 0.213 0.085 0.061 0.040 0.016 0.011 0.008 0.003 107 F 0.004 0.008 0.016 0.041 0.057 0.096 0.221 0.220 0.158 0.104 0.076 108 L 0.002 0.004 0.011 0.009 0.011 0.020 0.076 0.129 0.206 0.262 0.269 109 N 0.012 0.021 0.218 0.234 0.237 0.133 0.087 0.030 0.015 0.011 0.004 110 E 0.062 0.081 0.361 0.212 0.115 0.082 0.053 0.016 0.010 0.006 0.002 111 Y 0.016 0.011 0.012 0.023 0.031 0.064 0.166 0.223 0.193 0.155 0.106 112 G 0.211 0.138 0.050 0.092 0.077 0.091 0.125 0.082 0.062 0.046 0.026 113 P 0.136 0.110 0.127 0.126 0.093 0.091 0.092 0.061 0.066 0.057 0.041 114 Q 0.259 0.201 0.083 0.147 0.108 0.069 0.063 0.031 0.020 0.011 0.007 115 T 0.120 0.049 0.022 0.062 0.061 0.072 0.131 0.132 0.134 0.116 0.100 116 D 0.094 0.089 0.036 0.123 0.126 0.133 0.134 0.088 0.079 0.053 0.045 117 D 0.105 0.112 0.060 0.136 0.125 0.117 0.133 0.075 0.066 0.041 0.030 118 G 0.044 0.031 0.021 0.065 0.079 0.116 0.191 0.137 0.144 0.098 0.074 119 V 0.013 0.011 0.011 0.027 0.035 0.048 0.105 0.144 0.201 0.193 0.212 120 L 0.005 0.009 0.011 0.026 0.038 0.059 0.126 0.180 0.206 0.185 0.153 121 S 0.013 0.020 0.028 0.061 0.076 0.085 0.146 0.144 0.161 0.149 0.118 122 L 0.004 0.005 0.008 0.017 0.025 0.037 0.095 0.156 0.216 0.217 0.220 123 H 0.010 0.013 0.016 0.043 0.054 0.075 0.146 0.175 0.193 0.154 0.120 124 F 0.008 0.009 0.017 0.036 0.040 0.061 0.131 0.151 0.191 0.189 0.168 125 L 0.009 0.011 0.016 0.041 0.049 0.080 0.153 0.162 0.186 0.155 0.138 126 E 0.066 0.078 0.058 0.148 0.131 0.113 0.130 0.096 0.082 0.060 0.038 127 G 0.073 0.039 0.029 0.078 0.078 0.106 0.162 0.127 0.126 0.104 0.077 128 Q 0.099 0.078 0.042 0.107 0.101 0.094 0.126 0.098 0.101 0.082 0.072 129 G 0.136 0.091 0.037 0.104 0.091 0.106 0.138 0.096 0.092 0.065 0.044 130 G 0.153 0.088 0.047 0.122 0.109 0.100 0.123 0.083 0.076 0.060 0.040 131 F 0.040 0.035 0.024 0.074 0.078 0.101 0.144 0.144 0.144 0.115 0.098 132 R 0.112 0.106 0.046 0.132 0.114 0.118 0.140 0.086 0.070 0.047 0.030 133 S 0.079 0.069 0.044 0.115 0.110 0.102 0.147 0.110 0.097 0.075 0.051 134 I 0.031 0.021 0.018 0.041 0.050 0.087 0.153 0.156 0.179 0.147 0.117 135 D 0.163 0.146 0.096 0.204 0.130 0.084 0.076 0.040 0.029 0.021 0.011 136 F 0.048 0.046 0.032 0.070 0.074 0.093 0.171 0.164 0.130 0.100 0.071 137 S 0.060 0.090 0.041 0.105 0.114 0.117 0.159 0.111 0.090 0.072 0.041 138 A 0.252 0.145 0.083 0.171 0.115 0.081 0.073 0.037 0.022 0.014 0.007 139 E 0.398 0.099 0.096 0.130 0.081 0.065 0.058 0.030 0.021 0.014 0.008 140 D 0.065 0.104 0.055 0.146 