# TARGET T0440 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0440.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1611 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.347 0.078 0.035 0.085 0.082 0.085 0.109 0.069 0.055 0.033 0.022 2 K 0.159 0.108 0.054 0.135 0.138 0.103 0.107 0.069 0.062 0.040 0.024 3 R 0.087 0.085 0.048 0.120 0.115 0.122 0.164 0.100 0.084 0.044 0.031 4 D 0.092 0.065 0.037 0.089 0.122 0.104 0.156 0.126 0.112 0.061 0.037 5 G 0.024 0.023 0.020 0.043 0.062 0.079 0.148 0.154 0.192 0.143 0.113 6 H 0.014 0.018 0.019 0.046 0.066 0.083 0.177 0.156 0.186 0.135 0.100 7 T 0.007 0.008 0.010 0.021 0.032 0.042 0.125 0.188 0.241 0.176 0.151 8 H 0.006 0.006 0.010 0.021 0.035 0.035 0.100 0.155 0.221 0.200 0.212 9 T 0.007 0.008 0.012 0.028 0.038 0.052 0.112 0.137 0.203 0.194 0.209 10 E 0.019 0.025 0.026 0.088 0.117 0.110 0.169 0.156 0.141 0.086 0.062 11 F 0.020 0.017 0.018 0.050 0.063 0.078 0.162 0.181 0.174 0.140 0.097 12 C 0.016 0.016 0.015 0.046 0.048 0.071 0.129 0.152 0.192 0.180 0.135 13 P 0.081 0.074 0.036 0.095 0.098 0.131 0.147 0.106 0.101 0.078 0.052 14 H 0.111 0.079 0.036 0.121 0.129 0.109 0.140 0.098 0.074 0.063 0.041 15 G 0.110 0.059 0.024 0.064 0.063 0.072 0.111 0.112 0.143 0.136 0.106 16 T 0.180 0.317 0.042 0.128 0.109 0.067 0.062 0.032 0.028 0.023 0.013 17 H 0.313 0.159 0.037 0.159 0.137 0.073 0.059 0.030 0.017 0.010 0.007 18 D 0.546 0.116 0.035 0.077 0.069 0.044 0.043 0.027 0.019 0.014 0.010 19 D 0.055 0.412 0.045 0.205 0.155 0.054 0.045 0.013 0.009 0.005 0.002 20 V 0.003 0.003 0.003 0.007 0.014 0.031 0.127 0.268 0.242 0.153 0.151 21 E 0.210 0.111 0.193 0.273 0.100 0.063 0.029 0.010 0.005 0.005 0.001 22 E 0.023 0.048 0.173 0.376 0.161 0.108 0.070 0.027 0.008 0.004 0.001 23 M 0.001 0.001 0.002 0.003 0.004 0.012 0.081 0.131 0.251 0.283 0.231 24 V 0.001 0.001 0.010 0.010 0.018 0.063 0.248 0.151 0.231 0.146 0.121 25 L 0.001 0.004 0.669 0.146 0.090 0.050 0.025 0.008 0.004 0.002 0.001 26 K 0.001 0.003 0.097 0.108 0.198 0.232 0.299 0.041 0.016 0.005 0.002 27 A 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.002 0.019 0.070 0.189 0.344 0.372 28 I 0.002 0.005 0.048 0.056 0.069 0.203 0.363 0.121 0.071 0.044 0.017 29 E 0.009 0.020 0.687 0.159 0.073 0.028 0.014 0.005 0.003 0.002 0.001 30 L 0.017 0.013 0.043 0.055 0.128 0.226 0.369 0.088 0.036 0.018 0.008 31 D 0.368 0.207 0.088 0.117 0.062 0.043 0.049 0.019 0.021 0.016 0.010 32 F 0.002 0.002 0.004 0.005 0.007 0.020 0.058 0.109 0.190 0.186 0.418 33 D 0.080 0.211 0.234 0.262 