# TARGET T0423 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0423.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 910.806 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.092 0.124 0.015 0.031 0.038 0.098 0.061 0.541 2 S 0.067 0.335 0.013 0.016 0.026 0.074 0.057 0.412 3 D 0.046 0.415 0.018 0.018 0.027 0.066 0.065 0.345 4 V 0.054 0.512 0.020 0.027 0.022 0.057 0.071 0.237 5 I 0.073 0.734 0.010 0.008 0.009 0.021 0.048 0.096 6 E 0.061 0.714 0.009 0.006 0.009 0.024 0.048 0.129 7 G 0.042 0.582 0.025 0.019 0.017 0.031 0.075 0.210 8 R 0.070 0.504 0.021 0.017 0.020 0.050 0.089 0.228 9 L 0.157 0.175 0.072 0.024 0.026 0.067 0.201 0.277 10 K 0.304 0.091 0.014 0.021 0.026 0.070 0.086 0.387 11 E 0.057 0.009 0.012 0.008 0.014 0.061 0.083 0.756 12 L 0.017 0.010 0.043 0.036 0.084 0.190 0.050 0.568 13 G 0.023 0.004 0.032 0.028 0.066 0.114 0.039 0.693 14 F 0.010 0.003 0.057 0.073 0.056 0.141 0.031 0.629 15 T 0.059 0.011 0.060 0.027 0.046 0.117 0.057 0.623 16 L 0.271 0.017 0.030 0.031 0.026 0.109 0.106 0.409 17 P 0.056 0.013 0.026 0.010 0.014 0.101 0.029 0.751 18 V 0.084 0.014 0.021 0.010 0.016 0.112 0.042 0.701 19 A 0.041 0.017 0.026 0.021 0.024 0.138 0.057 0.675 20 A 0.109 0.024 0.022 0.017 0.027 0.095 0.055 0.650 21 A 0.153 0.013 0.026 0.030 0.031 0.118 0.083 0.546 22 P 0.043 0.010 0.025 0.022 0.035 0.106 0.055 0.703 23 A 0.087 0.008 0.020 0.011 0.027 0.100 0.027 0.719 24 A 0.073 0.009 0.033 0.027 0.033 0.150 0.046 0.629 25 N 0.020 0.015 0.026 0.016 0.041 0.136 0.033 0.714 26 Y 0.022 0.015 0.043 0.025 0.066 0.130 0.103 0.595 27 V 0.048 0.029 0.051 0.172 0.160 0.088 0.130 0.323 28 P 0.016 0.010 0.094 0.186 0.279 0.041 0.101 0.272 29 F 0.003 0.003 0.080 0.174 0.380 0.049 0.065 0.247 30 T 0.007 0.001 0.168 0.273 0.324 0.044 0.057 0.126 31 I 0.085 0.002 0.073 0.123 0.133 0.086 0.064 0.433 32 S 0.088 0.006 0.034 0.052 0.107 0.118 0.055 0.538 33 G 0.009 0.003 0.031 0.029 0.130 0.158 0.022 0.619 34 N 0.003 0.002 0.168 0.163 0.432 0.061 0.038 0.134 35 L 0.001 0.001 0.156 0.310 0.356 0.018 0.055 0.103 36 L 0.001 0.001 0.255 0.320 0.339 0.009 0.036 0.039 37 Y 0.007 0.001 0.364 0.255 0.270 0.013 0.031 0.058 38 V 0.103 0.002 0.169 0.320 0.201 0.033 0.059 0.113 39 S 0.012 0.001 0.061 0.042 0.138 0.072 0.022 0.651 40 G 0.013 0.002 0.075 0.066 0.240 0.122 0.017 0.464 41 Q 0.011 0.002 0.046 0.174 0.229 0.082 0.026 0.430 42 L 0.044 0.006 0.039 0.174 0.135 0.101 0.038 0.463 43 P 0.014 0.005 0.051 0.155 0.188 0.105 0.069 0.413 44 M 0.045 0.003 0.012 0.014 0.015 0.065 0.021 0.825 45 E 0.893 0.009 0.003 0.005 0.004 0.010 0.026 0.050 46 S 0.048 0.011 0.006 0.005 0.012 0.090 0.013 0.814 47 G 0.023 0.007 0.015 0.014 0.085 0.098 0.019 0.738 48 K 0.023 0.005 0.027 0.112 0.145 0.111 0.137 0.440 49 I 0.004 0.004 0.048 0.186 0.234 0.099 0.081 0.344 50 A 0.031 0.002 0.076 0.098 0.196 0.066 0.045 0.485 51 V 0.082 0.003 0.055 0.199 