# TARGET T0440 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t04-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0440.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1436 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.331 0.147 0.061 0.090 0.067 0.058 0.084 0.060 0.046 0.035 0.022 2 K 0.116 0.138 0.095 0.222 0.156 0.096 0.077 0.042 0.030 0.017 0.011 3 R 0.133 0.094 0.070 0.109 0.098 0.107 0.150 0.100 0.069 0.044 0.024 4 D 0.034 0.064 0.070 0.172 0.155 0.124 0.142 0.093 0.077 0.043 0.025 5 G 0.028 0.028 0.035 0.049 0.051 0.069 0.149 0.147 0.184 0.155 0.106 6 H 0.011 0.021 0.029 0.086 0.100 0.130 0.174 0.131 0.142 0.103 0.072 7 T 0.004 0.006 0.013 0.014 0.021 0.027 0.075 0.142 0.222 0.241 0.236 8 H 0.003 0.006 0.014 0.035 0.057 0.046 0.109 0.199 0.193 0.183 0.155 9 T 0.005 0.005 0.012 0.019 0.025 0.035 0.080 0.138 0.231 0.255 0.194 10 E 0.023 0.035 0.043 0.122 0.143 0.125 0.166 0.132 0.107 0.062 0.041 11 F 0.013 0.012 0.023 0.045 0.062 0.057 0.133 0.195 0.179 0.155 0.126 12 C 0.012 0.013 0.020 0.036 0.042 0.058 0.117 0.139 0.199 0.194 0.169 13 P 0.114 0.120 0.085 0.167 0.140 0.102 0.120 0.057 0.048 0.028 0.018 14 H 0.141 0.062 0.052 0.103 0.102 0.095 0.143 0.101 0.091 0.064 0.048 15 G 0.178 0.170 0.058 0.151 0.112 0.084 0.095 0.056 0.043 0.032 0.021 16 T 0.133 0.176 0.042 0.118 0.104 0.087 0.129 0.083 0.060 0.041 0.028 17 H 0.345 0.198 0.052 0.125 0.098 0.067 0.053 0.027 0.017 0.010 0.007 18 D 0.645 0.106 0.034 0.077 0.050 0.028 0.029 0.016 0.008 0.005 0.003 19 D 0.145 0.350 0.035 0.161 0.108 0.064 0.067 0.035 0.018 0.011 0.006 20 V 0.003 0.009 0.004 0.014 0.032 0.057 0.127 0.137 0.238 0.204 0.175 21 E 0.437 0.093 0.134 0.175 0.092 0.037 0.020 0.008 0.003 0.001 0.001 22 E 0.021 0.045 0.170 0.315 0.202 0.119 0.089 0.026 0.009 0.004 0.002 23 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.007 0.027 0.061 0.217 0.307 0.375 24 V 0.001 0.001 0.001 0.002 0.013 0.063 0.206 0.162 0.243 0.222 0.088 25 L 0.001 0.004 0.847 0.102 0.033 0.009 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 26 K 0.001 0.002 0.051 0.060 0.090 0.333 0.379 0.058 0.017 0.008 0.002 27 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.012 0.155 0.365 0.464 28 I 0.001 0.002 0.010 0.024 0.073 0.173 0.403 0.161 0.082 0.056 0.013 29 E 0.001 0.021 0.831 0.100 0.029 0.013 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 30 L 0.012 0.010 0.033 0.033 0.070 0.247 0.367 0.146 0.047 0.024 0.010 31 D 0.383 0.307 0.038 0.094 0.037 0.035 0.046 0.030 0.016 0.009 0.005 32 F 0.004 0.003 