# TARGET T0440 # Using neural net t04-2621-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0440.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1471 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.409 0.181 0.060 0.088 0.053 0.038 0.037 0.037 0.037 0.032 0.027 2 K 0.282 0.147 0.035 0.106 0.093 0.067 0.086 0.062 0.051 0.041 0.030 3 R 0.175 0.106 0.042 0.122 0.137 0.120 0.121 0.078 0.055 0.029 0.015 4 D 0.122 0.071 0.024 0.093 0.105 0.097 0.137 0.121 0.103 0.076 0.051 5 G 0.076 0.037 0.022 0.083 0.073 0.078 0.123 0.130 0.145 0.136 0.096 6 H 0.021 0.025 0.015 0.051 0.062 0.088 0.163 0.167 0.183 0.134 0.091 7 T 0.015 0.013 0.008 0.020 0.018 0.032 0.093 0.157 0.229 0.230 0.186 8 H 0.008 0.015 0.009 0.045 0.072 0.109 0.177 0.178 0.157 0.125 0.105 9 T 0.005 0.014 0.011 0.031 0.039 0.047 0.100 0.149 0.206 0.206 0.191 10 E 0.136 0.118 0.055 0.210 0.195 0.118 0.079 0.044 0.024 0.013 0.008 11 F 0.010 0.019 0.013 0.060 0.083 0.112 0.208 0.177 0.151 0.110 0.058 12 C 0.019 0.033 0.017 0.076 0.108 0.115 0.178 0.150 0.141 0.097 0.066 13 P 0.324 0.152 0.066 0.140 0.082 0.068 0.071 0.037 0.029 0.020 0.012 14 H 0.263 0.090 0.037 0.113 0.094 0.085 0.122 0.072 0.058 0.043 0.022 15 G 0.244 0.103 0.022 0.072 0.070 0.070 0.112 0.095 0.096 0.073 0.043 16 T 0.236 0.235 0.051 0.135 0.093 0.072 0.066 0.037 0.032 0.027 0.016 17 H 0.224 0.128 0.048 0.157 0.129 0.107 0.096 0.048 0.034 0.019 0.010 18 D 0.276 0.104 0.033 0.098 0.110 0.100 0.119 0.076 0.050 0.026 0.010 19 D 0.038 0.399 0.089 0.225 0.130 0.062 0.033 0.013 0.007 0.003 0.001 20 V 0.005 0.009 0.006 0.024 0.047 0.090 0.170 0.193 0.206 0.153 0.096 21 E 0.300 0.153 0.085 0.189 0.158 0.075 0.031 0.006 0.002 0.001 0.001 22 E 0.027 0.100 0.171 0.461 0.157 0.054 0.024 0.005 0.001 0.001 0.001 23 M 0.001 0.001 0.001 0.004 0.007 0.018 0.090 0.171 0.238 0.264 0.205 24 V 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 0.027 0.150 0.186 0.223 0.211 0.192 25 L 0.001 0.005 0.444 0.280 0.149 0.076 0.031 0.009 0.004 0.002 0.001 26 K 0.001 0.002 0.021 0.084 0.161 0.296 0.313 0.082 0.025 0.011 0.004 27 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.049 0.188 0.344 0.406 28 I 0.001 0.001 0.007 0.029 0.078 0.173 0.361 0.185 0.091 0.050 0.026 29 E 0.003 0.021 0.787 0.116 0.045 0.018 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 30 L 0.001 0.004 0.009 0.024 0.057 0.195 0.441 0.151 0.063 0.038 0.015 31 D 0.487 0.330 0.065 0.079 0.022 0.008 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 32 F 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.007 