# TARGET T0440 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-alpha-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 ABCDEFGHIST ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0440.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1615 # Pos AA A B C D E F G H I S T 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.128 0.201 0.113 0.030 0.304 0.024 0.022 0.042 0.029 0.058 0.049 2 K 0.244 0.147 0.027 0.008 0.426 0.010 0.021 0.036 0.019 0.024 0.038 3 R 0.260 0.148 0.034 0.017 0.349 0.027 0.019 0.024 0.015 0.025 0.081 4 D 0.172 0.146 0.076 0.047 0.292 0.067 0.061 0.037 0.018 0.038 0.044 5 G 0.201 0.131 0.051 0.027 0.241 0.024 0.033 0.079 0.069 0.081 0.063 6 H 0.143 0.173 0.063 0.032 0.312 0.035 0.037 0.068 0.040 0.057 0.040 7 T 0.164 0.160 0.044 0.019 0.308 0.021 0.038 0.073 0.047 0.058 0.067 8 H 0.183 0.129 0.054 0.024 0.241 0.023 0.030 0.059 0.071 0.100 0.086 9 T 0.094 0.259 0.126 0.023 0.295 0.021 0.021 0.052 0.040 0.037 0.033 10 E 0.130 0.161 0.053 0.016 0.208 0.017 0.049 0.147 0.101 0.075 0.042 11 F 0.080 0.148 0.060 0.025 0.163 0.033 0.066 0.099 0.094 0.184 0.047 12 C 0.107 0.251 0.248 0.014 0.290 0.007 0.006 0.028 0.015 0.015 0.018 13 P 0.011 0.026 0.012 0.008 0.016 0.029 0.125 0.407 0.324 0.034 0.008 14 H 0.030 0.113 0.081 0.039 0.060 0.025 0.082 0.146 0.112 0.281 0.031 15 G 0.077 0.107 0.067 0.027 0.110 0.014 0.021 0.137 0.133 0.220 0.087 16 T 0.045 0.145 0.083 0.026 0.109 0.027 0.055 0.184 0.155 0.129 0.043 17 H 0.065 0.156 0.075 0.028 0.112 0.028 0.051 0.169 0.108 0.158 0.050 18 D 0.022 0.176 0.118 0.038 0.054 0.041 0.087 0.139 0.080 0.221 0.025 19 D 0.035 0.516 0.291 0.003 0.082 0.001 0.001 0.039 0.006 0.013 0.012 20 V 0.001 0.003 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.817 0.171 0.003 0.001 21 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.949 0.049 0.001 0.001 22 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.986 0.012 0.001 0.001 23 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.995 0.005 0.001 0.001 24 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.989 0.011 0.001 0.001 25 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.994 0.006 0.001 0.001 26 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.995 0.004 0.001 0.001 27 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.981 0.017 0.001 0.001 28 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.911 0.085 0.001 0.001 29 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.053 0.846 0.058 0.029 0.011 30 L 0.001 0.776 0.176 0.001 0.011 0.001 0.024 0.008 0.001 0.001 0.001 31 D 0.022 0.002 0.002 0.003 0.004 0.004 0.004 0.007 0.004 0.370 0.578 32 F 0.143 0.355 0.067 0.015 0.263 0.006 0.007 0.034 0.035 0.033 0.041 33 D 0.061 0.105 0.036 0.034 0.119 0.220 0.146 0.123 0.054 0.049 0.052 34 E 0.261 0.101 0.029 0.014 0.439 0.007 0.028 0.040 0.032 0.024 0.024 35 Y 0.171 0.094 0.011 0.002 0.675 0.004 0.004 0.012 0.007 0.005 0.014 36 S 