# TARGET T0440 # Using neural net t04-2621-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0440.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 217 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.270 0.136 0.066 0.096 0.065 0.055 0.064 0.066 0.069 0.062 0.052 2 K 0.222 0.143 0.050 0.132 0.112 0.080 0.095 0.064 0.047 0.034 0.022 3 R 0.121 0.093 0.059 0.131 0.148 0.132 0.129 0.084 0.058 0.030 0.015 4 D 0.090 0.063 0.022 0.079 0.086 0.082 0.139 0.140 0.129 0.101 0.069 5 G 0.099 0.040 0.021 0.072 0.072 0.080 0.132 0.135 0.146 0.123 0.080 6 H 0.035 0.029 0.017 0.050 0.056 0.077 0.150 0.155 0.181 0.143 0.108 7 T 0.023 0.019 0.011 0.028 0.024 0.039 0.098 0.149 0.216 0.217 0.176 8 H 0.010 0.018 0.010 0.045 0.070 0.102 0.170 0.185 0.170 0.125 0.096 9 T 0.012 0.030 0.020 0.049 0.054 0.056 0.119 0.158 0.190 0.166 0.146 10 E 0.259 0.128 0.067 0.195 0.148 0.090 0.055 0.028 0.016 0.009 0.005 11 F 0.036 0.062 0.032 0.147 0.174 0.165 0.176 0.100 0.062 0.032 0.014 12 C 0.017 0.030 0.012 0.048 0.071 0.083 0.142 0.167 0.187 0.142 0.101 13 P 0.459 0.154 0.054 0.103 0.061 0.049 0.048 0.025 0.021 0.014 0.011 14 H 0.286 0.108 0.038 0.123 0.108 0.095 0.114 0.055 0.040 0.022 0.010 15 G 0.230 0.123 0.027 0.087 0.085 0.089 0.111 0.088 0.075 0.051 0.034 16 T 0.070 0.101 0.036 0.093 0.071 0.077 0.109 0.093 0.104 0.128 0.117 17 H 0.138 0.128 0.084 0.185 0.162 0.135 0.101 0.036 0.020 0.008 0.004 18 D 0.335 0.151 0.088 0.121 0.093 0.071 0.072 0.037 0.020 0.009 0.004 19 D 0.043 0.269 0.083 0.241 0.167 0.096 0.063 0.021 0.010 0.005 0.003 20 V 0.006 0.008 0.014 0.023 0.031 0.058 0.148 0.164 0.222 0.190 0.136 21 E 0.148 0.109 0.159 0.240 0.185 0.105 0.044 0.007 0.002 0.001 0.001 22 E 0.022 0.070 0.311 0.425 0.114 0.038 0.015 0.003 0.001 0.001 0.001 23 M 0.001 0.001 0.006 0.007 0.012 0.035 0.166 0.210 0.228 0.210 0.125 24 V 0.001 0.001 0.005 0.003 0.007 0.024 0.180 0.196 0.229 0.200 0.155 25 L 0.001 0.004 0.525 0.236 0.137 0.061 0.024 0.007 0.003 0.001 0.001 26 K 0.001 0.009 0.082 0.173 0.256 0.272 0.161 0.033 0.009 0.003 0.001 27 A 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.003 0.027 0.081 0.257 0.333 0.291 28 I 0.001 0.001 0.010 0.031 0.084 0.167 0.391 0.174 0.077 0.043 0.021 29 E 0.003 0.023 0.814 0.098 0.040 0.014 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 30 L 0.004 0.010 0.024 0.047 0.093 0.228 0.371 0.123 0.053 0.033 0.014 31 D 0.519 0.315 0.064 0.066 0.020 0.007 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 32 F 0.001 0.001 0.001 0.004 0.006 0.010 0.042 0.085 0.183 0.236 0.431 33 D 0.254 0.297 0.157 