0.139 0.034 0.020 0.009 0.006 0.003 0.001 34 E 0.034 0.063 0.054 0.104 0.120 0.144 0.182 0.110 0.095 0.056 0.039 35 Y 0.002 0.003 0.003 0.006 0.011 0.026 0.071 0.143 0.226 0.230 0.278 36 S 0.002 0.004 0.005 0.010 0.015 0.029 0.104 0.185 0.230 0.207 0.208 37 I 0.001 0.001 0.005 0.004 0.005 0.006 0.028 0.077 0.181 0.331 0.361 38 V 0.003 0.004 0.009 0.015 0.021 0.036 0.111 0.132 0.196 0.211 0.262 39 E 0.011 0.012 0.013 0.051 0.066 0.088 0.172 0.192 0.166 0.121 0.107 40 H 0.016 0.015 0.011 0.049 0.074 0.092 0.158 0.187 0.162 0.134 0.101 41 A 0.056 0.050 0.029 0.104 0.124 0.135 0.150 0.112 0.101 0.086 0.053 42 P 0.149 0.095 0.045 0.118 0.105 0.118 0.121 0.081 0.071 0.060 0.037 43 L 0.031 0.040 0.027 0.070 0.075 0.102 0.147 0.129 0.134 0.146 0.099 44 S 0.036 0.046 0.028 0.062 0.071 0.081 0.144 0.127 0.143 0.141 0.120 45 S 0.179 0.118 0.064 0.137 0.121 0.111 0.105 0.060 0.046 0.035 0.023 46 E 0.189 0.127 0.118 0.210 0.129 0.087 0.064 0.031 0.021 0.015 0.008 47 F 0.006 0.010 0.016 0.037 0.044 0.060 0.155 0.176 0.194 0.163 0.140 48 M 0.004 0.010 0.024 0.049 0.062 0.105 0.205 0.174 0.158 0.124 0.086 49 K 0.027 0.042 0.323 0.253 0.175 0.075 0.058 0.023 0.013 0.009 0.003 50 N 0.017 0.037 0.117 0.167 0.170 0.162 0.186 0.066 0.043 0.024 0.011 51 T 0.011 0.009 0.014 0.024 0.027 0.065 0.176 0.165 0.201 0.164 0.144 52 A 0.307 0.177 0.125 0.146 0.081 0.055 0.053 0.025 0.015 0.010 0.005 53 G 0.276 0.180 0.135 0.150 0.080 0.063 0.052 0.026 0.018 0.012 0.008 54 D 0.231 0.132 0.044 0.128 0.111 0.090 0.101 0.056 0.048 0.031 0.027 55 K 0.112 0.085 0.027 0.089 0.109 0.142 0.172 0.103 0.074 0.045 0.044 56 E 0.196 0.217 0.102 0.206 0.118 0.072 0.046 0.020 0.013 0.007 0.004 57 A 0.026 0.020 0.021 0.046 0.049 0.068 0.137 0.190 0.170 0.141 0.132 58 V 0.005 0.007 0.007 0.014 0.019 0.030 0.085 0.143 0.197 0.250 0.243 59 T 0.020 0.043 0.036 0.086 0.089 0.129 0.169 0.108 0.123 0.108 0.089 60 T 0.016 0.016 0.024 0.036 0.046 0.064 0.126 0.127 0.185 0.188 0.173 61 A 0.009 0.008 0.010 0.027 0.040 0.060 0.132 0.167 0.198 0.195 0.154 62 S 0.008 0.012 0.013 0.039 0.046 0.058 0.109 0.172 0.185 0.180 0.180 63 M 0.005 0.009 0.014 0.026 0.032 0.053 0.105 0.153 0.197 0.227 0.181 64 A 0.019 0.033 0.044 0.095 0.098 0.114 0.168 0.122 0.127 0.105 0.076 65 M 0.014 0.015 0.019 0.044 0.049 0.079 0.150 0.158 0.178 0.162 0.133 66 S 0.120 0.093 0.074 0.161 0.149 0.103 0.112 0.069 0.053 0.043 0.023 67 D 0.158 0.183 0.075 0.153 0.111 0.083 0.092 0.054 0.041 0.033 0.017 68 L 0.060 0.048 0.024 0.079 0.087 