0.006 0.010 0.022 0.034 0.092 0.131 0.187 0.189 0.322 33 D 0.127 0.157 0.194 0.219 0.168 0.058 0.041 0.019 0.009 0.005 0.003 34 E 0.007 0.018 0.037 0.083 0.115 0.183 0.268 0.126 0.091 0.048 0.025 35 Y 0.002 0.003 0.006 0.008 0.013 0.033 0.078 0.105 0.212 0.249 0.291 36 S 0.001 0.003 0.005 0.019 0.031 0.050 0.120 0.153 0.235 0.206 0.177 37 I 0.001 0.001 0.003 0.002 0.004 0.008 0.020 0.048 0.172 0.282 0.461 38 V 0.002 0.003 0.008 0.021 0.046 0.059 0.129 0.185 0.200 0.179 0.170 39 E 0.012 0.021 0.036 0.090 0.095 0.110 0.163 0.156 0.149 0.109 0.060 40 H 0.006 0.007 0.012 0.029 0.045 0.063 0.139 0.184 0.193 0.160 0.163 41 A 0.039 0.043 0.033 0.097 0.096 0.109 0.162 0.136 0.129 0.092 0.064 42 P 0.124 0.107 0.074 0.150 0.126 0.110 0.130 0.068 0.053 0.034 0.025 43 L 0.057 0.043 0.031 0.065 0.087 0.103 0.146 0.131 0.131 0.107 0.099 44 S 0.098 0.141 0.052 0.122 0.105 0.076 0.115 0.095 0.081 0.066 0.049 45 S 0.065 0.044 0.026 0.078 0.103 0.114 0.157 0.123 0.124 0.091 0.073 46 E 0.353 0.153 0.083 0.147 0.094 0.056 0.049 0.029 0.019 0.010 0.006 47 F 0.035 0.037 0.035 0.122 0.131 0.131 0.181 0.129 0.099 0.058 0.042 48 M 0.008 0.008 0.011 0.019 0.027 0.033 0.076 0.118 0.198 0.201 0.299 49 K 0.043 0.052 0.085 0.163 0.194 0.127 0.146 0.084 0.055 0.033 0.019 50 N 0.094 0.093 0.192 0.203 0.137 0.094 0.080 0.044 0.031 0.020 0.011 51 T 0.096 0.080 0.064 0.140 0.128 0.110 0.145 0.095 0.066 0.045 0.031 52 A 0.211 0.108 0.052 0.111 0.098 0.074 0.113 0.091 0.068 0.044 0.029 53 G 0.262 0.150 0.096 0.147 0.110 0.065 0.066 0.045 0.029 0.018 0.014 54 D 0.192 0.196 0.117 0.156 0.111 0.066 0.064 0.040 0.027 0.018 0.013 55 K 0.287 0.164 0.055 0.124 0.106 0.070 0.078 0.052 0.032 0.019 0.013 56 E 0.458 0.163 0.052 0.112 0.071 0.040 0.040 0.029 0.018 0.011 0.007 57 A 0.200 0.098 0.053 0.128 0.112 0.089 0.113 0.083 0.060 0.039 0.026 58 V 0.098 0.126 0.067 0.154 0.133 0.107 0.112 0.079 0.059 0.039 0.026 59 T 0.111 0.091 0.064 0.144 0.142 0.108 0.125 0.092 0.062 0.035 0.025 60 T 0.189 0.102 0.071 0.138 0.123 0.083 0.100 0.079 0.054 0.035 0.026 61 A 0.050 0.045 0.040 0.105 0.119 0.114 0.172 0.131 0.108 0.071 0.045 62 S 0.102 0.074 0.059 0.148 0.147 0.116 0.143 0.088 0.062 0.039 0.022 63 M 0.064 0.049 0.067 0.112 0.121 0.114 0.153 0.112 0.094 0.068 0.045 64 A 0.059 0.093 0.086 0.183 0.155 0.110 0.129 0.080 0.053 0.035 0.017 65 M 0.020 0.025 0.027 0.058 0.075 0.118 0.189 0.136 0.151 0.131 0.071 66 S 0.147 0.129 0.135 0.202 0.146 0.087 0.072 0.038 0.024 0.013 0.007 67 D 0.137 0.191 0.120 0.195 0.113 0.083 0.074 0.038 