0.194 0.070 0.018 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 34 E 0.002 0.014 0.010 0.064 0.124 0.220 0.297 0.149 0.078 0.030 0.012 35 Y 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.014 0.062 0.135 0.215 0.244 0.322 36 S 0.001 0.001 0.001 0.003 0.007 0.017 0.081 0.151 0.258 0.247 0.235 37 I 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.009 0.048 0.108 0.219 0.295 0.312 38 V 0.001 0.001 0.001 0.007 0.010 0.023 0.076 0.160 0.230 0.254 0.238 39 E 0.003 0.006 0.003 0.023 0.042 0.077 0.197 0.235 0.196 0.139 0.080 40 H 0.003 0.012 0.010 0.046 0.055 0.066 0.134 0.181 0.199 0.181 0.113 41 A 0.010 0.013 0.007 0.041 0.070 0.093 0.165 0.179 0.189 0.145 0.087 42 P 0.073 0.088 0.034 0.186 0.165 0.128 0.132 0.085 0.057 0.034 0.018 43 L 0.014 0.018 0.009 0.047 0.083 0.114 0.195 0.181 0.157 0.122 0.059 44 S 0.089 0.136 0.036 0.146 0.118 0.111 0.120 0.087 0.075 0.051 0.032 45 S 0.308 0.134 0.052 0.135 0.110 0.092 0.071 0.038 0.030 0.020 0.010 46 E 0.369 0.150 0.061 0.116 0.066 0.054 0.061 0.040 0.035 0.028 0.020 47 F 0.045 0.047 0.031 0.089 0.097 0.105 0.179 0.138 0.119 0.092 0.056 48 M 0.059 0.053 0.052 0.115 0.099 0.111 0.158 0.116 0.103 0.081 0.051 49 K 0.082 0.126 0.139 0.225 0.171 0.103 0.084 0.035 0.021 0.010 0.004 50 N 0.045 0.046 0.069 0.097 0.092 0.112 0.168 0.120 0.108 0.092 0.052 51 T 0.233 0.221 0.072 0.159 0.107 0.067 0.062 0.031 0.025 0.017 0.007 52 A 0.435 0.111 0.048 0.090 0.076 0.072 0.069 0.041 0.030 0.019 0.009 53 G 0.270 0.206 0.052 0.099 0.081 0.062 0.074 0.044 0.044 0.039 0.031 54 D 0.109 0.165 0.081 0.159 0.119 0.102 0.103 0.062 0.051 0.033 0.016 55 K 0.355 0.118 0.066 0.173 0.132 0.075 0.043 0.018 0.012 0.005 0.002 56 E 0.289 0.174 0.193 0.138 0.074 0.045 0.037 0.019 0.014 0.009 0.007 57 A 0.053 0.032 0.035 0.082 0.078 0.110 0.212 0.148 0.122 0.087 0.043 58 V 0.052 0.043 0.056 0.084 0.090 0.129 0.185 0.138 0.114 0.076 0.033 59 T 0.050 0.100 0.437 0.148 0.081 0.058 0.048 0.026 0.025 0.017 0.011 60 T 0.112 0.110 0.121 0.155 0.116 0.100 0.111 0.059 0.055 0.040 0.020 61 A 0.212 0.044 0.039 0.073 0.068 0.086 0.123 0.092 0.117 0.092 0.054 62 S 0.153 0.102 0.097 0.129 0.097 0.105 0.131 0.073 0.062 0.033 0.019 63 M 0.026 0.023 0.070 0.066 0.071 0.106 0.160 0.138 0.149 0.112 0.078 64 A 0.045 0.095 0.078 0.131 0.116 0.120 0.155 0.097 0.081 0.055 0.027 65 M 0.026 0.028 0.098 0.094 0.112 0.126 0.167 0.116 0.123 0.074 0.036 66 S 0.154 0.098 0.185 0.175 0.141 0.091 0.078 0.035 0.024 0.011 0.006 67 D 0.008 0.068 0.049 0.113 0.113 0.153 0.207 0.120 0.092 0.051 0.027 68 L 0.001 0.003 0.003 0.010 