0.135 0.124 0.157 0.080 0.062 0.046 0.026 141 Y 0.010 0.018 0.017 0.037 0.044 0.083 0.189 0.192 0.178 0.130 0.102 142 N 0.106 0.095 0.159 0.197 0.151 0.121 0.086 0.040 0.022 0.015 0.006 143 E 0.171 0.123 0.218 0.224 0.102 0.073 0.047 0.018 0.011 0.008 0.003 144 G 0.028 0.027 0.024 0.075 0.089 0.125 0.218 0.159 0.125 0.073 0.057 145 I 0.003 0.004 0.008 0.010 0.014 0.023 0.081 0.134 0.209 0.244 0.271 146 V 0.016 0.033 0.190 0.193 0.146 0.135 0.130 0.061 0.046 0.034 0.016 147 Q 0.036 0.062 0.231 0.207 0.164 0.100 0.100 0.043 0.030 0.019 0.008 148 F 0.021 0.021 0.020 0.048 0.057 0.112 0.232 0.173 0.145 0.105 0.065 149 Y 0.105 0.062 0.038 0.078 0.073 0.108 0.178 0.125 0.105 0.076 0.052 150 G 0.325 0.187 0.124 0.119 0.066 0.051 0.049 0.031 0.022 0.017 0.008 151 G 0.204 0.168 0.069 0.123 0.095 0.095 0.111 0.055 0.039 0.027 0.014 152 F 0.044 0.036 0.016 0.056 0.081 0.132 0.181 0.172 0.126 0.093 0.065 153 E 0.485 0.180 0.092 0.109 0.051 0.033 0.022 0.012 0.008 0.006 0.003 154 Q 0.085 0.092 0.099 0.197 0.171 0.129 0.109 0.061 0.030 0.018 0.010 155 A 0.010 0.014 0.018 0.030 0.033 0.053 0.139 0.157 0.211 0.191 0.145 156 Q 0.008 0.018 0.048 0.096 0.130 0.177 0.235 0.116 0.088 0.056 0.027 157 L 0.044 0.050 0.326 0.202 0.117 0.102 0.078 0.034 0.025 0.016 0.006 158 A 0.020 0.027 0.084 0.136 0.145 0.172 0.212 0.088 0.060 0.039 0.016 159 Y 0.003 0.012 0.017 0.023 0.024 0.041 0.135 0.196 0.224 0.197 0.127 160 L 0.005 0.011 0.039 0.061 0.085 0.165 0.237 0.159 0.111 0.085 0.042 161 E 0.180 0.080 0.489 0.145 0.049 0.024 0.017 0.007 0.004 0.004 0.001 162 G 0.014 0.040 0.052 0.155 0.154 0.235 0.229 0.062 0.036 0.017 0.006 163 V 0.001 0.001 0.002 0.002 0.003 0.005 0.031 0.087 0.222 0.294 0.354 164 K 0.009 0.019 0.101 0.167 0.222 0.244 0.156 0.042 0.020 0.015 0.004 165 Q 0.009 0.033 0.526 0.231 0.115 0.045 0.024 0.009 0.004 0.002 0.001 166 S 0.001 0.001 0.004 0.003 0.005 0.016 0.098 0.194 0.238 0.228 0.213 167 I 0.002 0.002 0.010 0.009 0.011 0.032 0.141 0.152 0.233 0.234 0.174 168 E 0.009 0.019 0.503 0.205 0.121 0.065 0.037 0.020 0.010 0.007 0.003 169 A 0.005 0.011 0.094 0.090 0.120 0.215 0.284 0.091 0.054 0.024 0.012 170 D 0.019 0.014 0.030 0.028 0.023 0.035 0.134 0.113 0.211 0.221 0.171 171 L 0.023 0.023 0.034 0.063 0.077 0.174 0.254 0.153 0.104 0.055 0.039 172 G 0.177 0.145 0.319 0.162 0.062 0.052 0.035 0.019 0.014 0.009 0.006 173 L 0.067 0.042 0.043 0.103 0.101 0.139 0.194 0.115 0.085 0.064 0.048 174 F 0.148 0.064 0.026 0.064 0.058 