0.024 0.017 0.008 68 L 0.015 0.017 0.013 0.026 0.038 0.083 0.153 0.125 0.205 0.186 0.140 69 P 0.377 0.198 0.076 0.155 0.089 0.040 0.032 0.017 0.008 0.005 0.002 70 Y 0.090 0.058 0.095 0.131 0.112 0.145 0.146 0.085 0.067 0.049 0.022 71 Y 0.050 0.092 0.052 0.133 0.128 0.142 0.173 0.097 0.068 0.041 0.023 72 F 0.018 0.018 0.018 0.044 0.062 0.091 0.177 0.173 0.168 0.136 0.093 73 K 0.110 0.114 0.163 0.191 0.149 0.099 0.079 0.044 0.025 0.016 0.008 74 K 0.070 0.134 0.099 0.235 0.163 0.098 0.100 0.053 0.026 0.015 0.007 75 M 0.020 0.013 0.013 0.029 0.045 0.076 0.142 0.150 0.198 0.182 0.132 76 N 0.132 0.098 0.103 0.179 0.146 0.113 0.118 0.056 0.032 0.016 0.008 77 H 0.029 0.053 0.156 0.205 0.165 0.126 0.120 0.066 0.040 0.026 0.014 78 I 0.003 0.004 0.009 0.010 0.018 0.045 0.119 0.128 0.231 0.246 0.188 79 K 0.049 0.095 0.101 0.234 0.179 0.112 0.112 0.056 0.034 0.020 0.007 80 K 0.070 0.068 0.227 0.188 0.132 0.115 0.096 0.048 0.029 0.019 0.008 81 K 0.108 0.118 0.140 0.214 0.153 0.104 0.084 0.041 0.020 0.012 0.006 82 Y 0.023 0.034 0.022 0.036 0.043 0.092 0.194 0.166 0.165 0.149 0.076 83 A 0.123 0.199 0.110 0.187 0.138 0.087 0.068 0.038 0.024 0.016 0.009 84 S 0.453 0.171 0.103 0.120 0.060 0.033 0.029 0.015 0.008 0.005 0.002 85 D 0.245 0.128 0.070 0.162 0.116 0.088 0.085 0.047 0.030 0.018 0.010 86 L 0.042 0.041 0.026 0.063 0.072 0.111 0.172 0.146 0.150 0.114 0.065 87 L 0.027 0.055 0.055 0.146 0.147 0.161 0.154 0.099 0.075 0.049 0.032 88 I 0.009 0.011 0.027 0.035 0.050 0.082 0.153 0.150 0.186 0.159 0.137 89 H 0.019 0.029 0.044 0.091 0.105 0.112 0.166 0.131 0.132 0.106 0.065 90 I 0.010 0.016 0.022 0.057 0.071 0.101 0.186 0.165 0.172 0.129 0.071 91 G 0.065 0.058 0.052 0.123 0.111 0.102 0.128 0.105 0.107 0.083 0.064 92 F 0.013 0.011 0.014 0.029 0.042 0.066 0.137 0.159 0.203 0.183 0.142 93 E 0.020 0.036 0.036 0.106 0.122 0.105 0.155 0.151 0.120 0.092 0.058 94 V 0.010 0.009 0.015 0.025 0.035 0.058 0.125 0.145 0.209 0.211 0.158 95 D 0.066 0.088 0.083 0.183 0.157 0.118 0.115 0.073 0.057 0.037 0.023 96 Y 0.041 0.032 0.035 0.075 0.084 0.108 0.182 0.145 0.138 0.106 0.054 97 L 0.050 0.063 0.040 0.099 0.093 0.122 0.170 0.111 0.111 0.089 0.052 98 I 0.129 0.102 0.070 0.136 0.117 0.107 0.132 0.077 0.063 0.042 0.025 99 G 0.264 0.174 0.075 0.157 0.104 0.069 0.064 0.039 0.026 0.017 0.010 100 Y 0.042 0.061 0.029 0.081 0.091 0.105 0.169 0.134 0.126 0.099 0.064 101 E 0.145 0.090 0.051 0.136 0.142 0.126 0.142 0.076 0.048 0.029 0.015 102 D 0.214 0.125 0.145 0.192 0.115 0.076 0.063 0.032 0.018 0.013 0.006 103 F 0.013 0.025 