0.028 0.068 0.179 0.197 0.222 0.168 0.120 69 P 0.417 0.143 0.155 0.150 0.075 0.034 0.018 0.005 0.002 0.001 0.001 70 Y 0.049 0.101 0.134 0.290 0.214 0.115 0.066 0.020 0.009 0.003 0.001 71 Y 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.010 0.060 0.132 0.247 0.282 0.261 72 F 0.001 0.001 0.003 0.018 0.064 0.163 0.298 0.183 0.144 0.079 0.048 73 K 0.043 0.051 0.742 0.112 0.035 0.011 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 74 K 0.001 0.002 0.005 0.035 0.069 0.213 0.403 0.171 0.065 0.028 0.009 75 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.025 0.090 0.221 0.312 0.349 76 N 0.010 0.019 0.147 0.294 0.245 0.176 0.081 0.017 0.006 0.002 0.001 77 H 0.006 0.031 0.469 0.238 0.144 0.075 0.029 0.005 0.002 0.001 0.001 78 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 0.087 0.142 0.246 0.282 0.230 79 K 0.001 0.001 0.003 0.014 0.032 0.078 0.302 0.244 0.196 0.096 0.034 80 K 0.005 0.017 0.723 0.175 0.059 0.016 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 81 K 0.004 0.017 0.092 0.095 0.145 0.289 0.276 0.056 0.019 0.006 0.002 82 Y 0.001 0.001 0.001 0.004 0.007 0.024 0.153 0.232 0.244 0.198 0.135 83 A 0.031 0.088 0.181 0.219 0.197 0.132 0.091 0.033 0.015 0.008 0.005 84 S 0.190 0.113 0.464 0.151 0.055 0.019 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 85 D 0.118 0.166 0.115 0.262 0.172 0.101 0.051 0.009 0.003 0.001 0.001 86 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.013 0.078 0.150 0.282 0.260 0.209 87 L 0.035 0.144 0.142 0.315 0.220 0.105 0.029 0.005 0.002 0.001 0.001 88 I 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.004 0.031 0.082 0.208 0.297 0.371 89 H 0.006 0.013 0.016 0.093 0.143 0.190 0.266 0.140 0.079 0.033 0.023 90 I 0.002 0.004 0.003 0.009 0.010 0.021 0.102 0.153 0.249 0.254 0.193 91 G 0.004 0.005 0.008 0.030 0.039 0.069 0.123 0.144 0.183 0.189 0.208 92 F 0.002 0.002 0.003 0.006 0.007 0.014 0.070 0.151 0.269 0.278 0.197 93 E 0.003 0.005 0.006 0.024 0.035 0.056 0.151 0.197 0.211 0.170 0.142 94 V 0.002 0.004 0.007 0.012 0.012 0.023 0.069 0.122 0.219 0.270 0.259 95 D 0.009 0.013 0.010 0.064 0.122 0.145 0.204 0.181 0.133 0.075 0.043 96 Y 0.008 0.019 0.016 0.042 0.047 0.064 0.144 0.174 0.212 0.177 0.098 97 L 0.013 0.017 0.014 0.063 0.084 0.105 0.183 0.165 0.164 0.118 0.072 98 I 0.055 0.062 0.039 0.131 0.135 0.144 0.177 0.108 0.081 0.045 0.023 99 G 0.205 0.181 0.071 0.151 0.120 0.086 0.076 0.046 0.031 0.022 0.010 100 Y 0.074 0.118 0.039 0.117 0.099 0.103 0.143 0.105 0.096 0.069 0.037 101 E 0.200 0.119 0.050 0.122 0.120 0.116 0.119 0.059 0.050 0.028 0.016 102 D 