0.212 0.122 0.012 0.002 0.587 0.005 0.009 0.013 0.005 0.007 0.026 37 I 0.316 0.108 0.016 0.006 0.344 0.007 0.009 0.015 0.014 0.038 0.127 38 V 0.109 0.216 0.141 0.047 0.293 0.040 0.028 0.039 0.021 0.032 0.033 39 E 0.065 0.127 0.053 0.031 0.101 0.040 0.114 0.214 0.150 0.071 0.033 40 H 0.053 0.067 0.042 0.029 0.076 0.020 0.041 0.093 0.118 0.406 0.055 41 A 0.052 0.334 0.166 0.026 0.170 0.018 0.020 0.071 0.062 0.055 0.026 42 P 0.046 0.128 0.090 0.024 0.076 0.032 0.080 0.232 0.147 0.105 0.040 43 L 0.064 0.134 0.049 0.016 0.087 0.013 0.044 0.230 0.136 0.188 0.039 44 S 0.067 0.100 0.039 0.017 0.117 0.014 0.016 0.329 0.167 0.091 0.043 45 S 0.008 0.022 0.014 0.009 0.015 0.022 0.048 0.627 0.199 0.033 0.005 46 E 0.015 0.028 0.016 0.005 0.024 0.006 0.029 0.538 0.133 0.193 0.013 47 F 0.039 0.024 0.008 0.003 0.044 0.003 0.008 0.617 0.159 0.075 0.020 48 M 0.012 0.025 0.010 0.003 0.026 0.007 0.013 0.706 0.173 0.019 0.005 49 K 0.011 0.033 0.013 0.003 0.025 0.010 0.048 0.684 0.134 0.033 0.006 50 N 0.037 0.037 0.018 0.006 0.056 0.011 0.069 0.507 0.116 0.123 0.021 51 T 0.041 0.087 0.048 0.008 0.068 0.008 0.033 0.458 0.149 0.076 0.025 52 A 0.034 0.043 0.034 0.028 0.042 0.055 0.119 0.375 0.139 0.094 0.037 53 G 0.016 0.320 0.163 0.134 0.047 0.062 0.107 0.071 0.033 0.037 0.010 54 D 0.056 0.019 0.021 0.042 0.038 0.012 0.013 0.030 0.028 0.449 0.292 55 K 0.070 0.423 0.105 0.008 0.262 0.006 0.010 0.029 0.029 0.030 0.027 56 E 0.138 0.271 0.059 0.007 0.408 0.015 0.020 0.024 0.015 0.015 0.029 57 A 0.350 0.129 0.030 0.014 0.322 0.011 0.019 0.023 0.014 0.022 0.066 58 V 0.205 0.165 0.077 0.049 0.299 0.046 0.025 0.025 0.013 0.026 0.067 59 T 0.080 0.187 0.152 0.108 0.135 0.112 0.068 0.051 0.037 0.041 0.029 60 T 0.209 0.114 0.053 0.041 0.207 0.015 0.019 0.038 0.047 0.157 0.100 61 A 0.123 0.239 0.050 0.010 0.420 0.017 0.019 0.037 0.030 0.026 0.029 62 S 0.251 0.104 0.014 0.005 0.506 0.008 0.018 0.021 0.013 0.013 0.046 63 M 0.237 0.185 0.038 0.009 0.397 0.013 0.012 0.018 0.015 0.022 0.055 64 A 0.181 0.205 0.064 0.019 0.356 0.017 0.024 0.035 0.017 0.024 0.057 65 M 0.147 0.141 0.052 0.029 0.181 0.024 0.032 0.111 0.118 0.083 0.080 66 S 0.029 0.130 0.075 0.056 0.070 0.074 0.159 0.218 0.106 0.063 0.020 67 D 0.065 0.099 0.085 0.037 0.081 0.022 0.041 0.073 0.068 0.366 0.062 68 L 0.058 0.382 0.185 0.013 0.190 0.007 0.007 0.066 0.040 0.034 0.019 69 P 0.021 0.060 0.023 0.008 0.033 0.020 0.039 0.496 0.238 0.049 0.015 70 Y 0.018 0.063 0.030 0.006 0.041 0.008 0.039 0.564 0.157 0.062 0.012 71 Y 0.041 0.052 0.012 0.004 0.046 0.004 0.014 0.634 0.092 0.074 0.029 72 F 0.034 0.019 0.004 0.002 0.043 0.004 0.007 0.723 0.133 0.022 0.011 73 K 0.008 0.017 0.007 0.002 0.020 0.010 0.023 0.817 0.082 0.010 0.003 74 K 0.026 0.016 0.006 0.002 0.029 0.004 0.024 0.749 0.084 0.050 0.010 75 M 0.026 0.025 0.008 0.005 0.043 0.006 0.017 0.676 0.147 0.035 0.011 76 N 0.013 0.013 0.006 0.005 0.019 0.010 0.027 0.710 0.158 0.032 0.007 77 H 0.015 