0.021 0.055 0.072 0.151 0.216 0.140 0.145 0.114 0.048 104 T 0.011 0.023 0.016 0.042 0.054 0.075 0.156 0.152 0.201 0.172 0.099 105 R 0.049 0.044 0.118 0.178 0.177 0.164 0.148 0.062 0.035 0.018 0.008 106 D 0.091 0.107 0.305 0.246 0.123 0.061 0.039 0.015 0.006 0.004 0.002 107 F 0.003 0.004 0.007 0.011 0.018 0.062 0.131 0.132 0.244 0.250 0.137 108 L 0.009 0.014 0.014 0.040 0.061 0.109 0.229 0.171 0.160 0.134 0.060 109 N 0.043 0.092 0.406 0.226 0.110 0.059 0.033 0.014 0.009 0.005 0.002 110 E 0.101 0.091 0.180 0.190 0.149 0.119 0.092 0.043 0.019 0.011 0.006 111 Y 0.050 0.054 0.025 0.056 0.060 0.091 0.175 0.167 0.137 0.117 0.067 112 G 0.136 0.105 0.051 0.121 0.131 0.115 0.132 0.092 0.057 0.039 0.022 113 P 0.345 0.144 0.142 0.148 0.084 0.049 0.040 0.023 0.012 0.008 0.004 114 Q 0.150 0.143 0.066 0.159 0.125 0.102 0.118 0.062 0.038 0.022 0.013 115 T 0.042 0.036 0.016 0.040 0.054 0.071 0.135 0.140 0.173 0.153 0.140 116 D 0.148 0.144 0.081 0.205 0.155 0.095 0.075 0.045 0.026 0.016 0.009 117 D 0.096 0.082 0.071 0.159 0.137 0.123 0.133 0.083 0.058 0.037 0.021 118 G 0.025 0.026 0.018 0.052 0.069 0.081 0.148 0.139 0.172 0.142 0.126 119 V 0.009 0.013 0.013 0.047 0.070 0.094 0.152 0.153 0.177 0.166 0.106 120 L 0.009 0.016 0.031 0.063 0.079 0.141 0.178 0.134 0.157 0.134 0.058 121 S 0.008 0.020 0.029 0.085 0.100 0.120 0.185 0.149 0.139 0.105 0.060 122 L 0.002 0.002 0.004 0.009 0.014 0.033 0.072 0.100 0.233 0.285 0.246 123 H 0.018 0.024 0.030 0.088 0.113 0.128 0.181 0.132 0.129 0.098 0.059 124 F 0.011 0.015 0.028 0.055 0.064 0.115 0.167 0.135 0.169 0.156 0.086 125 L 0.011 0.014 0.012 0.029 0.039 0.085 0.149 0.130 0.196 0.179 0.157 126 E 0.156 0.142 0.050 0.144 0.121 0.087 0.110 0.076 0.055 0.035 0.024 127 G 0.217 0.103 0.040 0.107 0.094 0.090 0.108 0.082 0.068 0.051 0.041 128 Q 0.290 0.162 0.035 0.124 0.096 0.071 0.075 0.055 0.039 0.030 0.023 129 G 0.241 0.123 0.028 0.107 0.099 0.087 0.101 0.082 0.061 0.042 0.030 130 G 0.177 0.107 0.034 0.111 0.103 0.090 0.102 0.087 0.078 0.057 0.054 131 F 0.035 0.036 0.018 0.055 0.068 0.088 0.134 0.134 0.159 0.146 0.128 132 R 0.102 0.096 0.040 0.147 0.147 0.113 0.126 0.090 0.067 0.044 0.028 133 S 0.186 0.117 0.046 0.141 0.115 0.093 0.100 0.074 0.059 0.043 0.026 134 I 0.072 0.044 0.023 0.083 0.092 0.112 0.162 0.123 0.127 0.096 0.066 135 D 0.124 0.117 0.051 0.148 0.122 0.098 0.116 0.079 0.066 0.050 0.030 136 F 0.033 0.026 0.020 0.057 0.073 0.116 0.159 0.134 0.161 0.131 0.091 137 S 0.123 0.183 0.068 0.142 0.112 0.083 0.097 0.068 0.056 0.044 0.026 138 A 0.043 0.044 