0.395 0.187 0.112 0.140 0.066 0.037 0.031 0.015 0.009 0.005 0.003 103 F 0.029 0.029 0.026 0.071 0.087 0.126 0.190 0.130 0.125 0.110 0.075 104 T 0.020 0.037 0.032 0.057 0.059 0.085 0.178 0.163 0.174 0.128 0.066 105 R 0.034 0.038 0.153 0.246 0.214 0.154 0.090 0.034 0.023 0.010 0.004 106 D 0.111 0.124 0.401 0.179 0.083 0.047 0.030 0.011 0.007 0.004 0.003 107 F 0.004 0.006 0.014 0.029 0.045 0.104 0.269 0.200 0.172 0.107 0.051 108 L 0.007 0.008 0.017 0.026 0.036 0.076 0.195 0.188 0.192 0.159 0.097 109 N 0.024 0.082 0.361 0.211 0.151 0.084 0.050 0.019 0.011 0.005 0.003 110 E 0.163 0.157 0.214 0.193 0.106 0.075 0.051 0.019 0.012 0.007 0.004 111 Y 0.076 0.050 0.018 0.066 0.080 0.100 0.174 0.139 0.128 0.106 0.063 112 G 0.368 0.171 0.037 0.095 0.070 0.075 0.071 0.042 0.034 0.020 0.017 113 P 0.239 0.123 0.053 0.123 0.096 0.084 0.094 0.059 0.055 0.044 0.031 114 Q 0.280 0.189 0.068 0.170 0.104 0.075 0.062 0.022 0.016 0.009 0.004 115 T 0.019 0.018 0.012 0.046 0.058 0.066 0.117 0.142 0.192 0.169 0.160 116 D 0.005 0.026 0.021 0.096 0.154 0.175 0.193 0.138 0.095 0.056 0.039 117 D 0.003 0.007 0.007 0.034 0.071 0.130 0.250 0.216 0.152 0.085 0.044 118 G 0.002 0.001 0.001 0.004 0.008 0.020 0.091 0.170 0.218 0.245 0.242 119 V 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.004 0.029 0.086 0.184 0.317 0.374 120 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.007 0.045 0.117 0.252 0.292 0.282 121 S 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.007 0.040 0.098 0.199 0.308 0.344 122 L 0.001 0.001 0.001 0.003 0.007 0.019 0.074 0.169 0.245 0.276 0.206 123 H 0.001 0.002 0.002 0.013 0.026 0.050 0.143 0.227 0.238 0.182 0.116 124 F 0.002 0.006 0.006 0.032 0.057 0.079 0.167 0.191 0.190 0.166 0.105 125 L 0.002 0.006 0.007 0.047 0.077 0.099 0.175 0.186 0.188 0.133 0.079 126 E 0.025 0.036 0.016 0.149 0.192 0.178 0.180 0.112 0.069 0.031 0.012 127 G 0.142 0.114 0.060 0.160 0.116 0.113 0.119 0.077 0.050 0.034 0.014 128 Q 0.231 0.182 0.066 0.161 0.100 0.069 0.078 0.044 0.031 0.024 0.014 129 G 0.411 0.171 0.034 0.084 0.063 0.054 0.055 0.040 0.037 0.031 0.019 130 G 0.225 0.157 0.029 0.107 0.090 0.071 0.092 0.067 0.072 0.055 0.036 131 F 0.087 0.063 0.027 0.087 0.081 0.091 0.139 0.111 0.127 0.110 0.078 132 R 0.073 0.097 0.055 0.166 0.168 0.135 0.125 0.074 0.058 0.033 0.015 133 S 0.126 0.116 0.070 0.176 0.146 0.106 0.101 0.067 0.048 0.029 0.015 134 I 0.118 0.045 0.040 0.094 0.102 0.120 0.161 0.111 0.097 0.074 0.038 135 D 0.179 0.135 0.078 0.177 0.121 0.085 0.100 0.055 0.040 0.020 0.009 136 F 0.014 0.012 0.013 0.025 0.039 0.070 0.161 0.175 