0.135 0.178 0.134 0.114 0.082 0.059 69 P 0.448 0.158 0.079 0.132 0.068 0.041 0.032 0.017 0.013 0.009 0.004 70 Y 0.083 0.092 0.069 0.170 0.147 0.151 0.134 0.069 0.044 0.029 0.013 71 Y 0.017 0.034 0.033 0.070 0.076 0.095 0.173 0.148 0.152 0.120 0.082 72 F 0.005 0.008 0.019 0.039 0.054 0.107 0.187 0.190 0.163 0.132 0.097 73 K 0.064 0.088 0.306 0.221 0.123 0.077 0.057 0.028 0.018 0.014 0.005 74 K 0.011 0.034 0.064 0.129 0.119 0.156 0.209 0.107 0.085 0.057 0.029 75 M 0.003 0.003 0.006 0.011 0.014 0.027 0.094 0.157 0.244 0.233 0.208 76 N 0.046 0.054 0.168 0.233 0.191 0.117 0.099 0.041 0.025 0.019 0.006 77 H 0.022 0.057 0.247 0.196 0.138 0.112 0.106 0.049 0.037 0.025 0.012 78 I 0.005 0.012 0.019 0.027 0.029 0.059 0.183 0.178 0.202 0.170 0.114 79 K 0.018 0.039 0.058 0.101 0.121 0.148 0.229 0.135 0.079 0.052 0.021 80 K 0.250 0.114 0.337 0.160 0.061 0.035 0.022 0.010 0.006 0.004 0.002 81 K 0.171 0.092 0.136 0.191 0.145 0.115 0.091 0.030 0.016 0.010 0.004 82 Y 0.048 0.055 0.032 0.060 0.054 0.088 0.185 0.141 0.149 0.110 0.077 83 A 0.048 0.086 0.074 0.132 0.155 0.168 0.159 0.079 0.050 0.031 0.018 84 S 0.286 0.173 0.288 0.123 0.054 0.031 0.022 0.010 0.006 0.004 0.002 85 D 0.106 0.111 0.078 0.252 0.188 0.139 0.080 0.025 0.013 0.006 0.003 86 L 0.005 0.003 0.005 0.010 0.013 0.024 0.080 0.141 0.231 0.229 0.258 87 L 0.014 0.042 0.072 0.184 0.217 0.161 0.153 0.069 0.047 0.026 0.015 88 I 0.004 0.013 0.083 0.052 0.042 0.067 0.115 0.123 0.193 0.186 0.123 89 H 0.008 0.019 0.041 0.068 0.080 0.099 0.190 0.156 0.147 0.114 0.077 90 I 0.009 0.015 0.019 0.037 0.043 0.084 0.160 0.189 0.186 0.162 0.094 91 G 0.183 0.129 0.120 0.189 0.113 0.081 0.064 0.039 0.034 0.032 0.015 92 F 0.020 0.023 0.029 0.078 0.095 0.124 0.203 0.167 0.129 0.085 0.045 93 E 0.013 0.017 0.022 0.042 0.041 0.049 0.108 0.129 0.204 0.215 0.161 94 V 0.008 0.013 0.028 0.056 0.073 0.123 0.202 0.162 0.152 0.111 0.075 95 D 0.055 0.104 0.208 0.184 0.115 0.098 0.089 0.054 0.044 0.033 0.015 96 Y 0.013 0.014 0.022 0.050 0.059 0.102 0.208 0.179 0.157 0.122 0.075 97 L 0.038 0.040 0.041 0.079 0.078 0.095 0.166 0.144 0.140 0.110 0.068 98 I 0.110 0.096 0.119 0.164 0.134 0.111 0.114 0.062 0.044 0.032 0.015 99 G 0.164 0.132 0.119 0.166 0.110 0.097 0.096 0.046 0.034 0.023 0.011 100 Y 0.021 0.028 0.023 0.055 0.065 0.102 0.179 0.166 0.159 0.121 0.081 101 E 0.158 0.146 0.090 0.182 0.138 0.101 0.089 0.042 0.028 0.018 0.008 102 D 0.284 0.131 0.158 0.160 0.100 0.057 0.051 0.026 0.016 0.011 0.006 103 F 0.024 0.040 0.040 0.103 0.116 0.146 