0.020 0.008 0.003 0.025 0.004 0.034 0.683 0.136 0.063 0.009 78 I 0.045 0.046 0.016 0.006 0.066 0.008 0.040 0.535 0.142 0.073 0.023 79 K 0.037 0.112 0.038 0.009 0.080 0.014 0.035 0.402 0.180 0.070 0.022 80 K 0.046 0.106 0.043 0.007 0.105 0.012 0.043 0.373 0.161 0.074 0.029 81 K 0.041 0.084 0.037 0.008 0.071 0.017 0.101 0.401 0.165 0.059 0.016 82 Y 0.072 0.104 0.047 0.018 0.079 0.023 0.074 0.214 0.094 0.218 0.057 83 A 0.107 0.133 0.085 0.031 0.177 0.020 0.023 0.172 0.099 0.106 0.045 84 S 0.016 0.048 0.028 0.028 0.027 0.052 0.083 0.462 0.196 0.050 0.010 85 D 0.053 0.055 0.019 0.012 0.083 0.011 0.052 0.263 0.116 0.291 0.045 86 L 0.214 0.096 0.014 0.003 0.372 0.004 0.011 0.165 0.055 0.026 0.040 87 L 0.134 0.112 0.010 0.002 0.468 0.014 0.032 0.173 0.032 0.011 0.012 88 I 0.253 0.133 0.016 0.004 0.364 0.011 0.021 0.106 0.027 0.019 0.046 89 H 0.206 0.052 0.042 0.037 0.166 0.047 0.063 0.129 0.029 0.085 0.143 90 I 0.030 0.371 0.143 0.080 0.112 0.052 0.078 0.071 0.027 0.025 0.013 91 G 0.093 0.054 0.049 0.105 0.058 0.030 0.021 0.049 0.038 0.313 0.192 92 F 0.054 0.343 0.136 0.015 0.232 0.009 0.013 0.085 0.048 0.040 0.025 93 E 0.246 0.126 0.024 0.005 0.350 0.010 0.018 0.109 0.043 0.018 0.051 94 V 0.130 0.213 0.043 0.017 0.225 0.032 0.030 0.151 0.072 0.025 0.064 95 D 0.105 0.111 0.064 0.026 0.188 0.041 0.100 0.209 0.045 0.066 0.044 96 Y 0.127 0.132 0.050 0.011 0.168 0.008 0.021 0.257 0.109 0.076 0.042 97 L 0.103 0.149 0.058 0.028 0.185 0.026 0.031 0.256 0.075 0.046 0.044 98 I 0.023 0.117 0.067 0.035 0.056 0.051 0.100 0.411 0.098 0.027 0.014 99 G 0.040 0.076 0.067 0.031 0.048 0.020 0.048 0.326 0.079 0.208 0.057 100 Y 0.056 0.085 0.030 0.009 0.079 0.006 0.010 0.439 0.143 0.108 0.034 101 E 0.010 0.022 0.007 0.004 0.019 0.011 0.015 0.707 0.173 0.024 0.007 102 D 0.008 0.013 0.008 0.003 0.014 0.006 0.023 0.783 0.102 0.033 0.006 103 F 0.009 0.017 0.007 0.002 0.012 0.002 0.012 0.826 0.066 0.040 0.007 104 T 0.010 0.009 0.002 0.001 0.010 0.001 0.003 0.835 0.101 0.023 0.005 105 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.002 0.881 0.108 0.003 0.001 106 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.009 0.909 0.069 0.007 0.001 107 F 0.003 0.003 0.001 0.001 0.003 0.001 0.010 0.877 0.082 0.017 0.002 108 L 0.006 0.004 0.001 0.001 0.009 0.003 0.012 0.751 0.181 0.028 0.004 109 N 0.003 0.015 0.008 0.002 0.007 0.005 0.040 0.729 0.166 0.021 0.003 110 E 0.017 0.018 0.016 0.003 0.020 0.009 0.139 0.445 0.113 0.192 0.027 111 Y 0.031 0.471 0.157 0.025 0.111 0.014 0.051 0.035 0.024 0.060 0.021 112 G 0.059 0.074 0.101 0.186 0.055 0.050 0.025 0.052 0.037 0.206 0.156 113 P 0.057 0.237 0.141 0.049 0.168 0.015 0.029 0.093 0.071 0.103 0.037 114 Q 0.106 0.158 0.120 0.034 0.164 0.036 0.051 0.125 0.075 0.084 0.047 115 T 0.055 0.099 0.078 0.044 0.089 0.040 0.073 0.267 0.141 0.079 0.036 116 D 0.044 0.111 0.086 0.043 0.079 0.035 0.046 0.192 0.138 0.181 0.044 117 D 0.065 0.118 0.072 0.029 0.105 0.029 