0.030 0.112 0.135 0.143 0.176 0.122 0.095 0.064 0.037 139 E 0.416 0.143 0.076 0.128 0.079 0.051 0.046 0.028 0.017 0.010 0.006 140 D 0.074 0.074 0.050 0.163 0.143 0.137 0.151 0.089 0.061 0.036 0.023 141 Y 0.015 0.016 0.014 0.028 0.040 0.051 0.103 0.137 0.196 0.194 0.207 142 N 0.022 0.038 0.040 0.092 0.127 0.125 0.174 0.128 0.114 0.083 0.058 143 E 0.067 0.072 0.148 0.202 0.174 0.112 0.095 0.057 0.038 0.022 0.013 144 G 0.083 0.054 0.051 0.128 0.132 0.124 0.174 0.111 0.071 0.044 0.027 145 I 0.007 0.009 0.011 0.026 0.034 0.049 0.110 0.136 0.225 0.205 0.188 146 V 0.014 0.013 0.020 0.045 0.070 0.094 0.168 0.150 0.171 0.146 0.107 147 Q 0.041 0.075 0.161 0.196 0.163 0.116 0.095 0.057 0.047 0.031 0.019 148 F 0.020 0.025 0.033 0.061 0.079 0.116 0.204 0.153 0.139 0.104 0.066 149 Y 0.027 0.025 0.017 0.048 0.059 0.098 0.183 0.143 0.168 0.139 0.094 150 G 0.330 0.161 0.086 0.154 0.106 0.054 0.049 0.027 0.016 0.009 0.006 151 G 0.149 0.187 0.065 0.143 0.116 0.089 0.104 0.062 0.040 0.029 0.016 152 F 0.023 0.029 0.013 0.050 0.079 0.119 0.205 0.147 0.152 0.108 0.074 153 E 0.487 0.135 0.096 0.123 0.067 0.035 0.031 0.014 0.007 0.003 0.001 154 Q 0.040 0.061 0.125 0.225 0.167 0.163 0.124 0.045 0.026 0.015 0.008 155 A 0.003 0.005 0.009 0.012 0.022 0.036 0.091 0.122 0.227 0.259 0.215 156 Q 0.004 0.009 0.019 0.059 0.109 0.168 0.281 0.158 0.102 0.071 0.019 157 L 0.012 0.030 0.470 0.189 0.103 0.095 0.054 0.020 0.014 0.009 0.003 158 A 0.016 0.031 0.144 0.176 0.163 0.191 0.161 0.066 0.028 0.016 0.007 159 Y 0.002 0.004 0.008 0.009 0.015 0.035 0.102 0.140 0.248 0.254 0.183 160 L 0.006 0.008 0.019 0.030 0.064 0.112 0.230 0.165 0.157 0.127 0.081 161 E 0.069 0.087 0.514 0.199 0.081 0.026 0.013 0.005 0.003 0.001 0.001 162 G 0.072 0.058 0.081 0.133 0.153 0.157 0.205 0.083 0.033 0.016 0.010 163 V 0.006 0.009 0.008 0.012 0.018 0.025 0.072 0.118 0.217 0.234 0.282 164 K 0.043 0.043 0.057 0.131 0.184 0.166 0.182 0.100 0.051 0.029 0.014 165 Q 0.079 0.098 0.354 0.228 0.109 0.058 0.038 0.017 0.010 0.006 0.003 166 S 0.012 0.012 0.023 0.035 0.055 0.090 0.195 0.168 0.172 0.128 0.111 167 I 0.017 0.019 0.020 0.042 0.052 0.063 0.136 0.156 0.199 0.168 0.126 168 E 0.060 0.090 0.168 0.209 0.164 0.107 0.088 0.048 0.033 0.019 0.012 169 A 0.076 0.056 0.116 0.142 0.148 0.107 0.127 0.097 0.061 0.039 0.031 170 D 0.105 0.106 0.059 0.113 0.101 0.098 0.150 0.106 0.079 0.055 0.030 171 L 0.079 0.063 0.040 0.114 0.116 0.116 0.158 0.118 0.094 0.062 0.039 172 G 0.367 0.158 0.102 0.129 0.078 0.051 0.047 0.028 0.020 0.013 0.008 173 L 0.098 0.073 0.058 