0.030 0.072 0.162 0.228 0.493 33 D 0.198 0.264 0.164 0.230 0.099 0.030 0.012 0.002 0.001 0.001 0.001 34 E 0.001 0.007 0.005 0.040 0.095 0.206 0.334 0.169 0.093 0.034 0.014 35 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.028 0.083 0.171 0.268 0.444 36 S 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.015 0.073 0.139 0.244 0.256 0.264 37 I 0.001 0.001 0.001 0.004 0.004 0.010 0.047 0.103 0.208 0.285 0.338 38 V 0.001 0.001 0.001 0.005 0.008 0.019 0.070 0.148 0.208 0.262 0.278 39 E 0.008 0.016 0.010 0.059 0.099 0.124 0.212 0.190 0.134 0.088 0.059 40 H 0.008 0.017 0.011 0.056 0.081 0.087 0.163 0.173 0.178 0.142 0.084 41 A 0.044 0.034 0.018 0.086 0.114 0.125 0.183 0.141 0.127 0.083 0.046 42 P 0.201 0.104 0.041 0.137 0.103 0.091 0.125 0.074 0.063 0.040 0.021 43 L 0.063 0.042 0.018 0.065 0.087 0.110 0.166 0.157 0.124 0.115 0.053 44 S 0.076 0.343 0.036 0.104 0.071 0.070 0.076 0.059 0.065 0.059 0.041 45 S 0.041 0.039 0.017 0.080 0.130 0.176 0.178 0.118 0.113 0.072 0.036 46 E 0.746 0.113 0.041 0.052 0.022 0.010 0.007 0.003 0.003 0.002 0.001 47 F 0.034 0.061 0.049 0.203 0.191 0.141 0.137 0.079 0.054 0.031 0.021 48 M 0.010 0.005 0.005 0.009 0.011 0.024 0.079 0.137 0.235 0.271 0.214 49 K 0.007 0.013 0.062 0.170 0.219 0.242 0.173 0.061 0.036 0.014 0.004 50 N 0.015 0.044 0.723 0.114 0.042 0.026 0.017 0.008 0.006 0.004 0.002 51 T 0.006 0.009 0.017 0.048 0.071 0.146 0.287 0.155 0.119 0.088 0.054 52 A 0.008 0.004 0.007 0.008 0.009 0.027 0.104 0.155 0.209 0.255 0.213 53 G 0.044 0.109 0.211 0.219 0.180 0.121 0.068 0.025 0.014 0.006 0.004 54 D 0.210 0.151 0.277 0.159 0.081 0.051 0.032 0.015 0.011 0.007 0.006 55 K 0.155 0.099 0.045 0.136 0.129 0.117 0.143 0.071 0.054 0.036 0.016 56 E 0.441 0.168 0.070 0.116 0.075 0.058 0.037 0.014 0.011 0.006 0.004 57 A 0.008 0.008 0.005 0.021 0.029 0.042 0.099 0.141 0.205 0.213 0.230 58 V 0.026 0.070 0.047 0.141 0.148 0.156 0.176 0.098 0.075 0.039 0.025 59 T 0.015 0.011 0.009 0.025 0.030 0.041 0.092 0.140 0.222 0.200 0.214 60 T 0.018 0.013 0.007 0.031 0.041 0.069 0.142 0.164 0.180 0.169 0.167 61 A 0.015 0.016 0.011 0.045 0.059 0.081 0.147 0.169 0.208 0.150 0.099 62 S 0.023 0.019 0.014 0.035 0.038 0.059 0.115 0.129 0.171 0.184 0.214 63 M 0.008 0.006 0.005 0.014 0.016 0.027 0.073 0.131 0.208 0.261 0.251 64 A 0.011 0.016 0.010 0.036 0.056 0.085 0.179 0.175 0.184 0.141 0.109 65 M 0.011 0.014 0.017 0.032 0.034 0.048 0.104 0.131 0.196 0.212 0.201 66 S 0.055 0.039 0.039 0.099 0.122 0.121 0.170 0.127 0.105 0.072 0.050 67 D 0.058 0.105 0.054 