0.085 0.151 0.113 0.111 0.086 0.093 175 K 0.103 0.125 0.071 0.183 0.152 0.119 0.105 0.049 0.044 0.028 0.022 176 P 0.020 0.013 0.022 0.027 0.029 0.051 0.110 0.142 0.193 0.177 0.216 177 R 0.015 0.024 0.020 0.071 0.098 0.146 0.201 0.122 0.136 0.101 0.065 178 R 0.005 0.009 0.009 0.020 0.028 0.048 0.122 0.171 0.217 0.183 0.188 179 M 0.002 0.003 0.006 0.008 0.011 0.019 0.060 0.102 0.175 0.271 0.343 180 G 0.002 0.002 0.004 0.006 0.008 0.015 0.054 0.130 0.210 0.264 0.304 181 H 0.002 0.005 0.012 0.022 0.031 0.045 0.114 0.165 0.186 0.204 0.214 182 I 0.004 0.005 0.010 0.026 0.036 0.071 0.146 0.151 0.191 0.193 0.165 183 S 0.050 0.053 0.065 0.150 0.153 0.128 0.149 0.097 0.074 0.052 0.030 184 L 0.010 0.019 0.020 0.071 0.088 0.124 0.203 0.154 0.142 0.103 0.065 185 C 0.003 0.004 0.009 0.014 0.015 0.029 0.074 0.094 0.203 0.254 0.302 186 Q 0.031 0.042 0.098 0.211 0.191 0.147 0.127 0.059 0.045 0.032 0.018 187 K 0.017 0.042 0.090 0.131 0.117 0.144 0.178 0.106 0.085 0.055 0.034 188 F 0.004 0.005 0.013 0.020 0.021 0.032 0.106 0.136 0.216 0.220 0.227 189 Q 0.015 0.019 0.042 0.068 0.069 0.108 0.217 0.146 0.143 0.102 0.071 190 Q 0.037 0.046 0.206 0.237 0.183 0.108 0.088 0.044 0.027 0.018 0.008 191 F 0.026 0.030 0.047 0.074 0.075 0.143 0.235 0.151 0.110 0.069 0.039 192 F 0.031 0.031 0.026 0.051 0.050 0.079 0.170 0.164 0.168 0.146 0.083 193 G 0.278 0.147 0.076 0.111 0.082 0.083 0.092 0.055 0.037 0.025 0.014 194 E 0.252 0.143 0.107 0.140 0.101 0.073 0.070 0.044 0.032 0.024 0.013 195 D 0.132 0.116 0.044 0.105 0.092 0.097 0.143 0.098 0.081 0.057 0.034 196 T 0.060 0.065 0.030 0.083 0.105 0.122 0.181 0.134 0.101 0.071 0.049 197 S 0.350 0.141 0.112 0.132 0.078 0.068 0.052 0.029 0.019 0.013 0.006 198 D 0.176 0.133 0.112 0.193 0.134 0.093 0.081 0.036 0.021 0.014 0.006 199 F 0.018 0.037 0.019 0.041 0.044 0.068 0.174 0.196 0.174 0.139 0.091 200 S 0.047 0.080 0.051 0.113 0.154 0.189 0.188 0.095 0.044 0.028 0.012 201 E 0.684 0.079 0.154 0.056 0.011 0.007 0.004 0.002 0.001 0.001 0.001 202 E 0.090 0.067 0.072 0.176 0.152 0.182 0.154 0.055 0.028 0.016 0.007 203 V 0.011 0.035 0.020 0.033 0.037 0.048 0.147 0.165 0.195 0.186 0.122 204 M 0.024 0.033 0.074 0.114 0.157 0.271 0.202 0.076 0.029 0.014 0.006 205 E 0.417 0.072 0.441 0.054 0.008 0.004 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 206 K 0.007 0.027 0.026 0.114 0.125 0.265 0.282 0.077 0.047 0.023 0.008 207 F 0.001 0.002 0.003 0.004 0.010 0.019 0.084 0.188 0.245 0.215 0.227 208 R 0.051 0.050 