0.039 0.178 0.150 0.169 0.047 118 G 0.089 0.121 0.052 0.023 0.179 0.028 0.053 0.176 0.102 0.125 0.052 119 V 0.160 0.116 0.039 0.022 0.186 0.020 0.042 0.129 0.077 0.131 0.078 120 L 0.071 0.250 0.163 0.041 0.166 0.034 0.032 0.076 0.050 0.082 0.035 121 S 0.121 0.298 0.130 0.015 0.271 0.009 0.011 0.060 0.028 0.026 0.030 122 L 0.091 0.100 0.022 0.009 0.143 0.019 0.040 0.269 0.210 0.057 0.041 123 H 0.074 0.093 0.052 0.018 0.144 0.035 0.098 0.267 0.102 0.086 0.032 124 F 0.148 0.090 0.030 0.011 0.167 0.011 0.032 0.226 0.102 0.130 0.054 125 L 0.079 0.132 0.057 0.033 0.149 0.037 0.048 0.192 0.116 0.113 0.044 126 E 0.066 0.138 0.123 0.060 0.126 0.053 0.075 0.178 0.075 0.078 0.029 127 G 0.068 0.094 0.074 0.030 0.096 0.023 0.071 0.203 0.132 0.161 0.049 128 Q 0.086 0.117 0.083 0.054 0.115 0.041 0.067 0.141 0.084 0.153 0.059 129 G 0.038 0.181 0.139 0.143 0.085 0.063 0.070 0.097 0.066 0.088 0.030 130 G 0.053 0.075 0.094 0.159 0.057 0.047 0.047 0.082 0.072 0.234 0.080 131 F 0.097 0.174 0.101 0.048 0.193 0.020 0.022 0.076 0.077 0.128 0.064 132 R 0.060 0.166 0.111 0.036 0.118 0.048 0.060 0.164 0.109 0.090 0.038 133 S 0.129 0.147 0.073 0.018 0.201 0.012 0.031 0.129 0.082 0.118 0.059 134 I 0.117 0.183 0.060 0.021 0.195 0.025 0.031 0.136 0.100 0.075 0.057 135 D 0.074 0.137 0.094 0.036 0.132 0.049 0.068 0.197 0.083 0.086 0.044 136 F 0.089 0.135 0.067 0.018 0.145 0.015 0.034 0.214 0.096 0.140 0.046 137 S 0.067 0.126 0.051 0.017 0.121 0.017 0.027 0.291 0.136 0.111 0.036 138 A 0.036 0.094 0.043 0.013 0.085 0.016 0.030 0.417 0.183 0.065 0.018 139 E 0.017 0.039 0.023 0.006 0.033 0.011 0.039 0.581 0.189 0.051 0.011 140 D 0.025 0.031 0.014 0.006 0.033 0.010 0.051 0.559 0.140 0.112 0.018 141 Y 0.039 0.104 0.034 0.012 0.064 0.010 0.026 0.411 0.140 0.132 0.029 142 N 0.023 0.043 0.032 0.010 0.044 0.014 0.024 0.563 0.154 0.073 0.020 143 E 0.012 0.055 0.028 0.006 0.027 0.013 0.054 0.577 0.166 0.054 0.007 144 G 0.034 0.032 0.014 0.007 0.040 0.008 0.035 0.521 0.124 0.153 0.031 145 I 0.052 0.041 0.013 0.007 0.068 0.006 0.016 0.484 0.195 0.089 0.029 146 V 0.028 0.065 0.025 0.007 0.072 0.023 0.044 0.513 0.168 0.042 0.013 147 Q 0.050 0.095 0.049 0.009 0.092 0.019 0.095 0.349 0.123 0.097 0.023 148 F 0.085 0.070 0.063 0.015 0.091 0.015 0.064 0.255 0.108 0.173 0.061 149 Y 0.040 0.151 0.094 0.069 0.086 0.053 0.090 0.194 0.098 0.094 0.031 150 G 0.016 0.077 0.079 0.218 0.025 0.080 0.092 0.150 0.091 0.145 0.027 151 G 0.033 0.076 0.091 0.069 0.050 0.014 0.017 0.103 0.066 0.413 0.068 152 F 0.065 0.215 0.074 0.009 0.159 0.006 0.008 0.280 0.107 0.052 0.024 153 E 0.016 0.043 0.015 0.004 0.035 0.011 0.019 0.653 0.177 0.020 0.008 154 Q 0.017 0.032 0.014 0.003 0.028 0.005 0.022 0.720 0.118 0.033 0.008 155 A 0.018 0.021 0.007 0.002 0.024 0.003 0.009 0.795 0.081 0.031 0.009 156 Q 0.009 0.010 0.003 0.001 0.012 0.001 0.004 0.828 0.118 0.011 0.003 157 L 0.004 0.006 0.002 0.001 0.008 0.003 0.008 0.851 0.109 0.006 0.002 158 A 0.004 