0.155 0.130 0.121 0.141 0.088 0.074 0.047 0.028 68 L 0.008 0.013 0.007 0.023 0.035 0.063 0.139 0.161 0.197 0.195 0.159 69 P 0.315 0.155 0.076 0.166 0.107 0.068 0.055 0.024 0.017 0.010 0.007 70 Y 0.223 0.125 0.066 0.137 0.120 0.092 0.100 0.058 0.041 0.025 0.014 71 Y 0.025 0.068 0.026 0.087 0.086 0.107 0.174 0.134 0.135 0.094 0.063 72 F 0.007 0.009 0.009 0.035 0.064 0.110 0.196 0.171 0.180 0.132 0.088 73 K 0.181 0.144 0.249 0.211 0.109 0.052 0.031 0.011 0.006 0.003 0.002 74 K 0.038 0.089 0.095 0.196 0.156 0.149 0.142 0.064 0.042 0.020 0.009 75 M 0.003 0.003 0.004 0.010 0.017 0.041 0.131 0.181 0.238 0.219 0.153 76 N 0.135 0.109 0.149 0.243 0.139 0.092 0.071 0.029 0.019 0.010 0.005 77 H 0.038 0.080 0.335 0.169 0.131 0.100 0.079 0.031 0.021 0.010 0.006 78 I 0.003 0.004 0.005 0.014 0.020 0.052 0.163 0.175 0.209 0.201 0.155 79 K 0.032 0.036 0.039 0.120 0.144 0.170 0.224 0.114 0.077 0.034 0.012 80 K 0.054 0.083 0.450 0.191 0.098 0.056 0.035 0.014 0.010 0.005 0.003 81 K 0.109 0.122 0.121 0.184 0.151 0.128 0.104 0.041 0.023 0.012 0.006 82 Y 0.009 0.009 0.006 0.017 0.026 0.062 0.154 0.177 0.204 0.191 0.146 83 A 0.100 0.190 0.119 0.177 0.152 0.109 0.084 0.034 0.021 0.010 0.005 84 S 0.274 0.133 0.154 0.157 0.093 0.067 0.054 0.026 0.021 0.013 0.007 85 D 0.214 0.137 0.074 0.181 0.132 0.093 0.083 0.035 0.026 0.015 0.010 86 L 0.015 0.013 0.012 0.033 0.038 0.071 0.155 0.161 0.207 0.167 0.127 87 L 0.029 0.049 0.071 0.142 0.157 0.184 0.158 0.088 0.065 0.036 0.021 88 I 0.008 0.012 0.036 0.045 0.049 0.072 0.147 0.160 0.184 0.156 0.132 89 H 0.017 0.023 0.039 0.074 0.085 0.106 0.200 0.160 0.140 0.094 0.062 90 I 0.014 0.017 0.028 0.061 0.062 0.083 0.157 0.147 0.177 0.150 0.103 91 G 0.080 0.099 0.096 0.166 0.141 0.123 0.106 0.066 0.058 0.040 0.026 92 F 0.013 0.018 0.020 0.037 0.042 0.059 0.128 0.152 0.203 0.187 0.140 93 E 0.035 0.042 0.034 0.076 0.086 0.096 0.178 0.140 0.137 0.100 0.076 94 V 0.043 0.042 0.041 0.085 0.085 0.108 0.169 0.129 0.133 0.098 0.068 95 D 0.100 0.096 0.076 0.164 0.144 0.122 0.117 0.069 0.052 0.035 0.024 96 Y 0.015 0.018 0.015 0.035 0.041 0.059 0.128 0.142 0.195 0.194 0.157 97 L 0.052 0.054 0.039 0.093 0.099 0.120 0.180 0.125 0.109 0.077 0.051 98 I 0.140 0.100 0.069 0.135 0.120 0.101 0.120 0.077 0.067 0.045 0.027 99 G 0.197 0.157 0.072 0.130 0.106 0.086 0.090 0.056 0.046 0.036 0.025 100 Y 0.043 0.067 0.036 0.097 0.092 0.104 0.167 0.124 0.120 0.098 0.053 101 E 0.149 0.103 0.069 0.170 0.162 0.134 0.110 0.046 0.034 0.016 0.008 102 D 0.319 0.149 0.190 0.139 0.069 0.047 0.043 0.020 0.013 