0.131 0.081 0.054 0.394 52 T 0.010 0.004 0.082 0.041 0.121 0.072 0.022 0.648 53 G 0.016 0.005 0.083 0.086 0.231 0.106 0.037 0.435 54 L 0.013 0.004 0.116 0.204 0.150 0.100 0.068 0.345 55 V 0.060 0.008 0.065 0.077 0.084 0.090 0.046 0.568 56 G 0.222 0.015 0.047 0.068 0.076 0.082 0.087 0.404 57 R 0.036 0.014 0.037 0.029 0.058 0.114 0.036 0.677 58 D 0.023 0.017 0.027 0.016 0.037 0.094 0.023 0.764 59 V 0.022 0.030 0.046 0.055 0.036 0.132 0.047 0.630 60 D 0.171 0.329 0.017 0.011 0.012 0.070 0.083 0.307 61 V 0.182 0.543 0.008 0.004 0.005 0.034 0.065 0.160 62 A 0.022 0.549 0.007 0.004 0.005 0.042 0.073 0.298 63 S 0.008 0.931 0.001 0.001 0.001 0.005 0.029 0.024 64 A 0.001 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.003 65 Q 0.001 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.002 66 R 0.001 0.978 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 0.002 67 A 0.001 0.974 0.001 0.001 0.001 0.001 0.023 0.001 68 A 0.002 0.849 0.001 0.001 0.001 0.001 0.146 0.001 69 E 0.001 0.968 0.001 0.001 0.001 0.001 0.027 0.003 70 L 0.004 0.297 0.004 0.001 0.001 0.002 0.686 0.007 71 C 0.008 0.909 0.001 0.001 0.001 0.002 0.077 0.004 72 A 0.014 0.934 0.001 0.001 0.001 0.002 0.032 0.017 73 V 0.002 0.918 0.001 0.001 0.001 0.003 0.040 0.037 74 N 0.003 0.976 0.001 0.001 0.001 0.002 0.016 0.004 75 I 0.003 0.976 0.001 0.001 0.001 0.001 0.019 0.001 76 L 0.002 0.975 0.001 0.001 0.001 0.001 0.019 0.002 77 A 0.001 0.982 0.002 0.001 0.001 0.001 0.010 0.004 78 Q 0.003 0.984 0.005 0.001 0.001 0.001 0.006 0.002 79 V 0.030 0.841 0.059 0.001 0.001 0.003 0.057 0.009 80 K 0.062 0.516 0.063 0.003 0.001 0.023 0.169 0.163 81 A 0.117 0.143 0.224 0.003 0.002 0.052 0.146 0.312 82 A 0.402 0.045 0.060 0.004 0.003 0.089 0.044 0.353 83 L 0.271 0.011 0.007 0.001 0.001 0.048 0.014 0.647 84 N 0.007 0.006 0.002 0.001 0.001 0.052 0.004 0.927 85 G 0.008 0.014 0.013 0.003 0.004 0.091 0.020 0.848 86 D 0.288 0.228 0.010 0.016 0.007 0.078 0.059 0.314 87 L 0.181 0.216 0.018 0.008 0.007 0.066 0.051 0.452 88 S 0.025 0.111 0.035 0.018 0.029 0.097 0.111 0.574 89 K 0.074 0.210 0.021 0.023 0.034 0.066 0.270 0.303 90 I 0.079 0.272 0.013 0.024 0.031 0.082 0.231 0.268 91 R 0.021 0.153 0.037 0.045 0.111 0.087 0.186 0.360 92 R 0.024 0.153 0.064 0.103 0.275 0.057 0.147 0.177 93 V 0.009 0.047 0.143 0.087 0.209 0.078 0.169 0.259 94 I 0.006 0.016 0.234 0.243 0.248 0.048 0.104 0.100 95 K 0.012 0.015 0.163 0.153 0.182 0.095 0.178 0.202 96 L 0.006 0.012 0.233 0.111 0.148 0.112 0.118 0.260 97 N 0.007 0.007 0.341 0.121 0.267 0.044 0.113 0.101 98 G 0.011 0.005 0.299 0.149 0.218 0.035 0.130 0.153 99 F 0.008 0.006 0.407 0.172 0.220 0.027 0.056 0.103 100 V 0.028 0.010 0.206 0.138 0.168 0.081 0.058 0.310 101 A 0.011 0.008 0.171 0.083 0.090 0.160 0.057 0.420 102 S 0.069 0.062 0.027 0.010 0.018 0.124 0.043 0.647 103 V 0.418 0.243 0.011 0.004 0.004 0.062 0.062 0.196 104 P 0.059 