0.010 0.004 0.001 0.009 0.003 0.042 0.865 0.050 0.010 0.002 159 Y 0.014 0.015 0.005 0.002 0.011 0.002 0.023 0.728 0.092 0.094 0.014 160 L 0.011 0.023 0.009 0.003 0.025 0.003 0.005 0.755 0.139 0.020 0.007 161 E 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.006 0.025 0.875 0.082 0.004 0.001 162 G 0.002 0.007 0.005 0.001 0.004 0.001 0.010 0.853 0.048 0.064 0.004 163 V 0.003 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.926 0.058 0.007 0.002 164 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.947 0.051 0.001 0.001 165 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.975 0.021 0.001 0.001 166 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.974 0.020 0.002 0.001 167 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.946 0.050 0.001 0.001 168 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.945 0.045 0.002 0.001 169 A 0.001 0.003 0.002 0.001 0.002 0.001 0.020 0.907 0.059 0.004 0.001 170 D 0.008 0.005 0.003 0.001 0.008 0.004 0.043 0.791 0.101 0.028 0.007 171 L 0.014 0.073 0.019 0.008 0.026 0.015 0.080 0.540 0.180 0.036 0.009 172 G 0.023 0.014 0.018 0.021 0.017 0.027 0.094 0.264 0.096 0.340 0.085 173 L 0.067 0.224 0.119 0.027 0.142 0.017 0.065 0.111 0.060 0.130 0.039 174 F 0.079 0.148 0.090 0.064 0.115 0.063 0.050 0.057 0.056 0.184 0.094 175 K 0.097 0.205 0.145 0.066 0.174 0.028 0.039 0.068 0.050 0.076 0.053 176 P 0.172 0.205 0.045 0.010 0.344 0.010 0.018 0.071 0.049 0.034 0.043 177 R 0.160 0.189 0.034 0.006 0.408 0.014 0.024 0.072 0.042 0.019 0.032 178 R 0.254 0.104 0.016 0.005 0.411 0.012 0.021 0.059 0.032 0.028 0.057 179 M 0.185 0.130 0.035 0.016 0.256 0.024 0.042 0.100 0.043 0.091 0.078 180 G 0.083 0.220 0.121 0.049 0.169 0.045 0.049 0.077 0.033 0.105 0.048 181 H 0.115 0.345 0.153 0.013 0.280 0.004 0.003 0.030 0.012 0.021 0.024 182 I 0.012 0.023 0.005 0.003 0.026 0.010 0.019 0.484 0.385 0.026 0.007 183 S 0.008 0.016 0.011 0.004 0.016 0.009 0.052 0.681 0.162 0.036 0.005 184 L 0.020 0.028 0.009 0.003 0.024 0.003 0.015 0.607 0.129 0.147 0.017 185 C 0.030 0.024 0.008 0.003 0.037 0.004 0.011 0.657 0.148 0.059 0.018 186 Q 0.006 0.014 0.007 0.003 0.013 0.009 0.017 0.757 0.152 0.018 0.003 187 K 0.011 0.018 0.008 0.003 0.020 0.006 0.044 0.696 0.129 0.058 0.007 188 F 0.037 0.040 0.017 0.006 0.055 0.007 0.036 0.550 0.152 0.077 0.021 189 Q 0.036 0.051 0.017 0.006 0.072 0.011 0.032 0.496 0.182 0.078 0.020 190 Q 0.030 0.079 0.035 0.005 0.062 0.010 0.070 0.467 0.153 0.068 0.021 191 F 0.072 0.086 0.060 0.015 0.101 0.023 0.093 0.269 0.100 0.135 0.045 192 F 0.040 0.359 0.136 0.044 0.118 0.027 0.048 0.095 0.048 0.060 0.026 193 G 0.065 0.071 0.084 0.069 0.075 0.031 0.031 0.145 0.085 0.228 0.117 194 E 0.026 0.178 0.090 0.022 0.084 0.021 0.058 0.260 0.151 0.091 0.020 195 D 0.083 0.177 0.092 0.019 0.134 0.017 0.029 0.150 0.076 0.154 0.071 196 T 0.050 0.075 0.031 0.011 0.090 0.010 0.019 0.327 0.258 0.098 0.032 197 S 0.015 0.061 0.031 0.011 0.036 0.024 