0.007 0.004 103 F 0.014 0.024 0.025 0.065 0.087 0.138 0.205 0.137 0.129 0.110 0.066 104 T 0.008 0.018 0.012 0.020 0.026 0.052 0.158 0.184 0.234 0.187 0.101 105 R 0.029 0.034 0.156 0.289 0.246 0.147 0.064 0.019 0.011 0.004 0.002 106 D 0.077 0.104 0.416 0.188 0.095 0.057 0.038 0.012 0.007 0.004 0.003 107 F 0.001 0.002 0.007 0.020 0.030 0.077 0.230 0.221 0.220 0.133 0.060 108 L 0.001 0.001 0.006 0.008 0.015 0.041 0.153 0.195 0.242 0.221 0.116 109 N 0.006 0.035 0.501 0.230 0.128 0.056 0.027 0.010 0.005 0.002 0.001 110 E 0.060 0.101 0.285 0.187 0.136 0.118 0.077 0.020 0.011 0.005 0.002 111 Y 0.009 0.006 0.004 0.015 0.022 0.049 0.148 0.174 0.200 0.224 0.149 112 G 0.121 0.160 0.029 0.107 0.113 0.128 0.148 0.088 0.061 0.031 0.014 113 P 0.255 0.134 0.118 0.127 0.090 0.066 0.064 0.045 0.042 0.034 0.024 114 Q 0.128 0.107 0.035 0.144 0.134 0.120 0.161 0.078 0.047 0.030 0.015 115 T 0.121 0.084 0.046 0.101 0.093 0.100 0.114 0.098 0.103 0.075 0.063 116 D 0.156 0.135 0.060 0.159 0.129 0.107 0.092 0.059 0.046 0.033 0.024 117 D 0.241 0.159 0.071 0.145 0.107 0.090 0.085 0.046 0.030 0.017 0.008 118 G 0.054 0.056 0.024 0.089 0.116 0.134 0.189 0.132 0.102 0.067 0.037 119 V 0.003 0.004 0.002 0.013 0.017 0.026 0.075 0.120 0.192 0.245 0.300 120 L 0.004 0.008 0.009 0.036 0.057 0.094 0.191 0.176 0.193 0.137 0.097 121 S 0.014 0.023 0.026 0.079 0.072 0.092 0.149 0.148 0.156 0.137 0.105 122 L 0.005 0.006 0.006 0.023 0.039 0.082 0.144 0.184 0.203 0.184 0.125 123 H 0.005 0.012 0.008 0.037 0.052 0.071 0.154 0.195 0.191 0.156 0.118 124 F 0.007 0.012 0.016 0.034 0.040 0.054 0.133 0.145 0.176 0.211 0.172 125 L 0.021 0.030 0.046 0.125 0.117 0.124 0.158 0.117 0.108 0.089 0.065 126 E 0.061 0.066 0.037 0.159 0.166 0.140 0.143 0.091 0.072 0.044 0.021 127 G 0.129 0.072 0.063 0.093 0.068 0.083 0.120 0.102 0.101 0.098 0.071 128 Q 0.174 0.156 0.074 0.154 0.110 0.084 0.103 0.054 0.042 0.030 0.019 129 G 0.189 0.094 0.035 0.080 0.073 0.082 0.090 0.087 0.100 0.093 0.077 130 G 0.124 0.134 0.039 0.133 0.111 0.084 0.109 0.076 0.077 0.062 0.052 131 F 0.122 0.046 0.033 0.066 0.053 0.057 0.099 0.097 0.142 0.149 0.137 132 R 0.140 0.102 0.048 0.141 0.148 0.124 0.114 0.071 0.059 0.035 0.018 133 S 0.132 0.111 0.061 0.137 0.105 0.095 0.102 0.082 0.076 0.056 0.043 134 I 0.106 0.043 0.032 0.066 0.079 0.099 0.153 0.118 0.120 0.108 0.077 135 D 0.143 0.117 0.061 0.136 0.099 0.083 0.116 0.084 0.077 0.053 0.031 136 F 0.016 0.013 0.010 0.031 0.050 0.075 0.150 0.170 0.179 0.179 0.128 137 S 0.098 0.211 0.071 0.146 0.098 0.077 0.095 0.060 0.058 0.048 