# TARGET T0437 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t04-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0437.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 16.5273 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.083 0.080 0.010 0.016 0.025 0.080 0.048 0.658 2 K 0.036 0.086 0.020 0.036 0.033 0.096 0.071 0.622 3 D 0.062 0.146 0.022 0.032 0.056 0.071 0.062 0.551 4 V 0.083 0.306 0.045 0.054 0.074 0.067 0.064 0.307 5 V 0.111 0.164 0.030 0.029 0.057 0.077 0.086 0.448 6 D 0.036 0.069 0.077 0.054 0.079 0.100 0.262 0.324 7 K 0.034 0.115 0.143 0.039 0.079 0.093 0.221 0.276 8 C 0.112 0.051 0.108 0.034 0.023 0.103 0.281 0.288 9 S 0.270 0.055 0.021 0.015 0.012 0.081 0.106 0.441 10 T 0.053 0.021 0.029 0.006 0.011 0.134 0.044 0.704 11 K 0.016 0.027 0.046 0.011 0.018 0.156 0.035 0.692 12 G 0.021 0.033 0.049 0.024 0.045 0.153 0.082 0.594 13 C 0.016 0.030 0.135 0.093 0.113 0.124 0.097 0.394 14 A 0.013 0.015 0.170 0.067 0.167 0.104 0.135 0.328 15 I 0.014 0.011 0.290 0.096 0.125 0.083 0.087 0.295 16 D 0.044 0.025 0.224 0.082 0.265 0.069 0.117 0.174 17 I 0.014 0.015 0.186 0.115 0.258 0.089 0.061 0.262 18 G 0.004 0.008 0.081 0.161 0.382 0.061 0.051 0.252 19 T 0.003 0.004 0.117 0.307 0.413 0.030 0.039 0.087 20 V 0.003 0.001 0.069 0.311 0.436 0.034 0.045 0.101 21 I 0.006 0.001 0.104 0.281 0.312 0.063 0.073 0.160 22 D 0.150 0.002 0.039 0.097 0.208 0.078 0.079 0.347 23 N 0.107 0.002 0.009 0.020 0.031 0.136 0.049 0.647 24 D 0.009 0.002 0.004 0.022 0.025 0.143 0.023 0.772 25 N 0.017 0.009 0.007 0.049 0.084 0.129 0.041 0.665 26 C 0.042 0.031 0.022 0.157 0.195 0.087 0.056 0.409 27 T 0.026 0.015 0.021 0.142 0.160 0.091 0.106 0.440 28 S 0.005 0.020 0.031 0.313 0.336 0.051 0.072 0.171 29 K 0.032 0.039 0.031 0.187 0.449 0.038 0.053 0.171 30 F 0.020 0.049 0.023 0.403 0.249 0.037 0.059 0.159 31 S 0.046 0.088 0.064 0.178 0.292 0.060 0.086 0.186 32 R 0.044 0.054 0.098 0.094 0.139 0.063 0.285 0.222 33 F 0.036 0.106 0.049 0.084 0.071 0.088 0.121 0.445 34 F 0.123 0.295 0.023 0.029 0.038 0.071 0.068 0.354 35 A 0.014 0.260 0.027 0.008 0.009 0.061 0.090 0.532 36 T 0.007 0.922 0.001 0.001 0.001 0.006 0.032 0.029 37 R 0.008 0.979 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.003 38 E 0.005 0.592 0.003 0.001 0.001 0.010 0.348 0.041 39 E 0.001 0.941 0.001 0.001 0.001 0.003 0.045 0.008 40 A 0.002 0.984 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.001 41 E 0.006 0.112 0.004 0.001 0.001 0.005 0.865 0.007 42 S 0.001 0.822 0.002 0.001 0.001 0.013 0.109 0.052 43 F 0.004 0.953 0.005 0.001 0.001 0.004 0.022 0.012 44 M 0.011 0.938 0.001 0.001 0.001 0.003 0.038 0.009 45 T 0.004 0.920 0.001 0.001 0.001 0.006 0.026 0.044 46 K 0.004 0.944 0.002 0.001 0.001 0.003 0.024 0.022 47 L 0.008 0.921 0.001 0.001 0.001 0.002 0.059 