This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 51 NATAA R A 2 52 NATAA V A 3 53 NATAA T A 4 54 NATAA R A 5 55 NATAA K A 6 56 NATAA A A 7 57 NATRO P A 8 58 NATAA S A 9 59 NATAA R A 10 60 NATAA D A 11 61 NATAA E A 12 62 NATRO P A 13 63 NATRO C A 14 64 NATAA S A 15 65 NATAA S A 16 66 NATAA T A 17 67 NATAA S A 18 68 NATAA R A 19 69 NATRO P A 20 70 NATAA A A 21 71 NATAA L A 22 72 NATAA E A 23 73 NATAA E A 24 74 NATAA D A 25 75 NATAA V A 26 76 NATAA I A 27 77 NATAA Y A 28 78 NATAA H A 29 79 NATAA V A 30 80 NATAA K A 31 81 NATAA Y A 32 82 NATAA D A 33 83 NATAA D A 34 84 NATAA Y A 35 85 NATRO P A 36 86 NATAA E A 37 87 NATAA N A 38 88 NATAA G A 39 89 NATAA V A 40 90 NATAA V A 41 91 NATAA Q A 42 92 NATAA M A 43 93 NATAA N A 44 94 NATAA S A 45 95 NATAA R A 46 96 NATAA D A 47 97 NATAA V A 48 98 NATAA R A 49 99 NATAA A A 50 100 NATAA R A 51 101 NATAA A A 52 102 NATAA R A 53 103 NATAA T A 54 104 NATAA I A 55 105 NATAA I A 56 106 NATAA K A 57 107 NATAA W A 58 108 NATAA Q A 59 109 NATAA D A 60 110 NATAA L A 61 111 NATAA E A 62 112 NATAA V A 63 113 NATAA G A 64 114 NATAA Q A 65 115 NATAA V A 66 116 NATAA V A 67 117 NATAA M A 68 118 NATAA L A 69 119 NATAA N A 70 120 NATAA Y A 71 121 NATAA N A 72 122 NATRO P A 73 123 NATAA D A 74 124 NATAA N A 75 125 NATRO P A 76 126 NATAA K A 77 127 NATAA E A 78 128 NATAA R A 79 129 NATAA G A 80 130 NATAA F A 81 131 NATAA W A 82 132 NATAA Y A 83 133 NATAA D A 84 134 NATAA A A 85 135 NATAA E A 86 136 NATAA I A 87 137 NATAA S A 88 138 NATAA R A 89 139 NATAA K A 90 140 NATAA R A 91 141 NATAA E A 92 142 NATAA T A 93 143 NATAA R A 94 144 NATAA T A 95 145 NATAA A A 96 146 NATAA R A 97 147 NATAA E A 98 148 NATAA L A 99 149 NATAA Y A 100 150 NATAA A A 101 151 NATAA N