0.039 138 A 0.042 0.030 0.033 0.095 0.117 0.131 0.170 0.131 0.122 0.086 0.044 139 E 0.343 0.144 0.084 0.153 0.091 0.058 0.052 0.027 0.024 0.014 0.009 140 D 0.033 0.075 0.063 0.152 0.144 0.137 0.168 0.102 0.068 0.038 0.021 141 Y 0.006 0.005 0.003 0.009 0.014 0.032 0.090 0.137 0.207 0.254 0.243 142 N 0.020 0.053 0.039 0.111 0.149 0.159 0.201 0.111 0.087 0.048 0.023 143 E 0.117 0.109 0.301 0.262 0.109 0.051 0.027 0.011 0.008 0.004 0.002 144 G 0.115 0.072 0.054 0.138 0.120 0.118 0.143 0.080 0.069 0.049 0.042 145 I 0.008 0.007 0.011 0.022 0.027 0.060 0.166 0.201 0.225 0.167 0.105 146 V 0.007 0.012 0.036 0.063 0.092 0.151 0.248 0.161 0.123 0.072 0.035 147 Q 0.033 0.093 0.446 0.173 0.102 0.062 0.044 0.021 0.015 0.008 0.005 148 F 0.038 0.040 0.044 0.095 0.111 0.147 0.224 0.126 0.092 0.057 0.025 149 Y 0.049 0.028 0.016 0.040 0.047 0.069 0.160 0.146 0.180 0.153 0.111 150 G 0.236 0.145 0.071 0.127 0.112 0.098 0.087 0.052 0.039 0.024 0.011 151 G 0.161 0.357 0.065 0.139 0.090 0.061 0.050 0.030 0.023 0.016 0.009 152 F 0.027 0.027 0.011 0.046 0.080 0.128 0.197 0.159 0.161 0.104 0.059 153 E 0.351 0.151 0.063 0.144 0.110 0.080 0.060 0.021 0.013 0.005 0.003 154 Q 0.086 0.116 0.146 0.296 0.158 0.092 0.060 0.024 0.014 0.005 0.003 155 A 0.004 0.003 0.006 0.009 0.012 0.027 0.095 0.156 0.239 0.247 0.202 156 Q 0.002 0.002 0.011 0.025 0.046 0.107 0.256 0.212 0.171 0.110 0.058 157 L 0.003 0.014 0.476 0.229 0.133 0.075 0.040 0.015 0.009 0.005 0.002 158 A 0.005 0.015 0.091 0.114 0.158 0.227 0.228 0.084 0.042 0.023 0.013 159 Y 0.001 0.001 0.002 0.002 0.003 0.008 0.062 0.135 0.268 0.308 0.211 160 L 0.001 0.002 0.007 0.019 0.046 0.120 0.261 0.185 0.170 0.117 0.072 161 E 0.050 0.069 0.594 0.172 0.067 0.026 0.012 0.004 0.003 0.001 0.001 162 G 0.006 0.017 0.024 0.060 0.105 0.196 0.314 0.137 0.080 0.045 0.017 163 V 0.002 0.002 0.002 0.004 0.004 0.010 0.044 0.099 0.240 0.317 0.278 164 K 0.011 0.020 0.031 0.127 0.201 0.276 0.204 0.070 0.040 0.016 0.006 165 Q 0.024 0.061 0.385 0.245 0.120 0.077 0.049 0.019 0.012 0.005 0.002 166 S 0.004 0.005 0.008 0.020 0.025 0.050 0.159 0.178 0.215 0.190 0.146 167 I 0.003 0.001 0.004 0.009 0.012 0.035 0.112 0.172 0.249 0.245 0.156 168 E 0.005 0.024 0.170 0.221 0.239 0.157 0.103 0.045 0.023 0.008 0.003 169 A 0.010 0.027 0.179 0.104 0.106 0.152 0.178 0.096 0.077 0.045 0.026 170 D 0.018 0.018 0.016 0.050 0.063 0.101 0.235 0.178 0.146 0.113 0.061 171 L 0.034 0.047 0.027 0.087 0.085 0.121 0.185 0.147 0.126 0.093 0.046 172 G 0.344 0.170 0.130 0.129 0.083 0.050 0.038 0.022 0.016 0.011 0.007 