0.376 0.210 0.111 0.137 0.044 0.010 0.005 0.005 0.001 209 V 0.003 0.017 0.330 0.221 0.149 0.131 0.087 0.038 0.014 0.008 0.003 210 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.033 0.138 0.244 0.316 0.262 211 L 0.001 0.001 0.010 0.009 0.016 0.067 0.216 0.177 0.204 0.200 0.100 212 A 0.004 0.008 0.750 0.135 0.046 0.029 0.015 0.006 0.003 0.003 0.001 213 L 0.001 0.002 0.026 0.042 0.077 0.225 0.431 0.123 0.051 0.016 0.007 214 V 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.011 0.029 0.145 0.335 0.474 215 K 0.001 0.003 0.044 0.067 0.107 0.268 0.337 0.088 0.048 0.024 0.013 216 K 0.011 0.025 0.730 0.135 0.057 0.024 0.010 0.004 0.002 0.001 0.001 217 R 0.009 0.008 0.023 0.035 0.057 0.169 0.365 0.187 0.078 0.048 0.020 218 D 0.422 0.130 0.063 0.075 0.042 0.045 0.068 0.042 0.048 0.040 0.025 219 Y 0.017 0.016 0.021 0.029 0.037 0.081 0.145 0.145 0.192 0.174 0.144 220 E 0.068 0.107 0.140 0.143 0.124 0.115 0.112 0.065 0.060 0.039 0.027 221 L 0.003 0.004 0.005 0.007 0.012 0.020 0.071 0.158 0.219 0.267 0.234 222 D 0.007 0.012 0.014 0.029 0.041 0.058 0.118 0.174 0.184 0.172 0.191 223 F 0.002 0.003 0.007 0.008 0.010 0.017 0.053 0.096 0.187 0.304 0.315 224 N 0.006 0.009 0.019 0.040 0.048 0.077 0.151 0.163 0.192 0.148 0.147 225 T 0.010 0.011 0.016 0.041 0.050 0.076 0.150 0.161 0.190 0.159 0.136 226 A 0.027 0.031 0.028 0.084 0.103 0.110 0.169 0.139 0.139 0.103 0.066 227 G 0.079 0.067 0.046 0.125 0.129 0.108 0.144 0.105 0.092 0.063 0.044 228 L 0.024 0.019 0.020 0.052 0.044 0.073 0.130 0.120 0.179 0.180 0.159 229 F 0.045 0.044 0.035 0.110 0.094 0.115 0.157 0.117 0.121 0.081 0.081 230 K 0.092 0.105 0.056 0.140 0.130 0.106 0.127 0.087 0.073 0.051 0.034 231 P 0.196 0.092 0.051 0.124 0.096 0.107 0.111 0.073 0.068 0.050 0.031 232 L 0.077 0.054 0.034 0.083 0.073 0.103 0.146 0.119 0.123 0.108 0.078 233 C 0.074 0.064 0.030 0.093 0.084 0.100 0.157 0.135 0.108 0.089 0.065 234 G 0.212 0.151 0.053 0.117 0.103 0.085 0.097 0.068 0.053 0.037 0.023 235 E 0.291 0.208 0.063 0.136 0.101 0.061 0.054 0.032 0.026 0.019 0.010 236 T 0.306 0.091 0.037 0.112 0.098 0.086 0.104 0.062 0.050 0.033 0.022 237 Y 0.161 0.106 0.045 0.121 0.116 0.103 0.126 0.088 0.062 0.044 0.028 238 P 0.072 0.190 0.068 0.157 0.129 0.114 0.121 0.060 0.047 0.029 0.012 239 P 0.032 0.031 0.022 0.054 0.086 0.124 0.220 0.182 0.126 0.077 0.046 240 K 0.419 0.127 0.117 0.157 0.068 0.048 0.031 0.014 0.009 0.008 0.003 241 K 0.015 0.032 0.047 0.238 0.230 0.183 0.152 0.067 0.023 0.009 