0.178 0.182 0.132 137 S 0.114 0.352 0.102 0.155 0.090 0.052 0.052 0.028 0.024 0.019 0.012 138 A 0.159 0.101 0.086 0.163 0.146 0.119 0.101 0.053 0.042 0.022 0.008 139 E 0.569 0.137 0.077 0.112 0.050 0.023 0.016 0.007 0.005 0.003 0.002 140 D 0.061 0.082 0.083 0.154 0.128 0.120 0.157 0.090 0.066 0.037 0.023 141 Y 0.028 0.019 0.015 0.043 0.060 0.118 0.207 0.183 0.155 0.110 0.064 142 N 0.111 0.155 0.184 0.152 0.116 0.101 0.087 0.041 0.029 0.016 0.009 143 E 0.195 0.158 0.244 0.177 0.086 0.051 0.039 0.020 0.015 0.010 0.005 144 G 0.147 0.088 0.040 0.112 0.107 0.105 0.138 0.083 0.080 0.061 0.038 145 I 0.014 0.015 0.018 0.041 0.050 0.090 0.174 0.159 0.186 0.151 0.101 146 V 0.017 0.024 0.059 0.110 0.131 0.150 0.181 0.128 0.108 0.062 0.031 147 Q 0.029 0.065 0.174 0.185 0.142 0.122 0.120 0.071 0.050 0.026 0.016 148 F 0.019 0.015 0.025 0.045 0.051 0.086 0.194 0.172 0.163 0.142 0.088 149 Y 0.030 0.033 0.026 0.075 0.088 0.115 0.188 0.149 0.146 0.101 0.049 150 G 0.173 0.130 0.123 0.139 0.103 0.083 0.088 0.057 0.052 0.035 0.018 151 G 0.096 0.090 0.043 0.095 0.081 0.083 0.137 0.101 0.105 0.102 0.068 152 F 0.056 0.062 0.026 0.069 0.086 0.108 0.164 0.131 0.145 0.103 0.052 153 E 0.281 0.203 0.083 0.181 0.111 0.064 0.041 0.018 0.012 0.005 0.002 154 Q 0.221 0.137 0.122 0.198 0.123 0.081 0.058 0.027 0.019 0.009 0.004 155 A 0.048 0.032 0.031 0.052 0.055 0.086 0.160 0.150 0.179 0.129 0.079 156 Q 0.006 0.012 0.020 0.070 0.096 0.170 0.275 0.168 0.108 0.054 0.022 157 L 0.015 0.033 0.280 0.193 0.150 0.122 0.103 0.047 0.033 0.016 0.007 158 A 0.018 0.038 0.210 0.175 0.149 0.147 0.145 0.059 0.035 0.015 0.009 159 Y 0.001 0.001 0.003 0.006 0.009 0.023 0.118 0.181 0.265 0.251 0.144 160 L 0.001 0.001 0.005 0.011 0.031 0.087 0.250 0.202 0.195 0.133 0.087 161 E 0.008 0.028 0.513 0.230 0.128 0.056 0.023 0.007 0.004 0.001 0.001 162 G 0.002 0.016 0.035 0.122 0.192 0.252 0.241 0.086 0.036 0.013 0.004 163 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.028 0.091 0.260 0.340 0.277 164 K 0.001 0.003 0.012 0.069 0.183 0.303 0.293 0.084 0.036 0.011 0.004 165 Q 0.018 0.053 0.623 0.201 0.065 0.026 0.010 0.002 0.001 0.001 0.001 166 S 0.001 0.001 0.003 0.013 0.028 0.093 0.311 0.230 0.168 0.108 0.046 167 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.028 0.104 0.243 0.333 0.288 168 E 0.001 0.005 0.181 0.224 0.255 0.195 0.093 0.026 0.012 0.004 0.002 169 A 0.004 0.021 0.365 0.182 0.149 0.146 0.086 0.026 0.013 0.006 0.003 170 D 0.001 0.001 0.002 0.005 0.010 0.038 0.188 0.211 0.227 0.193 0.124 171 L 0.005 0.004 0.007 0.014 0.018 0.046 0.163 0.207 0.227 0.199 0.109 