0.139 0.129 0.113 0.146 0.095 0.073 0.047 0.030 174 F 0.055 0.057 0.034 0.064 0.069 0.090 0.148 0.131 0.140 0.125 0.088 175 K 0.098 0.121 0.072 0.181 0.156 0.108 0.104 0.064 0.047 0.029 0.020 176 P 0.214 0.132 0.079 0.148 0.114 0.079 0.087 0.062 0.039 0.028 0.019 177 R 0.066 0.055 0.033 0.119 0.134 0.128 0.162 0.113 0.092 0.064 0.034 178 R 0.050 0.058 0.036 0.100 0.102 0.118 0.187 0.129 0.109 0.074 0.037 179 M 0.015 0.021 0.032 0.087 0.104 0.146 0.185 0.120 0.125 0.091 0.075 180 G 0.006 0.009 0.016 0.022 0.035 0.049 0.111 0.127 0.214 0.211 0.199 181 H 0.001 0.005 0.009 0.025 0.047 0.046 0.114 0.152 0.212 0.209 0.181 182 I 0.001 0.001 0.003 0.006 0.013 0.029 0.067 0.111 0.228 0.283 0.258 183 S 0.025 0.045 0.082 0.198 0.185 0.131 0.138 0.080 0.059 0.035 0.021 184 L 0.001 0.003 0.009 0.023 0.044 0.058 0.162 0.228 0.191 0.162 0.120 185 C 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.009 0.022 0.042 0.196 0.311 0.412 186 Q 0.008 0.012 0.037 0.082 0.140 0.159 0.256 0.117 0.095 0.061 0.032 187 K 0.008 0.021 0.105 0.115 0.109 0.188 0.174 0.088 0.088 0.075 0.029 188 F 0.001 0.004 0.006 0.011 0.015 0.067 0.143 0.107 0.234 0.255 0.155 189 Q 0.058 0.056 0.027 0.093 0.100 0.116 0.192 0.131 0.110 0.070 0.046 190 Q 0.189 0.115 0.137 0.173 0.117 0.084 0.071 0.045 0.031 0.021 0.016 191 F 0.038 0.038 0.037 0.077 0.090 0.145 0.183 0.125 0.110 0.095 0.062 192 F 0.019 0.031 0.012 0.040 0.050 0.083 0.142 0.156 0.179 0.159 0.128 193 G 0.110 0.092 0.046 0.123 0.130 0.105 0.123 0.101 0.074 0.051 0.043 194 E 0.184 0.076 0.069 0.138 0.124 0.097 0.112 0.078 0.055 0.038 0.027 195 D 0.052 0.050 0.029 0.086 0.092 0.109 0.155 0.132 0.127 0.098 0.069 196 T 0.033 0.058 0.022 0.074 0.086 0.093 0.150 0.143 0.141 0.109 0.090 197 S 0.162 0.071 0.044 0.111 0.126 0.099 0.128 0.094 0.076 0.049 0.040 198 D 0.368 0.121 0.081 0.152 0.103 0.053 0.053 0.031 0.019 0.012 0.008 199 F 0.016 0.031 0.017 0.062 0.080 0.111 0.184 0.154 0.153 0.123 0.070 200 S 0.014 0.025 0.014 0.049 0.077 0.107 0.181 0.153 0.163 0.126 0.090 201 E 0.255 0.102 0.166 0.196 0.129 0.060 0.049 0.023 0.012 0.005 0.003 202 E 0.111 0.083 0.117 0.222 0.172 0.111 0.101 0.043 0.021 0.011 0.007 203 V 0.002 0.006 0.006 0.009 0.014 0.028 0.081 0.100 0.233 0.272 0.250 204 M 0.015 0.016 0.024 0.075 0.164 0.198 0.265 0.115 0.070 0.038 0.019 205 E 0.173 0.091 0.528 0.149 0.041 0.010 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 206 K 0.011 0.036 0.044 0.145 0.182 0.198 0.235 0.090 0.034 0.018 0.007 207 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.015 