0.206 0.136 0.098 0.059 0.032 104 T 0.005 0.010 0.018 0.025 0.026 0.046 0.149 0.137 0.215 0.212 0.157 105 R 0.013 0.025 0.080 0.157 0.179 0.216 0.183 0.074 0.040 0.023 0.010 106 D 0.110 0.086 0.351 0.217 0.093 0.063 0.041 0.017 0.011 0.008 0.003 107 F 0.004 0.009 0.015 0.037 0.049 0.084 0.201 0.216 0.170 0.122 0.091 108 L 0.003 0.006 0.014 0.015 0.018 0.033 0.106 0.155 0.203 0.232 0.214 109 N 0.026 0.037 0.271 0.254 0.202 0.100 0.061 0.024 0.012 0.009 0.003 110 E 0.092 0.094 0.289 0.203 0.119 0.093 0.065 0.021 0.013 0.007 0.003 111 Y 0.033 0.019 0.017 0.035 0.041 0.070 0.166 0.189 0.184 0.149 0.098 112 G 0.138 0.092 0.041 0.079 0.073 0.106 0.159 0.111 0.095 0.065 0.042 113 P 0.114 0.117 0.146 0.142 0.104 0.094 0.091 0.057 0.058 0.046 0.031 114 Q 0.217 0.141 0.076 0.125 0.107 0.090 0.105 0.059 0.040 0.024 0.017 115 T 0.126 0.062 0.027 0.084 0.081 0.092 0.139 0.121 0.110 0.089 0.068 116 D 0.112 0.084 0.037 0.113 0.109 0.118 0.131 0.097 0.087 0.061 0.052 117 D 0.125 0.111 0.055 0.125 0.122 0.114 0.127 0.077 0.067 0.045 0.032 118 G 0.074 0.055 0.028 0.094 0.108 0.139 0.180 0.114 0.103 0.064 0.041 119 V 0.017 0.015 0.014 0.036 0.042 0.054 0.115 0.145 0.190 0.185 0.187 120 L 0.007 0.009 0.010 0.023 0.032 0.051 0.117 0.177 0.209 0.195 0.173 121 S 0.021 0.036 0.039 0.091 0.102 0.103 0.149 0.130 0.133 0.115 0.082 122 L 0.008 0.009 0.012 0.031 0.042 0.059 0.123 0.157 0.204 0.186 0.171 123 H 0.011 0.014 0.017 0.043 0.054 0.077 0.151 0.171 0.190 0.154 0.117 124 F 0.009 0.013 0.020 0.049 0.052 0.074 0.147 0.159 0.180 0.161 0.135 125 L 0.007 0.009 0.015 0.031 0.037 0.064 0.134 0.162 0.196 0.178 0.167 126 E 0.059 0.083 0.073 0.179 0.151 0.111 0.118 0.080 0.067 0.050 0.029 127 G 0.097 0.049 0.035 0.088 0.084 0.111 0.163 0.118 0.110 0.084 0.061 128 Q 0.101 0.080 0.042 0.110 0.105 0.097 0.129 0.096 0.096 0.079 0.065 129 G 0.177 0.109 0.039 0.108 0.090 0.100 0.128 0.085 0.078 0.052 0.034 130 G 0.162 0.093 0.047 0.123 0.106 0.096 0.119 0.080 0.075 0.059 0.039 131 F 0.045 0.040 0.026 0.082 0.085 0.109 0.148 0.138 0.135 0.104 0.088 132 R 0.101 0.097 0.043 0.129 0.114 0.120 0.149 0.092 0.075 0.049 0.032 133 S 0.073 0.070 0.044 0.120 0.113 0.104 0.148 0.107 0.097 0.073 0.051 134 I 0.022 0.015 0.014 0.030 0.037 0.068 0.136 0.157 0.197 0.171 0.151 135 D 0.142 0.136 0.092 0.213 0.139 0.091 0.082 0.042 0.030 0.022 0.012 136 F 0.043 0.042 0.031 0.067 0.072 0.091 0.167 0.165 0.137 0.109 0.077 137 S 0.067 0.105 0.045 0.117 0.118 0.114 0.151 0.098 0.082 0.066 0.037 138 A 0.201 