172 G 0.048 0.102 0.398 0.196 0.121 0.065 0.039 0.016 0.009 0.004 0.003 173 L 0.072 0.106 0.102 0.185 0.142 0.136 0.122 0.060 0.038 0.023 0.014 174 F 0.103 0.055 0.022 0.066 0.075 0.092 0.147 0.124 0.127 0.112 0.076 175 K 0.109 0.186 0.068 0.211 0.167 0.123 0.085 0.026 0.015 0.006 0.003 176 P 0.006 0.003 0.003 0.008 0.012 0.017 0.053 0.110 0.217 0.259 0.312 177 R 0.026 0.079 0.053 0.228 0.220 0.168 0.138 0.052 0.024 0.008 0.004 178 R 0.003 0.012 0.010 0.054 0.083 0.141 0.275 0.183 0.138 0.070 0.032 179 M 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.007 0.028 0.076 0.173 0.281 0.426 180 G 0.001 0.002 0.002 0.010 0.018 0.039 0.158 0.210 0.251 0.184 0.124 181 H 0.001 0.002 0.002 0.010 0.013 0.028 0.111 0.177 0.255 0.247 0.156 182 I 0.001 0.001 0.003 0.009 0.010 0.021 0.072 0.123 0.216 0.274 0.270 183 S 0.004 0.008 0.011 0.058 0.086 0.107 0.192 0.203 0.167 0.105 0.056 184 L 0.001 0.004 0.005 0.017 0.019 0.030 0.109 0.175 0.273 0.248 0.118 185 C 0.001 0.002 0.004 0.021 0.031 0.055 0.122 0.174 0.266 0.204 0.121 186 Q 0.005 0.011 0.027 0.083 0.117 0.159 0.233 0.159 0.124 0.059 0.023 187 K 0.005 0.015 0.022 0.090 0.144 0.193 0.256 0.150 0.082 0.034 0.010 188 F 0.002 0.005 0.005 0.018 0.022 0.045 0.132 0.197 0.243 0.217 0.114 189 Q 0.023 0.038 0.036 0.153 0.184 0.166 0.181 0.112 0.062 0.031 0.013 190 Q 0.113 0.142 0.199 0.211 0.131 0.082 0.062 0.030 0.018 0.009 0.003 191 F 0.020 0.033 0.023 0.087 0.097 0.121 0.212 0.157 0.121 0.090 0.040 192 F 0.054 0.051 0.023 0.065 0.076 0.102 0.182 0.147 0.135 0.105 0.060 193 G 0.204 0.175 0.095 0.162 0.109 0.079 0.080 0.041 0.029 0.017 0.009 194 E 0.268 0.118 0.074 0.134 0.100 0.084 0.088 0.050 0.040 0.031 0.014 195 D 0.345 0.263 0.063 0.120 0.074 0.045 0.037 0.019 0.017 0.010 0.005 196 T 0.139 0.091 0.053 0.130 0.120 0.106 0.132 0.085 0.073 0.047 0.023 197 S 0.373 0.166 0.080 0.147 0.083 0.053 0.049 0.021 0.016 0.009 0.004 198 D 0.339 0.194 0.135 0.145 0.087 0.045 0.030 0.013 0.008 0.003 0.001 199 F 0.020 0.034 0.015 0.042 0.057 0.101 0.177 0.161 0.154 0.140 0.100 200 S 0.038 0.139 0.044 0.110 0.150 0.145 0.168 0.088 0.064 0.037 0.017 201 E 0.570 0.131 0.146 0.098 0.036 0.011 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 202 E 0.217 0.178 0.113 0.248 0.135 0.064 0.033 0.007 0.003 0.001 0.001 203 V 0.001 0.002 0.004 0.008 0.011 0.038 0.148 0.210 0.255 0.197 0.126 204 M 0.003 0.005 0.017 0.084 0.195 0.281 0.289 0.083 0.032 0.009 0.003 205 E 0.054 0.041 0.857 0.039 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 206 K 0.001 0.001 0.013 0.042 0.085 0.244 0.392 0.135 