0.060 0.099 0.253 0.333 0.233 208 R 0.030 0.038 0.337 0.278 0.188 0.076 0.034 0.012 0.004 0.002 0.001 209 V 0.006 0.025 0.413 0.237 0.149 0.095 0.054 0.015 0.004 0.002 0.001 210 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.024 0.048 0.201 0.306 0.413 211 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 0.066 0.202 0.156 0.239 0.213 0.110 212 A 0.003 0.011 0.782 0.136 0.047 0.013 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 213 L 0.001 0.002 0.021 0.029 0.052 0.286 0.458 0.083 0.041 0.021 0.006 214 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.009 0.123 0.279 0.586 215 K 0.003 0.005 0.015 0.050 0.135 0.196 0.328 0.149 0.066 0.040 0.014 216 K 0.003 0.056 0.693 0.150 0.051 0.028 0.009 0.003 0.003 0.002 0.001 217 R 0.010 0.015 0.022 0.049 0.100 0.225 0.328 0.152 0.052 0.028 0.020 218 D 0.449 0.169 0.035 0.079 0.045 0.045 0.061 0.051 0.032 0.022 0.011 219 Y 0.017 0.018 0.027 0.057 0.071 0.114 0.208 0.150 0.161 0.105 0.071 220 E 0.029 0.058 0.074 0.140 0.151 0.121 0.159 0.095 0.078 0.052 0.042 221 L 0.001 0.003 0.008 0.009 0.014 0.026 0.072 0.100 0.229 0.250 0.288 222 D 0.002 0.005 0.008 0.020 0.042 0.071 0.145 0.186 0.187 0.173 0.161 223 F 0.001 0.001 0.003 0.006 0.010 0.012 0.034 0.106 0.199 0.309 0.319 224 N 0.002 0.004 0.011 0.029 0.056 0.077 0.148 0.200 0.194 0.168 0.110 225 T 0.005 0.009 0.017 0.039 0.049 0.074 0.149 0.169 0.211 0.183 0.095 226 A 0.016 0.020 0.028 0.080 0.092 0.144 0.207 0.142 0.139 0.086 0.047 227 G 0.116 0.096 0.074 0.146 0.122 0.105 0.138 0.078 0.060 0.038 0.026 228 L 0.012 0.010 0.017 0.029 0.039 0.057 0.109 0.126 0.194 0.196 0.212 229 F 0.029 0.048 0.031 0.078 0.098 0.124 0.185 0.125 0.115 0.100 0.068 230 K 0.084 0.116 0.088 0.183 0.152 0.112 0.111 0.063 0.045 0.028 0.018 231 P 0.345 0.118 0.061 0.128 0.097 0.072 0.074 0.043 0.029 0.020 0.015 232 L 0.084 0.055 0.027 0.073 0.073 0.091 0.142 0.117 0.133 0.119 0.087 233 C 0.073 0.080 0.029 0.100 0.105 0.118 0.152 0.115 0.102 0.078 0.048 234 G 0.137 0.129 0.048 0.116 0.103 0.108 0.123 0.080 0.071 0.054 0.031 235 E 0.261 0.188 0.066 0.165 0.111 0.066 0.063 0.036 0.023 0.013 0.008 236 T 0.289 0.125 0.045 0.123 0.097 0.080 0.093 0.059 0.042 0.030 0.017 237 Y 0.092 0.076 0.031 0.108 0.114 0.133 0.147 0.107 0.086 0.066 0.042 238 P 0.085 0.270 0.054 0.141 0.117 0.093 0.094 0.063 0.040 0.029 0.014 239 P 0.041 0.046 0.025 0.081 0.113 0.155 0.206 0.125 0.105 0.068 0.035 240 K 0.573 0.086 0.089 0.121 0.059 0.028 0.024 0.011 0.005 0.003 0.001 241 K 0.041 0.082 0.072 0.262 0.203 