0.124 0.069 0.165 0.128 0.102 0.099 0.052 0.031 0.019 0.009 139 E 0.414 0.103 0.102 0.129 0.075 0.059 0.051 0.028 0.019 0.013 0.007 140 D 0.053 0.102 0.058 0.155 0.140 0.131 0.162 0.077 0.058 0.043 0.023 141 Y 0.006 0.012 0.012 0.027 0.034 0.068 0.171 0.204 0.195 0.146 0.124 142 N 0.116 0.095 0.177 0.212 0.147 0.109 0.074 0.033 0.019 0.014 0.005 143 E 0.122 0.109 0.235 0.248 0.118 0.081 0.049 0.018 0.011 0.007 0.003 144 G 0.023 0.023 0.023 0.063 0.076 0.111 0.216 0.169 0.141 0.087 0.070 145 I 0.002 0.004 0.008 0.012 0.016 0.028 0.094 0.147 0.216 0.237 0.236 146 V 0.017 0.036 0.235 0.195 0.139 0.116 0.115 0.056 0.044 0.033 0.015 147 Q 0.027 0.051 0.199 0.197 0.182 0.110 0.121 0.049 0.034 0.021 0.009 148 F 0.026 0.027 0.024 0.053 0.060 0.118 0.235 0.156 0.139 0.098 0.063 149 Y 0.098 0.061 0.038 0.080 0.080 0.117 0.184 0.127 0.097 0.069 0.049 150 G 0.414 0.202 0.115 0.105 0.050 0.035 0.031 0.020 0.013 0.010 0.005 151 G 0.214 0.169 0.063 0.131 0.102 0.096 0.101 0.051 0.036 0.024 0.013 152 F 0.050 0.038 0.017 0.059 0.083 0.129 0.175 0.164 0.127 0.094 0.065 153 E 0.353 0.178 0.105 0.146 0.080 0.056 0.039 0.018 0.013 0.009 0.004 154 Q 0.039 0.063 0.086 0.177 0.174 0.143 0.141 0.089 0.047 0.026 0.015 155 A 0.005 0.008 0.014 0.019 0.020 0.034 0.109 0.143 0.225 0.229 0.193 156 Q 0.007 0.015 0.044 0.099 0.127 0.180 0.236 0.121 0.087 0.055 0.028 157 L 0.055 0.059 0.335 0.211 0.110 0.085 0.066 0.032 0.024 0.016 0.007 158 A 0.022 0.025 0.060 0.106 0.120 0.163 0.230 0.112 0.081 0.055 0.024 159 Y 0.011 0.027 0.028 0.041 0.039 0.063 0.166 0.181 0.190 0.165 0.090 160 L 0.015 0.023 0.052 0.097 0.120 0.193 0.220 0.123 0.078 0.054 0.026 161 E 0.305 0.114 0.349 0.124 0.046 0.024 0.018 0.008 0.005 0.004 0.002 162 G 0.040 0.092 0.061 0.178 0.159 0.177 0.178 0.055 0.034 0.018 0.007 163 V 0.002 0.002 0.003 0.004 0.006 0.013 0.059 0.129 0.239 0.249 0.294 164 K 0.035 0.055 0.163 0.234 0.202 0.167 0.092 0.027 0.013 0.010 0.003 165 Q 0.025 0.055 0.410 0.267 0.131 0.060 0.032 0.012 0.005 0.003 0.001 166 S 0.001 0.002 0.005 0.006 0.009 0.024 0.110 0.186 0.237 0.218 0.203 167 I 0.001 0.002 0.010 0.011 0.014 0.036 0.141 0.156 0.229 0.223 0.178 168 E 0.005 0.017 0.460 0.203 0.149 0.072 0.046 0.023 0.012 0.009 0.003 169 A 0.005 0.012 0.111 0.103 0.132 0.197 0.259 0.086 0.056 0.026 0.013 170 D 0.010 0.009 0.021 0.021 0.019 0.032 0.128 0.124 0.219 0.223 0.194 171 L 0.017 0.019 0.031 0.059 0.067 0.151 0.244 0.166 0.125 0.072 0.048 172 G 0.145 0.132 0.299 0.183 0.077 0.063 0.043 0.023 0.017 