0.285 0.017 0.009 0.008 0.081 0.046 0.496 105 E 0.069 0.517 0.009 0.005 0.008 0.041 0.063 0.287 106 F 0.162 0.353 0.018 0.012 0.014 0.057 0.187 0.197 107 V 0.101 0.349 0.015 0.019 0.024 0.079 0.151 0.263 108 E 0.039 0.291 0.011 0.009 0.021 0.052 0.062 0.515 109 Q 0.044 0.208 0.026 0.026 0.060 0.100 0.113 0.424 110 H 0.076 0.152 0.041 0.051 0.061 0.086 0.262 0.271 111 L 0.030 0.133 0.065 0.068 0.088 0.108 0.090 0.418 112 V 0.077 0.119 0.046 0.029 0.054 0.110 0.035 0.529 113 I 0.152 0.094 0.039 0.028 0.024 0.091 0.227 0.344 114 N 0.026 0.160 0.029 0.014 0.018 0.099 0.137 0.516 115 G 0.050 0.538 0.010 0.004 0.005 0.050 0.035 0.308 116 A 0.044 0.850 0.004 0.004 0.003 0.014 0.019 0.063 117 S 0.056 0.791 0.004 0.001 0.003 0.018 0.035 0.091 118 N 0.011 0.101 0.004 0.002 0.003 0.014 0.820 0.046 119 L 0.011 0.514 0.010 0.005 0.005 0.022 0.381 0.050 120 I 0.092 0.723 0.008 0.004 0.009 0.023 0.052 0.089 121 A 0.101 0.247 0.048 0.033 0.036 0.060 0.154 0.320 122 T 0.115 0.116 0.045 0.020 0.040 0.090 0.130 0.444 123 V 0.198 0.041 0.025 0.010 0.013 0.145 0.076 0.493 124 L 0.020 0.008 0.055 0.019 0.021 0.163 0.073 0.640 125 G 0.106 0.008 0.010 0.003 0.006 0.080 0.021 0.767 126 E 0.423 0.013 0.013 0.004 0.004 0.066 0.076 0.400 127 P 0.024 0.015 0.028 0.005 0.010 0.148 0.022 0.748 128 G 0.016 0.011 0.018 0.003 0.010 0.084 0.018 0.841 129 R 0.043 0.053 0.046 0.035 0.020 0.139 0.053 0.613 130 H 0.079 0.248 0.076 0.019 0.030 0.085 0.106 0.357 131 A 0.087 0.266 0.068 0.032 0.063 0.082 0.101 0.300 132 R 0.020 0.094 0.128 0.089 0.151 0.063 0.159 0.296 133 A 0.019 0.318 0.144 0.084 0.143 0.042 0.074 0.178 134 A 0.032 0.186 0.212 0.077 0.156 0.055 0.068 0.214 135 V 0.017 0.018 0.384 0.240 0.124 0.033 0.089 0.095 136 G 0.167 0.047 0.104 0.089 0.136 0.063 0.115 0.278 137 M 0.378 0.007 0.047 0.047 0.061 0.057 0.049 0.355 138 A 0.034 0.004 0.010 0.052 0.073 0.108 0.032 0.688 139 S 0.001 0.001 0.005 0.006 0.010 0.040 0.012 0.925 140 L 0.165 0.002 0.011 0.030 0.030 0.128 0.041 0.594 141 P 0.743 0.001 0.004 0.003 0.002 0.023 0.039 0.185 142 F 0.094 0.001 0.008 0.003 0.013 0.137 0.012 0.732 143 N 0.005 0.001 0.018 0.003 0.031 0.058 0.016 0.869 144 A 0.004 0.003 0.084 0.166 0.238 0.109 0.038 0.360 145 S 0.001 0.003 0.270 0.177 0.311 0.023 0.053 0.162 146 V 0.001 0.005 0.205 0.374 0.308 0.011 0.037 0.059 147 E 0.001 0.005 0.526 0.181 0.214 0.005 0.034 0.034 148 I 0.004 0.012 0.136 0.487 0.267 0.010 0.044 0.040 149 D 0.003 0.010 0.302 0.177 0.327 0.020 0.055 0.104 150 A 0.004 0.010 0.102 0.305 0.495 0.014 0.037 0.033 151 I 0.006 0.005 0.089 0.289 0.459 0.013 0.038 0.102 152 V 0.005 0.002 0.060 0.440 0.419 0.012 0.019 0.043 153 E 0.007 0.002 0.047 0.261 0.449 0.028 0.031 0.175 154 I 0.019 0.002 0.039 0.261 0.266 0.070 0.030 0.313 155 D 0.039 0.004 0.026 0.080 0.129 0.106 0.040 0.576 156 V 0.051 0.005 0.016 0.032 0.051 0.120 0.043 0.683