0.056 0.467 0.227 0.060 0.012 198 D 0.032 0.058 0.035 0.010 0.051 0.011 0.048 0.382 0.141 0.202 0.029 199 F 0.049 0.111 0.044 0.007 0.086 0.006 0.017 0.272 0.169 0.210 0.030 200 S 0.023 0.104 0.039 0.003 0.072 0.004 0.008 0.493 0.220 0.026 0.008 201 E 0.002 0.009 0.003 0.001 0.006 0.003 0.020 0.699 0.242 0.013 0.001 202 E 0.003 0.008 0.003 0.001 0.006 0.001 0.025 0.795 0.119 0.036 0.003 203 V 0.010 0.013 0.004 0.001 0.012 0.001 0.009 0.628 0.181 0.128 0.012 204 M 0.008 0.032 0.015 0.001 0.020 0.002 0.004 0.800 0.100 0.014 0.004 205 E 0.001 0.012 0.004 0.001 0.003 0.001 0.013 0.910 0.052 0.003 0.001 206 K 0.003 0.009 0.004 0.001 0.003 0.001 0.010 0.900 0.049 0.020 0.002 207 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.928 0.064 0.003 0.001 208 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.961 0.037 0.001 0.001 209 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.989 0.008 0.001 0.001 210 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.979 0.016 0.002 0.001 211 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.954 0.045 0.001 0.001 212 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.979 0.021 0.001 0.001 213 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.979 0.018 0.001 0.001 214 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.942 0.046 0.004 0.001 215 K 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.832 0.155 0.003 0.001 216 K 0.003 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 0.075 0.659 0.116 0.119 0.015 217 R 0.004 0.751 0.158 0.002 0.028 0.003 0.043 0.008 0.002 0.002 0.001 218 D 0.034 0.002 0.002 0.003 0.006 0.005 0.004 0.004 0.004 0.359 0.576 219 Y 0.042 0.546 0.077 0.008 0.235 0.007 0.022 0.015 0.011 0.020 0.015 220 E 0.286 0.078 0.005 0.003 0.548 0.009 0.018 0.009 0.005 0.006 0.034 221 L 0.172 0.081 0.008 0.002 0.721 0.002 0.002 0.002 0.001 0.001 0.007 222 D 0.181 0.070 0.004 0.001 0.720 0.002 0.002 0.003 0.001 0.001 0.016 223 F 0.373 0.084 0.008 0.002 0.455 0.002 0.002 0.003 0.002 0.005 0.062 224 N 0.172 0.130 0.083 0.061 0.236 0.057 0.052 0.024 0.013 0.066 0.107 225 T 0.127 0.132 0.121 0.064 0.206 0.036 0.047 0.067 0.062 0.083 0.055 226 A 0.048 0.212 0.098 0.101 0.101 0.070 0.053 0.063 0.100 0.128 0.026 227 G 0.057 0.075 0.082 0.084 0.083 0.043 0.050 0.095 0.120 0.250 0.061 228 L 0.095 0.126 0.049 0.016 0.176 0.012 0.047 0.166 0.132 0.128 0.054 229 F 0.098 0.158 0.081 0.033 0.169 0.027 0.038 0.087 0.100 0.145 0.063 230 K 0.039 0.316 0.232 0.050 0.133 0.029 0.029 0.065 0.049 0.042 0.015 231 P 0.083 0.188 0.172 0.022 0.146 0.013 0.038 0.136 0.097 0.067 0.037 232 L 0.063 0.056 0.034 0.018 0.066 0.034 0.100 0.295 0.207 0.090 0.037 233 C 0.031 0.237 0.085 0.082 0.063 0.052 0.097 0.128 0.108 0.091 0.026 234 G 0.027 0.044 0.066 0.095 0.031 0.028 0.025 0.090 0.125 0.374 0.094 235 E 0.042 0.273 0.131 0.016 0.166 0.008 0.026 0.095 0.110 0.105 0.028 236 T 0.077 0.169 0.055 0.013 0.130 0.021 0.056 0.109 