0.011 0.007 173 L 0.051 0.035 0.041 0.096 0.096 0.140 0.201 0.125 0.094 0.070 0.052 174 F 0.150 0.065 0.027 0.066 0.058 0.084 0.151 0.110 0.114 0.087 0.088 175 K 0.113 0.131 0.067 0.177 0.146 0.113 0.104 0.051 0.046 0.030 0.023 176 P 0.021 0.013 0.021 0.027 0.028 0.049 0.107 0.137 0.194 0.179 0.225 177 R 0.019 0.029 0.021 0.079 0.104 0.147 0.197 0.119 0.130 0.095 0.061 178 R 0.006 0.011 0.010 0.022 0.030 0.049 0.120 0.167 0.212 0.184 0.189 179 M 0.003 0.004 0.007 0.010 0.013 0.022 0.066 0.107 0.178 0.262 0.328 180 G 0.002 0.003 0.006 0.009 0.011 0.021 0.068 0.144 0.213 0.245 0.277 181 H 0.003 0.007 0.014 0.028 0.037 0.052 0.124 0.164 0.181 0.196 0.195 182 I 0.006 0.007 0.012 0.032 0.044 0.088 0.163 0.161 0.178 0.169 0.142 183 S 0.076 0.079 0.082 0.184 0.163 0.114 0.114 0.074 0.054 0.039 0.021 184 L 0.011 0.019 0.019 0.064 0.081 0.115 0.197 0.157 0.151 0.114 0.073 185 C 0.005 0.005 0.011 0.019 0.020 0.039 0.088 0.101 0.205 0.243 0.265 186 Q 0.030 0.042 0.108 0.211 0.187 0.149 0.126 0.058 0.043 0.031 0.016 187 K 0.011 0.031 0.077 0.115 0.110 0.146 0.196 0.123 0.096 0.059 0.037 188 F 0.003 0.004 0.010 0.015 0.015 0.024 0.090 0.128 0.220 0.235 0.256 189 Q 0.016 0.020 0.050 0.080 0.080 0.122 0.222 0.135 0.128 0.089 0.060 190 Q 0.038 0.047 0.218 0.243 0.183 0.103 0.082 0.039 0.024 0.016 0.007 191 F 0.021 0.022 0.035 0.058 0.063 0.128 0.239 0.172 0.130 0.083 0.050 192 F 0.048 0.048 0.035 0.071 0.064 0.092 0.173 0.145 0.142 0.118 0.064 193 G 0.267 0.137 0.073 0.113 0.086 0.087 0.097 0.057 0.039 0.027 0.016 194 E 0.264 0.136 0.099 0.133 0.099 0.078 0.075 0.046 0.033 0.024 0.013 195 D 0.097 0.106 0.040 0.105 0.094 0.103 0.158 0.111 0.088 0.064 0.036 196 T 0.036 0.043 0.023 0.054 0.074 0.098 0.176 0.160 0.138 0.110 0.087 197 S 0.301 0.133 0.108 0.141 0.095 0.088 0.062 0.032 0.020 0.014 0.007 198 D 0.220 0.147 0.142 0.207 0.118 0.067 0.051 0.023 0.013 0.009 0.004 199 F 0.009 0.024 0.014 0.029 0.033 0.051 0.152 0.213 0.196 0.166 0.114 200 S 0.014 0.036 0.032 0.072 0.120 0.209 0.245 0.141 0.068 0.044 0.019 201 E 0.593 0.065 0.250 0.066 0.010 0.008 0.004 0.002 0.001 0.001 0.001 202 E 0.048 0.045 0.092 0.211 0.180 0.207 0.144 0.042 0.018 0.009 0.003 203 V 0.003 0.011 0.009 0.011 0.012 0.019 0.083 0.137 0.232 0.277 0.207 204 M 0.007 0.015 0.046 0.079 0.145 0.317 0.250 0.088 0.032 0.015 0.007 205 E 0.291 0.050 0.616 0.035 0.004 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 206 K 0.005 0.024 0.029 0.129 0.137 0.300 0.273 0.054 0.030 0.014 0.004 207 F 0.001 