173 L 0.106 0.088 0.043 0.146 0.126 0.111 0.163 0.087 0.064 0.043 0.023 174 F 0.039 0.036 0.014 0.039 0.053 0.081 0.143 0.143 0.184 0.156 0.112 175 K 0.109 0.204 0.077 0.242 0.154 0.094 0.060 0.027 0.019 0.009 0.006 176 P 0.116 0.043 0.029 0.057 0.070 0.086 0.140 0.127 0.137 0.112 0.083 177 R 0.182 0.215 0.088 0.203 0.127 0.074 0.056 0.025 0.017 0.008 0.004 178 R 0.026 0.028 0.014 0.073 0.097 0.143 0.231 0.152 0.118 0.078 0.040 179 M 0.025 0.026 0.029 0.081 0.097 0.104 0.153 0.143 0.143 0.116 0.084 180 G 0.020 0.074 0.054 0.142 0.138 0.138 0.166 0.108 0.085 0.047 0.026 181 H 0.001 0.002 0.001 0.009 0.016 0.035 0.122 0.185 0.250 0.234 0.145 182 I 0.002 0.003 0.004 0.022 0.055 0.114 0.208 0.166 0.184 0.139 0.102 183 S 0.056 0.088 0.153 0.288 0.179 0.100 0.073 0.031 0.019 0.008 0.005 184 L 0.001 0.002 0.003 0.018 0.025 0.050 0.165 0.215 0.242 0.189 0.090 185 C 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.009 0.038 0.098 0.225 0.315 0.309 186 Q 0.003 0.010 0.095 0.200 0.230 0.204 0.153 0.058 0.031 0.011 0.005 187 K 0.002 0.019 0.104 0.151 0.181 0.218 0.197 0.073 0.035 0.015 0.006 188 F 0.001 0.001 0.001 0.003 0.006 0.023 0.123 0.196 0.248 0.247 0.152 189 Q 0.070 0.050 0.027 0.121 0.118 0.142 0.202 0.130 0.080 0.040 0.019 190 Q 0.144 0.139 0.319 0.199 0.092 0.048 0.028 0.013 0.009 0.005 0.003 191 F 0.019 0.037 0.025 0.080 0.094 0.140 0.232 0.152 0.112 0.076 0.033 192 F 0.032 0.033 0.012 0.032 0.040 0.064 0.145 0.166 0.202 0.165 0.111 193 G 0.077 0.075 0.036 0.084 0.091 0.109 0.157 0.118 0.117 0.084 0.053 194 E 0.203 0.097 0.075 0.152 0.115 0.093 0.093 0.061 0.050 0.038 0.022 195 D 0.098 0.080 0.031 0.105 0.116 0.117 0.147 0.109 0.102 0.061 0.034 196 T 0.021 0.035 0.022 0.058 0.063 0.094 0.165 0.169 0.170 0.131 0.073 197 S 0.230 0.117 0.086 0.155 0.114 0.085 0.086 0.049 0.040 0.025 0.012 198 D 0.421 0.147 0.103 0.113 0.071 0.047 0.043 0.024 0.016 0.009 0.005 199 F 0.014 0.017 0.010 0.035 0.049 0.085 0.179 0.172 0.190 0.155 0.095 200 S 0.019 0.039 0.025 0.056 0.072 0.109 0.191 0.151 0.156 0.113 0.069 201 E 0.242 0.132 0.297 0.194 0.079 0.031 0.015 0.005 0.003 0.001 0.001 202 E 0.225 0.128 0.151 0.163 0.123 0.088 0.063 0.026 0.018 0.009 0.006 203 V 0.002 0.010 0.008 0.018 0.021 0.060 0.168 0.188 0.216 0.181 0.128 204 M 0.004 0.008 0.015 0.058 0.139 0.240 0.318 0.125 0.063 0.022 0.008 205 E 0.134 0.082 0.703 0.058 0.015 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 206 K 0.001 0.009 0.024 0.113 0.164 0.259 0.267 0.096 0.045 0.017 0.006 207 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.019 