0.131 0.160 0.079 237 Y 0.030 0.337 0.321 0.023 0.112 0.012 0.027 0.050 0.030 0.042 0.017 238 P 0.015 0.508 0.320 0.006 0.042 0.003 0.005 0.060 0.020 0.013 0.007 239 P 0.011 0.055 0.018 0.001 0.024 0.002 0.004 0.677 0.193 0.010 0.004 240 K 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.860 0.128 0.003 0.001 241 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.973 0.018 0.004 0.001 242 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.979 0.016 0.002 0.001 243 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.967 0.033 0.001 0.001 244 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.983 0.016 0.001 0.001 245 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.980 0.016 0.001 0.001 246 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.939 0.052 0.003 0.001 247 S 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.853 0.135 0.002 0.001 248 E 0.003 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 0.081 0.671 0.092 0.124 0.017 249 L 0.003 0.831 0.111 0.001 0.027 0.002 0.017 0.004 0.001 0.002 0.001 250 Q 0.021 0.001 0.002 0.004 0.003 0.005 0.004 0.004 0.003 0.367 0.586 251 I 0.027 0.646 0.125 0.005 0.174 0.002 0.003 0.004 0.003 0.005 0.006 252 P 0.195 0.160 0.016 0.005 0.513 0.020 0.016 0.011 0.007 0.008 0.048 253 F 0.280 0.089 0.017 0.007 0.566 0.004 0.005 0.006 0.004 0.003 0.019 254 V 0.218 0.121 0.029 0.010 0.514 0.019 0.017 0.017 0.006 0.010 0.038 255 Y 0.204 0.150 0.082 0.042 0.274 0.030 0.028 0.032 0.024 0.055 0.077 256 G 0.097 0.161 0.124 0.113 0.163 0.038 0.026 0.045 0.046 0.135 0.051 257 S 0.081 0.208 0.108 0.049 0.234 0.026 0.025 0.071 0.070 0.088 0.040 258 D 0.120 0.159 0.083 0.017 0.223 0.019 0.040 0.131 0.104 0.063 0.040 259 S 0.065 0.059 0.030 0.019 0.079 0.028 0.090 0.304 0.177 0.102 0.048 260 H 0.042 0.200 0.138 0.076 0.093 0.045 0.077 0.103 0.065 0.134 0.029 261 G 0.078 0.176 0.194 0.083 0.107 0.022 0.020 0.088 0.044 0.114 0.074 262 V 0.073 0.104 0.043 0.025 0.119 0.020 0.031 0.258 0.183 0.105 0.040 263 Q 0.035 0.129 0.073 0.022 0.077 0.041 0.079 0.318 0.135 0.070 0.021 264 D 0.135 0.066 0.048 0.019 0.150 0.018 0.040 0.205 0.083 0.168 0.069 265 I 0.057 0.252 0.096 0.035 0.125 0.034 0.059 0.159 0.081 0.072 0.029 266 G 0.080 0.069 0.106 0.109 0.074 0.058 0.044 0.119 0.052 0.186 0.102 267 R 0.034 0.186 0.139 0.066 0.099 0.037 0.058 0.165 0.102 0.088 0.024 268 G 0.091 0.130 0.097 0.062 0.105 0.038 0.035 0.107 0.056 0.205 0.076 269 Y 0.096 0.098 0.035 0.023 0.157 0.017 0.021 0.202 0.180 0.113 0.057 270 S 0.037 0.081 0.046 0.021 0.078 0.046 0.056 0.313 0.237 0.065 0.020 271 T 0.061 0.074 0.029 0.011 0.113 0.014 0.053 0.272 0.212 0.131 0.031 272 Y 0.111 0.109 0.033 0.012 0.180 0.013 0.044 0.145 0.124 0.171 0.059 273 C 0.085 0.283 0.128 0.012 0.256 0.012 0.023 0.063 0.042 0.062 0.035 274 Q 0.078 0.372 0.166 0.009 0.215 0.009 0.018 0.044 0.034 0.031 0.024 275 K 0.078 0.360 0.148 0.015 0.199 0.015 0.036 0.063 0.041 0.023 0.021