0.001 0.002 0.002 0.005 0.009 0.053 0.173 0.247 0.233 0.275 208 R 0.033 0.041 0.334 0.205 0.130 0.184 0.052 0.011 0.005 0.005 0.001 209 V 0.003 0.016 0.511 0.205 0.105 0.083 0.046 0.019 0.007 0.005 0.001 210 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.038 0.170 0.254 0.298 0.232 211 L 0.001 0.001 0.009 0.007 0.012 0.049 0.179 0.172 0.215 0.241 0.114 212 A 0.004 0.007 0.769 0.126 0.041 0.028 0.013 0.005 0.003 0.003 0.001 213 L 0.001 0.002 0.033 0.049 0.086 0.243 0.419 0.106 0.043 0.013 0.005 214 V 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.010 0.028 0.144 0.339 0.475 215 K 0.001 0.003 0.040 0.063 0.101 0.276 0.345 0.089 0.047 0.023 0.012 216 K 0.012 0.026 0.752 0.127 0.048 0.020 0.008 0.003 0.001 0.001 0.001 217 R 0.009 0.008 0.022 0.033 0.056 0.166 0.366 0.195 0.078 0.048 0.020 218 D 0.434 0.134 0.063 0.073 0.040 0.042 0.063 0.040 0.046 0.040 0.024 219 Y 0.020 0.018 0.023 0.032 0.039 0.086 0.149 0.137 0.185 0.170 0.140 220 E 0.075 0.112 0.150 0.148 0.126 0.111 0.105 0.060 0.054 0.034 0.024 221 L 0.003 0.005 0.006 0.009 0.016 0.027 0.085 0.165 0.221 0.251 0.210 222 D 0.007 0.013 0.015 0.030 0.042 0.061 0.120 0.171 0.183 0.169 0.188 223 F 0.002 0.003 0.008 0.008 0.011 0.018 0.057 0.102 0.189 0.296 0.306 224 N 0.005 0.009 0.020 0.040 0.048 0.075 0.148 0.164 0.193 0.152 0.144 225 T 0.008 0.009 0.015 0.036 0.045 0.070 0.144 0.160 0.197 0.170 0.145 226 A 0.024 0.029 0.029 0.083 0.104 0.110 0.171 0.141 0.139 0.104 0.066 227 G 0.071 0.062 0.045 0.123 0.127 0.112 0.149 0.109 0.096 0.064 0.043 228 L 0.023 0.018 0.020 0.048 0.041 0.067 0.127 0.120 0.181 0.186 0.169 229 F 0.040 0.037 0.032 0.103 0.091 0.116 0.161 0.123 0.128 0.086 0.084 230 K 0.114 0.120 0.062 0.148 0.130 0.101 0.114 0.075 0.064 0.044 0.029 231 P 0.168 0.091 0.050 0.124 0.103 0.111 0.119 0.078 0.071 0.053 0.033 232 L 0.086 0.054 0.033 0.078 0.068 0.097 0.145 0.118 0.125 0.110 0.085 233 C 0.078 0.067 0.031 0.097 0.089 0.103 0.155 0.133 0.103 0.084 0.059 234 G 0.212 0.160 0.058 0.125 0.103 0.086 0.093 0.064 0.047 0.032 0.019 235 E 0.256 0.175 0.058 0.142 0.114 0.074 0.070 0.041 0.034 0.024 0.012 236 T 0.242 0.075 0.034 0.101 0.094 0.096 0.124 0.081 0.070 0.048 0.035 237 Y 0.147 0.110 0.052 0.138 0.126 0.103 0.120 0.080 0.057 0.041 0.025 238 P 0.051 0.129 0.057 0.130 0.121 0.120 0.147 0.090 0.080 0.051 0.024 239 P 0.048 0.045 0.028 0.071 0.107 0.122 0.202 0.152 0.112 0.072 0.040 240 K 0.382 0.135 0.113 0.165 0.077 0.051 0.036 0.016 0.012 0.010 0.004 241 K 0.013 0.027 0.035 