0.151 0.118 0.042 0.017 0.008 0.004 242 I 0.001 0.001 0.002 0.003 0.006 0.010 0.034 0.080 0.226 0.297 0.342 243 V 0.001 0.001 0.005 0.018 0.069 0.192 0.337 0.156 0.116 0.075 0.030 244 T 0.003 0.017 0.803 0.129 0.036 0.008 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 245 L 0.001 0.001 0.011 0.018 0.036 0.217 0.374 0.132 0.108 0.078 0.023 246 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.019 0.040 0.222 0.369 0.343 247 S 0.011 0.024 0.154 0.172 0.215 0.165 0.163 0.058 0.023 0.011 0.004 248 E 0.004 0.045 0.656 0.161 0.073 0.038 0.014 0.005 0.002 0.002 0.001 249 L 0.006 0.006 0.010 0.014 0.030 0.126 0.275 0.187 0.157 0.117 0.070 250 Q 0.387 0.251 0.050 0.128 0.058 0.037 0.040 0.024 0.014 0.008 0.004 251 I 0.009 0.008 0.024 0.025 0.035 0.059 0.124 0.123 0.210 0.190 0.192 252 P 0.048 0.109 0.117 0.202 0.178 0.116 0.112 0.052 0.034 0.019 0.015 253 F 0.003 0.006 0.014 0.020 0.030 0.053 0.130 0.157 0.217 0.194 0.176 254 V 0.002 0.005 0.009 0.018 0.031 0.053 0.107 0.162 0.192 0.211 0.211 255 Y 0.002 0.004 0.008 0.021 0.030 0.036 0.103 0.185 0.227 0.234 0.151 256 G 0.003 0.004 0.012 0.026 0.039 0.054 0.113 0.157 0.212 0.218 0.162 257 S 0.002 0.004 0.011 0.020 0.030 0.037 0.094 0.174 0.225 0.232 0.170 258 D 0.004 0.007 0.012 0.033 0.047 0.083 0.159 0.166 0.215 0.174 0.101 259 S 0.005 0.006 0.016 0.022 0.031 0.033 0.081 0.131 0.193 0.217 0.265 260 H 0.012 0.012 0.020 0.043 0.066 0.120 0.185 0.152 0.173 0.141 0.075 261 G 0.052 0.070 0.055 0.128 0.115 0.100 0.168 0.110 0.097 0.065 0.040 262 V 0.018 0.022 0.022 0.053 0.069 0.101 0.174 0.146 0.158 0.131 0.106 263 Q 0.207 0.121 0.071 0.157 0.125 0.091 0.107 0.050 0.036 0.022 0.013 264 D 0.145 0.166 0.094 0.179 0.121 0.091 0.085 0.048 0.032 0.025 0.014 265 I 0.033 0.038 0.020 0.056 0.069 0.128 0.180 0.123 0.147 0.129 0.078 266 G 0.224 0.162 0.053 0.123 0.093 0.083 0.104 0.060 0.046 0.036 0.017 267 R 0.121 0.099 0.101 0.172 0.130 0.127 0.104 0.057 0.044 0.028 0.015 268 G 0.213 0.207 0.071 0.156 0.105 0.079 0.076 0.043 0.025 0.016 0.008 269 Y 0.014 0.017 0.012 0.032 0.044 0.080 0.154 0.151 0.200 0.166 0.131 270 S 0.210 0.144 0.108 0.177 0.141 0.083 0.067 0.036 0.018 0.010 0.006 271 T 0.141 0.120 0.140 0.228 0.149 0.086 0.072 0.034 0.016 0.008 0.005 272 Y 0.028 0.024 0.028 0.048 0.066 0.081 0.166 0.160 0.165 0.136 0.099 273 C 0.031 0.025 0.032 0.087 0.106 0.124 0.214 0.153 0.115 0.076 0.036 274 Q 0.050 0.162 0.369 0.216 0.096 0.052 0.029 0.012 0.008 0.004 0.002 275 K 0.041 0.062 0.103 0.136 0.167 0.128 0.156 0.100 0.053 0.031 0.022