0.056 0.025 0.007 207 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.026 0.091 0.212 0.310 0.360 208 R 0.001 0.003 0.097 0.244 0.342 0.241 0.059 0.010 0.003 0.001 0.001 209 V 0.001 0.021 0.458 0.211 0.170 0.094 0.036 0.006 0.002 0.001 0.001 210 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.047 0.118 0.263 0.317 0.251 211 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 0.122 0.171 0.227 0.255 0.214 212 A 0.001 0.008 0.454 0.335 0.145 0.040 0.011 0.004 0.002 0.001 0.001 213 L 0.001 0.001 0.004 0.016 0.059 0.257 0.475 0.128 0.041 0.015 0.004 214 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.040 0.177 0.358 0.419 215 K 0.001 0.002 0.007 0.058 0.156 0.259 0.339 0.113 0.044 0.014 0.007 216 K 0.011 0.044 0.663 0.169 0.069 0.029 0.011 0.003 0.001 0.001 0.001 217 R 0.005 0.012 0.007 0.060 0.109 0.238 0.398 0.118 0.038 0.014 0.003 218 D 0.635 0.203 0.025 0.069 0.029 0.017 0.012 0.006 0.003 0.001 0.001 219 Y 0.003 0.016 0.015 0.057 0.104 0.131 0.204 0.192 0.137 0.091 0.051 220 E 0.019 0.048 0.024 0.116 0.171 0.240 0.212 0.084 0.048 0.023 0.014 221 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.006 0.042 0.117 0.256 0.292 0.280 222 D 0.007 0.006 0.006 0.028 0.044 0.087 0.197 0.177 0.172 0.139 0.136 223 F 0.003 0.003 0.005 0.007 0.006 0.010 0.039 0.091 0.199 0.288 0.348 224 N 0.002 0.003 0.004 0.019 0.026 0.050 0.135 0.176 0.210 0.199 0.177 225 T 0.002 0.006 0.012 0.018 0.017 0.027 0.084 0.134 0.214 0.258 0.229 226 A 0.009 0.014 0.021 0.055 0.079 0.111 0.189 0.165 0.165 0.119 0.073 227 G 0.027 0.035 0.038 0.088 0.083 0.098 0.167 0.145 0.149 0.102 0.068 228 L 0.023 0.022 0.020 0.049 0.062 0.080 0.155 0.152 0.180 0.153 0.102 229 F 0.022 0.036 0.030 0.084 0.083 0.102 0.159 0.135 0.151 0.108 0.089 230 K 0.057 0.077 0.036 0.115 0.147 0.142 0.154 0.111 0.091 0.049 0.021 231 P 0.288 0.137 0.061 0.133 0.099 0.080 0.080 0.054 0.038 0.021 0.010 232 L 0.160 0.093 0.043 0.121 0.126 0.108 0.137 0.084 0.064 0.041 0.022 233 C 0.035 0.037 0.016 0.054 0.056 0.076 0.153 0.168 0.163 0.137 0.105 234 G 0.199 0.138 0.047 0.131 0.123 0.096 0.099 0.064 0.051 0.032 0.019 235 E 0.127 0.069 0.030 0.073 0.065 0.079 0.144 0.132 0.119 0.101 0.060 236 T 0.170 0.072 0.021 0.084 0.081 0.080 0.135 0.108 0.114 0.083 0.052 237 Y 0.022 0.022 0.010 0.042 0.069 0.090 0.172 0.176 0.180 0.127 0.089 238 P 0.009 0.132 0.031 0.101 0.105 0.117 0.156 0.121 0.105 0.077 0.046 239 P 0.014 0.034 0.014 0.081 0.175 0.203 0.206 0.124 0.080 0.043 0.025 240 K 0.451 0.200 0.055 0.140 0.092 0.039 0.016 0.004 0.002 0.001 0.001 241 K 0.019 0.075 0.044 