# TARGET T0437 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0437.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 52 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.021 0.005 0.010 0.062 0.151 0.751 2 K 0.047 0.019 0.036 0.169 0.200 0.530 3 D 0.076 0.037 0.047 0.199 0.213 0.429 4 V 0.088 0.022 0.049 0.307 0.199 0.336 5 V 0.086 0.011 0.025 0.195 0.248 0.435 6 D 0.077 0.019 0.045 0.398 0.235 0.227 7 K 0.085 0.032 0.062 0.417 0.220 0.184 8 C 0.081 0.012 0.121 0.427 0.235 0.123 9 S 0.093 0.015 0.132 0.238 0.412 0.110 10 T 0.079 0.009 0.093 0.157 0.516 0.147 11 K 0.086 0.015 0.045 0.095 0.518 0.241 12 G 0.095 0.008 0.022 0.025 0.424 0.425 13 C 0.248 0.024 0.019 0.015 0.264 0.430 14 A 0.458 0.030 0.034 0.013 0.240 0.226 15 I 0.527 0.013 0.030 0.013 0.233 0.184 16 D 0.715 0.010 0.016 0.006 0.134 0.120 17 I 0.721 0.004 0.015 0.007 0.135 0.118 18 G 0.790 0.003 0.011 0.008 0.092 0.096 19 T 0.919 0.005 0.005 0.004 0.032 0.036 20 V 0.932 0.004 0.005 0.003 0.029 0.027 21 I 0.925 0.010 0.002 0.002 0.030 0.031 22 D 0.675 0.015 0.007 0.007 0.244 0.052 23 N 0.178 0.007 0.013 0.008 0.762 0.032 24 D 0.062 0.004 0.009 0.002 0.899 0.024 25 N 0.057 0.002 0.004 0.001 0.896 0.040 26 C 0.664 0.011 0.001 0.001 0.163 0.161 27 T 0.937 0.007 0.001 0.001 0.011 0.045 28 S 0.969 0.001 0.001 0.001 0.005 0.025 29 K 0.986 0.001 0.001 0.001 0.004 0.009 30 F 0.983 0.002 0.001 0.001 0.003 0.011 31 S 0.979 0.001 0.001 0.001 0.005 0.015 32 R 0.960 0.001 0.001 0.001 0.012 0.025 33 F 0.903 0.007 0.002 0.001 0.024 0.063 34 F 0.514 0.015 0.011 0.005 0.243 0.212 35 A 0.078 0.014 0.017 0.012 0.406 0.473 36 T 0.021 0.013 0.008 0.046 0.308 0.603 37 R 0.001 0.001 0.007 0.965 0.020 0.007 38 E 0.001 0.001 0.002 0.974 0.016 0.007 39 E 0.001 0.001 0.003 0.983 0.011 0.002 40 A 0.001 0.001 0.001 0.990 0.004 0.005 41 E 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 42 S 0.001 0.001 0.001 0.994 0.004 0.002 43 F 0.001 0.001 0.001 0.994 0.003 0.002 44 M 0.001 0.001 0.001 0.995 0.002 0.002 45 T 0.001 0.001 0.001 0.993 0.004 0.002 46 K 0.001 0.001 0.001 0.981 0.006 0.012 47 L 0.001 0.001 0.001 0.978 0.003 0.018 48 K 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 49 E 0.001 0.001 0.001 0.995 0.002 0.002 50 L 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 51 A 0.001 0.001 0.002 0.990 0.005 0.002 52 A 0.001 0.001 0.006 0.981 0.010 0.003 53 A 0.001 0.001 0.008 0.939 0.034 0.018 54 A 0.001 0.002 0.010 0.786 0.095 0.106 55 S 0.002 0.014 0.081 0.311 0.360 0.232 56 S 0.004 0.005 0.224 0.102 0.544 0.121 57 A 0.005 0.004 0.225 0.059 0.555 0.152 58 D 0.017 0.013 0.068 0.019 0.615 0.268 59 E 0.056 0.012 0.031 0.011 0.485 0.404 60 G 0.147 0.019 0.030 0.011 0.360 0.434 61 A 0.332 0.017 0.027 0.010 0.296 0.320 62 S 0.600 0.022 0.010 0.004 0.135 0.229 63 V 0.770 0.010 0.003 0.002 0.056 0.159 64 A 0.836 0.005 0.005 0.002 0.047 0.105 65 Y 0.857 0.002 0.006 0.002 0.047 0.087 66 K 0.901 0.003 0.005 0.002 0.039 0.050 67 I 0.922 0.003 0.002 0.002 0.026 0.044 68 K 0.939 0.004 0.001 0.002 0.024 0.029 69 D 0.905 0.009 0.002 0.003 0.041 0.040 70 L 0.639 0.011 0.008 0.008 0.287 0.046 71 E 0.158 0.004 0.018 0.013 0.764 0.043 72 G 0.046 0.003 0.013 0.004 0.889 0.045 73 Q 0.227 0.008 0.004 0.001 0.618 0.142 74 V 0.807 0.006 0.001 0.001 0.050 0.136 75 E 0.956 0.003 0.001 0.001 0.007 0.034 76 L 0.978 0.001 0.001 0.001 0.004 0.017 77 D 0.983 0.001 0.001 0.001 0.004 0.012 78 A 0.981 0.001 0.001 0.001 0.003 0.015 79 A 0.984 0.001 0.001 0.001 0.003 0.012 80 F 0.972 0.001 0.001 0.001 0.002 0.025 81 T 0.961 0.001 0.001 0.001 0.004 0.034 82 F 0.856 0.003 0.001 0.001 0.008 0.133 83 S 0.771 0.007 0.001 0.005 0.021 0.196 84 C 0.416 0.009 0.002 0.017 0.072 0.484 85 Q 0.345 0.021 0.009 0.095 0.101 0.429 86 A 0.164 0.011 0.027 0.495 0.101 0.202 87 E 0.037 0.002 0.011 0.899 0.032 0.019 88 M 0.010 0.001 0.005 0.963 0.015 0.006 89 I 0.004 0.001 0.003 0.982 0.007 0.004 90 I 0.001 0.001 0.002 0.991 0.004 0.002 91 F 0.001 0.001 0.003 0.991 0.004 0.002 92 E 0.001 0.001 0.002 0.991 0.004 0.002 93 L 0.001 0.001 0.003 0.975 0.009 0.012 94 S 0.001 0.001 0.011 0.895 0.034 0.059 95 L 0.001 0.001 0.043 0.840 0.067 0.048 96 R 0.003 0.006 0.093 0.749 0.104 0.047 97 S 0.006 0.005 0.073 0.537 0.159 0.219 98 L 0.005 0.003 0.049 0.308 0.127 0.508 99 A 0.001 0.002 0.003 0.019 0.045 0.931