0.008 48 K 0.007 0.947 0.001 0.001 0.001 0.003 0.023 0.019 49 E 0.024 0.854 0.003 0.001 0.001 0.008 0.037 0.074 50 L 0.059 0.772 0.015 0.001 0.002 0.015 0.063 0.074 51 A 0.189 0.507 0.025 0.003 0.003 0.032 0.122 0.119 52 A 0.073 0.191 0.022 0.005 0.009 0.064 0.153 0.483 53 A 0.044 0.118 0.037 0.009 0.013 0.108 0.086 0.586 54 A 0.099 0.092 0.060 0.018 0.018 0.106 0.145 0.462 55 S 0.062 0.035 0.032 0.015 0.016 0.095 0.035 0.711 56 S 0.204 0.024 0.034 0.009 0.015 0.078 0.066 0.569 57 A 0.134 0.012 0.023 0.014 0.014 0.088 0.052 0.663 58 D 0.107 0.007 0.037 0.006 0.020 0.103 0.047 0.672 59 E 0.027 0.009 0.029 0.022 0.032 0.152 0.034 0.695 60 G 0.022 0.005 0.008 0.015 0.027 0.128 0.022 0.772 61 A 0.010 0.016 0.076 0.142 0.156 0.131 0.054 0.415 62 S 0.030 0.025 0.109 0.099 0.201 0.082 0.080 0.374 63 V 0.015 0.019 0.099 0.260 0.202 0.065 0.062 0.279 64 A 0.030 0.029 0.114 0.201 0.333 0.048 0.038 0.208 65 Y 0.025 0.027 0.067 0.210 0.310 0.044 0.054 0.263 66 K 0.033 0.040 0.050 0.211 0.261 0.054 0.048 0.303 67 I 0.098 0.030 0.033 0.147 0.221 0.072 0.044 0.356 68 K 0.034 0.015 0.038 0.150 0.169 0.067 0.057 0.471 69 D 0.207 0.011 0.024 0.046 0.063 0.074 0.058 0.518 70 L 0.600 0.009 0.005 0.018 0.024 0.030 0.031 0.283 71 E 0.038 0.003 0.013 0.010 0.034 0.090 0.017 0.793 72 G 0.006 0.004 0.017 0.058 0.150 0.106 0.022 0.639 73 Q 0.007 0.003 0.035 0.170 0.318 0.084 0.069 0.313 74 V 0.004 0.002 0.069 0.427 0.390 0.018 0.024 0.066 75 E 0.009 0.002 0.112 0.149 0.469 0.037 0.027 0.196 76 L 0.004 0.002 0.142 0.337 0.385 0.024 0.032 0.076 77 D 0.006 0.001 0.044 0.181 0.461 0.047 0.027 0.234 78 A 0.003 0.003 0.077 0.443 0.378 0.018 0.043 0.036 79 A 0.005 0.002 0.025 0.221 0.325 0.055 0.021 0.346 80 F 0.003 0.005 0.072 0.428 0.392 0.022 0.040 0.037 81 T 0.016 0.008 0.031 0.266 0.343 0.051 0.053 0.233 82 F 0.012 0.015 0.040 0.336 0.245 0.065 0.078 0.210 83 S 0.028 0.096 0.040 0.214 0.223 0.068 0.068 0.264 84 C 0.029 0.153 0.030 0.122 0.184 0.066 0.090 0.326 85 Q 0.015 0.345 0.027 0.133 0.099 0.039 0.202 0.142 86 A 0.030 0.295 0.018 0.088 0.097 0.038 0.251 0.184 87 E 0.005 0.679 0.021 0.143 0.060 0.007 0.056 0.030 88 M 0.023 0.775 0.015 0.014 0.106 0.005 0.026 0.035 89 I 0.004 0.689 0.026 0.096 0.066 0.007 0.093 0.019 90 I 0.014 0.380 0.058 0.054 0.170 0.015 0.274 0.035 91 F 0.022 0.463 0.034 0.136 0.076 0.012 0.225 0.032 92 E 0.070 0.423 0.044 0.051 0.093 0.036 0.118 0.164 93 L 0.037 0.247 0.089 0.086 0.060 0.062 0.271 0.148 94 S 0.042 0.279 0.056 0.038 0.058 0.090 0.147 0.290 95 L 0.160 0.253 0.030 0.030 0.031 0.076 0.121 0.297 96 R 0.111 0.148 0.017 0.040 0.027 0.072 0.131 0.454 97 S 0.084 0.073 0.022 0.017 0.030 0.103 0.058 0.614 98 L 0.135 0.067 0.039 0.025 0.039 0.098 0.094 0.504 99 A 0.106 0.037 0.024 0.018 0.030 0.100 0.057 0.629