0.003 242 I 0.001 0.001 0.003 0.003 0.004 0.007 0.048 0.092 0.239 0.301 0.301 243 V 0.001 0.002 0.015 0.030 0.045 0.164 0.342 0.137 0.140 0.076 0.050 244 T 0.003 0.010 0.569 0.217 0.117 0.046 0.024 0.008 0.004 0.002 0.001 245 L 0.001 0.002 0.016 0.021 0.036 0.141 0.370 0.213 0.113 0.056 0.032 246 A 0.001 0.001 0.006 0.003 0.003 0.004 0.028 0.076 0.191 0.339 0.348 247 S 0.005 0.009 0.151 0.147 0.189 0.195 0.180 0.062 0.031 0.023 0.008 248 E 0.014 0.038 0.479 0.217 0.144 0.063 0.031 0.008 0.004 0.002 0.001 249 L 0.014 0.007 0.017 0.022 0.032 0.089 0.245 0.223 0.162 0.120 0.069 250 Q 0.371 0.201 0.074 0.109 0.066 0.046 0.054 0.027 0.024 0.017 0.011 251 I 0.012 0.013 0.025 0.028 0.028 0.048 0.100 0.125 0.194 0.194 0.234 252 P 0.111 0.133 0.080 0.168 0.149 0.115 0.118 0.053 0.042 0.019 0.013 253 F 0.011 0.012 0.011 0.016 0.022 0.035 0.112 0.140 0.231 0.215 0.194 254 V 0.005 0.006 0.005 0.009 0.014 0.026 0.078 0.117 0.206 0.203 0.331 255 Y 0.003 0.004 0.005 0.008 0.014 0.023 0.079 0.121 0.213 0.224 0.305 256 G 0.004 0.005 0.007 0.013 0.023 0.027 0.085 0.135 0.219 0.218 0.265 257 S 0.003 0.004 0.005 0.011 0.021 0.026 0.083 0.135 0.207 0.222 0.283 258 D 0.006 0.007 0.007 0.025 0.043 0.053 0.120 0.188 0.207 0.173 0.172 259 S 0.009 0.010 0.011 0.032 0.051 0.058 0.118 0.158 0.185 0.179 0.189 260 H 0.014 0.019 0.018 0.054 0.081 0.101 0.155 0.169 0.155 0.135 0.099 261 G 0.060 0.058 0.041 0.120 0.128 0.121 0.142 0.109 0.091 0.075 0.054 262 V 0.029 0.021 0.019 0.056 0.074 0.087 0.133 0.143 0.148 0.158 0.132 263 Q 0.164 0.139 0.069 0.173 0.140 0.096 0.078 0.048 0.041 0.032 0.020 264 D 0.205 0.130 0.063 0.129 0.099 0.078 0.091 0.062 0.056 0.052 0.035 265 I 0.045 0.043 0.028 0.076 0.081 0.119 0.156 0.141 0.125 0.109 0.077 266 G 0.327 0.159 0.072 0.141 0.088 0.062 0.060 0.033 0.027 0.020 0.012 267 R 0.137 0.106 0.061 0.118 0.110 0.115 0.125 0.080 0.067 0.054 0.028 268 G 0.259 0.202 0.072 0.148 0.097 0.076 0.065 0.032 0.025 0.016 0.009 269 Y 0.030 0.026 0.020 0.060 0.070 0.105 0.172 0.168 0.145 0.118 0.086 270 S 0.237 0.159 0.115 0.171 0.107 0.073 0.057 0.033 0.024 0.017 0.008 271 T 0.141 0.146 0.119 0.210 0.163 0.087 0.069 0.031 0.019 0.011 0.005 272 Y 0.033 0.038 0.034 0.065 0.055 0.080 0.145 0.126 0.165 0.144 0.115 273 C 0.031 0.034 0.037 0.090 0.110 0.165 0.211 0.136 0.095 0.057 0.034 274 Q 0.324 0.248 0.227 0.137 0.038 0.012 0.006 0.004 0.002 0.001 0.001 275 K 0.073 0.034 0.039 0.084 0.096 0.170 0.190 0.123 0.094 0.064 0.035