0.310 0.238 0.167 0.097 0.031 0.012 0.003 0.002 242 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.033 0.111 0.241 0.301 0.306 243 V 0.001 0.001 0.002 0.009 0.024 0.067 0.191 0.181 0.201 0.173 0.152 244 T 0.002 0.013 0.435 0.299 0.142 0.068 0.028 0.008 0.004 0.002 0.001 245 L 0.001 0.001 0.002 0.012 0.027 0.108 0.342 0.229 0.136 0.093 0.050 246 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.017 0.073 0.199 0.348 0.361 247 S 0.002 0.009 0.061 0.154 0.196 0.233 0.210 0.077 0.035 0.014 0.009 248 E 0.013 0.049 0.494 0.213 0.117 0.070 0.029 0.008 0.004 0.002 0.001 249 L 0.001 0.002 0.001 0.011 0.024 0.082 0.306 0.234 0.157 0.120 0.061 250 Q 0.461 0.305 0.052 0.113 0.040 0.016 0.008 0.002 0.001 0.001 0.001 251 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.023 0.072 0.190 0.265 0.442 252 P 0.076 0.157 0.071 0.267 0.198 0.127 0.069 0.019 0.008 0.003 0.003 253 F 0.001 0.001 0.001 0.003 0.007 0.020 0.101 0.187 0.281 0.209 0.189 254 V 0.001 0.001 0.001 0.004 0.007 0.021 0.077 0.132 0.192 0.221 0.345 255 Y 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.008 0.041 0.108 0.242 0.279 0.314 256 G 0.002 0.003 0.002 0.011 0.013 0.027 0.087 0.139 0.212 0.228 0.276 257 S 0.002 0.003 0.002 0.009 0.011 0.023 0.069 0.146 0.214 0.260 0.262 258 D 0.006 0.012 0.006 0.040 0.072 0.092 0.188 0.204 0.172 0.120 0.089 259 S 0.013 0.016 0.009 0.033 0.037 0.052 0.096 0.126 0.181 0.193 0.244 260 H 0.012 0.012 0.006 0.040 0.079 0.109 0.173 0.162 0.158 0.136 0.113 261 G 0.046 0.096 0.032 0.130 0.125 0.115 0.147 0.105 0.096 0.061 0.046 262 V 0.017 0.014 0.011 0.034 0.048 0.069 0.128 0.141 0.183 0.182 0.173 263 Q 0.341 0.143 0.083 0.192 0.104 0.060 0.039 0.016 0.010 0.005 0.005 264 D 0.019 0.048 0.035 0.112 0.135 0.185 0.209 0.114 0.077 0.044 0.023 265 I 0.004 0.006 0.005 0.013 0.015 0.022 0.062 0.114 0.209 0.259 0.291 266 G 0.055 0.040 0.030 0.066 0.079 0.104 0.191 0.129 0.127 0.091 0.088 267 R 0.132 0.151 0.139 0.223 0.137 0.085 0.068 0.030 0.019 0.011 0.005 268 G 0.167 0.208 0.079 0.180 0.143 0.103 0.068 0.025 0.015 0.008 0.004 269 Y 0.016 0.018 0.013 0.036 0.041 0.058 0.128 0.142 0.198 0.193 0.158 270 S 0.149 0.160 0.106 0.185 0.142 0.103 0.087 0.032 0.021 0.010 0.005 271 T 0.163 0.192 0.176 0.218 0.109 0.063 0.046 0.018 0.009 0.003 0.001 272 Y 0.024 0.013 0.016 0.036 0.049 0.095 0.219 0.192 0.157 0.126 0.073 273 C 0.022 0.025 0.045 0.089 0.097 0.121 0.173 0.136 0.138 0.100 0.054 274 Q 0.086 0.144 0.214 0.220 0.148 0.081 0.057 0.026 0.016 0.006 0.002 275 K 0.158 0.128 0.103 0.153 0.122 0.106 0.099 0.061 0.037 0.024 0.010