0.070 0.199 0.313 0.397 208 R 0.002 0.007 0.070 0.246 0.334 0.254 0.070 0.011 0.004 0.001 0.001 209 V 0.001 0.021 0.361 0.245 0.190 0.116 0.049 0.011 0.004 0.001 0.001 210 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.049 0.121 0.230 0.305 0.291 211 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.084 0.151 0.240 0.271 0.243 212 A 0.002 0.010 0.482 0.303 0.136 0.047 0.013 0.004 0.002 0.001 0.001 213 L 0.001 0.001 0.004 0.022 0.066 0.261 0.448 0.132 0.044 0.017 0.005 214 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.037 0.158 0.346 0.453 215 K 0.001 0.002 0.009 0.063 0.152 0.249 0.318 0.123 0.053 0.019 0.010 216 K 0.014 0.046 0.691 0.155 0.059 0.023 0.008 0.002 0.001 0.001 0.001 217 R 0.002 0.007 0.004 0.038 0.080 0.219 0.421 0.148 0.051 0.023 0.006 218 D 0.588 0.203 0.027 0.079 0.036 0.023 0.020 0.012 0.006 0.003 0.003 219 Y 0.003 0.009 0.007 0.027 0.050 0.077 0.161 0.194 0.193 0.158 0.121 220 E 0.030 0.057 0.028 0.120 0.151 0.193 0.198 0.095 0.064 0.037 0.026 221 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.006 0.039 0.112 0.252 0.285 0.299 222 D 0.004 0.004 0.003 0.017 0.026 0.058 0.158 0.170 0.192 0.172 0.197 223 F 0.002 0.002 0.002 0.005 0.005 0.009 0.033 0.086 0.192 0.301 0.364 224 N 0.002 0.004 0.003 0.021 0.037 0.072 0.163 0.196 0.208 0.163 0.130 225 T 0.004 0.008 0.009 0.023 0.024 0.037 0.099 0.152 0.214 0.232 0.198 226 A 0.026 0.029 0.021 0.089 0.113 0.139 0.183 0.141 0.125 0.087 0.048 227 G 0.092 0.078 0.044 0.139 0.117 0.112 0.136 0.104 0.090 0.055 0.033 228 L 0.034 0.033 0.016 0.060 0.077 0.091 0.162 0.153 0.159 0.128 0.088 229 F 0.023 0.034 0.029 0.071 0.069 0.087 0.146 0.133 0.159 0.127 0.124 230 K 0.081 0.113 0.054 0.165 0.174 0.145 0.126 0.066 0.046 0.022 0.009 231 P 0.385 0.161 0.080 0.138 0.086 0.057 0.042 0.023 0.015 0.008 0.004 232 L 0.057 0.056 0.026 0.084 0.106 0.114 0.187 0.134 0.110 0.081 0.045 233 C 0.036 0.052 0.023 0.069 0.077 0.095 0.162 0.145 0.140 0.112 0.090 234 G 0.116 0.091 0.040 0.112 0.140 0.124 0.148 0.090 0.070 0.044 0.025 235 E 0.358 0.145 0.070 0.126 0.080 0.060 0.065 0.038 0.027 0.020 0.012 236 T 0.209 0.096 0.040 0.133 0.122 0.098 0.127 0.070 0.056 0.031 0.016 237 Y 0.019 0.027 0.011 0.045 0.074 0.101 0.189 0.186 0.166 0.114 0.068 238 P 0.035 0.396 0.069 0.127 0.091 0.080 0.081 0.046 0.034 0.025 0.016 239 P 0.014 0.017 0.008 0.056 0.140 0.203 0.239 0.138 0.095 0.057 0.034 240 K 0.550 0.193 0.055 0.099 0.058 0.025 0.014 0.004 0.002 0.001 0.001 241 K 0.005 0.039 0.035 0.321 0.264 0.176 