This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATAA K A 3 3 NATAA D A 4 4 NATAA V A 5 5 NATAA V A 6 6 NATAA D A 7 7 NATAA K A 8 8 NATRO C A 9 9 NATAA S A 10 10 NATAA T A 11 11 NATAA K A 12 12 NATAA G A 13 13 NATRO C A 14 14 NATAA A A 15 15 NATAA I A 16 16 NATAA D A 17 17 NATAA I A 18 18 NATAA G A 19 19 NATAA T A 20 20 NATAA V A 21 21 NATAA I A 22 22 NATAA D A 23 23 NATAA N A 24 24 NATAA D A 25 25 NATAA N A 26 26 NATRO C A 27 27 NATAA T A 28 28 NATAA S A 29 29 NATAA K A 30 30 NATAA F A 31 31 NATAA S A 32 32 NATAA R A 33 33 NATAA F A 34 34 NATAA F A 35 35 NATAA A A 36 36 NATAA T A 37 37 NATAA R A 38 38 NATAA E A 39 39 NATAA E A 40 40 NATAA A A 41 41 NATAA E A 42 42 NATAA S A 43 43 NATAA F A 44 44 NATAA M A 45 45 NATAA T A 46 46 NATAA K A 47 47 NATAA L A 48 48 NATAA K A 49 49 NATAA E A 50 50 NATAA L A 51 51 NATAA A A 52 52 NATAA A A 53 53 NATAA A A 54 54 NATAA A A 55 55 NATAA S A 56 56 NATAA S A 57 57 NATAA A A 58 58 NATAA D A 59 59 NATAA E A 60 60 NATAA G A 61 61 NATAA A A 62 62 NATAA S A 63 63 NATAA V A 64 64 NATAA A A 65 65 NATAA Y A 66 66 NATAA K A 67 67 NATAA I A 68 68 NATAA K A 69 69 NATAA D A 70 70 NATAA L A 71 71 NATAA E A 72 72 NATAA G A 73 73 NATAA Q A 74 74 NATAA V A 75 75 NATAA E A 76 76 NATAA L A 77 77 NATAA D A 78 78 NATAA A A 79 79 NATAA A A 80 80 NATAA F A 81 81 NATAA T A 82 82 NATAA F A 83 83 NATAA S A 84 84 NATRO C A 85 85 NATAA Q A 86 86 NATAA A A 87 87 NATAA E A 88 88 NATAA M A 89 89 NATAA I A 90 90 NATAA I A 91 91 NATAA F A 92 92 NATAA E A 93 93 NATAA L A 94 94 NATAA S A 95 95 NATAA L A 96 96 NATAA R A 97 97 NATAA S A 98 98 NATAA L A 99 99 NATAA A