0.205 0.226 0.188 0.180 0.084 0.028 0.010 0.004 242 I 0.001 0.001 0.003 0.003 0.004 0.007 0.050 0.081 0.235 0.313 0.301 243 V 0.001 0.002 0.013 0.030 0.043 0.173 0.358 0.132 0.136 0.064 0.048 244 T 0.003 0.010 0.504 0.241 0.138 0.058 0.029 0.010 0.005 0.002 0.001 245 L 0.001 0.002 0.013 0.018 0.034 0.129 0.347 0.242 0.118 0.060 0.036 246 A 0.001 0.001 0.007 0.003 0.002 0.004 0.026 0.080 0.185 0.353 0.339 247 S 0.005 0.010 0.162 0.145 0.176 0.190 0.179 0.065 0.033 0.027 0.008 248 E 0.014 0.038 0.464 0.223 0.146 0.066 0.032 0.008 0.004 0.003 0.001 249 L 0.014 0.007 0.017 0.022 0.033 0.089 0.243 0.219 0.164 0.124 0.069 250 Q 0.371 0.213 0.073 0.112 0.067 0.045 0.049 0.024 0.021 0.015 0.009 251 I 0.010 0.011 0.022 0.024 0.024 0.043 0.092 0.120 0.196 0.202 0.255 252 P 0.117 0.142 0.084 0.179 0.155 0.107 0.105 0.046 0.036 0.017 0.011 253 F 0.013 0.014 0.012 0.019 0.025 0.040 0.118 0.142 0.228 0.207 0.182 254 V 0.006 0.006 0.006 0.010 0.016 0.029 0.083 0.118 0.206 0.201 0.320 255 Y 0.004 0.005 0.005 0.009 0.016 0.026 0.086 0.126 0.215 0.218 0.289 256 G 0.004 0.006 0.008 0.014 0.025 0.029 0.090 0.138 0.220 0.215 0.250 257 S 0.004 0.004 0.005 0.011 0.022 0.027 0.086 0.136 0.208 0.223 0.274 258 D 0.006 0.008 0.007 0.025 0.043 0.053 0.120 0.187 0.206 0.173 0.171 259 S 0.009 0.010 0.010 0.031 0.049 0.056 0.115 0.155 0.186 0.182 0.196 260 H 0.014 0.020 0.019 0.054 0.081 0.101 0.155 0.168 0.154 0.134 0.099 261 G 0.060 0.059 0.041 0.120 0.128 0.121 0.143 0.108 0.090 0.074 0.053 262 V 0.029 0.022 0.019 0.057 0.076 0.090 0.136 0.145 0.146 0.152 0.127 263 Q 0.181 0.150 0.070 0.175 0.138 0.090 0.072 0.044 0.036 0.029 0.017 264 D 0.221 0.134 0.062 0.131 0.099 0.077 0.087 0.059 0.052 0.048 0.031 265 I 0.041 0.040 0.026 0.071 0.076 0.114 0.155 0.142 0.133 0.118 0.085 266 G 0.295 0.156 0.072 0.148 0.098 0.068 0.067 0.035 0.028 0.020 0.012 267 R 0.147 0.106 0.067 0.120 0.111 0.112 0.122 0.075 0.062 0.050 0.027 268 G 0.201 0.195 0.075 0.162 0.109 0.087 0.076 0.036 0.028 0.020 0.010 269 Y 0.021 0.022 0.016 0.050 0.058 0.093 0.170 0.192 0.160 0.126 0.093 270 S 0.185 0.140 0.111 0.191 0.122 0.094 0.072 0.037 0.025 0.017 0.007 271 T 0.142 0.131 0.140 0.222 0.155 0.085 0.065 0.027 0.017 0.011 0.005 272 Y 0.020 0.028 0.029 0.055 0.053 0.077 0.156 0.143 0.173 0.150 0.115 273 C 0.011 0.021 0.028 0.060 0.070 0.119 0.204 0.165 0.142 0.105 0.074 274 Q 0.161 0.224 0.303 0.187 0.070 0.026 0.014 0.008 0.004 0.003 0.001 275 K 0.321 0.111 0.113 0.153 0.111 0.083 0.061 0.024 0.013 0.008 0.003