0.104 0.036 0.015 0.004 0.002 242 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.026 0.097 0.226 0.313 0.333 243 V 0.001 0.001 0.003 0.022 0.071 0.197 0.305 0.165 0.118 0.071 0.047 244 T 0.003 0.022 0.590 0.243 0.087 0.034 0.014 0.003 0.002 0.001 0.001 245 L 0.001 0.001 0.001 0.007 0.019 0.092 0.350 0.247 0.142 0.094 0.049 246 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.053 0.179 0.355 0.402 247 S 0.001 0.007 0.106 0.210 0.259 0.224 0.132 0.038 0.015 0.006 0.004 248 E 0.007 0.035 0.523 0.196 0.118 0.077 0.032 0.008 0.003 0.001 0.001 249 L 0.001 0.001 0.001 0.006 0.016 0.069 0.310 0.247 0.167 0.123 0.060 250 Q 0.580 0.238 0.036 0.081 0.031 0.016 0.011 0.004 0.002 0.001 0.001 251 I 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.009 0.036 0.087 0.184 0.255 0.419 252 P 0.071 0.118 0.048 0.185 0.170 0.155 0.138 0.057 0.031 0.015 0.012 253 F 0.002 0.002 0.001 0.006 0.012 0.027 0.111 0.173 0.254 0.200 0.211 254 V 0.003 0.002 0.001 0.006 0.009 0.022 0.068 0.117 0.186 0.237 0.349 255 Y 0.002 0.002 0.002 0.008 0.013 0.027 0.085 0.161 0.258 0.230 0.212 256 G 0.005 0.004 0.003 0.012 0.014 0.029 0.094 0.149 0.211 0.227 0.251 257 S 0.003 0.003 0.002 0.009 0.011 0.022 0.068 0.139 0.205 0.263 0.275 258 D 0.005 0.009 0.006 0.031 0.050 0.070 0.153 0.187 0.195 0.157 0.138 259 S 0.008 0.011 0.007 0.024 0.028 0.043 0.093 0.131 0.189 0.216 0.250 260 H 0.009 0.010 0.006 0.032 0.058 0.085 0.153 0.169 0.183 0.164 0.130 261 G 0.032 0.058 0.022 0.100 0.114 0.112 0.162 0.126 0.117 0.087 0.072 262 V 0.023 0.026 0.017 0.056 0.070 0.089 0.143 0.140 0.162 0.149 0.125 263 Q 0.251 0.129 0.074 0.195 0.133 0.086 0.064 0.029 0.019 0.011 0.009 264 D 0.109 0.137 0.061 0.161 0.131 0.123 0.121 0.065 0.045 0.028 0.017 265 I 0.024 0.027 0.015 0.046 0.055 0.079 0.147 0.150 0.178 0.156 0.123 266 G 0.240 0.146 0.063 0.118 0.092 0.078 0.095 0.054 0.048 0.035 0.031 267 R 0.139 0.132 0.092 0.182 0.132 0.097 0.098 0.054 0.037 0.024 0.013 268 G 0.238 0.222 0.076 0.171 0.119 0.079 0.050 0.020 0.013 0.007 0.005 269 Y 0.023 0.028 0.018 0.055 0.071 0.095 0.163 0.154 0.166 0.133 0.094 270 S 0.194 0.157 0.084 0.167 0.133 0.096 0.082 0.039 0.027 0.014 0.007 271 T 0.154 0.184 0.134 0.191 0.127 0.080 0.066 0.030 0.019 0.009 0.005 272 Y 0.020 0.017 0.012 0.036 0.049 0.080 0.187 0.183 0.170 0.146 0.101 273 C 0.029 0.031 0.028 0.070 0.086 0.107 0.173 0.144 0.144 0.112 0.075 274 Q 0.219 0.183 0.171 0.183 0.104 0.059 0.042 0.018 0.012 0.005 0.002 275 K 0.391 0.165 0.095 0.132 0.074 0.052 0.043 0.022 0.014 0.008 0.005